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[bssd] 流水账:我在那战斗的7年里(4)
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[bssd] 流水账:我在那战斗的7年里(4)# Biology - 生物学
n*m
1
烟男的书里
除了亵渎和尘缘一本正经点
总觉得伊很多行文处
透露着一股子轻浮
就是那种只有知道自己是猪脚的优越感
比如明知道作死的几率很大还不停的故意去作死
比如很多类似与指环王里战斗中数敌人首级的那种桥段
和猫腻的那些装逼的段落差不多的恶心
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c*a
2
不兼容, 版本不相容,还有连带LOAD了各种不需要的库,造出系统愚蠢笨重,维护都
很难,而且很不稳定, 稍微一个轮子出问题, 连带一堆。
不知道为什么这么多弯曲傻逼公司都用JAVA堆轮子。
而且还有人吹捧?
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f*s
3
我继续,包子啊,包子,谢谢~
(4)
-------------------
话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
些,您就那么几个人,已经很牛了。
但是想想,我当时其实处境很危险,这个题目对大小老板都不是太重要的东东,
成功了锦上添花,不成还可以赖到另一个人头上,而且他们各自都不清楚该对我有多少
指导,毕竟还有另一个pi 在,管得太多也不好,所以我基本处于3不管地段,不去实验
室都没人知道。如果我是个postdoc,那可能会是很理想的状态,但我当时还是个刚知
道怎么拿 pipet 1年的学生。庆幸的是,我还算脸皮厚而且不招人讨厌,别人做试验的
时候就跟在后面看,学技术,同时想尽各种方法的努力提蛋白,因为蛋白不稳定要24小
时连转,半夜哆嗦着在cold room ,几个小时不停换buffer看柱子,可惜都不成,照我
当时的产量速度,要3,4 年才能积攒到需要的量开始做assay。。而且估计到时候酶也
死了。几个月后,也许是两边老板都觉得让我挣扎一个非常没前途的题目太可怜, 于是
不约而同都各自在自己的实验室里找了个边角的题目让我来做,让我至少有些data,不
至于在lab meeting 上显的太凄惨。。 瞬间,我就有了3个互相不搭调的题目,很忙,
但是后来想想,其实那是对multi-tasking,prioritize,时间分配能力的一种锻炼。
后来那两个边角料的题目,一个让我参加了人生第一个学术大会,还拿了个award,另
一个几年后也发了篇paper。但是说实话,我最大的收获是,有了信心,明白其实我还
是可以做的很好。同时,也在老板们面前证明了自己。
当时有人跟我说,你不如就顺着一个边角题目做下去,估计也能毕业了。不过,我
还是老毛病,越是看上去不可能的事我越要去做,所以还是念念不忘我最开始的题目,
当然心里也有盘算,觉得自己太享受这种有2个pi的环境了,不想放弃任何一个。
有时候觉得,其实能够塑造一个人的道路的就是那么几个巧合或者瞬间。我最大
的幸运是能在合适的时间遇到合适的机会或人。第2年下半年的时候有一次系里journal
club,要找paper讲,老板不喜欢我找的一篇讲机理的文章,给我2天的时间再准备一
篇,我决定找篇讲技术的,容易准备, 就这样碰巧搜到一篇刚发了一个月的paper,讲
一个改进的蛋白表达系统。我看的心潮澎湃,因为如果能成,这个系统也许会解决我的
蛋白的问题。第2天讲完paper之后,我立刻跟老板说,我想联系这些作者,看看能不能
用他们的系统,paper是欧洲发的,估计他们那时候也很想知道,这个系统的应用性如
何,所以很快给我回了信,往返签了一堆paperwork(我发现其实我还挺享受这个过程
), 免费寄了全套载体和菌株。我现在还庆幸,当时问的早,因为不出1年,他们就用
这个技术成立了一个蛋白表达公司,不会再给任何人材料,后来我作为最开始的合作者
,还跟他们有联系帮做promotion 的flyer之类的,就不罗嗦了。 恩,还有当然不用猜
,这个系统肯定是work了,要不我就不在这瞎白乎了。反正那是我们第一次过完柱子染
胶就直接看到了蛋白,而不是要做western才知道在哪里。。老板们的喜悦之情自然不
用提,系里其他教授们系主任也开始意识到我的存在是“认真”的。后来老板对我说,
他们那么多年的学生里,有极端聪明的,有拼命努力工作的,我可能在这两点上没有绝
对优势,但是我不轻易give up , 所以 persistent 绝对第一 ^_^ .
其实,这件事给我带来的不仅仅是试验上的进展,还有对自己未来职业方向的思
考,因为我是在那时候第一次接触到所谓的 technology transfer ,才意识到原来有那
么种职位,原来学生物的也可以去做law 或者 product development, 对我来说没准会
比单纯做试验写paper,写grant 更有意思。这些都是最开始的零星想法,1,2年后变
成了实际的探索,最后又机缘巧合的引到了做regulatory的路上,不过现在,我可以肯
定的说,对我来说,product development 的过程确实比在学校做试验写paper要有趣
,虽然有时候还是挺怀念实验室的环境,但是,未来的机会那么多,没有时间也不会想
再回头看 .
不过,话说回来,那时候也就是零星小想法,毕竟很快就到第3年了,蛋白有眉目
了,但发现assay没人会做,小老板也就是理论上操作过,实际也没用过。。。所以,
在其他题目也磕磕绊绊着的同时,我的第2个大难题就来了。
恩,想起来前几天有同学问过,如果自己做的东西老板其实也不太懂怎么办,其
实办法很简单,把自己教会了,再教他们,然后你就毕业了。我下一篇讲我怎么“教”
老板的,呵呵 =)
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N*e
4
能不能举个栗子
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p*n
5
赞,膜拜一下
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S*e
6
A senior citizen was driving down the freeway when his wife called his cell
phone.
"Herman, I just heard on the news that there's a car going the wrong way on
Route 280. Please be careful!"
"It's not just one car," said Herman, "It's hundreds of them!"
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q*n
7
赞,膜拜二下
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w*g
8
Javascript彻底java化了。写个hello world先下载几百兆的包,一个解释型语言编译
跟c++那么慢。

:不兼容, 版本不相容,还有连带LOAD了各种不需要的库,造出系统愚蠢笨重,维护都
:很难,而且很不稳定, 稍微一个轮子出问题, 连带一堆。
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K*n
9
嗯,co-膜拜
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g*t
10
golang,rust make a lot of sense


: Javascript彻底java化了。写个hello world先下载几百兆的包,一个解释型语
言编译

: 跟c 那么慢。

: :不兼容, 版本不相容,还有连带LOAD了各种不需要的库,造出系统愚蠢笨重
,维护都

: :很难,而且很不稳定, 稍微一个轮子出问题, 连带一堆。



【在 w***g 的大作中提到】
: Javascript彻底java化了。写个hello world先下载几百兆的包,一个解释型语言编译
: 跟c++那么慢。
:
: :不兼容, 版本不相容,还有连带LOAD了各种不需要的库,造出系统愚蠢笨重,维护都
: :很难,而且很不稳定, 稍微一个轮子出问题, 连带一堆。

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s*y
11
很好看!

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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L*k
12
两个问题,一个是build system的问题,一个是open source的双刃剑问题。
比如maven的广泛应用maven在外理dependency上有非常大的弊端。这方面bazel要好的
多。
至少有些版本冲突是open source的双刃剑了,但真正出冲突的时候也不会太多,也就
那么几个库容易起冲突比如guava.
shade/fork/custom classloader花功夫总能解决。开源虽然免费但吃白吃也不总是那
么轻松。

:不兼容, 版本不相容,还有连带LOAD了各种不需要的库,造出系统愚蠢笨重,维护都
:很难,而且很不稳定, 稍微一个轮子出问题, 连带一堆。
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w*e
13
先顶后看~

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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v*a
14
有思想有深度有inspiration
期待下回

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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k*a
15
you're lucky and smart, so no doubt you can survive...
so sad i am neither...

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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f*s
16
别难过呀,其实对我来说,好多不高兴的事,时间长了可能就不记得了,所以可能没有
写出来 。要说幸运,我的幸运是有选择性记忆的天赋=)而聪明不聪明其实人和人区
别不大的,关键要看笨鸟怎么飞了,呵呵。
我是乐天派的人,不过有时候会用很多精力来担心未来和下一步(后果就是经常忘了手
头在做什么,或者之前不小心说了什么。。)我现在的mentor 说她开始十分的
impressed,后来觉得我有点 paranoid,不过,就像intel那人说的“Only the
Paranoid Survive” =)
所以想,其实好多时候,太多的事情是不可控的,但是也许survive 的根本是尽量的多
设想scenario,然后找出各种解决方案,怎么把看似不可控的各种可能性都变为可控,
这样无论哪种事情发生,都会有准备。
不过说是这么说啊,我很多时候也懒的想那么多,那种时候多半是乐观主义精神占上风
的时候,呵呵。

【在 k****a 的大作中提到】
: you're lucky and smart, so no doubt you can survive...
: so sad i am neither...

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w*e
17
看完再顶~一直想问楼主是如何申请到RA的,现在看来早晚要提到,就排队耐心等待了
呵呵

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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D*a
18
大赞!

【在 f******s 的大作中提到】
: 别难过呀,其实对我来说,好多不高兴的事,时间长了可能就不记得了,所以可能没有
: 写出来 。要说幸运,我的幸运是有选择性记忆的天赋=)而聪明不聪明其实人和人区
: 别不大的,关键要看笨鸟怎么飞了,呵呵。
: 我是乐天派的人,不过有时候会用很多精力来担心未来和下一步(后果就是经常忘了手
: 头在做什么,或者之前不小心说了什么。。)我现在的mentor 说她开始十分的
: impressed,后来觉得我有点 paranoid,不过,就像intel那人说的“Only the
: Paranoid Survive” =)
: 所以想,其实好多时候,太多的事情是不可控的,但是也许survive 的根本是尽量的多
: 设想scenario,然后找出各种解决方案,怎么把看似不可控的各种可能性都变为可控,
: 这样无论哪种事情发生,都会有准备。

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o*4
19
re
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b*n
20
那个欧洲的表达体系是不是在periplasm表达?

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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H*S
21
写得真好!
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t*n
22
猛人啊,佩服佩服!!!
反衬我这种衰人....

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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g*r
23
轻轻顶你一下。
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g*5
24
我决定找篇讲技术的,容易准备, 就这样碰巧搜到一篇刚发了一个月的paper,讲
一个改进的蛋白表达系统。我看的心潮澎湃,因为如果能成,这个系统也许会解决我的
蛋白的问题。
QIU LINK.
IS IT THIS ONE?
http://peds.oxfordjournals.org/content/16/12/1131.full
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f*s
25
好多同学都问,恩,是这篇 :
Baculovirus expression system for heterologous multiprotein complexes
http://www.nature.com/nbt/journal/v22/n12/full/nbt1036.html
他们成立的公司叫 redbiotec, 好像只做蛋白,不会给你载体。不过这个已经出现好
几年了,所以应该有其他公司会卖类似的系统的。

【在 g*********5 的大作中提到】
: 我决定找篇讲技术的,容易准备, 就这样碰巧搜到一篇刚发了一个月的paper,讲
: 一个改进的蛋白表达系统。我看的心潮澎湃,因为如果能成,这个系统也许会解决我的
: 蛋白的问题。
: QIU LINK.
: IS IT THIS ONE?
: http://peds.oxfordjournals.org/content/16/12/1131.full

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s*y
26
抽时间写下一部吧。我们在巴巴的等着呢:)

【在 f******s 的大作中提到】
: 我继续,包子啊,包子,谢谢~
: (4)
: -------------------
: 话说我的两个实验室合作的题目,第一件事其实就是提蛋白,要大量的蛋白(做过
: 稳态前动力学/用过quench flow的同学都知道呵),但是那个蛋白其实一直是老板的
: 一大头疼, 虽然我们当时号称是唯一一个能提取表达提取那个重组蛋白的实验室(多
: subunit,且不能用e coli表达,又不能加任何tag),其实整个过程很多时候靠运气,
: 投入大,产量很小,且不好重复,不好控制。不过说来,但凡是大重组蛋白都会有这个
: 问题,我后来跟老板说,您看就算是大药厂上市20几年的重组蛋白药,头疼的也还是这
: 些,您就那么几个人,已经很牛了。

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Z*B
27
不错
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S*n
28
我当时还找过这个redbiotec呢,不过是对他们的baculovirus感兴趣
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