Redian新闻
>
刚刚试做ChIP,请专家帮忙看看问题
avatar
b*a
2
两天扫了3次雪了,老腰吃不消了
avatar
o*w
3
4KB随机读/写性能 从G2的最高35K/8.6K IOPS 到最高50K/40K IOPS ,写的性能提高了
4/5倍 啊,怎么没人讨论这个啊?
avatar
l*u
4
500张纸CL上貌似不好出呀,要是PAD给咳嗽了就坑爹了。
avatar
n*2
5
1、如何判断DNA-Protein 被over cross linking 还是under cross linking?
2、在sonication的优化过程中,0次sonication的DNA 总是有smear。我用的是MCF7
cell line,第一步就用1% Formaldehyde固定,然后大体是harvest=>lysis=>sonicate
=>reverse=>proteanaseK=>DNA purification。DNA降解最可能会在哪一步呢?
3、如果用histone检验实验体系,如何选择DNA binding region?
谢了。
avatar
p*w
6
立马把信用卡balance付为0
然后停用,直到看到账单statement,然后也干净付清,这样基本上就没问题了
也许时间上可以卡一下,但我是最谨慎的办法,懒得细算,每一家情况不一样

【在 G*******n 的大作中提到】
: rt
: 谢谢

avatar
b*a
7
烦总,你们那边什么情况?
avatar
c*m
8
不要和G2比,这方面的改善intel哪里好意思提。一年前的Vertex 2 读写就是一直是
50K/45K IOPS.

【在 o******w 的大作中提到】
: 4KB随机读/写性能 从G2的最高35K/8.6K IOPS 到最高50K/40K IOPS ,写的性能提高了
: 4/5倍 啊,怎么没人讨论这个啊?

avatar
r*y
9
HP在下一盘很大的棋
avatar
k*n
10
1:1% formaldehyde crosslink 10-20min 应该都不会有太大问题。
2:理论上dna哪一步都不会降解。除非你有dnase的污染。
3:单纯的histone不是很好的检验体系,你可以用polii和h3k4me3或者h3ac的抗体做系
统的阳性对照。
avatar
G*n
11
前几天,我已经付完了balance,
但是,我今天又用了它,
我现在要怎么办?
需要继续付么?
会被收interst么?

【在 p*********w 的大作中提到】
: 立马把信用卡balance付为0
: 然后停用,直到看到账单statement,然后也干净付清,这样基本上就没问题了
: 也许时间上可以卡一下,但我是最谨慎的办法,懒得细算,每一家情况不一样

avatar
d*e
12
昨天下了,今天变成冰,正化呢

【在 b*a 的大作中提到】
: 烦总,你们那边什么情况?
avatar
A*s
13
买不起
等G2再降价!

【在 o******w 的大作中提到】
: 4KB随机读/写性能 从G2的最高35K/8.6K IOPS 到最高50K/40K IOPS ,写的性能提高了
: 4/5倍 啊,怎么没人讨论这个啊?

avatar
d*7
14
2 可不一定。如果不用qiagen kit回收dna,而用phenol回收的话,phenol的pH有时候
会变低,低
pH会讲解DNA

【在 k*****n 的大作中提到】
: 1:1% formaldehyde crosslink 10-20min 应该都不会有太大问题。
: 2:理论上dna哪一步都不会降解。除非你有dnase的污染。
: 3:单纯的histone不是很好的检验体系,你可以用polii和h3k4me3或者h3ac的抗体做系
: 统的阳性对照。

avatar
p*w
15
一般的规矩是你 late 了就没有 grace period,
老的要从头算,新的也要从用的那天算利息。
你可以赶紧继续付款,把 balance 搞成0,这样利息也就是1天2天而已。
(个别信用卡可能限制你一定时间内付款的次数等等约束)
一个原则:就是清干净一个月再开始玩。否则里面很多弯弯绕惹不起。

【在 G*******n 的大作中提到】
: 前几天,我已经付完了balance,
: 但是,我今天又用了它,
: 我现在要怎么办?
: 需要继续付么?
: 会被收interst么?

avatar
b*a
16
雪下墨迹了
本来明天要去一个地方,那地方学比我这大一倍,看来去不成了

【在 d********e 的大作中提到】
: 昨天下了,今天变成冰,正化呢
avatar
A*s
17
可是vertex2会fail
再各大网站上的review连四星都失守了,硬盘这东西谁敢随便来

【在 c*m 的大作中提到】
: 不要和G2比,这方面的改善intel哪里好意思提。一年前的Vertex 2 读写就是一直是
: 50K/45K IOPS.

avatar
d*7
18
1。做time-course,跑western blot,能在IP下看见蛋白的范围大概就行,然后做PCR
优化
2。不用纠结0次sonication,我从来不跑0 sonication的
3。看别人用啥region

sonicate

【在 n******2 的大作中提到】
: 1、如何判断DNA-Protein 被over cross linking 还是under cross linking?
: 2、在sonication的优化过程中,0次sonication的DNA 总是有smear。我用的是MCF7
: cell line,第一步就用1% Formaldehyde固定,然后大体是harvest=>lysis=>sonicate
: =>reverse=>proteanaseK=>DNA purification。DNA降解最可能会在哪一步呢?
: 3、如果用histone检验实验体系,如何选择DNA binding region?
: 谢了。

avatar
s*g
19
应该是立刻把你的欠款还掉 否则直接收利息 不再像之前的那样有一个月的免息期
花了就有利息
多查看账单 一旦有charge就赶紧还掉
等一个月,重新有了grace period 再说

【在 G*******n 的大作中提到】
: 前几天,我已经付完了balance,
: 但是,我今天又用了它,
: 我现在要怎么办?
: 需要继续付么?
: 会被收interst么?

avatar
d*e
20
当然不能去了,窝家里多舒服
球球会理解的

【在 b*a 的大作中提到】
: 雪下墨迹了
: 本来明天要去一个地方,那地方学比我这大一倍,看来去不成了

avatar
d*0
21
intel毕竟可靠些
avatar
n*2
22
1、我用的是pcr纯化试剂盒回收dna.
2、0 sonication 的smear有没有可能是RNA?各位在优化sonication的条件时用RNase处
理DNA吗?
3、sonication中,我采用最小功率(大功率极易产生bubble)并依次增加次数的方法
进行优化体系,但始终能在胶上看到有大片段DNA的存在。这是什么原因?sonicate次
数不够(目前已经提高到20多次,15s/pulse)? 还是over cross linking(10min)?
avatar
b*y
23
Overpay this card asap, then wait for the next statement to see if there
are any financial fees.
avatar
b*a
24
还好有飞哥
---球球

【在 d********e 的大作中提到】
: 当然不能去了,窝家里多舒服
: 球球会理解的

avatar
o*w
25
数据宝贵啊,目前安全性和速度做的比较平衡的也就intel好点。

【在 c*m 的大作中提到】
: 不要和G2比,这方面的改善intel哪里好意思提。一年前的Vertex 2 读写就是一直是
: 50K/45K IOPS.

avatar
z*a
26
one more ChIP person, I would avoid ChIP whenever I can.
my comments on your questions.
0 sonication 的smear是RNA, 用RNase处理DNA is necessary
over fixed or sonicator is broken
avatar
h*U
27
飞鸽冒雪驱车,真不容易

【在 b***a 的大作中提到】
: 还好有飞哥
: ---球球

avatar
a*o
28
1. Optimal crossing has a wide range, usually it does not matter, check
published paper for a reasonable time.
2. You need treat your sample with RNase before running on agarose gel,
otherwise most you see is RNA
3. Promoters are generally depleted of histone and coding regions have high
level of histone. It is not a good choice to use histone. You can detect
histone association even without crossing.

sonicate

【在 n******2 的大作中提到】
: 1、如何判断DNA-Protein 被over cross linking 还是under cross linking?
: 2、在sonication的优化过程中,0次sonication的DNA 总是有smear。我用的是MCF7
: cell line,第一步就用1% Formaldehyde固定,然后大体是harvest=>lysis=>sonicate
: =>reverse=>proteanaseK=>DNA purification。DNA降解最可能会在哪一步呢?
: 3、如果用histone检验实验体系,如何选择DNA binding region?
: 谢了。

avatar
b*a
29
昨晚没能回去
---飞哥

【在 h***U 的大作中提到】
: 飞鸽冒雪驱车,真不容易
avatar
k*n
30
你别告诉我你没reverse crosslink就直接跑dna胶了
avatar
h*U
31
看把你嫉妒的

【在 b***a 的大作中提到】
: 昨晚没能回去
: ---飞哥

avatar
b*a
32
开完光有什么感觉?

【在 h***U 的大作中提到】
: 看把你嫉妒的
avatar
h*U
33
问谁呢?

【在 b***a 的大作中提到】
: 开完光有什么感觉?
avatar
b*a
34
太好了,都忘记了

【在 h***U 的大作中提到】
: 问谁呢?
相关阅读
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章,不代表同意其说法或描述,仅为提供更多信息,也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责,与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿,如发现稿件侵权,或作者不愿在本网发表文章,请版权拥有者通知本网处理。