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怎样将 Go 的 基因 转换到 affymetrix ID
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怎样将 Go 的 基因 转换到 affymetrix ID# Biology - 生物学
x*u
1
RT?多谢。
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s*d
2
1、超级简单有效的锻炼——坐在椅子上锻炼腿部
大腿与地面平行。
将椅子调高,使大腿与地面平行,可以降低对肌肉、肌腱和骨骼的压力,预防肌肉
骨骼疾病;选择靠背椅,在腰部放一个卷起的毛巾或靠枕;手、手腕和前臂在一条直线
上,使小臂放在办公桌上时肘部成直角;头部和身体保持直线,稍微前倾;肘部应靠近
身体,弯曲90—120度为宜;双肩放松,上臂自然下垂;双脚平放在地板上;椅子最好
加个垫子。
2、超级有效的解乏方法——延展你的身体
双手背在后面,两手抓紧,头向后仰,同时双手努力向后,做出小飞燕的动作。这
个动作不但有健身的效果,还能运动你的双肩,解除困乏!
3、利用自己的自力来锻炼。
地球引力无处不在,可以用来健身。自身的重量带来的阻力,能随时随地进行肌肉
锻炼。比如,俯卧撑、门框当单杠做拉伸、工作间多走动等都是很好的锻炼方式。
4、促进脑部血液循环的几种非常简单的方法
头部和肩部运动,不仅有助于消除疲劳,促进头部血液循环,保持健美姿态,而且
还是防止颈椎病的有效手段。头侧屈、头俯仰、头绕环、肩耸动这样连续5次为一组,
一天最好每一个半小时一次。
这些都是相对静态的运动和健身,这样的方式简单、可操作性强。简简单单就能得
到更多的精力和更健康的身体,何乐而不为呢!
5。经常走动。
美国梅奥诊所研究发现,身体对同一坐姿的可承受时限为20分钟,之后就会产生不
适感。建议每隔15分钟,站立、拉伸或走动一下,至少30秒应改变一次坐姿。
6。减少重复动作。
重复动作必然导致疲劳和压力。电话等常用物件应保持在手臂范围内;可以左右手
换着使用电脑鼠标。
7。与电脑屏幕保持健康距离。
电脑屏幕应该位于正前方至少50厘米,屏幕高度应该略微低于双眼高度。屏幕不应
正对窗口,以免反光。
8。经常远眺和眨眼。
为了防止眼睛干涩和疲劳,眼睛焦距应经常变换,眺望远处或经常眨眼,都有助于
保持眼睛湿润。
9。保持键盘等办公用品清洁。
键盘和电话等办公设备容易滋生细菌。办公桌隐藏的细菌甚至比马桶坐垫还要多,
长时间坐在其附近,呼吸道就会受伤害。
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k*n
3
导师要看合作者的一批基因芯片数据,把和我们相关的通路做了go分析,然后想转换到
affymetrix ID看看芯片数据的情况。请教有没有什么方法可以批量把go 的基因转换到
affymetrix ID的?
谢谢
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r*h
4
啥是combo卡?反正我家小的是绿卡,我的不是,我走的是美国人的道,我还跟那个管
整理人群的人晃了一下我的和儿子的,他让我走美国的。
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m*T
5
去Affy的NetAffx查查看,它有batch查询的功能。将你需要的所有基因ID存到一个Text
文件中(follow它所需要的格式),然后用batch query的功能去试试。
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k*n
6
刚开始就 试过了,没有试出来怎样用,呵呵??
谢谢,再去看看

Text

【在 m***T 的大作中提到】
: 去Affy的NetAffx查查看,它有batch查询的功能。将你需要的所有基因ID存到一个Text
: 文件中(follow它所需要的格式),然后用batch query的功能去试试。

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k*n
9
太复杂了,有没有简单的啊?

【在 k****n 的大作中提到】
: thanks, will try it.
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c*s
10
不很清楚你说的“go的基因”指什么,如果指基因名称、并且你的芯片是比较常见的芯
片,ensembl的biomart应该可以转换。在www.ensembl.org点上面的BioMart,Database
选Ensembl Genes 63,然后选物种,然后(可选)建立filter,选你要输出的
Attributes就行了,microarray在External->Microarray里面,如果里面有你的
platform的话。
或者去affymetrix的网站下载你的platform的相关文件里面应该能找到对应关系。matlab里面
也有可以处理affymetrix data的包,也许比R的更容易使用一点,至少文档更清楚……

【在 k****n 的大作中提到】
: 导师要看合作者的一批基因芯片数据,把和我们相关的通路做了go分析,然后想转换到
: affymetrix ID看看芯片数据的情况。请教有没有什么方法可以批量把go 的基因转换到
: affymetrix ID的?
: 谢谢

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o*h
11
library(hgu95av2.db) or library(hgu133a.db), sth like that.
toTable(revmap(hgu95av2GO)[c("GO:0080146")]), ........

【在 g**********t 的大作中提到】
: bioconductor肯定可以做,不过我没怎么用过,你可以研究一下。
: http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ann

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