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有一些human cell的CTCF的chip-seq data,怎么找切入点
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有一些human cell的CTCF的chip-seq data,怎么找切入点# Biology - 生物学
e*t
1
未发表的。大约20个细胞系。。。
我是做bioinfo的,seq alignment以后,怎么找一些生物学意义?比如,寻找一些有趣
的motif(这个比较不靠谱,我承认,但也能发文章)。或者,特定motif和gene
expression的关系,这个很有意思,可惜没有gene expression的data。
还能干些啥?大家来讨论讨论。多谢。
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g*t
2
都是什么细胞系?病理的还是正常的?不同组织的?
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e*t
3
都是不同组织的正常细胞,比如纤维细胞,上皮细胞。
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s*x
4
没啥希望, encode的CTCF都做了十几个细胞系了,也没看出什么门道。
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