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急! 请教做protein crystallography的大牛,包子答谢!

急! 请教做protein crystallography的大牛,包子答谢!# Biology - 生物学

l*s2011-11-01 07:11

1 楼

如果自己不需要机票，是不是到二手版卖掉更划算呢，没有必要转成mileage。
当然也可以直接转成cash，只是觉得卖掉更值钱。
没有任何实战经验，只是潜水得来的东西，很有可能把chase 和其他的credit card混
淆了
请轻拍

t*62011-11-01 07:11

2 楼

杨幂诈捐事件全梳理，杨幂胜诉？中间人失职还是杨幂炒作？去年，杨幂深陷“诈
捐门”，引起了轩然大波。早在2016年，杨幂参加《我是证人》发布会，多次提及自己
在拍摄中体会到盲人的烦恼和痛苦，并向盲人学校捐赠100个盲杖，50台盲文打印机。
工作室也发消息称，大幂幂的捐赠将陆续送到盲人手中，用爱让世界不再黑暗。
从“诈捐”、“托捐”、到“起诉”，让吃瓜群众大感社会复杂，人心难测！杨幂
真你有没有做过欺诈性的捐赠？4月2日，突然有媒体爆料，称杨幂在拍摄《我是证人》
时，参加了盲人体验活动，在电影宣传期间中承诺向盲人捐赠打字机和盲棒。盲童们还
在电影宣传现场阅读感谢信。不过，直到影片宣传后活动爆发，盲人也没有收到捐款。
“诈捐”事件被媒体报道后曝光，杨幂工演播室对事件迅速作出回应，对未能落实捐款
向公众道歉，并立即购买捐款到位。
之后中国青年报更新动态发文表示，诈捐等慈善捐赠严重失信行为将不能参评中
华慈善奖。该条发文配图报纸中的标题是杨幂涉诈捐风波，引起了大家的争议。照
这样看，似乎坐实了杨幂诈捐行为，这锅背得似乎不冤。

X*u2011-11-01 07:11

3 楼

我跟男朋友交往快一年了。我们俩都为了这份感情付出很多。我们都是高中同学。后来
前后我们都出了国。很巧
合的我们都来到了同一个洲读本科。他没有好好学习导致他要读5年的本科。而我已经
硕士在读1年了。我们上的
是不同大学。那时候他还跟他前女友好着。我也一样跟我前男友好着。我们都在结束先
前的恋爱半年后联系开始
频乏。越聊越对彼此有好感。那时候我已经本科毕业了。之所以当初接受他因为他的真
诚。他明明知道我要去另
一个洲读书他还那么坚持。后来我们也曾经因为距离的缘故吵架过。可是每次吵架后来
的周末他都会开车来我的
洲找我。反正是吵架和好吵架和好。今天我回到我以前读本科的那所城市了。因为我亲
戚住这里所以每次回来就
像回家都会住家里。以前我回来他都会送我回家可是今天他的火车有一个小时的时间才
会开他都不愿意送我。他
说他累了明天还要上课。后来我给他打电话也是因为这件事情吵架。我问如果时间倒流
会不会送我。他说不会。
后来我就说那么我们下周再下周都别见面了。后来他说那他也没办法。请问爱情达人他
是不是变心了？他是不是
不够爱我？还是我要求太苛刻了？

n*n2011-11-01 07:11

4 楼

有两问题我不太理解.想请教.
做蛋白结晶解析时候为了解决phase problem, 大家常用MAD法, 蛋白里面incorporate
Se-Met来做.
请问是不是解这个蛋白结构时候只要结晶Se-Met的蛋白就可以了? 这个Se-Met蛋白可以
代表native protein的structure吗? 是否要同时也结晶native的蛋白然后确认?
如果native和Se-Met都要结晶的话,那么我们先是用MAD法得到了Se-Met蛋白的结构,然
后native的结构要怎么从diffraction data得到呢?用molecular replacement法? 还是
我想太多了?
qualify考试的东西,很急,希望有大牛能解答,包子答谢!

z*e2011-11-01 07:11

5 楼

是的.

X*u2011-11-01 07:11

6 楼

补充一下，最让我受不了的是他跟我做地铁的时候明知道他不打算送我走的话应该在他
下地铁的时候陪陪我说说话可是他一直拿我的iphone玩三国杀。他真的在乎我吗？我们
本来就聚少离多

J*n2011-11-01 07:11

7 楼

1.请问是不是解这个蛋白结构时候只要结晶Se-Met的蛋白就可以了? 这个Se-Met蛋白可以
代表native protein的structure吗? 是否要同时也结晶native的蛋白然后确认?
是的。可以代表。不是必须的，但是一般native的分辨率更好，所以很多人会同事发表
MAD和native的数据，但是最终用native数据refine。
2.如果native和Se-Met都要结晶的话,那么我们先是用MAD法得到了Se-Met蛋白的结构,然
后native的结构要怎么从diffraction data得到呢?用molecular replacement法? 还是
我想太多了?
Se-Met晶体-MAD计算得到低分辨率的结构，如果native data和MAD data isomorphous
(同一个space group，unit cell差不多)，直接refine。如果不同的space group。那
么molecular replacement再refine。

incorporate

【在 n****n 的大作中提到】

: 有两问题我不太理解.想请教.
: 做蛋白结晶解析时候为了解决phase problem, 大家常用MAD法, 蛋白里面incorporate
: Se-Met来做.
: 请问是不是解这个蛋白结构时候只要结晶Se-Met的蛋白就可以了? 这个Se-Met蛋白可以
: 代表native protein的structure吗? 是否要同时也结晶native的蛋白然后确认?
: 如果native和Se-Met都要结晶的话,那么我们先是用MAD法得到了Se-Met蛋白的结构,然
: 后native的结构要怎么从diffraction data得到呢?用molecular replacement法? 还是
: 我想太多了?
: qualify考试的东西,很急,希望有大牛能解答,包子答谢!

j*12011-11-01 07:11

8 楼

现在的行情卖掉划算，如果不自己换机票的话

L*t2011-11-01 07:11

9 楼

你喜欢他的程度多过他喜欢你，所以会有这种不被重视的感觉。

【在 X*****u 的大作中提到】

: 补充一下，最让我受不了的是他跟我做地铁的时候明知道他不打算送我走的话应该在他
: 下地铁的时候陪陪我说说话可是他一直拿我的iphone玩三国杀。他真的在乎我吗？我们
: 本来就聚少离多

n*n2011-11-01 07:11

10 楼

w*e2011-11-01 07:11

11 楼

说过的话要算数，不然就别说。
然后看他怎么办。

J*n2011-11-01 07:11

12 楼

X*u2011-11-01 07:11

13 楼

嗨，因为昨天我们打电话的时候闹地很不愉快。我现在是等他主动向我道歉和好还是我
向他和好？我打算一周不理他看他怎样。我这么做合适吗？

n*n2011-11-01 07:11

14 楼

多谢,还有一个问题,是不是Se-Met置换会导致蛋白溶解度降低? 另外是不是Se-Met容
易被氧化,需要用什么措施来保护?

可以
,然
isomorphous

【在 J********n 的大作中提到】

: 1.请问是不是解这个蛋白结构时候只要结晶Se-Met的蛋白就可以了? 这个Se-Met蛋白可以
: 代表native protein的structure吗? 是否要同时也结晶native的蛋白然后确认?
: 是的。可以代表。不是必须的，但是一般native的分辨率更好，所以很多人会同事发表
: MAD和native的数据，但是最终用native数据refine。
: 2.如果native和Se-Met都要结晶的话,那么我们先是用MAD法得到了Se-Met蛋白的结构,然
: 后native的结构要怎么从diffraction data得到呢?用molecular replacement法? 还是
: 我想太多了?
: Se-Met晶体-MAD计算得到低分辨率的结构，如果native data和MAD data isomorphous
: (同一个space group，unit cell差不多)，直接refine。如果不同的space group。那
: 么molecular replacement再refine。

w*e2011-11-01 07:11

15 楼

如果，平时是你关心他多一点，合理。

n*n2011-11-01 07:11

16 楼

另外,请问如果做molecular replacement, 蛋白之间的相似性需要达到多高.
假设我有一个蛋白,它其中的一个Cys可以存在两种形式,一个是自由态,另外一个是和另
一个位点的Cys形成disulfide bond. 这两种情况下的蛋白相似性足以使用molecular
replacement吗? 我知道这个蛋白在Cys自由的情况下是比较容易结晶的.

【在 n****n 的大作中提到】

: 多谢,还有一个问题,是不是Se-Met置换会导致蛋白溶解度降低? 另外是不是Se-Met容
: 易被氧化,需要用什么措施来保护?
:
: 可以
: ,然
: isomorphous

l*r2011-11-01 07:11

17 楼

Like attracts like, if you want him to care about you, send your care about
him first.
一周不理他? He may walk away.

【在 X*****u 的大作中提到】

: 嗨，因为昨天我们打电话的时候闹地很不愉快。我现在是等他主动向我道歉和好还是我
: 向他和好？我打算一周不理他看他怎样。我这么做合适吗？

J*n2011-11-01 07:11

18 楼

是不是Se-Met置换会导致蛋白溶解度降低?
不一定。not necessarily.
另外是不是Se-Met容易被氧化,需要用什么措施来保护?
我自己从来没有遇到过，不过看到有过这类的paper。如果是intracellular蛋白，没有
二硫键的，加点TCEP或者b-Me就好。

【在 n****n 的大作中提到】

: 多谢,还有一个问题,是不是Se-Met置换会导致蛋白溶解度降低? 另外是不是Se-Met容
: 易被氧化,需要用什么措施来保护?
:
: 可以
: ,然
: isomorphous

w*e2011-11-01 07:11

19 楼

如果总是吵，还不如分开的好。
总是吵和没什么可吵的，都是爱的终点的信号。

J*n2011-11-01 07:11

20 楼

另外,请问如果做molecular replacement, 蛋白之间的相似性需要达到多高.
一般sequence identity<30%就比较困难了。但是也要看最后结构的RMSD差多少。RMSD>
2A就基本不可能了。虽然去年david baker发了篇combining molecular replacement
with rosetta的paper。
Improved molecular replacement by density- and energy-guided protein
structure optimization
Nature 473, 540–543 (26 May 2011)
假设我有一个蛋白,它其中的一个Cys可以存在两种形式,一个是自由态,另外一个是和另
一个位点的Cys形成disulfide bond. 这两种情况下的蛋白相似性足以使用molecular
replacement吗? 我知道这个蛋白在Cys自由的情况下是比较容易结晶的.
应该足够了，即使有major conformational change，也可用利用一些fragment来做MR。
包子呢？

【在 n****n 的大作中提到】

: 另外,请问如果做molecular replacement, 蛋白之间的相似性需要达到多高.
: 假设我有一个蛋白,它其中的一个Cys可以存在两种形式,一个是自由态,另外一个是和另
: 一个位点的Cys形成disulfide bond. 这两种情况下的蛋白相似性足以使用molecular
: replacement吗? 我知道这个蛋白在Cys自由的情况下是比较容易结晶的.

s*72011-11-01 07:11

21 楼

男人，说的永远比做的多。慢慢看淡吧。

X*u2011-11-01 07:11

22 楼

我也这么觉得的

【在 w********e 的大作中提到】

: 如果，平时是你关心他多一点，合理。

X*u2011-11-01 07:11

23 楼

。。。。。。有那么严重啊。。。我也不想的。
哦对了。最新消息。今天我回宿舍了，因为今天又课。然后今天到现在收到bf 4 个断信
一个是问我回去了没有，看我没回话，他又打了句honey? 然后下午发了下 qinqin, 半
小时前发了
love u.
我到现在一直都没理过他。我可以考虑3天后再理他。这样合适不？

【在 l********r 的大作中提到】

: Like attracts like, if you want him to care about you, send your care about
: him first.
: 一周不理他? He may walk away.

y*u2011-11-01 07:11

24 楼

不合適，別玩這些，既然人家先破冰了，你就不要再裝下去了，兩個人還是盡量少吵架
微妙。盡快結束LD，不然他會越來越冷淡的。。。

l*a2011-11-01 07:11

25 楼

男人都这个德性
追得时候用心
追到了，就放在一边，倒不是他不爱你。
等他意识到了问题不就联系你了
喜欢他就表拿架子

d*y2011-11-01 07:11

26 楼

如果他一直没联系，说明他不在乎，那你就算了，现在他既然主动找你几次了，你该回
电不要再僵着了。

x*n2011-11-01 07:11

27 楼

我觉得啊，你当初选择什么样的人，他就会是什么样的人。
如果他本来是很善良的人，忽然不送你不安慰你了，那不是他变了，是不爱你。
如果他是冷漠的人，那你就应该试着接受他。不然分手。

【在 X*****u 的大作中提到】

: 我跟男朋友交往快一年了。我们俩都为了这份感情付出很多。我们都是高中同学。后来
: 前后我们都出了国。很巧
: 合的我们都来到了同一个洲读本科。他没有好好学习导致他要读5年的本科。而我已经
: 硕士在读1年了。我们上的
: 是不同大学。那时候他还跟他前女友好着。我也一样跟我前男友好着。我们都在结束先
: 前的恋爱半年后联系开始
: 频乏。越聊越对彼此有好感。那时候我已经本科毕业了。之所以当初接受他因为他的真
: 诚。他明明知道我要去另
: 一个洲读书他还那么坚持。后来我们也曾经因为距离的缘故吵架过。可是每次吵架后来
: 的周末他都会开车来我的

r*42011-11-01 07:11

28 楼

为什么总是他送你迁就你，偶尔不送你就闹？男人就不能觉得累吗？

【在 X*****u 的大作中提到】

p*y2011-11-01 07:11

29 楼

不合适，他都主动跟你和好了，你再闹只会闹的他真的不理你了

断信

【在 X*****u 的大作中提到】

: 。。。。。。有那么严重啊。。。我也不想的。
: 哦对了。最新消息。今天我回宿舍了，因为今天又课。然后今天到现在收到bf 4 个断信
: 一个是问我回去了没有，看我没回话，他又打了句honey? 然后下午发了下 qinqin, 半
: 小时前发了
: love u.
: 我到现在一直都没理过他。我可以考虑3天后再理他。这样合适不？