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评价评价这两个lab

评价评价这两个lab# Biology - 生物学

y*o2012-02-18 08:02

1 楼

No1.死魂盒 (2012年)
导演: 奥勒·博内代尔
主演: 杰弗里·迪恩·摩根、凯拉·塞吉维克
影片讲述在一个平凡日子里，一名中年男子克莱德从前妻那里接回两个女儿，而当他们
驱车行驶到周边社区游玩时，女儿艾米莉看中一个陈旧但设计别致的木匣子，而此时的
她不知道，这里面隐藏了一个恐怖秘密，一旦盒子被打开后，厄运就会如影随形，因为
艾米莉打开了木匣子，她和她家人的噩梦也开始了......该片是根据真实事件创作的《
盒子里的恶灵》而改编。
NO2.太平间闹鬼事件(2009年)
导演: Peter Cornwell
主演: 维吉妮娅·马德森、凯尔·加尔纳、伊莱亚斯·科泰斯
影片讲述女主角莎拉有着一个幸福的家庭，丈夫皮特努力工作，三个孩子又聪明可爱，
一切都看起来很美好，但不料一场灾难突然降临到他们身上，儿子迈特患有癌症，夫妻
两人想尽一切办法只求爱子能逃离死神魔掌，却反而厄运不断。自从一家人搬进这所房
子后，儿子迈特和两个弟妹都经常看到恐怖幻想，随着灵异事件不断发生，女主角莎拉
试图去了解真相，却发现原来他们的房子曾经是一个停尸房......这部影片是根据真实
事件改编，影片里的画面、音效和构思都很不错，让你看后吓出一身冷汗。
NO3.安魂曲 (2006年)
导演: 汉斯-克里斯坦·施密特
主演: 桑德拉·惠勒、伯格哈特·克莱斯纳、伊摩根·蔻格
影片讲述女主角蜜雪拉自幼体弱多病，不过通过自身努力，还是进入到大学学习深造，
甚至在大学里遇见了一个叫史蒂夫的男子，让蜜雪拉体会到爱情的甜蜜。一段平静有序
的日子过去后，她的旧疾复发，奇怪的声音和神秘的身影频繁出现在她周围，神父兰道
尔怀疑是她被恶魔附身，而当一名叫波切特的神父决心为她举行一场驱魔仪式之时，事
态步入无法掌控的局面。电影是史上唯一一部经教廷承认的恐怖事件改编而成，一个几
乎被妖魔化的恐怖故事，直面心中的恐惧。
NO4.仪式 (2011年)
导演: 米凯尔·哈弗斯特罗姆
主演: 安东尼·霍普金斯、科林·奥多霍诺、艾莉丝·布拉加
影片讲述主人翁迈克是一个出身于葬仪家庭的神学院学生，可他心中一直找不到任何信
义依附，后来机缘巧合下，被派往梵蒂冈参加一个驱魔师的培训课程。由于他对上帝心
存怀疑，迈克和授课老师展开激烈辩论，后在老师推荐下前往拜访了因驱魔而声名显赫
的卢卡斯神父。尽管拜访了卢卡斯神父，迈克依然觉得魔鬼不存在，直至一系列古怪事
件发生在自己身上，迈克的灵魂深处受到动摇......这部电影风格很独树一帜，尤其坟
场挖人那一段最让人毛骨悚然。
NO5.康斯坦丁(2005年)
导演: 弗朗西斯·劳伦斯
主演: 基努·里维斯、蕾切尔·薇兹、希亚·拉博夫
影片讲述男主角康斯坦丁生来就能看出人间的恶魔和天使，这让年幼的他感到很痛苦，
曾想过用自杀方式结束自己痛苦，后来获悉上帝与撒旦之间有过协议，谁也不准插足人
间事，一次他在帮助一名女警调查她妹妹离奇死亡事情时，康斯坦丁获悉天使长加百利
意图和撒旦的儿子联合起来统治人间的阴谋。康斯坦丁自然竭尽全力去阻止这一股黑暗
势力降临人间.....电影的观看性很强，被认为是综合类驱魔影片，能看到剧情的完美
呈现。

w*x2012-02-18 08:02

2 楼

两个年轻PI
(1)
http://www.fraserlab.org/
刚看到他们的新文
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867412000
(2)
http://www.crg.es/ben_lehner
(1)的薄厚，很年轻的样子，文章看着也很不错
大家觉得他们的研究有前景否？还是炒作成分居大？

c*e2012-02-18 08:02

3 楼

西班牙的这个CRG地理位置真的是太好了，有通道直接到海边，他们去其他地方做报告
，都有一个slide专门炫耀一下，大家还知道其他环境优美的研究所吗？

c*72012-02-18 08:02

4 楼

坊间传言，Scripps的环境也很优美？

D*a2012-02-18 08:02

5 楼

看了看那篇cell。。。
这个，他们说，“Fitness” in this context is similar to that measured in
yeast in either liquid growth or colony growth assays and is an aggregate
property of the population; a defect in fitness could result from many
different causes from changes in brood size, viability, or growth rate, or
other more subtle defects in organism function. (result 第一段末尾)
下面更简化成了fitness = number of animals /remaining food (bacteria)
这个首先存疑。本来在实验室里养了千秋万代的虫子，当然是适应了实验室环境，然后
敲掉一些genes，发现在实验室环境中敲掉的那些基因的虫子比原来的长的慢。。。而
且长得慢不慢第一代还看不出来，得多传几代。。。额，谁来给我解释下这个实验的意
义？。。。
另外，结合aging people的研究，很多长寿的KO都影响生殖和代谢（进食多少），那么
这些KO是不适应环境的？当然从一个角度说他们虫少力量小，但是顾此失彼阿。关键是
我们人类现在没事生孩子玩的成了个例了。

【在 w***x 的大作中提到】

: 两个年轻PI
: (1)
: http://www.fraserlab.org/
: 刚看到他们的新文
: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867412000
: (2)
: http://www.crg.es/ben_lehner
: (1)的薄厚，很年轻的样子，文章看着也很不错
: 大家觉得他们的研究有前景否？还是炒作成分居大？

b*42012-02-18 08:02

6 楼

true, and Salk is better

【在 c*********7 的大作中提到】

: 坊间传言，Scripps的环境也很优美？

w*x2012-02-18 08:02

7 楼

我觉得这个文章的卖点是
“虫子里做过很多遍genome wide RNAi，每次都发现只有15-20%基因KO是有表型的，
其他貌似是wild type，所以人们以为很多基因是冗余的，或者genetic network具有
robustness，使得表型被掩盖了。总之有不少理论都试图解释为什么那么多KO都是wild type。
现在呢，发现，原先认为KO是wild type表型的那些基因
实际上是会影响phenotype的，只是因为以前screen只看单代，使得KO表型弱的基因的
效应没有充分显现。所以，那些貌似不影响表型的基因很多实际上是有表型的，看上去
dispensable的基因还是很重要的。”
至于用种群数量来衡量，我觉得是从做酵母的人那里继承来的吧。
做酵母的人也是用growth rate来看KO表型的，举个例子：
http://www.sciencemag.org/content/327/5964/425.full
对于fitness，用多代繁衍的数目来衡量还是有一些意义的。长寿的KO我觉得在大多数
生物生存的环境里都是不适应环境的，否则那些生物早都长寿了吧。。。活得长不是终
极标准，后代多才是。。。
有意思的是酵母的genome wide KO在同一实验条件下一般也只有20%有growth表型。所以本文作
者想了个理由来解释为什么虫子里有表型的比例那么高。他们认为酵母的KO在不同条件（比如温度啦
营养供应啦）下，有表型的基因set是不同的。在同一条件下表现出表型的基因数量有限。相比起
来，尽管虫子也是生长在单一环境中的，但是虫子是多细胞生物，每个细胞的微环境不同，所以总会
有一些细胞一些器官组织受到KO的影响，最终体现为繁衍能力的差别。。。

aggregate
rate, or

【在 D*a 的大作中提到】

: 看了看那篇cell。。。
: 这个，他们说，“Fitness” in this context is similar to that measured in
: yeast in either liquid growth or colony growth assays and is an aggregate
: property of the population; a defect in fitness could result from many
: different causes from changes in brood size, viability, or growth rate, or
: other more subtle defects in organism function. (result 第一段末尾)
: 下面更简化成了fitness = number of animals /remaining food (bacteria)
: 这个首先存疑。本来在实验室里养了千秋万代的虫子，当然是适应了实验室环境，然后
: 敲掉一些genes，发现在实验室环境中敲掉的那些基因的虫子比原来的长的慢。。。而
: 且长得慢不慢第一代还看不出来，得多传几代。。。额，谁来给我解释下这个实验的意

s*s2012-02-18 08:02

8 楼

没看过paper，不过就你说的第一点来谈，主要原因是，包括现在所有
的模式生物，都长在完美的恒温，良好湿度，没有天敌，没有传染病寄
生虫，大量food的条件中，其实很可能大量所谓KO没有表型的基因只是
野外生存才有用的

【在 w***x 的大作中提到】

: 我觉得这个文章的卖点是
: “虫子里做过很多遍genome wide RNAi，每次都发现只有15-20%基因KO是有表型的，
: 其他貌似是wild type，所以人们以为很多基因是冗余的，或者genetic network具有
: robustness，使得表型被掩盖了。总之有不少理论都试图解释为什么那么多KO都是wild type。
: 现在呢，发现，原先认为KO是wild type表型的那些基因
: 实际上是会影响phenotype的，只是因为以前screen只看单代，使得KO表型弱的基因的
: 效应没有充分显现。所以，那些貌似不影响表型的基因很多实际上是有表型的，看上去
: dispensable的基因还是很重要的。”
: 至于用种群数量来衡量，我觉得是从做酵母的人那里继承来的吧。
: 做酵母的人也是用growth rate来看KO表型的，举个例子：

y*82012-02-18 08:02

9 楼

想起一个做果蝇的朋友的故事。
由于种种原因，朋友养的果蝇很久没有换瓶子了。然后发现只有两个株系还有幸存者。
偏生这两个株系都有同一个基因突变。后来就发现这个基因负调控的另一个基因能促进
果蝇活得很长。

w*x2012-02-18 08:02

10 楼

是这样的，不过这paper认为此类基因（cryptic variation？）对于lab condition下
的动物仍然是有微妙影响的，通过放大表型依然能察觉。

【在 s******s 的大作中提到】

: 没看过paper，不过就你说的第一点来谈，主要原因是，包括现在所有
: 的模式生物，都长在完美的恒温，良好湿度，没有天敌，没有传染病寄
: 生虫，大量food的条件中，其实很可能大量所谓KO没有表型的基因只是
: 野外生存才有用的

y*82012-02-18 08:02

11 楼

文章的卖点是有。但是RNAi的off target效应让大多数实验只screen比较直接的表型。
做到个别基因，都必须有多重的正负Controls.
虽然我认同作者的观点，不过具体的实验数据可能没有太大的意义。

wild type。

【在 w***x 的大作中提到】

D*a2012-02-18 08:02

12 楼

培养条件这个问题，我倒是觉得，动物的培养恰恰跟人现在处的环境是一样的。
大家也都知道长寿的活不过野外环境，但是我们人现在本身就不是放养的，谁没事生一
个足球队啊。

【在 s******s 的大作中提到】

l*12012-02-18 08:02

13 楼

Human colony only middle east some colony likes Qatar and UAE are
not same as US and France and other OECD countries/area colony
there 10％ family 没事生一个足球队。
//news.sohu.com/20060411/n242746810.shtml
//sports.sohu.com/20111208/n328262203_1.shtml

【在 D*a 的大作中提到】

: 培养条件这个问题，我倒是觉得，动物的培养恰恰跟人现在处的环境是一样的。
: 大家也都知道长寿的活不过野外环境，但是我们人现在本身就不是放养的，谁没事生一
: 个足球队啊。