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想了解一下实际工作中需要解决的 NP-complete 问题?
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想了解一下实际工作中需要解决的 NP-complete 问题?# Biology - 生物学
b*y
1
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: buddyboy (hello), 信区: Military
标 题: 笑死!一群老美看《人民的名义》后,畅谈观后感
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 2 00:45:14 2017, 美东)
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k*a
2
Rt
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h*x
3
麻烦想了解一下诸位在实际工作(比如,金融,生物,工程计算,等领域)中有需要解
决某 NP-complete 问题的吗?
如果有,能否说明一下具体是哪个 NPC problem,以及 problem size 有多大。
谢谢!
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w*t
4
李旦还可以
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l*s
5
What is NP complete?
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c*n
6
钱不够啊,反正打酱油的

【在 k******a 的大作中提到】
: Rt
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s*s
7
你计算机版可以这么问,生物版就算做bioinformatics都不一定知道你说啥

【在 h**x 的大作中提到】
: 麻烦想了解一下诸位在实际工作(比如,金融,生物,工程计算,等领域)中有需要解
: 决某 NP-complete 问题的吗?
: 如果有,能否说明一下具体是哪个 NPC problem,以及 problem size 有多大。
: 谢谢!

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h*p
8
图个喜性呗。
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h*x
9

http://en.wikipedia.org/wiki/NP-complete
非常粗略的说,就是算法上只能做到指数级运算时间,而不是多项式运算时间
Boolean satisfiability problem (Sat.)
N-puzzle
Knapsack problem
Hamiltonian path problem
Travelling salesman problem
Subgraph isomorphism problem
Subset sum problem
Clique problem
Vertex cover problem
Independent set problem
Dominating set problem
Graph coloring problem

【在 l*********s 的大作中提到】
: What is NP complete?
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w*r
10
optimal multiple sequence alignment

【在 h**x 的大作中提到】
: 麻烦想了解一下诸位在实际工作(比如,金融,生物,工程计算,等领域)中有需要解
: 决某 NP-complete 问题的吗?
: 如果有,能否说明一下具体是哪个 NPC problem,以及 problem size 有多大。
: 谢谢!

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h*x
11

problem size 有多大?
那你们现在是怎么算的?我主要想了解 hardware 用多大的 cluster (多少个CPU), 一
般一个问题算多少天,或多少小时?

【在 w********r 的大作中提到】
: optimal multiple sequence alignment
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y*n
12
protein folding/misfolding
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y*n
13
现在是用笨办法,两个两个去比再连起来。普通pc就能搞定还很快,效果还可以

【在 h**x 的大作中提到】
:
: problem size 有多大?
: 那你们现在是怎么算的?我主要想了解 hardware 用多大的 cluster (多少个CPU), 一
: 般一个问题算多少天,或多少小时?

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j*x
14
做bioinfor的不知道什么是NP-complete还敢称自己是做bioinfor吗,呵呵
bioinfor最初始的基本问题(例如alignment)以及至今的未解难题(例如structure
prediction)乃至当今的热点(例如network),都是NP问题的典型

【在 s******s 的大作中提到】
: 你计算机版可以这么问,生物版就算做bioinformatics都不一定知道你说啥
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l*1
15
PRH to target DNA
protein oligomeric assembly
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675722

【在 h**x 的大作中提到】
:
: problem size 有多大?
: 那你们现在是怎么算的?我主要想了解 hardware 用多大的 cluster (多少个CPU), 一
: 般一个问题算多少天,或多少小时?

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