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?怎样Blast较大的序列?
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?怎样Blast较大的序列?# Biology - 生物学
m*e
1
http://dx.doi.org/10.1016/0016-2361(91)90067-K
Effect of water vapour on the pyrolysis of solid fuelsstar, open: 1. Effect
of water vapour during the pyrolysis of solid fuels on the yield and
composition of the liquid products
http://dx.doi.org/10.1016/0016-2361(92)90071-U
Effect of water vapour on the pyrolysis of solid fuels: 2. Effect of water
vapour during the pyrolysis of solid fuels on the formation of the porous
structure of semicoke
my email address is s*********[email protected]
多谢了。
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h*1
2
被淘汰的参加复活赛逆袭?
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k*g
3
☆─────────────────────────────────────☆
aaaty (阿提) 于 (Sat Dec 8 02:02:01 2012, 美东) 提到:
有些功能,比如同步书签,联系人之类的,从.Mac或者更早就开始做了,所以还勉强可
以用。
但是一旦到了Documents in the cloud和iWork的integration,苹果做的就非常非常烂。
不给云里的传统文件系统。好吧,你至少真的给个更好的解决方案吧?但是没有!而且
不单iOS上的iWork和Mac上的不完全兼容,而且经常打开一个文件会说在别的设备上修
改过,请问保留哪个? 其实给的信息也很少不知道自己选对没有。最可怕的是经
常iOS上修改过的文档看起来自动不会上传上去。说实话去年这个功能出来的时候我用
过,还是在手机上,其实运行的还可以,修改过的spreadsheet基本上马上就通过3G上
传了。现在是越来越烂,经常很多文件卡死一直显示一个空空的进度条,或者右上角一
个上传标志,但是永不消失。
我想也许是需要重设一下吧。在Numbers和Pages里面关闭iCloud功能,提示是否要删除
这些文档或者还是保留?我当然只敢保留,因为明显上传有问题啊。但是重开iCloud之
后就给我制造武术duplicated的文件,在文件名后加个2,有些文件后面甚至是3,5,
都不知道什么时候搞出来的。
此时此刻,有个今天创建的numbers文档,在经历了以上所有之后,还是不能上传。在
Mac上还是看不到。
所以,iCloud是谁做的,谁就应该被fire掉!
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unclegua (纯洁的刮叔) 于 (Sat Dec 8 03:42:36 2012, 美东) 提到:
不说别的, 我机器上的itunes match经常不能用...我承认自己不把音乐放本地有点二,
但也不至于经常不能用吧.

烂。
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Neoly1983 (Neo_ly1983) 于 (Sat Dec 8 07:49:47 2012, 美东) 提到:
icloud自动同步联系人,待办事项,iphone照片,等等,还是挺好用的。
一定想共享文件的话,还是用dropbox之类的吧,不要太纠结了~~~
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kingting (Kingting) 于 (Sat Dec 8 15:00:08 2012, 美东) 提到:
说起来还真是的。 因为习惯了google,icloud 出了麻烦,什么方便都没有。
icloud backup 竟然用了我的DATA,害得好几个月都超过流量。
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thymeee (节俭灌水种地养娃) 于 (Sat Dec 8 18:56:17 2012, 美东) 提到:
叹一下,
因开始没设ID,
现在不知该怎么icloud。
借问,
如果两个苹果终端,
一个中国,一个美国,
也能icloud共享吗?
谢谢。
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kingting (Kingting) 于 (Sat Dec 8 19:16:10 2012, 美东) 提到:
photostream 可以呀。
1. 通用一个ID, 你拍他看。 不要乱拍哦。
2. 两个ID, photostream share,share 什么看什么。
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thymeee (节俭灌水种地养娃) 于 (Sat Dec 8 19:27:04 2012, 美东) 提到:
谢版主。
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lordofwar (warlord) 于 (Sat Dec 8 19:32:02 2012, 美东) 提到:
扯吧,iCloud backup压根就不能用cellular
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kingting (Kingting) 于 (Sat Dec 8 20:25:24 2012, 美东) 提到:
我也是这么以为的。后来发现每天12:30 am 左右上传 几兆到几十兆,删除所有软件
,reset,restore iphone 都试过,最后把icloud backup 关闭就好了。
我不是个例,网上抱怨的很多。
可能是个bug
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bleakhand (bleakhand) 于 (Sat Dec 8 20:25:40 2012, 美东) 提到:
名媛被盗号了。
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aaaty (阿提) 于 (Sat Dec 8 22:13:56 2012, 美东) 提到:
PA
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
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vinco (vinco) 于 (Sat Dec 8 23:56:12 2012, 美东) 提到:
还是老老实实用dropbox吧,稳定至上
烂。
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aaaty (阿提) 于 (Sun Dec 9 00:02:47 2012, 美东) 提到:
iWork和Dropbox没有integration啊。
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bensongshu (笨松鼠) 于 (Sun Dec 9 06:13:18 2012, 美东) 提到:
表示一直没怎么搞懂过。。。
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wavelets02 (稻草人) 于 (Sun Dec 9 06:16:46 2012, 美东) 提到:
icloud 是itune 和me的延伸,
这两个都是苹果最糟痛骂和失败的产品。
不过概念还是好的,只是细节上的问题。
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aaaty (阿提) 于 (Sun Dec 9 12:06:57 2012, 美东) 提到:
iTunes is not a failure at all. You are misguided.
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
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wavelets02 (稻草人) 于 (Sun Dec 9 12:14:16 2012, 美东) 提到:
itune 不算失败,是被痛骂的。
me.com 是失败后重搞的。
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aaaty (阿提) 于 (Sun Dec 9 12:17:24 2012, 美东) 提到:
被某些不怎么用不会用的骂啊
这群人换了os x也一样会骂,而且可能会骂大部分苹果软件。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
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kawaii805214 (kawaii小猫妖) 于 (Sun Dec 9 14:43:52 2012, 美东) 提到:
完全同意!因为在没有网络的教室上课,icloud弄丢了我一节课的笔记!以后不敢因为
同步容易,把笔记只保存在icloud里边了。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.7
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aaaty (阿提) 于 (Sun Dec 9 14:59:37 2012, 美东) 提到:
会丢么?难道不是在有网络的地方的时候再上传?
我也在没有网络的地方用过,没丢过
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meiatmei (Ahhh, potential customer~) 于 (Sun Dec 9 18:03:21 2012, 美东) 提到:
是挺烂的。
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l*1
4
国内的,家用的!
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t*z
5
我有个6.6kb的DNA序列,是某个细菌基因组中的一段。我想知道还有哪些别的细菌含有
这个片段,就做megablast,但是找到的除了自身,就再也没有有意义的hit了。但是我
知道别的基因组里确实有整段的同源序列的。想来6.6kb也不是很大,那该怎么做好呢
?多谢!
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m*e
6
anyone help? Pls.
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s*c
7
我觉得胡彦斌肯定能回来,我怎么感觉韩红好像知道啥似的,上一场她开玩笑说下一场
把胡彦斌投走,结果他真走了,然后又对胡彦斌说突围赛见,说不定胡彦斌就真突围了
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y*n
8
tenda。因为据说可以算出mac,一家使用,造福大众。
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y*n
9
这段区域有Recombination hotspot 没,有的话估计在别的物种中已被打乱了
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h*1
10
胡彦斌上我歌有点吃亏,创作型歌手不让唱自己的歌。

【在 s********c 的大作中提到】
: 我觉得胡彦斌肯定能回来,我怎么感觉韩红好像知道啥似的,上一场她开玩笑说下一场
: 把胡彦斌投走,结果他真走了,然后又对胡彦斌说突围赛见,说不定胡彦斌就真突围了

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P*a
11
不开WPS你也用不了

【在 y*****n 的大作中提到】
: tenda。因为据说可以算出mac,一家使用,造福大众。
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t*z
12

不清楚啊。怎么预测recombination hotspot呢?

【在 y**********n 的大作中提到】
: 这段区域有Recombination hotspot 没,有的话估计在别的物种中已被打乱了
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s*c
13
没有唱功的创作型歌手不占便宜是真的,第一季羽泉夺冠有诸多因素,比如主持人光环
,甄嬛她老公光环,羽凡的高音再加上海泉的改编,同一季的尚雯婕就明显吃亏。第二
季曹格算是个创作型歌手,也是半路淘汰,邓紫棋是创作型,但是更多依靠的是自己的
舞台魅力和唱功,其他人都不是严格意义上的创作型歌手。第三季就一个胡彦斌吧。

【在 h******1 的大作中提到】
: 胡彦斌上我歌有点吃亏,创作型歌手不让唱自己的歌。
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l*1
14
just try
GO Term Analysis
//www.geneontology.org
i.e.
//www.jcvi.org/cgi-bin/manatee-euk/shared/go_cgi/show_go_tree.cgi?
db=rca1&GO_TERM=GO:0010844&expand=1&view_mode=Regular&refresh_mode=Fast
or
//www.ebi.ac.uk/QuickGO/GTerm?id=GO:0010844
Two recent papers:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20140238
//www.ntu.edu.sg/home/zhengjie/publications/BIBM%202011.pdf

【在 t*****z 的大作中提到】
:
: 不清楚啊。怎么预测recombination hotspot呢?

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b*m
15
羽泉是非常适合我歌的,能唱而且编曲花招百出。邓紫其是另一种花招,一会儿钢琴了
,一会儿热舞了的,她该再来一段架子鼓,不过都是花拳绣腿。

【在 s********c 的大作中提到】
: 没有唱功的创作型歌手不占便宜是真的,第一季羽泉夺冠有诸多因素,比如主持人光环
: ,甄嬛她老公光环,羽凡的高音再加上海泉的改编,同一季的尚雯婕就明显吃亏。第二
: 季曹格算是个创作型歌手,也是半路淘汰,邓紫棋是创作型,但是更多依靠的是自己的
: 舞台魅力和唱功,其他人都不是严格意义上的创作型歌手。第三季就一个胡彦斌吧。

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K*4
16
单单用blastp就可以了吧
不要用mega

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我有个6.6kb的DNA序列,是某个细菌基因组中的一段。我想知道还有哪些别的细菌含有
: 这个片段,就做megablast,但是找到的除了自身,就再也没有有意义的hit了。但是我
: 知道别的基因组里确实有整段的同源序列的。想来6.6kb也不是很大,那该怎么做好呢
: ?多谢!

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s*c
17
对艺术品位在一个固定层次上的五百评审,花拳绣腿就够了,不过我就为邓紫棋鸣不平
,她唱那个lady marmalade应该是一个人干了四五个人的活吧,为什么“干了三个人的
活”的某人就得第一,她唱得更好却没得第一

【在 b*********m 的大作中提到】
: 羽泉是非常适合我歌的,能唱而且编曲花招百出。邓紫其是另一种花招,一会儿钢琴了
: ,一会儿热舞了的,她该再来一段架子鼓,不过都是花拳绣腿。

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n*7
18
用blastp 处理DNA?

【在 K**4 的大作中提到】
: 单单用blastp就可以了吧
: 不要用mega

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s*e
19
很简单,她俩不是在一场比赛里比啊。呵呵。

【在 s********c 的大作中提到】
: 对艺术品位在一个固定层次上的五百评审,花拳绣腿就够了,不过我就为邓紫棋鸣不平
: ,她唱那个lady marmalade应该是一个人干了四五个人的活吧,为什么“干了三个人的
: 活”的某人就得第一,她唱得更好却没得第一

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n*7
20
GO annotation跟这个预测本身不沾边吧?
扫了一眼你贴的文章,似乎就是检查一下结合到predicted sites 的gene 有些富集的
GO terms罢了

【在 l**********1 的大作中提到】
: just try
: GO Term Analysis
: //www.geneontology.org
: i.e.
: //www.jcvi.org/cgi-bin/manatee-euk/shared/go_cgi/show_go_tree.cgi?
: db=rca1&GO_TERM=GO:0010844&expand=1&view_mode=Regular&refresh_mode=Fast
: or
: //www.ebi.ac.uk/QuickGO/GTerm?id=GO:0010844
: Two recent papers:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20140238

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h*1
21
是张靓颖的可能性也不是没有,马上春晚就到了。
既然是拿张靓颖当枪使,那就用到极致。
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K*4
22
哦,没有看仔细,
那么6kb的dna序列,只有2k的蛋白质阿
很小的
你用blastx 就可以了

【在 n******7 的大作中提到】
: 用blastp 处理DNA?
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s*c
23
张靓颖又要上春晚?上次已经唱走调了,就别再丢人了吧

【在 h******1 的大作中提到】
: 是张靓颖的可能性也不是没有,马上春晚就到了。
: 既然是拿张靓颖当枪使,那就用到极致。

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b*n
24
用blastx
不要用blastn,这个在以genome为subject进行blast的时候很坑爹
原因不知

【在 t*****z 的大作中提到】
: 我有个6.6kb的DNA序列,是某个细菌基因组中的一段。我想知道还有哪些别的细菌含有
: 这个片段,就做megablast,但是找到的除了自身,就再也没有有意义的hit了。但是我
: 知道别的基因组里确实有整段的同源序列的。想来6.6kb也不是很大,那该怎么做好呢
: ?多谢!

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p*r
25
胡彦斌全能星战就是复活夺冠的
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l*1
26
>回复]
[ 1 ]
发信人: thomasz (thomasz), 信区: Biology
标 题: ?怎样Blast较大的序列?
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Feb 25 14:36:17 2012, 美东)
我有个6.6kb的DNA序列,是某个细菌基因组中的一段
。但是我
知道别的基因组里确实有整段的同源序列的。想来6.6kb也不是很大,那该怎么做好呢
?多谢!
----
and
cited:

------------
出一大堆 somewhat similar to Optimize for Somewhat similar sequences by (blastn)
then what is the next step?
Fishing most important hits?
//www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi?
CMD=Web&LAYOUT=TwoWindows&AUTO_FORMAT=Semiauto&ALIGNMENTS=50&ALIGNMENT_VIEW=Pairwi
se&
CLIENT=web&DATABASE=nr&DESCRIPTIONS=100&ENTREZ_QUERY=%28none%29&EXPECT=10&FILTER=L&F
OR
MAT_OBJECT=Alignment&FORMAT_TYPE=HTML&NCBI_GI=on&PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&SERVI
CE
=plain&SET_DEFAULTS.x=34&SET_DEFAULTS.y=8&SHOW_OVERVIEW=on&END_OF_HTTPGET=Yes&SHOW_LI
NK
OUT=yes&GET_SEQUENCE=yes

【在 b******n 的大作中提到】
: 用blastx
: 不要用blastn,这个在以genome为subject进行blast的时候很坑爹
: 原因不知

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h*1
27
这我说了不算,你说了也不算。

【在 s********c 的大作中提到】
: 张靓颖又要上春晚?上次已经唱走调了,就别再丢人了吧
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b*n
28
在细菌中,长达6.6kb的片段不coding任何东西很少见的
如果有,一般是rRNA

VIEW=Pairwi
10&FILTER=L
Translations&
OVERVIEW=on&UNGAP
blastn)
VIEW=Pairwi
10&FILTER=L
PROGRAM=blastn&S
HTTPGET=Yes&SH

【在 l**********1 的大作中提到】
: >回复]
: [ 1 ]
: 发信人: thomasz (thomasz), 信区: Biology
: 标 题: ?怎样Blast较大的序列?
: 发信站: BBS 未名空间站 (Sat Feb 25 14:36:17 2012, 美东)
: 我有个6.6kb的DNA序列,是某个细菌基因组中的一段
: 。但是我
: 知道别的基因组里确实有整段的同源序列的。想来6.6kb也不是很大,那该怎么做好呢
: ?多谢!
: ----

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Q*u
29
那首lady要不是新人最多打个C。勉强B

【在 s********c 的大作中提到】
: 对艺术品位在一个固定层次上的五百评审,花拳绣腿就够了,不过我就为邓紫棋鸣不平
: ,她唱那个lady marmalade应该是一个人干了四五个人的活吧,为什么“干了三个人的
: 活”的某人就得第一,她唱得更好却没得第一

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l*1
30
是吗?
海洋里的细菌
浮黴菌門
Isosphaera屬
its full Genome sequence report:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21475588
刚出来
你以前就blastx 过了吗?
http://www.mitbbs.com/article_t1/Biology/31637179_0_2.html
23th floor

【在 b******n 的大作中提到】
: 在细菌中,长达6.6kb的片段不coding任何东西很少见的
: 如果有,一般是rRNA
:
: VIEW=Pairwi
: 10&FILTER=L
: Translations&
: OVERVIEW=on&UNGAP
: blastn)
: VIEW=Pairwi
: 10&FILTER=L

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b*g
31
春哥还独唱呢

【在 s********c 的大作中提到】
: 张靓颖又要上春晚?上次已经唱走调了,就别再丢人了吧
avatar
s*c
32
春哥独唱是应该的,“春”晚当然是“春”哥的晚会

【在 b*******g 的大作中提到】
: 春哥还独唱呢
avatar
h*1
33
很难能找出别人跟她配。

【在 s********c 的大作中提到】
: 春哥独唱是应该的,“春”晚当然是“春”哥的晚会
avatar
b*n
34
谭维维来了张靓颖就没戏了。
张充其量是谭的子集。

【在 s**********e 的大作中提到】
: 很简单,她俩不是在一场比赛里比啊。呵呵。
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h*1
35
来日方长,张靓颖被秒杀不下100次了,不在乎多这一次。

【在 b******n 的大作中提到】
: 谭维维来了张靓颖就没戏了。
: 张充其量是谭的子集。

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