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怎样设计小实验来确定一个基因编码的蛋白质是protein kinase
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怎样设计小实验来确定一个基因编码的蛋白质是protein kinase# Biology - 生物学
P*7
1 楼
已面试facebook, bloomberg, linkedin三家，都拿到offer。在本版收益很多，特来回
馈。
背景：12月-4月找faculty全军覆没，5月份开始准备工业界面试，花了近1个月时
间将本版1万
多帖子过了一遍，发现绝大部分面试题都不出其中，非常有用。这里补充一些自己遇见
的题目：
推荐“A Collection of Dice Problems”,面试facebook时遇到不少概率题，都不超出
这篇文
章的思路和难度。
Lock-free algorithms。推荐
http://www.ibm.com/developerworks/java/library/j-jtp04186/index.html
Bloomberg题目较容易，比如一个数组只有0，1两个数字，如何O(n)time, O(1)space排
序。但
同样思路的题目在facebook就变成一个数组有k个不同数字,假设k是常数，如何O(n)
time,
O(1)space排序，现场写出程序还是很麻烦。
另外小尾羊曾总结O(nlgn)的算法找出最长增长序列，面试中有遇到。
排序和binary sear
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B*y
2 楼
今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
同事说不洗的
还说
如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
我满脸疑惑
同事说
他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
我更疑惑了
我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
同事站起来，把两只手放在髋的两边，向后做成喇叭状
晃动 PP 说， 你看他们在卡车两边装两个管子，就是这么 spray 的
我实在没有勇气再漏出困惑的表情，因为我害怕他给我展示什么是 human waste
我这个人比较敏感，中饭白点了，由于大脑里浮想连篇，开始干呕
而我这个同事大口大口吃很香，我索性把还没有来的及动的牛排扒拉到他盘子里
后面的甜点和水果我也没有办法下咽
一回家专门搜了一下，墨西哥是用 human waste irrigate, 而不是 spray
我想这两种方式还是有差别的
还是用化肥吧
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b*t
3 楼
漫威影业，从初出茅庐，到声望崇拜，总共花了十年。　　而从声望崇拜，再到人人喊
打，却只用了七天时间。
在4月13日的微博里，我们仍然能见到漫威粉丝热情洋溢的回复，话语间满是能在上海
迪士尼这个如梦似幻的地方见到偶像的期待。然而打那以后，漫威在中国的宣发部门，
就用一套抽奖不说清楚规则+临时更换到场明星+不允许夜排却放了夜排观众进场+红毯
现场管理混乱的组合拳，搞得粉丝怨声载道。　　好不容易等来了发布会，所有人都觉
得这场闹剧该有一个了结了。但是谁都没有想到，前面的那些幺蛾子，居然只是个开始
。
在19日这场名为“漫威十周年”的发布会上，从08年第一部漫威电影开始就为之站台的
钢铁侠小罗伯特·唐尼、无数迷妹为之倾倒的英伦男神洛基“抖森”、可爱搞怪无极限
的小蜘蛛“荷兰弟”、还有绿巨人马克·鲁法洛，居然在开场之后就退居次席，反而为
别人的登台而鼓掌助威，就好像这次发布会的主角不是他们一样。　　当时现场的主持
人是这么说的：“Would you mind step aside？（你们能往旁边站一站吗？）”
而走上来的这些明星，清一色都是国内歌手，比如炎亚纶、张靓颖、张杰还有陈奕迅。
是的，他们确实都很有名气，其中的某些人也有实力——可他们和漫威十周年又有什么
关系呢？
现场的主持人似乎看出了在场人员的疑惑，只能这么打着圆场：“其实他们都是漫威的
粉丝，你们（指演员）可以和他们交流。”　　但除了陈奕迅之外，其他歌手也并没有
表现出什么对漫威电影的喜爱之情。更尴尬的是，陈奕迅还口误把超级英雄说成了“
Superman”，惹恼了漫威粉丝不说，也让DC躺着中了一枪……　　紧接着，这场发布会
就变成了一个国内歌星的演唱会，你方唱罢我登场，唯独把超级英雄们冷落在了一旁。
钢铁侠小罗伯特·唐尼也少有的在公开场合面露愠色，暖心的小蜘蛛赶紧凑上去把手搭
在肩上，默默地安慰他。　　而最后的大合影，直接点燃了所有粉丝的怒火。
这次的座上宾，本来的主角们，居然全部都缩在了一角，甚至连钢铁侠这个漫威宇宙的
奠基人物，都没有站在中间。那么他的位置都被谁占了呢？是陈奕迅，是张杰，是那些
本来不应该出现在这里的国内歌星们。
有的人可能会问：这不就是个站位问题吗，粉丝们至于这么小题大做吗？好歹这也是国
内的主场，让他们稍微站得靠边了一点，应该也没什么问题吧？　　虽然我向来对追星
不怎么感冒，也认为很多“脑残粉”的行为确实令人不齿，但这回真不一样。结合漫威
中国之前的那些昏招，最后的合影站位只不过是所有问题的一个缩影。真正让粉丝愤怒
的，是他们对待明星的方式，是他们主次不分的态度，是他们欺骗粉丝的手段。　　这
就好比我走进一家号称澳洲进口牛肉的餐馆，结果他们给我端上来的却是从麦当劳进口
的巨无霸。换你，你会高兴吗？
所以，当你看到现在漫威影业微博下面的一片骂声，你一点儿都不应该觉得奇怪。自作
孽，不可活，漫威中国的宣发部门生动地给我们上演了一出如何在一周内毁掉自己十年
基业的大戏。
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w*a
4 楼
该考虑换个MACBOOK了。不过跑的还是那么快。
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y*a
5 楼
如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
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h*3
6 楼
牛人, 真是苦尽甘来.
请问有本Debug书的电子版么?

【在 P*******7 的大作中提到】
: 已面试facebook, bloomberg, linkedin三家，都拿到offer。在本版收益很多，特来回
: 馈。
: 背景：12月-4月找faculty全军覆没，5月份开始准备工业界面试，花了近1个月时
: 间将本版1万
: 多帖子过了一遍，发现绝大部分面试题都不出其中，非常有用。这里补充一些自己遇见
: 的题目：
: 推荐“A Collection of Dice Problems”,面试facebook时遇到不少概率题，都不超出
: 这篇文
: 章的思路和难度。
: Lock-free algorithms。推荐
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M*t
7 楼
有啥可恶心的？

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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x*a
8 楼
升级内存了么
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q*8
9 楼
删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的
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t*t
10 楼
神啊，横扫工业界啊。大大cong下
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c*s
11 楼
This is so called organic :))

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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w*a
12 楼
升级了。
硬盘也换了一个。刚开始80G。
后来换到200G。

【在 x******a 的大作中提到】
: 升级内存了么
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g*5
13 楼
…… 您是学生物的？
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s*e
14 楼
congs

【在 P*******7 的大作中提到】
: 已面试facebook, bloomberg, linkedin三家，都拿到offer。在本版收益很多，特来回
: 馈。
: 背景：12月-4月找faculty全军覆没，5月份开始准备工业界面试，花了近1个月时
: 间将本版1万
: 多帖子过了一遍，发现绝大部分面试题都不出其中，非常有用。这里补充一些自己遇见
: 的题目：
: 推荐“A Collection of Dice Problems”,面试facebook时遇到不少概率题，都不超出
: 这篇文
: 章的思路和难度。
: Lock-free algorithms。推荐
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B*y
15 楼
在种的菜上spray human waste 你不觉得恶心?

【在 M*****t 的大作中提到】
: 有啥可恶心的？
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x*a
16 楼
我的05年的也在用，内存1.5gb，硬盘160，单上网，看pdf和写写latex还挺快的。

【在 w**a 的大作中提到】
: 升级了。
: 硬盘也换了一个。刚开始80G。
: 后来换到200G。
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l*1
17 楼
please refer Cell 2011 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
full text link:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
from one Super Niu Lab at Stanford:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/

【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
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w*u
18 楼
Cong!
I think I know you. :)
did u decide where to go?

【在 P*******7 的大作中提到】
: 已面试facebook, bloomberg, linkedin三家，都拿到offer。在本版收益很多，特来回
: 馈。
: 背景：12月-4月找faculty全军覆没，5月份开始准备工业界面试，花了近1个月时
: 间将本版1万
: 多帖子过了一遍，发现绝大部分面试题都不出其中，非常有用。这里补充一些自己遇见
: 的题目：
: 推荐“A Collection of Dice Problems”,面试facebook时遇到不少概率题，都不超出
: 这篇文
: 章的思路和难度。
: Lock-free algorithms。推荐
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R*m
19 楼
从前我小时候种菜都是这样种的。有什么恶心的。
我还用手抓过鸡粪，猪粪，还有你提到的愤。抓好后，手还是臭臭的，就在水稻田的污
水里，洗洗，开始吃饭。
不过，即使在美国，我也是基本不吃生菜的，除非西红柿，黄瓜等及少数几样，连荸荠
我都不太敢生吃（有姜片虫哦）。想想地里各式虫子，花花绿绿，天上地下，鸡粪牛粪
（HD有一种organic肥卖，你要仔细读读，可以发现，是用下水道的东东做的偶），我
是吃不下去的。要煮过才放心。

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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y*a
20 楼
我晕，不是作业，我自己的实验。。。 自己刚刚学生物，对蛋白质方面一点都不懂。
。。

【在 q*******8 的大作中提到】
: 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的
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P*7
21 楼
5点你还不睡？

【在 w****u 的大作中提到】
: Cong!
: I think I know you. :)
: did u decide where to go?
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D*1
22 楼
LOL
for dust you are, and unto dust shall you return.

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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y*a
23 楼
我刚入行生物一年多，生化知识薄弱，自己的project 是protein kinase～

【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
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P*7
24 楼
CSDN上有

【在 h******3 的大作中提到】
: 牛人, 真是苦尽甘来.
: 请问有本Debug书的电子版么?
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a*y
25 楼
好奇的问一句你都浮想啥了？

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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y*a
26 楼
非常感谢，我先看看的！

【在 l**********1 的大作中提到】
: please refer Cell 2011 one paper:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
: full text link:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
: from one Super Niu Lab at Stanford:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/
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P*b
27 楼
牛人啊

【在 P*******7 的大作中提到】
: 已面试facebook, bloomberg, linkedin三家，都拿到offer。在本版收益很多，特来回
: 馈。
: 背景：12月-4月找faculty全军覆没，5月份开始准备工业界面试，花了近1个月时
: 间将本版1万
: 多帖子过了一遍，发现绝大部分面试题都不出其中，非常有用。这里补充一些自己遇见
: 的题目：
: 推荐“A Collection of Dice Problems”,面试facebook时遇到不少概率题，都不超出
: 这篇文
: 章的思路和难度。
: Lock-free algorithms。推荐
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M*t
28 楼
你是吃菜，又不是吃屎，有啥恶心的？

【在 B*****y 的大作中提到】
: 在种的菜上spray human waste 你不觉得恶心?
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l*1
29 楼
De rien.

【在 y*******a 的大作中提到】
: 非常感谢，我先看看的！
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s*5
30 楼

能稍微相信说一下面的都是什么position吗？
谢谢！

【在 P*******7 的大作中提到】
: 已面试facebook, bloomberg, linkedin三家，都拿到offer。在本版收益很多，特来回
: 馈。
: 背景：12月-4月找faculty全军覆没，5月份开始准备工业界面试，花了近1个月时
: 间将本版1万
: 多帖子过了一遍，发现绝大部分面试题都不出其中，非常有用。这里补充一些自己遇见
: 的题目：
: 推荐“A Collection of Dice Problems”,面试facebook时遇到不少概率题，都不超出
: 这篇文
: 章的思路和难度。
: Lock-free algorithms。推荐
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l*d
31 楼
菜＝屎！

【在 M*****t 的大作中提到】
: 你是吃菜，又不是吃屎，有啥恶心的？
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y*a
32 楼
你好,你是不是觉得这个问题很简单啊? 没别的意思,只是想知道自己弱到什么程度了.
我们实验室不太做蛋白的实验~

【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
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v*n
33 楼
牛的不行了啊
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M*t
34 楼
哦，那我吃左边那个。。

【在 l*********d 的大作中提到】
: 菜＝屎！
avatar
q*8
35 楼
我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation.
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n*9
36 楼
I can only say niu XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
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P*5
37 楼
false farmer!
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y*a
38 楼
谢谢你的回复，听你这么一说还是很简单的，不知道实际操作起来会不会比较顺利。我
这两天看了看文献，和你说的过程差不多，只是人家做的都是已经知道substrate蛋白
了，我自己没想到可以先做Y2H来找substrate。
另外，我要改改自己说话的方式了，我自己读起来也像一道作业题，呵呵～

【在 q*******8 的大作中提到】
: 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
: 个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
: interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation.
avatar
i*9
39 楼
厉害，
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B*y
40 楼
膜拜

【在 R*******m 的大作中提到】
: 从前我小时候种菜都是这样种的。有什么恶心的。
: 我还用手抓过鸡粪，猪粪，还有你提到的愤。抓好后，手还是臭臭的，就在水稻田的污
: 水里，洗洗，开始吃饭。
: 不过，即使在美国，我也是基本不吃生菜的，除非西红柿，黄瓜等及少数几样，连荸荠
: 我都不太敢生吃（有姜片虫哦）。想想地里各式虫子，花花绿绿，天上地下，鸡粪牛粪
: （HD有一种organic肥卖，你要仔细读读，可以发现，是用下水道的东东做的偶），我
: 是吃不下去的。要煮过才放心。
avatar
q*8
41 楼
当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。
avatar
c*h
42 楼
谢谢分享　很有用的心得
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B*y
43 楼
臭味等东西

【在 a*********y 的大作中提到】
: 好奇的问一句你都浮想啥了？
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y*a
44 楼
可是我的这个protein kinase gene 是新的，目前data base上已经可以得到cDNA, 但
是protein还没得到，是不是就没有办法缩小范围了呢？

【在 q*******8 的大作中提到】
: 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
: 这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。
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j*g
45 楼
For the sorting w/ k elements problem, it's easy to achieve O(n) time
complexity and O(1) space complexity by using counting/frequency sort:
step 0: initialize counting/freq array k, where k0 ... kn elements can be
indexed into 0 to n of the array. And array is initialized to be 0.
step 1: scan the array, and for each a[i] do k[a[i]]++;
step 2: rescan the array and put final sorted element back in.
count = 0;
for (i = 0; i < k; i++)
for (j = 0; j < k[i]; j++)
a[count++] = i;
(a bit simplified assumping k elements are in fact 0 to k - 1, but you get
the idea.
HOWEVER,
if k = 0 and 1 (your bloomberg problem), it can be done like this even more
simplified:
begin = 0; end = n - 1;
while (begin < end)
{
while (begin < end && a[begin] == 0) begin++;
if (begin < end) { swap (begin, end); end--; }
while (begin < end && a[end] == 1) end--;
if (begin < end) { swap (begin, end); begin++;}
}
this is bit like the partition step in the qsort. So it's really only ONE
linear scan, compared with frequency/counting sort's 2 linear scans.
WHICH prompts me to think is there any generic better way to solve th k-
element problem better than the counting/frequncy sorting algo?
hm.....
avatar
B*y
46 楼
恶心死了

【在 l*********d 的大作中提到】
: 菜＝屎！
avatar
q*8
47 楼
那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。
avatar
P*7
48 楼
The dutch national flag problem.

be

【在 j*****g 的大作中提到】
: For the sorting w/ k elements problem, it's easy to achieve O(n) time
: complexity and O(1) space complexity by using counting/frequency sort:
: step 0: initialize counting/freq array k, where k0 ... kn elements can be
: indexed into 0 to n of the array. And array is initialized to be 0.
: step 1: scan the array, and for each a[i] do k[a[i]]++;
: step 2: rescan the array and put final sorted element back in.
: count = 0;
: for (i = 0; i < k; i++)
: for (j = 0; j < k[i]; j++)
: a[count++] = i;
avatar
B*y
49 楼
啥是True farmer

【在 P******5 的大作中提到】
: false farmer!
avatar
y*a
50 楼
好的，非常感谢！

【在 q*******8 的大作中提到】
: 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。
avatar
j*g
51 楼
靠！工作越久，脑子越僵。真理呀。。。
The same one scan partition algorithm run k - 1 times....//tears

【在 P*******7 的大作中提到】
: The dutch national flag problem.
:
: be
avatar
a*y
52 楼
口味蛮重的嘛

【在 B*****y 的大作中提到】
: 臭味等东西
avatar
b*y
53 楼
Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
protein auto-phosphorylate itself.
However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
Good luck!
avatar
P*o
54 楼
厉害
avatar
a*y
55 楼
上面觉得不恶心的都是

【在 B*****y 的大作中提到】
: 啥是True farmer
avatar
y*a
56 楼
谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
是老板提出来了。。。

the
their
and

【在 b******y 的大作中提到】
: Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
: through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
: presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
: protein auto-phosphorylate itself.
: However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
: kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
: trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
: substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
: 3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
: Good luck!
avatar
B*y
57 楼
我感觉没有用化肥干净啊，用排泄物容易污染菜菜们

【在 a*********y 的大作中提到】
: 上面觉得不恶心的都是
avatar
l*1
58 楼
one mentor in your future career (possible)
HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
//www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
//facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
//www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
plus this one:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289

【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
: 不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
: 是老板提出来了。。。
:
: the
: their
: and
avatar
l*d
59 楼
反正结果都一样！

【在 M*****t 的大作中提到】
: 哦，那我吃左边那个。。
avatar
c*b
60 楼
你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
去找substrate.
http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。

【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
avatar
s*y
61 楼
你肯定小时候没在农村呆过，嗯

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
avatar
c*b
62 楼
Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢

project:

【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
avatar
l*1
63 楼
不是吃化肥就是吃屎！哈哈哈哈哈哈
avatar
y*a
64 楼
谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
还是搜索能力高啊？

【在 c********b 的大作中提到】
: 你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
: 去找substrate.
: http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
: 如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
: 可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。
avatar
B*y
65 楼
那版上的大牛们还忙活什么

【在 l*****1 的大作中提到】
: 不是吃化肥就是吃屎！哈哈哈哈哈哈
avatar
y*a
66 楼
miRNA也是我的一个project，嘿嘿～

【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
avatar
l*d
67 楼
过程，就是过程！

【在 B*****y 的大作中提到】
: 那版上的大牛们还忙活什么
avatar
l*1
68 楼
Continue to 18th floor
not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs:
References:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
more
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
citedin&uid=15565159
original hint from:
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
NB: if HIV treatment is not relative to 抗性和kinase
Are you sure? centuribob (Planta)
回复]
[ 20 ]
发信人: centuribob (Planta), 信区: Biology
标 题: Re: 怎样设计小实验来确定一个基因编码的蛋白质是protein kina
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 9 2012, 美东)
Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢

【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
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w*r
69 楼
说穿了豆是原子分子，本质上没区别，没啥

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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l*1
70 楼
每天一早起来 洗漱 化妆后 第一件事 就是 上买买提 bbs Biology
看别人的求的paper 的题目 以及 摘要 和自己的有关联没有
如有 必须取得那个paper 的全文 当然有的时侯就在null floor 楼下的 sendspace
link
里就能立马拿到full text pdf file/s.
还有每晚卸妆后 临睡前也必须来这里check 一次
你坚持这样做三年 1001晨+1001晚 以上 你
成不了能及时获得很好的paper 的你
那就来提诉我吧 ... 赔给你100个包子
原因: 三个臭皮匠 有时侯可能抵一个诸葛亮的一个想法
这里三年 偶遇30个wsn wsnv 千老的急求papers relative to your projects.
抵一个JD Watson的一个想法还是有可能的吧
//en.wikipedia.org/wiki/James_D._Watson

【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
: 经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
: 还是搜索能力高啊？
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d*y
71 楼
一看就知自己没种过地
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c*b
72 楼
I did not see your logic.
I was saying Xuemei did not work on Kinase and resistance. Did her group
publish original research report on HIV?? I bet she has no permission to
work on HIV yet. I will meet her this May, and I can ask her if you want me
to.
As for myself, I am a pure RNA biologist. I work on miRNA, non coding
pathogen RNA, circular RNA, etc. I guess I am pretty familiar with
literatures in plant RNA biology.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
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l*t
73 楼
是之谓 矫情
千百年来粮食和蔬菜都是这么种出来的吧
化肥才存在几天？
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c*b
74 楼
I got your point a little bit:
You think non-coding RNA is involved in resistance, so Xuemei's study has a
link there.
That is pretty... NAIVE.
Again, she focus on smRNA metabolism, not function. So the link is like
everything is linked in a celll, directly or indirectly.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
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c*1
75 楼
上海姑娘
avatar
c*b
76 楼
"not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs"
This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
avatar
l*i
77 楼
我联想到了2girls1cup
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l*1
78 楼
请注意你的用词
>Xuemei又不做抗性和kinase
是"和"而不是"或"
then
what is this?
a)
her Vita:
19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
from
//www.plantbiology.ucr.edu/faculty/chen.html
and her review article:
b)
//www.springerlink.com/content/p22k662q1162kp07/
and this:
c)
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675573
Plant Cell. 2010 Jul;22(7):2156-
Orchestration of the floral transition and floral development in Arabidopsis
by the bifunctional transcription factor APETALA2.
Yant L, Mathieu J, Dinh TT, Ott F, Lanz C, Wollmann H, Chen X, Schmid M.
Source
Max Planck Institute for Developmental Biology, D-72076 Tübingen, Germany.
and UC Riverside
full text link:
//www.plantcell.org/content/22/7/2156.full.pdf
难不成合作项目= 2nd last author did nothing about Kinase?
你是她老公或相好的话 那偶就闪人了 centuribob (Planta) 老大 You are always correct
for her topics.

【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
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n*h
79 楼
怎么这个贴招来了平时本版这么少见的ID了
avatar
l*1
80 楼
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20023165
full text link:
//www.weigelworld.org/research/publications/2010/pdfs/Rodriguez%
20Development%202010.pdf
even Xue-mei Chen before 2010 never did Arabidopsis cyclin-dependent
kinases and microRNA
after 2011 she should noted that paper.
And You centuribob (Planta) from 2012 now still ignored it?

【在 c********b 的大作中提到】
: "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs"
: This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
: RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.
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B*a
81 楼
啊！ 还enjoy过程?!

【在 l*********d 的大作中提到】
: 过程，就是过程！
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y*a
82 楼
如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
avatar
l*g
83 楼
这也会恶心的吐？
你应该去看看人皮肤的缩微图片
以及一些人身上的寄生虫的照片
保证你现在身上就有

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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q*8
84 楼
删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的
avatar
b*e
85 楼
现在这年代了，还有这么无知加矫情的人？？？假的吧？
avatar
g*5
86 楼
…… 您是学生物的？
avatar
d*s
87 楼
结果就是：吃左边那个，制造右边那个。
菜=屎。。。
。。。

【在 l*********d 的大作中提到】
: 反正结果都一样！
avatar
l*1
88 楼
please refer Cell 2011 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
full text link:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
from one Super Niu Lab at Stanford:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/

【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
avatar
B*y
89 楼
精辟

【在 l*********d 的大作中提到】
: 过程，就是过程！
avatar
y*a
90 楼
我晕，不是作业，我自己的实验。。。 自己刚刚学生物，对蛋白质方面一点都不懂。
。。

【在 q*******8 的大作中提到】
: 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的
avatar
B*y
91 楼
我被奖了20伪币
上首页了

【在 n******h 的大作中提到】
: 怎么这个贴招来了平时本版这么少见的ID了
avatar
y*a
92 楼
我刚入行生物一年多，生化知识薄弱，自己的project 是protein kinase～

【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
avatar
l*1
93 楼
鼓掌！

【在 d*****s 的大作中提到】
: 结果就是：吃左边那个，制造右边那个。
: 菜=屎。。。
: 。。。
avatar
y*a
94 楼
非常感谢，我先看看的！

【在 l**********1 的大作中提到】
: please refer Cell 2011 one paper:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
: full text link:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
: from one Super Niu Lab at Stanford:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/
avatar
l*1
95 楼
我们这里不带地域歧视的。

【在 c*****1 的大作中提到】
: 上海姑娘
avatar
l*1
96 楼
De rien.

【在 y*******a 的大作中提到】
: 非常感谢，我先看看的！
avatar
w*7
97 楼
种地的很多都这样 除非楼主愿意吃“生化食品”而不是有机食品
avatar
y*a
98 楼
你好,你是不是觉得这个问题很简单啊? 没别的意思,只是想知道自己弱到什么程度了.
我们实验室不太做蛋白的实验~

【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
avatar
a*g
99 楼
你同事跟你开这种半荤半素的玩笑,你不去讨伐,还来这里矫情
这里的人(除了我)都很厚道,都忍着不说

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
avatar
q*8
100 楼
我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation.
avatar
l*d
101 楼
你没看她家菜的伙食可好了，都是鸡蛋、鸡蛋汤的。
俺们家的菜就是吃waste。

【在 a****g 的大作中提到】
: 你同事跟你开这种半荤半素的玩笑,你不去讨伐,还来这里矫情
: 这里的人(除了我)都很厚道,都忍着不说
avatar
y*a
102 楼
谢谢你的回复，听你这么一说还是很简单的，不知道实际操作起来会不会比较顺利。我
这两天看了看文献，和你说的过程差不多，只是人家做的都是已经知道substrate蛋白
了，我自己没想到可以先做Y2H来找substrate。
另外，我要改改自己说话的方式了，我自己读起来也像一道作业题，呵呵～

【在 q*******8 的大作中提到】
: 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
: 个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
: interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation.
avatar
a*g
103 楼
:)

【在 l*********d 的大作中提到】
: 你没看她家菜的伙食可好了，都是鸡蛋、鸡蛋汤的。
: 俺们家的菜就是吃waste。
avatar
q*8
104 楼
当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。
avatar
h*n
105 楼
庄稼一枝花, 全靠粪当家.

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
avatar
y*a
106 楼
可是我的这个protein kinase gene 是新的，目前data base上已经可以得到cDNA, 但
是protein还没得到，是不是就没有办法缩小范围了呢？

【在 q*******8 的大作中提到】
: 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
: 这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。
avatar
l*u
107 楼
菜倒是不觉得怎么样，这不是性骚扰吗？还带比划的...
看来不洗还是有些影响的...
avatar
q*8
108 楼
那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。
avatar
t*1
109 楼
何不食肉糜？
avatar
y*a
110 楼
好的，非常感谢！

【在 q*******8 的大作中提到】
: 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。
avatar
C*3
111 楼
这一看就是个养尊处优没下地干过活的小姐。。。。哎

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
avatar
b*y
112 楼
Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
protein auto-phosphorylate itself.
However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
Good luck!
avatar
j*h
113 楼
吃下去最后不都变成屎了，纠结啥
除非你不拉屎
avatar
y*a
114 楼
谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
是老板提出来了。。。

the
their
and

【在 b******y 的大作中提到】
: Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
: through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
: presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
: protein auto-phosphorylate itself.
: However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
: kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
: trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
: substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
: 3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
: Good luck!
avatar
l*d
115 楼
那个waste一部分是通过毛孔排泄的，肉里面难道没有这个成分，lol。

【在 t*********1 的大作中提到】
: 何不食肉糜？
avatar
l*1
116 楼
one mentor in your future career (possible)
HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
//www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
//facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
//www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
plus this one:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289

【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
: 不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
: 是老板提出来了。。。
:
: the
: their
: and
avatar
a*4
117 楼
没化肥的是ORGANIC,懂？
你从小就吃这些长大的，忘了？
avatar
c*b
118 楼
你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
去找substrate.
http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。

【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
avatar
b*n
119 楼
你是真傻，还是装傻，不知道之前organic纯天然的都是这么来的么？
avatar
c*b
120 楼
Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢

project:

【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
avatar
H*r
121 楼
呃，不食人间烟火的大小姐。

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
avatar
y*a
122 楼
谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
还是搜索能力高啊？

【在 c********b 的大作中提到】
: 你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
: 去找substrate.
: http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
: 如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
: 可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。
avatar
g*o
123 楼
没怎么跟这个帖子哦，看来要打扫打扫卫生了，老大去哪了？故意考验我的吗？
avatar
y*a
124 楼
miRNA也是我的一个project，嘿嘿～

【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
avatar
m*i
125 楼
所有中国餐馆都不洗菜，这不是常识吗？

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
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l*1
126 楼
Continue to 18th floor
not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs:
References:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
more
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
citedin&uid=15565159
original hint from:
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
NB: if HIV treatment is not relative to 抗性和kinase
Are you sure? centuribob (Planta)
回复]
[ 20 ]
发信人: centuribob (Planta), 信区: Biology
标 题: Re: 怎样设计小实验来确定一个基因编码的蛋白质是protein kina
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 9 2012, 美东)
Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢

【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
avatar
T*4
127 楼
脏东西都扫出去。
番茄有事干了

【在 g*********o 的大作中提到】
: 没怎么跟这个帖子哦，看来要打扫打扫卫生了，老大去哪了？故意考验我的吗？
avatar
l*1
128 楼
每天一早起来 洗漱 化妆后 第一件事 就是 上买买提 bbs Biology
看别人的求的paper 的题目 以及 摘要 和自己的有关联没有
如有 必须取得那个paper 的全文 当然有的时侯就在null floor 楼下的 sendspace
link
里就能立马拿到full text pdf file/s.
还有每晚卸妆后 临睡前也必须来这里check 一次
你坚持这样做三年 1001晨+1001晚 以上 你
成不了能及时获得很好的paper 的你
那就来提诉我吧 ... 赔给你100个包子
原因: 三个臭皮匠 有时侯可能抵一个诸葛亮的一个想法
这里三年 偶遇30个wsn wsnv 千老的急求papers relative to your projects.
抵一个JD Watson的一个想法还是有可能的吧
//en.wikipedia.org/wiki/James_D._Watson

【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
: 经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
: 还是搜索能力高啊？
avatar
o*0
129 楼
人家认为自己是可爱嘛

【在 a****g 的大作中提到】
: 你同事跟你开这种半荤半素的玩笑,你不去讨伐,还来这里矫情
: 这里的人(除了我)都很厚道,都忍着不说
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c*b
130 楼
I did not see your logic.
I was saying Xuemei did not work on Kinase and resistance. Did her group
publish original research report on HIV?? I bet she has no permission to
work on HIV yet. I will meet her this May, and I can ask her if you want me
to.
As for myself, I am a pure RNA biologist. I work on miRNA, non coding
pathogen RNA, circular RNA, etc. I guess I am pretty familiar with
literatures in plant RNA biology.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
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T*9
131 楼
楼主是有多金贵多娇气啊，那你啥也别吃算了，鸡蛋上还有鸡粪呢
你吃九转大肠的时候有没有丰富的联想过
一边嚷嚷着要吃有机食品，一边又嫌有机食品的“养料”恶心……
楼主应该去农场干农活半年
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c*b
132 楼
I got your point a little bit:
You think non-coding RNA is involved in resistance, so Xuemei's study has a
link there.
That is pretty... NAIVE.
Again, she focus on smRNA metabolism, not function. So the link is like
everything is linked in a celll, directly or indirectly.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
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j*i
133 楼
一个女同志，把自己的饭拨给男同事吃。这样好吗？
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c*b
134 楼
"not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs"
This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
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T*4
135 楼
难道倒掉？多浪费啊

【在 j****i 的大作中提到】
: 一个女同志，把自己的饭拨给男同事吃。这样好吗？
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l*1
136 楼
请注意你的用词
>Xuemei又不做抗性和kinase
是"和"而不是"或"
then
what is this?
a)
her Vita:
19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
from
//www.plantbiology.ucr.edu/faculty/chen.html
and her review article:
b)
//www.springerlink.com/content/p22k662q1162kp07/
and this:
c)
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675573
Plant Cell. 2010 Jul;22(7):2156-
Orchestration of the floral transition and floral development in Arabidopsis
by the bifunctional transcription factor APETALA2.
Yant L, Mathieu J, Dinh TT, Ott F, Lanz C, Wollmann H, Chen X, Schmid M.
Source
Max Planck Institute for Developmental Biology, D-72076 Tübingen, Germany.
and UC Riverside
full text link:
//www.plantcell.org/content/22/7/2156.full.pdf
难不成合作项目= 2nd last author did nothing about Kinase?
你是她老公或相好的话 那偶就闪人了 centuribob (Planta) 老大 You are always correct
for her topics.

【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
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j*i
137 楼
你做的对，浪费不好

【在 T*******4 的大作中提到】
: 难道倒掉？多浪费啊
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l*1
138 楼
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20023165
full text link:
//www.weigelworld.org/research/publications/2010/pdfs/Rodriguez%
20Development%202010.pdf
even Xue-mei Chen before 2010 never did Arabidopsis cyclin-dependent
kinases and microRNA
after 2011 she should noted that paper.
And You centuribob (Planta) from 2012 now still ignored it?

【在 c********b 的大作中提到】
: "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs"
: This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
: RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.
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a*g
139 楼
席娟,你不懂这种暧昧的幸福感

【在 j****i 的大作中提到】
: 一个女同志，把自己的饭拨给男同事吃。这样好吗？
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c*b
140 楼
她postdoc老板是做花的顶尖人物，这两篇提到了kinase，但是focus是花啊.
我没有说我对她特别了解，但是我觉得focus在kinase或抗性是要关注机理，而你提到
的例子都是在关注别的机理时提到了kinase,所以不能算她的focus.
至于你怎么想的，我没兴趣。

【在 l**********1 的大作中提到】
: 请注意你的用词
: >Xuemei又不做抗性和kinase
: 是"和"而不是"或"
: then
: what is this?
: a)
: her Vita:
: 19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
: cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
: identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
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j*i
141 楼
这样好吗？

【在 a****g 的大作中提到】
: 席娟,你不懂这种暧昧的幸福感
avatar
l*1
142 楼
你就差多玛三个字
的关联=XYZ below shown
Xuemei又不做抗性和kinase（XYZ) ，人家做小RNA的代谢
害得我还以为你是她的原同事呢
BTW
既然centuribob (Planta) 的大 是专搞RNA world的
是Yonath Ada 的lab出来的薄厚 /PI 你认识吗? i mean met him/her before whom was PD
from her:
//www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/2009/
//www.weizmann.ac.il/sb/faculty_pages/Yonath/
Weizmann Institute of Science, Rehovot, IL,
The amazing ribosome
link:
//www.euchems-prague2012.cz/files/euchems-adv-210x279-05.pdf

【在 c********b 的大作中提到】
: 她postdoc老板是做花的顶尖人物，这两篇提到了kinase，但是focus是花啊.
: 我没有说我对她特别了解，但是我觉得focus在kinase或抗性是要关注机理，而你提到
: 的例子都是在关注别的机理时提到了kinase,所以不能算她的focus.
: 至于你怎么想的，我没兴趣。
avatar
l*d
143 楼
感觉好就行！

【在 j****i 的大作中提到】
: 这样好吗？
avatar
s*i
144 楼
鸡蛋还是鸡屁股里出来的呢
avatar
s*t
145 楼
你不知道种粮种菜都是浇粪施肥的？
无知。

【在 B*****y 的大作中提到】
: 在种的菜上spray human waste 你不觉得恶心?
avatar
B*y
146 楼
我恶心的是"spray＂ 这个词
把Human waste spray 到菜上，能吃下去吗

【在 s*********t 的大作中提到】
: 你不知道种粮种菜都是浇粪施肥的？
: 无知。
avatar
z*n
147 楼
那个超级怀疑是你同事骚扰你，lol
想不出来任何把粑粑喷到菜上的理由

【在 B*****y 的大作中提到】
: 我恶心的是"spray＂ 这个词
: 把Human waste spray 到菜上，能吃下去吗
avatar
j*i
148 楼
赶紧去HR报告吧。被人吃豆腐了，牛排也没了

【在 z*********n 的大作中提到】
: 那个超级怀疑是你同事骚扰你，lol
: 想不出来任何把粑粑喷到菜上的理由
avatar
B*y
149 楼
不明白你的意思
我回来专门查了一下，irrigate 我没有问题，spray我确实感到恶心

【在 z*********n 的大作中提到】
: 那个超级怀疑是你同事骚扰你，lol
: 想不出来任何把粑粑喷到菜上的理由
avatar
i*t
150 楼
真是个傻丫头

【在 B*****y 的大作中提到】
: 不明白你的意思
: 我回来专门查了一下，irrigate 我没有问题，spray我确实感到恶心
avatar
z*n
151 楼
问题是是不可能spray的，你同事故意做淫秽动作骚扰你呢

【在 B*****y 的大作中提到】
: 不明白你的意思
: 我回来专门查了一下，irrigate 我没有问题，spray我确实感到恶心
avatar
f*i
152 楼
浇大粪是个技巧活，没经验的用粪勺根本浇不均匀

【在 B*****y 的大作中提到】
: 我恶心的是"spray＂ 这个词
: 把Human waste spray 到菜上，能吃下去吗
avatar
l*u
153 楼
不一腚是骚扰呀，可能就是比较熟，比较随便。

【在 z*********n 的大作中提到】
: 问题是是不可能spray的，你同事故意做淫秽动作骚扰你呢
avatar
l*d
154 楼
挺可爱的小姑娘，俺稀饭！

【在 i****t 的大作中提到】
: 真是个傻丫头
avatar
r*o
155 楼
avatar
a*g
156 楼
老三很有经验

【在 z*********n 的大作中提到】
: 问题是是不可能spray的，你同事故意做淫秽动作骚扰你呢
avatar
B*y
157 楼
你这个人干吗想那么歪

【在 z*********n 的大作中提到】
: 问题是是不可能spray的，你同事故意做淫秽动作骚扰你呢
avatar
B*y
158 楼
就是。他觉得我这个人比较笨
什么他都喜欢给我比划一下，好给我一个直观的印象
然后瞪着纯真的大眼睛问我
你的明白？

【在 l*****u 的大作中提到】
: 不一腚是骚扰呀，可能就是比较熟，比较随便。
avatar
B*y
159 楼
难道你这样骚扰过别的姑娘?

【在 z*********n 的大作中提到】
: 问题是是不可能spray的，你同事故意做淫秽动作骚扰你呢
avatar
f*e
160 楼
你们没见过农民为了争抢公厕的积累物打架的吧。过去农民种菜，都是把排泄物沤成粪
水，然后用一个大瓢撒到庄稼（包括蔬菜）上面，现在粮食用化肥的多了，蔬菜用粪水
的还是很多。
所以说，中国（特别是南方）的蔬菜不能生吃，有寄生虫。美国的蔬菜，能不生吃也尽
量不要生吃。实在不行，就吃包得比较紧的蔬菜，象Iceberg lettuce之类的。
avatar
B*y
161 楼
请你详细解释用大瓢撒这个动作

【在 f*******e 的大作中提到】
: 你们没见过农民为了争抢公厕的积累物打架的吧。过去农民种菜，都是把排泄物沤成粪
: 水，然后用一个大瓢撒到庄稼（包括蔬菜）上面，现在粮食用化肥的多了，蔬菜用粪水
: 的还是很多。
: 所以说，中国（特别是南方）的蔬菜不能生吃，有寄生虫。美国的蔬菜，能不生吃也尽
: 量不要生吃。实在不行，就吃包得比较紧的蔬菜，象Iceberg lettuce之类的。
avatar
f*e
162 楼
就是用一个大瓢（比奶锅大一圈）舀上大半瓢，使劲往空中一甩，粪水就化成星星点点
飞到庄稼上面了，其实，就是人工spray。

【在 B*****y 的大作中提到】
: 请你详细解释用大瓢撒这个动作
avatar
t*l
163 楼
当然是有机的好。老祖宗粪肥从战国时期就开用了。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 B*****y 的大作中提到】
: 今天中午和同事一起吃午饭，因为我昨天洗自己种的青菜着实费了点事，就随便问了一
: 下同事餐馆他们洗菜吗，如果洗的话，能洗干净么
: 同事说不洗的
: 还说
: 如果碰上从墨西哥进口的菜，就更悲催了
: 我满脸疑惑
: 同事说
: 他们墨西哥人 在菜上 spray human waste 来促使植物省长
: 我更疑惑了
: 我不太确定他human waste 的定义 和 spray 的方式
avatar
t*l
164 楼
虫子叫刺身。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 R*******m 的大作中提到】
: 从前我小时候种菜都是这样种的。有什么恶心的。
: 我还用手抓过鸡粪，猪粪，还有你提到的愤。抓好后，手还是臭臭的，就在水稻田的污
: 水里，洗洗，开始吃饭。
: 不过，即使在美国，我也是基本不吃生菜的，除非西红柿，黄瓜等及少数几样，连荸荠
: 我都不太敢生吃（有姜片虫哦）。想想地里各式虫子，花花绿绿，天上地下，鸡粪牛粪
: （HD有一种organic肥卖，你要仔细读读，可以发现，是用下水道的东东做的偶），我
: 是吃不下去的。要煮过才放心。
avatar
f*i
165 楼
泼的时候得画圆圈的
光使劲的话，要么泼到自己身上，要么泼到邻居那里

【在 f*******e 的大作中提到】
: 就是用一个大瓢（比奶锅大一圈）舀上大半瓢，使劲往空中一甩，粪水就化成星星点点
: 飞到庄稼上面了，其实，就是人工spray。
avatar
B*y
166 楼
你是凭空想象，亲眼见过还是亲手实施过

【在 f*******e 的大作中提到】
: 就是用一个大瓢（比奶锅大一圈）舀上大半瓢，使劲往空中一甩，粪水就化成星星点点
: 飞到庄稼上面了，其实，就是人工spray。
avatar
B*y
167 楼
这两天别说中饭，晚饭也没有胃口吃了
一天就吃了几个苹果，几串葡萄充饥
avatar
b*e
168 楼
蔬菜都那样搞，水果不那样搞？？

【在 B*****y 的大作中提到】
: 这两天别说中饭，晚饭也没有胃口吃了
: 一天就吃了几个苹果，几串葡萄充饥
avatar
B*y
169 楼
你纯心要逼死我呀

【在 b********e 的大作中提到】
: 蔬菜都那样搞，水果不那样搞？？
avatar
f*e
170 楼
想象的不会这么活灵活现的 :-)

【在 B*****y 的大作中提到】
: 你是凭空想象，亲眼见过还是亲手实施过
avatar
s*0
171 楼

有机肥肯定要比化肥好啊，化肥可是用石油分解后做的，
楼主太少见多怪了，如果真的连有机肥都排斥，那施过化肥
的菜更不应该吃了

【在 B*****y 的大作中提到】
: 我感觉没有用化肥干净啊，用排泄物容易污染菜菜们
avatar
l*u
172 楼
只有施主能逼死施主。其实蔬菜水果都一样，而且水果的虫害那么厉害都是靠农药。施
主还是多洗多泡就好了。而且在公司密闭环境里有个猛人放个屁，还不是大家一人一口
就吸掉了？ Be strong. Be tough!

【在 B*****y 的大作中提到】
: 你纯心要逼死我呀
avatar
y*f
173 楼
老毛子的上山下乡真是有好处，让广大城市里的娃娃知道菜菜是怎么长出来的
avatar
l*t
174 楼
看对谁来说了
对直接当事人，估计都很enjoy啊
对间接当事人，比如楼主老公男同事媳妇，八成不太好
对打酱油的，觉得啥的都有

【在 j****i 的大作中提到】
: 这样好吗？
avatar
R*m
175 楼
你的这个就真的很恶心了 ：）
“而且在公司密闭环境里有个猛人放个屁，还不是大家一人一口就吸掉了”

【在 l*****u 的大作中提到】
: 只有施主能逼死施主。其实蔬菜水果都一样，而且水果的虫害那么厉害都是靠农药。施
: 主还是多洗多泡就好了。而且在公司密闭环境里有个猛人放个屁，还不是大家一人一口
: 就吸掉了？ Be strong. Be tough!
avatar
T*4
176 楼
就是那样子的
你如果介意的话
最好不要吃沙拉，绿叶蔬菜，（还有很多其他的别人种出来的东东，保不齐别人就那样
种出来的）
或者只吃自己种的东西

【在 B*****y 的大作中提到】
: 你是凭空想象，亲眼见过还是亲手实施过
avatar
B*y
177 楼
我是不吃沙拉，在餐馆，我不吃任何生的东西，除了水果

【在 T*******4 的大作中提到】
: 就是那样子的
: 你如果介意的话
: 最好不要吃沙拉，绿叶蔬菜，（还有很多其他的别人种出来的东东，保不齐别人就那样
: 种出来的）
: 或者只吃自己种的东西
avatar
l*d
178 楼
照吃照啦吧！
生物就是这样循环的、互相依存的。

【在 B*****y 的大作中提到】
: 我是不吃沙拉，在餐馆，我不吃任何生的东西，除了水果
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