Redian新闻
>
基因data mining很茫然啊
avatar
基因data mining很茫然啊# Biology - 生物学
g*a
1
请教:打指模的地方几点开门?
是八点吗?
查不到。
谢谢!
avatar
o*i
2
每个人都有一个一夜暴富的梦,因为很多梦想必须要有物质基础作为支撑。金钱并不会
衍生出罪恶,贪婪才会。反倒是没有金钱的世界会变成空中楼阁,所以每个人都有做着
关于金钱美梦的权利。不过今天我们就是要把美梦成真,来说说下半年发财机会最多的
星座都有谁,快做好准备吧!
一、金牛座
罗鸣老师认为,金牛座在下半年的财运可以说是让人眼红,上半年的投资会让金牛得到
一笔可观的受益。金牛最懂得先苦后甜的道理,所以一看准时机,就会节衣缩食的过日
子,把大部分积蓄用来投资或者理理财,这也就是金牛为什么明明很有钱,但却是一副
月光族的样子。因为正真有本事的人,总是很低调。
二、双子座
上半年双子座的工作热情并不高涨,所以业绩平平,反而是有一些投机取巧的嫌疑,但
是当双子得到自己人生中最多的一桶金时,很多人都会十分诧异和羡慕。原来双子在放
长线钓大鱼,他们总是不顾及眼前的蝇头小利,而是通过自己的人脉来得到更多的投资
机会,所以才会拥有更多的发财机会。
下半年最多发财机会的星座有哪些?
三、狮子座
狮子座在下半年的财运可以说是近几年的新高。如果狮子座打算创业就一定要把握好下
半年的机会,因为在下半年狮子座总是出门遇贵人,不仅得到多方提点,还会得到可观
的资金支持。如果没有创业的打算,也一定要把握好投资的机会,通过朋友多方了解消
息,也是得到发财机会的重中之重。有一个年轻的老板,在广州花巨资买下了一个旺铺
,但是生意却一直冷冷清清,不管他在宣传方面投入了多少钱财。他很失望,压力也越
来越大。最终他通过玄佛服务网联系了罗鸣老师,请求帮他摆脱现在的状况。在罗鸣老
师的建议下,他做了店铺风水调整。后来,他反馈,几个月后,越来越多的客人到店里
来,两年后,他开了三家连锁店。
四、天蝎座
天蝎座上半年的财运也不再少数,但都是通过自己多年积累的人脉和眼光得来的,不过
也多是一些小财运。而到了下半年,天蝎座会有很多发横财的机会,比如说中奖率超高
,甚至高的天蝎自己都会有些诧异。但是好运气来了,谁也挡不住。不过需要提醒天蝎
的是在有大笔资金之后,谨慎投资。
下半年最多发财机会的星座有哪些?
五、摩羯座
罗鸣老师指出,摩羯在下半年不仅有财运,还有官运。一直踏实本分的摩羯会在下半年
迎来事业上的春天,因为在工作的变动中,摩羯很容易遇到自己的伯乐,因此随着工作
的升职,财运自然也会随之而来。虽然工作量有所增多,但是看着高收入的摩羯也是应
该平衡的。需要提醒摩羯的是,一定要寻求稳定,不能因为眼前利益而轻易跳槽。
avatar
C*d
3
自上次在Amazon卖掉了4S之后,买了lumia920,当时pre-order的,只是看好了cyan的
颜色和那个相机
拿到机器之后,相机表现确实不一般,比4S好,比当时任何一款手机除了那个808都好。
但是用了两个月,发现这个windows phone的大方格子,看着实在有点无趣,而且没有
背景图案,设置主题什么颜色方格子就是啥颜色的了。虽然有人说,iphone、android
的图标也挡住了他们的背景图案,但是这个感觉真不一样
虽然大部分app在windows上都有,可总感觉有些别扭。
windows phone总体来说就是比较单调,尤其是那些个大方格子,还有那个右边的一排
列表。。
avatar
a*y
4
有一些病人transcriptome的数据
虽然有证据标明我们的样本似乎有一些marker和糖尿病有关,但是我们做的其实完全不
是糖尿病。
所以当分析这些microarray data的时候,一个很长的list,有不同的参数可以重新排
列看那些基因比较重要。
但是很常见的情况是,往往排在最前面的是一些和糖尿病,metabolic syndrome,甚至
癌症有关的基因。
不知道是因为研究肥胖,心脏病,糖尿病的实验多,导致随便找个基因就是类似的
association就出来了,还是真的这些基因在我们研究的问题上也有作用……是不是癌
症糖尿病肥胖研究带来的annotation bias啊?
怎么办啊……
avatar
g*e
5
我的要求也是八点
但是我提前一天去了
根本没有人
他们很清闲
avatar
l*r
6
又用回5了?

好。
android

【在 C***d 的大作中提到】
: 自上次在Amazon卖掉了4S之后,买了lumia920,当时pre-order的,只是看好了cyan的
: 颜色和那个相机
: 拿到机器之后,相机表现确实不一般,比4S好,比当时任何一款手机除了那个808都好。
: 但是用了两个月,发现这个windows phone的大方格子,看着实在有点无趣,而且没有
: 背景图案,设置主题什么颜色方格子就是啥颜色的了。虽然有人说,iphone、android
: 的图标也挡住了他们的背景图案,但是这个感觉真不一样
: 虽然大部分app在windows上都有,可总感觉有些别扭。
: windows phone总体来说就是比较单调,尤其是那些个大方格子,还有那个右边的一排
: 列表。。

avatar
l*1
7
pay USDollar 2K per year to KEGG
then dig deeper mining data etc
according to below paper:
//jaguar.biologie.hu-berlin.de/~schaber/papers/Schaber2009IETSB.pdf
its Fig. 2
or this Master dissertation:
//etd.ohiolink.edu/send-pdf.cgi/Ananthanpillai%20Balaji.pdf?ucin1259080814
also please refer below figure:
cited from Book Chapter:
//www.intechopen.com/books/data_mining_and_knowledge_discovery_in_real_life_applications/data_minin
g_in_the_molecular_biology_era_-_a_study_directed_to_carbohydrates_biosynthesis_and_accu
last please go to:
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31648237.html
3rd floor
NB:
if without their ID from KEGG
please try HUGO and Uniport etc for get all IDs
//www.uniprot.org/help/about
//www.hugo-international.org/index.php

【在 a***y 的大作中提到】
: 有一些病人transcriptome的数据
: 虽然有证据标明我们的样本似乎有一些marker和糖尿病有关,但是我们做的其实完全不
: 是糖尿病。
: 所以当分析这些microarray data的时候,一个很长的list,有不同的参数可以重新排
: 列看那些基因比较重要。
: 但是很常见的情况是,往往排在最前面的是一些和糖尿病,metabolic syndrome,甚至
: 癌症有关的基因。
: 不知道是因为研究肥胖,心脏病,糖尿病的实验多,导致随便找个基因就是类似的
: association就出来了,还是真的这些基因在我们研究的问题上也有作用……是不是癌
: 症糖尿病肥胖研究带来的annotation bias啊?

avatar
w*t
8
那不是单调,是个性。

好。
android

【在 C***d 的大作中提到】
: 自上次在Amazon卖掉了4S之后,买了lumia920,当时pre-order的,只是看好了cyan的
: 颜色和那个相机
: 拿到机器之后,相机表现确实不一般,比4S好,比当时任何一款手机除了那个808都好。
: 但是用了两个月,发现这个windows phone的大方格子,看着实在有点无趣,而且没有
: 背景图案,设置主题什么颜色方格子就是啥颜色的了。虽然有人说,iphone、android
: 的图标也挡住了他们的背景图案,但是这个感觉真不一样
: 虽然大部分app在windows上都有,可总感觉有些别扭。
: windows phone总体来说就是比较单调,尤其是那些个大方格子,还有那个右边的一排
: 列表。。

avatar
s*a
9
KEGG is never the best source of transcriptomic analysis.
Pay me $2K, I will give you the analysis in 24 hrs. LOL
But seriously, find some help in stead of wasting time.
avatar
a*y
10
用过Windows Phone 7就知道不用上8了。

好。
android

【在 C***d 的大作中提到】
: 自上次在Amazon卖掉了4S之后,买了lumia920,当时pre-order的,只是看好了cyan的
: 颜色和那个相机
: 拿到机器之后,相机表现确实不一般,比4S好,比当时任何一款手机除了那个808都好。
: 但是用了两个月,发现这个windows phone的大方格子,看着实在有点无趣,而且没有
: 背景图案,设置主题什么颜色方格子就是啥颜色的了。虽然有人说,iphone、android
: 的图标也挡住了他们的背景图案,但是这个感觉真不一样
: 虽然大部分app在windows上都有,可总感觉有些别扭。
: windows phone总体来说就是比较单调,尤其是那些个大方格子,还有那个右边的一排
: 列表。。

avatar
a*y
11
啊。
KEGG貌似有用不过不免费了的话我也没经费subscribe啊。
其他的看起来慢复杂的。但是我大概明白了你的意思。
UniProt我再细细研究一下。

life_applications/data_minin

【在 l**********1 的大作中提到】
: pay USDollar 2K per year to KEGG
: then dig deeper mining data etc
: according to below paper:
: //jaguar.biologie.hu-berlin.de/~schaber/papers/Schaber2009IETSB.pdf
: its Fig. 2
: or this Master dissertation:
: //etd.ohiolink.edu/send-pdf.cgi/Ananthanpillai%20Balaji.pdf?ucin1259080814
: also please refer below figure:
: cited from Book Chapter:
: //www.intechopen.com/books/data_mining_and_knowledge_discovery_in_real_life_applications/data_minin

avatar
C*d
12
木有,用着棒子的note

【在 l*****r 的大作中提到】
: 又用回5了?
:
: 好。
: android

avatar
a*y
13
数据是已经被biostatistician/informatician分析过了
但是接下来就是要make sense那些基因真的有意义,这个貌似别人也没法帮忙
因为课题还是很新的领域,literature search也没有发现有多少相关的研究
扫过这些gene list的时候,很多有微弱证据表明和我最开始提到的疾病有关,所以我
不知道是因为这些annotation是已经biased towards这些疾病,还是真的就是相关。
所以之前lotkaeuler11的意思大概是放到network里面看看,如果我读懂了的话。
参数是有了,可以根据不同的标准进行rank,但是还是只能人工的一个一个的把top
candidate细看才知道有没有价值吧?

【在 s******a 的大作中提到】
: KEGG is never the best source of transcriptomic analysis.
: Pay me $2K, I will give you the analysis in 24 hrs. LOL
: But seriously, find some help in stead of wasting time.

avatar
C*d
14
那我宁愿不要这个个性,无聊的个性会被人喜欢么?

【在 w******t 的大作中提到】
: 那不是单调,是个性。
:
: 好。
: android

avatar
a*y
15
HUGO上有什么resources,没看到啊

life_applications/data_minin

【在 l**********1 的大作中提到】
: pay USDollar 2K per year to KEGG
: then dig deeper mining data etc
: according to below paper:
: //jaguar.biologie.hu-berlin.de/~schaber/papers/Schaber2009IETSB.pdf
: its Fig. 2
: or this Master dissertation:
: //etd.ohiolink.edu/send-pdf.cgi/Ananthanpillai%20Balaji.pdf?ucin1259080814
: also please refer below figure:
: cited from Book Chapter:
: //www.intechopen.com/books/data_mining_and_knowledge_discovery_in_real_life_applications/data_minin

avatar
C*d
16
好吧,反正我是体会到了windows phone的无聊之处了

【在 a***y 的大作中提到】
: 用过Windows Phone 7就知道不用上8了。
:
: 好。
: android

avatar
j*p
17
Try DAVID (there is KEGG pathway) or ingenuity pathway analysis and get your
genelist ranked in someway. Instead of trying them one by one blindly, you
need to kind of having an idea to try which ones first.
avatar
d*I
18
大方格子说用来放东西的,你找的app估计都是ios上面的 copycat,才会单调。我上面
weather, stock, news, photos, social不要太花哨。

好。
android

【在 C***d 的大作中提到】
: 自上次在Amazon卖掉了4S之后,买了lumia920,当时pre-order的,只是看好了cyan的
: 颜色和那个相机
: 拿到机器之后,相机表现确实不一般,比4S好,比当时任何一款手机除了那个808都好。
: 但是用了两个月,发现这个windows phone的大方格子,看着实在有点无趣,而且没有
: 背景图案,设置主题什么颜色方格子就是啥颜色的了。虽然有人说,iphone、android
: 的图标也挡住了他们的背景图案,但是这个感觉真不一样
: 虽然大部分app在windows上都有,可总感觉有些别扭。
: windows phone总体来说就是比较单调,尤其是那些个大方格子,还有那个右边的一排
: 列表。。

avatar
l*1
19
HTTPS//portal.dnb.de/resolver.htm?identifier=988098547&contentkey=34
//www.bioparadigms.org/slc/menu.asp

【在 a***y 的大作中提到】
: HUGO上有什么resources,没看到啊
:
: life_applications/data_minin

avatar
C*d
20
iOS上的copycat??
livetile是有点意思,但总有乱糟糟眼花缭乱的感觉

【在 d**********I 的大作中提到】
: 大方格子说用来放东西的,你找的app估计都是ios上面的 copycat,才会单调。我上面
: weather, stock, news, photos, social不要太花哨。
:
: 好。
: android

avatar
l*1
21
Bingo
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2561161/
To LZ
plus this one:
//idconverter.bioinfo.cnio.es/

your
you

【在 j*p 的大作中提到】
: Try DAVID (there is KEGG pathway) or ingenuity pathway analysis and get your
: genelist ranked in someway. Instead of trying them one by one blindly, you
: need to kind of having an idea to try which ones first.

avatar
a*y
22
根本就是这样的。
眼花缭乱不是好事。

【在 C***d 的大作中提到】
: iOS上的copycat??
: livetile是有点意思,但总有乱糟糟眼花缭乱的感觉

avatar
l*1
23
Oui.
Especially transporter protein/s whom might be/are relative to that/those target gene/s..
.
BTW, if you got break, BAO ZI One please transfer to my mitbbs financial account
W-E-I-B-I ten .
>回复]
0
[ 5 ]
发信人: aaaty (阿fan提), 信区: Biology
标 题: Re: 基因data mining很茫然啊
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Mar 26 14:48:08 2012, 美东)
数据是已经被biostatistician/informatician分析过了
但是接下来就是要make sense那些基因真的有意义,这个貌似别人也没法帮忙
因为课题还是很新的领域,
所以之前lotkaeuler11的意思大概是放到network里面看看,如果我读懂了的话。
avatar
d*k
24
我觉得习惯了还好啦,livetile算是wp里最有新意的东西了。如果比较闲,好好调整一
下配色,把People,me,weather,stock,news这些好好排个版视觉效果还是不错的。
iphone发布都6年了,九宫图的界面基本没变过。将来肯定也会上大的动态icon.这是趋
势,就看AMG哪一家能先找到最合理让用户满意的设计,然后其他两家再跟进copy.
另外:夸wp一下:pin很实用,我把nokia drive的常用线路和几个网页直接pin到了桌面
。再骂一下: apps还是不给力,比如微信,功能就是iphone版的零头。搞得我周末在
家都是拿领导的4s和同学们聊天。

【在 C***d 的大作中提到】
: iOS上的copycat??
: livetile是有点意思,但总有乱糟糟眼花缭乱的感觉

avatar
a*y
25
I see. Thanks. I think the bioinformatician already tried to look at it from
pathway perspective and only found one pathway that seem to correlate, and
we are little puzzled by why that is the only one.
I can try the tools you mentioned. Ingenuity is kind of expensive, at lab
lunch they were talking about buying one license but I don't know what would
happen.

your
you

【在 j*p 的大作中提到】
: Try DAVID (there is KEGG pathway) or ingenuity pathway analysis and get your
: genelist ranked in someway. Instead of trying them one by one blindly, you
: need to kind of having an idea to try which ones first.

avatar
C*d
26
哦对了,忘了说了,nokia drive还是相当棒的

【在 d******k 的大作中提到】
: 我觉得习惯了还好啦,livetile算是wp里最有新意的东西了。如果比较闲,好好调整一
: 下配色,把People,me,weather,stock,news这些好好排个版视觉效果还是不错的。
: iphone发布都6年了,九宫图的界面基本没变过。将来肯定也会上大的动态icon.这是趋
: 势,就看AMG哪一家能先找到最合理让用户满意的设计,然后其他两家再跟进copy.
: 另外:夸wp一下:pin很实用,我把nokia drive的常用线路和几个网页直接pin到了桌面
: 。再骂一下: apps还是不给力,比如微信,功能就是iphone版的零头。搞得我周末在
: 家都是拿领导的4s和同学们聊天。

avatar
a*y
27
what is your financial account?
lotkaeuler11?

target gene/s..
account

【在 l**********1 的大作中提到】
: Oui.
: Especially transporter protein/s whom might be/are relative to that/those target gene/s..
: .
: BTW, if you got break, BAO ZI One please transfer to my mitbbs financial account
: W-E-I-B-I ten .
: >回复]
: 0
: [ 5 ]
: 发信人: aaaty (阿fan提), 信区: Biology
: 标 题: Re: 基因data mining很茫然啊

avatar
k*i
28
苹果用惯了确实很舒服,目前问题是屏幕太小,触屏灵感度比起nokia差,打字很不方
便,lumia的灵感读超爽,发短信微博什么的很舒服,懒得用手指时,就直接拿个咖啡
勺拨了,nb的很。 感觉lumia更适合商业男性使用,屏幕大,有分量,拿着像个男人,
功能界面直接了当,务实快速。苹果总体来说肯定比棒子三星的好,只是几年用同一款
手机太out了,光内部升级,就像旧房子翻新一样,太没劲了。棒子的三星用着更烦,
除了屏幕大,几乎没优点,安卓程序乱七八糟,屏幕放满就觉得眼花,屏幕没有脸部防
触摸功能,贴着脸打电话就会启动屏幕,下面的两个触摸按键过于敏感,不小心就会按
到不该按到返回键。还有开关键的位置也很二,照相时很容易不小心按关机,用的爷很
不爽。
avatar
a*y
29
Thanks. this ID converter is super helpful
I was actually searching for a tool to convert affymetrix ID to other IDs.

【在 l**********1 的大作中提到】
: Bingo
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2561161/
: To LZ
: plus this one:
: //idconverter.bioinfo.cnio.es/
:
: your
: you

avatar
l*1
30
yes

【在 a***y 的大作中提到】
: what is your financial account?
: lotkaeuler11?
:
: target gene/s..
: account

avatar
l*1
31
De rien.

【在 a***y 的大作中提到】
: Thanks. this ID converter is super helpful
: I was actually searching for a tool to convert affymetrix ID to other IDs.

avatar
l*1
32
LZ你上哪个HUGO网站啦?
please go to:
//www.genenames.org/
or
//www.avatar.se/xref/wr/index
or
//www.ebi.ac.uk/uniprot/
then you never say that "HUGO上有什么resources,没看到啊" again

【在 a***y 的大作中提到】
: HUGO上有什么resources,没看到啊
:
: life_applications/data_minin

avatar
h*c
33
ingenuity only makes you feel even more confused, trust me....david is a
good resource, there is another tool called toppsuite is another option
相关阅读
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章,不代表同意其说法或描述,仅为提供更多信息,也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责,与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿,如发现稿件侵权,或作者不愿在本网发表文章,请版权拥有者通知本网处理。