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Quantification of western blot 的困惑
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Quantification of western blot 的困惑# Biology - 生物学
a*n
1
六相缘起三门分别:初,列名略释;二,明教兴意;三,问答解释。
初,列名者。
谓总相,别相,同相,异相,成相,坏相。
总相者,一舍多德故。别相者,多德非一故。别依比总,满彼总故。同相者,多义不相
违,同成一总故。异相者,多义相望,各各异故。成相者,由此诸缘起成故。坏相者,
诸义各住自法不移动故。
第二,教兴意者。
此教为显一乘圆教、法界缘起无尽、圆融自在、相即无碍镕融乃至因陀罗无穷理事等。
此义现前,一切惑障一断一切断,得九世十世惑灭。行德即一成一切成。理性即一显一
切显。并普别具足,始终皆齐。初发心时便成正觉。良由如是法界缘起,六相镕融,因
果同时,相即自在,具足逆顺。因即普贤解行及以证入。果即十佛境界所显无穷。广如
《华严经》说。
第三,问答解释者。
然缘起法一切处通,今且略就缘成舍辨。
问:何者是总相?
答:舍是。
问:此但椽等诸缘。何者是舍耶?
答:椽即是舍。何以故?为椽全自独能作舍故。若离于椽,舍即不成。若得椽时,即得
舍矣。
问:若椽全自独作舍者,未有瓦等亦应作舍。
答:未有瓦等时,不是椽故不作。非谓是椽而不能作。今言能作者,但论椽能作,不说
非椽作。何以故?椽是因缘。由未成舍时无因缘故,非是椽也。若是椽者,其毕全成。
若不全成,不名为椽。
问:若椽等诸缘,各出少力,共作不全作者。有何过失?
答:有断常过。若不全成但少力者,诸缘各少力。此但多个少力,不成一全舍,故是断
也。诸缘并少力,皆无全成,执有全舍者,无因有故,是其常也。若不全成者,去却一
椽时,舍应犹在。舍既不全成,故知非少力并全成也。
问:无一椽时岂非舍耶?
答:但是破舍,无好舍也。故知好舍全属一椽。既属一椽故,知椽即是舍也。
问:舍既即是椽者。余板瓦等应即是椽耶?
答:总并是椽。何以故?去却椽即无舍故。所以然者,若无椽即舍坏。舍坏故,不名板
瓦等。是故板瓦等即是椽也。若不即椽者,舍即不成,椽瓦等并皆不成。今既并成,故
知相即耳。一椽既尔,余椽例然。是故一切缘起法不成则已,成则相即镕融,无碍自在
,圆极难思,出过情量。法性缘起一切处准知。
第二,别相者。
椽等诸缘别于总故。若不别者,总义不成。由无别时,即无总故。此义云何?本以别成
总,由无别故,总不成也。是故别者,即以总成别也。
问:若总即别者,应不成总耶?
答:由总即别故,是故得成总。如椽即是舍,故名总相。即是椽故,名别相。若不即舍
,不是椽。若不即椽,不是舍。总别相即,此可思之。
问:若相即者,云何说别?
答:秖由相即,是故成别。若不相即者,总在别外,故非总也。别在总外,故非别也。
思之可解。
问:若不别者有何过耶?
答:有断常过。若无别者,即无别椽瓦。无别椽瓦故,即不成总舍,故此断也。若无别
椽瓦等,而有总舍者,无因有舍,是常过也。
第三,同相者。
椽等诸缘和同作舍,不相违故,皆名舍缘,非作余物,故名同相也。
问:此与总相何别耶?
答:总相唯望一舍说。今此同相约椽等诸缘,虽体各别,成力义齐故,名同相也。
问:若不同者有何过耶?
答:若不同者,有断常过也。何者?若不同者,椽等诸义互相违背,不同作舍。舍不得
有,故是断也。若相违不作舍,而执有舍者,无因有舍,故是常也。
第四,异相者。
椽等诸缘,随自形类相望差别故。
问:若异者应不同耶?
答:秖由异故,所以同耳。若不异者,椽既丈二,瓦亦应尔,坏本缘法故,失前齐同成
舍义也。今既舍成,同名缘者,当知异也。
问:此与别相有何异耶?
答:前别相者,但椽等诸缘别于一舍,故说别相。今异相者,椽等诸缘迭互相望,各各
异相也。
问:若不异者,有何过失耶?
答:有断常过。何者?若不异者,瓦即同椽丈二,坏本缘法,不共成舍,故是断。若坏
缘不成舍,而执有舍者,无因有舍,故是常也。
第五,成相者。
由此诸缘,舍义成故。由成舍故,椽等名缘。若不尔者,二俱不成。今现得成故,知成
相互成之耳。
问:现见椽等诸缘,各住自法,本不作舍。何因得有舍义成耶?
答:秖由椽等诸缘不作故,舍义得成。所以然者,若椽作舍去,即失本椽法故,舍义不
得成。今由不作故,椽等诸缘现前故,由此现前故,舍义得成矣。又若不作舍,椽等不
名多缘。今既得缘名,明知定作舍。
问:若不成者,何过失耶?
答:有断常过。何者?舍本依椽等诸缘成,今既并不作,不得有舍故,是断也。本以缘
成舍名为椽,今既不作舍,故无椽,是断。若不成者,舍无因有,故是常也。又椽不作
舍,得椽名者,亦是常也。
第六,坏相者。
椽等诸缘各住自法,本不作故。
问:现见椽等诸缘作舍成就,何故乃说本不作耶?
答:秖由不作故,舍法得成。若作舍去,不住自法有舍义即不成。何以故?作去失法,
舍不成故。今既舍成,明知不作也。
问:若作去有何失?
答:有断常二失。若言椽作舍去,即失椽法。失椽法故,舍即无椽不得有,是断也。若
失椽法而有舍者,无椽有舍是常也。
又总即一舍,别即诸缘;同即互不相违,异即诸缘各别;成即诸缘办果,坏即各住自法
。别为颂曰:
一即具多名总相  多即非一是别相  多类自同成于总  各体别异现于同
一多缘起理妙成  坏住自法常不作  唯智境界非事识  以此方便会一乘
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l*n
2
近期投的一篇稿件。
Statistical reviewer认为western和qPCR样本小, quantification的图应该用 dot
diagram 而不是 bar graph。
我翻遍了文献看到的western和qPCR都是用bar graph啊。该怎么回他啊。谢谢了!
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T*i
3
非原则性问题,又不费劲,就别跟reviewer挣了。

【在 l****n 的大作中提到】
: 近期投的一篇稿件。
: Statistical reviewer认为western和qPCR样本小, quantification的图应该用 dot
: diagram 而不是 bar graph。
: 我翻遍了文献看到的western和qPCR都是用bar graph啊。该怎么回他啊。谢谢了!

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l*n
4
说得也对,只是觉得这样的话很怪异

【在 T****i 的大作中提到】
: 非原则性问题,又不费劲,就别跟reviewer挣了。
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A*y
5
Are you trying to look for 20% change? It is not REAL :(
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m*n
6
lz问一个问题,你们一般是怎么做wb条带浓度分析的啊,imagej吗?我们实验室都没人
做wb,然后现在实验结果我都不知道怎么数量化,是取条带中间最浓的一块算pixel还
是整个条带的的面积和浓度呀?求指导~~~谢谢~~~
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h*o
7
why?
有些东西能有20%变化就不错了
那种manipulate system达到100%或者更高的system才是NOT real呢

【在 A******y 的大作中提到】
: Are you trying to look for 20% change? It is not REAL :(
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l*n
8
对,我用imageJ,测整条带的density。
这里有教程:
http://d.dxy.cn/preview/1738439

【在 m******n 的大作中提到】
: lz问一个问题,你们一般是怎么做wb条带浓度分析的啊,imagej吗?我们实验室都没人
: 做wb,然后现在实验结果我都不知道怎么数量化,是取条带中间最浓的一块算pixel还
: 是整个条带的的面积和浓度呀?求指导~~~谢谢~~~

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l*n
9
说实话20%左右的变化我也是不信的,western个人感觉要肉眼就能看到差别才算真有改
变。很多文章其实western都不做quantification。

【在 A******y 的大作中提到】
: Are you trying to look for 20% change? It is not REAL :(
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D*a
10
现在很多机器可以拍照和定量,应该比imageJ准确,imageJ貌似只能到255。

【在 m******n 的大作中提到】
: lz问一个问题,你们一般是怎么做wb条带浓度分析的啊,imagej吗?我们实验室都没人
: 做wb,然后现在实验结果我都不知道怎么数量化,是取条带中间最浓的一块算pixel还
: 是整个条带的的面积和浓度呀?求指导~~~谢谢~~~

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m*n
11

谢谢啦,先学习一下看看~~~

【在 l****n 的大作中提到】
: 对,我用imageJ,测整条带的density。
: 这里有教程:
: http://d.dxy.cn/preview/1738439

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m*n
12

我也最好机器能帮我测好,不过貌似这里大家都不知道咋弄~~~

【在 D*a 的大作中提到】
: 现在很多机器可以拍照和定量,应该比imageJ准确,imageJ貌似只能到255。
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D*a
13
这话说的,难道不都是看机器的说明书学?

【在 m******n 的大作中提到】
:
: 我也最好机器能帮我测好,不过貌似这里大家都不知道咋弄~~~

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g*5
14
Licor...
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