1Science2Cell vs Plos One - 未名空间MITBBS历史存档

1Science2Cell vs Plos One# Biology - 生物学

G*52012-11-02 07:11

1 楼

比如跳槽了的人，之前买的设备可不可以带走呢？
我觉得用startup或者其它学校的钱买的东西是要留下来的，但是用自己申请到的
federal money买的设备呢？
以前学校的老板接手过隔壁lab跳槽后留下的东西，记不清是startup还是NSF的钱买的
了。现在我的lab的前PI跳走了，只留下一堆书，我还考虑要不要写个邮件给人家寄过
去。。

b*n2012-11-02 07:11

2 楼

1 Science 2 Cell papers:
Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
3deprivation. Science 293: 829–834.
Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
1293–1305.
Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.
Plos one paper:
Correnti, C., V. Richardson, A. K. Sia, A. D. Bandaranayake, M. Ruiz, Y.
Suryo Rahmanto, Z. Kovacevic, M. C. Clifton, M. A. Holmes, B. K. Kaiser, J.
Barasch, K. N. Raymond, D. R. Richardson & R. K. Strong, (2012) Siderocalin/
Lcn2/NGAL/24p3 does not drive apoptosis through gentisic acid mediated iron
withdrawal in hematopoietic cell lines. PloS one 7: e43696.
1Science+2 Cell papers就是讲了这么一个story，发现内源性能结合铁离子的小分子
化合物A可以结合蛋白质B，然后A+B可以被细胞表面受体R识别，从而进出细胞导致铁离
子的进出细胞，从而更改细胞的凋亡状态（比如过量外源性B能诱导凋亡）。还鉴定出A
的合成蛋白X，是细菌中某蛋白Y的homolog。
Plos one Paper开始了全盘否定，首先说根据化学结构常识分析来说A+B是不能被R结合
的，接下来又验证A是不能跟铁结合的，B也不能跟R结合，过量B不能诱导凋亡。合成蛋
白X其实不是Y的homolog，应该是Z的homolog。一系列分析和实验数据直指Science+
2Cell文章逻辑上有毛病，结果被否定（不是简单说不能重复）。
咱们看热闹的主要是看对阵双方大佬，Science+2Cell的通讯作者是HHMI，Plos one的
通讯作者是一比较牛的结构生物学家，感觉声势不够拉上了院士。
接下来要看HHMI方如何应招了。

G*52012-11-02 07:11

3 楼

自己消灭零回复。。

q*g2012-11-02 07:11

4 楼

有意思。是不是因为别的杂志都不接受，一怒之下投了PLOS ONE?

s*s2012-11-02 07:11

5 楼

很有可能。很多时候，编辑就一句话，解释一下为啥你的结果和xx不一样。
估计作者心里都在骂，凭啥就不能是xx在瞎做

【在 q******g 的大作中提到】

: 有意思。是不是因为别的杂志都不接受，一怒之下投了PLOS ONE?

s*a2012-11-02 07:11

6 楼

第一作者居然是一个人

IL-
mammalian

【在 b******n 的大作中提到】

: 1 Science 2 Cell papers:
: Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
: apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
: 3deprivation. Science 293: 829–834.
: Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
: lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
: 1293–1305.
: Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
: siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
: enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.

n*k2012-11-02 07:11

7 楼

有点意思，搬个板凳等下文。

n*k2012-11-02 07:11

8 楼

通常经过n个人手连续几篇cns下来的story还被人pia的机会比较小，你懂得。。。。。。

【在 s******a 的大作中提到】

: 第一作者居然是一个人
:
: IL-
: mammalian

a*k2012-11-02 07:11

9 楼

话说Michael Green也是奇葩，CNS发了无数，引用也不错，混了这么多年都没有院士。
内行人说说为啥？

IL-
mammalian

【在 b******n 的大作中提到】

: 1 Science 2 Cell papers:
: Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
: apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
: 3deprivation. Science 293: 829–834.
: Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
: lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
: 1293–1305.
: Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
: siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
: enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.

K*42012-11-02 07:11

10 楼

3篇magazine papers的一座是老印
不用看了。

IL-
mammalian

【在 b******n 的大作中提到】

: 1 Science 2 Cell papers:
: Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
: apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
: 3deprivation. Science 293: 829–834.
: Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
: lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
: 1293–1305.
: Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
: siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
: enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.

u*d2012-11-02 07:11

11 楼

lol

【在 K**4 的大作中提到】

: 3篇magazine papers的一座是老印
: 不用看了。
:
: IL-
: mammalian

b*s2012-11-02 07:11

12 楼

先看看无数的CNS是什么就知道了，尤其第一作者
列子先：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18267069
Oncogenic BRAF Induces Senescence and Apoptosis through Pathways Mediated by
the Secreted Protein IGFBP7
Narendra Wajapeyee1, Ryan W. Serra1, Xiaochun Zhu1, Meera Mahalingam2 and
Michael R. Green1, Go To Corresponding Author,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20478260
Cell. 2010 May 14;141(4):717-27.
IGFBP7 is not required for B-RAF-induced melanocyte senescence.

【在 a********k 的大作中提到】

: 话说Michael Green也是奇葩，CNS发了无数，引用也不错，混了这么多年都没有院士。
: 内行人说说为啥？
:
: IL-
: mammalian

m*82012-11-02 07:11

13 楼

这就足够了。
--------------
首先说根据化学结构常识分析来说A+B是不能被R结合
的

r*t2012-11-02 07:11

14 楼

反方才一片PLOSONE，似乎还不成气候嘛

b*n2012-11-02 07:11

15 楼

1 Science 2 Cell papers:
Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
3deprivation. Science 293: 829–834.
Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
1293–1305.
Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.
Plos one paper:
Correnti, C., V. Richardson, A. K. Sia, A. D. Bandaranayake, M. Ruiz, Y.
Suryo Rahmanto, Z. Kovacevic, M. C. Clifton, M. A. Holmes, B. K. Kaiser, J.
Barasch, K. N. Raymond, D. R. Richardson & R. K. Strong, (2012) Siderocalin/
Lcn2/NGAL/24p3 does not drive apoptosis through gentisic acid mediated iron
withdrawal in hematopoietic cell lines. PloS one 7: e43696.
1Science+2 Cell papers就是讲了这么一个story，发现内源性能结合铁离子的小分子
化合物A可以结合蛋白质B，然后A+B可以被细胞表面受体R识别，从而进出细胞导致铁离
子的进出细胞，从而更改细胞的凋亡状态（比如过量外源性B能诱导凋亡）。还鉴定出A
的合成蛋白X，是细菌中某蛋白Y的homolog。
Plos one Paper开始了全盘否定，首先说根据化学结构常识分析来说A是不能被B结合
的，接下来又验证A是不能跟铁结合的，B也不能跟R结合，过量B不能诱导凋亡。合成蛋
白X其实不是Y的homolog，应该是Z的homolog。一系列分析和实验数据直指Science+
2Cell文章逻辑上有毛病，结果被否定（不是简单说不能重复）。
咱们看热闹的主要是看对阵双方大佬，Science+2Cell的通讯作者是HHMI，Plos one的
通讯作者是一比较牛的结构生物学家，感觉声势不够拉上了院士。
接下来要看HHMI方如何应招了。

q*g2012-11-02 07:11

16 楼

有意思。是不是因为别的杂志都不接受，一怒之下投了PLOS ONE?

s*s2012-11-02 07:11

17 楼

很有可能。很多时候，编辑就一句话，解释一下为啥你的结果和xx不一样。
估计作者心里都在骂，凭啥就不能是xx在瞎做

【在 q******g 的大作中提到】

: 有意思。是不是因为别的杂志都不接受，一怒之下投了PLOS ONE?

s*a2012-11-02 07:11

18 楼

第一作者居然是一个人

IL-
mammalian

【在 b******n 的大作中提到】

: 1 Science 2 Cell papers:
: Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
: apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
: 3deprivation. Science 293: 829–834.
: Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
: lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
: 1293–1305.
: Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
: siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
: enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.

n*k2012-11-02 07:11

19 楼

有点意思，搬个板凳等下文。

n*k2012-11-02 07:11

20 楼

通常经过n个人手连续几篇cns下来的story还被人pia的机会比较小，你懂得。。。。。。

【在 s******a 的大作中提到】

: 第一作者居然是一个人
:
: IL-
: mammalian

a*k2012-11-02 07:11

21 楼

话说Michael Green也是奇葩，CNS发了无数，引用也不错，混了这么多年都没有院士。
内行人说说为啥？

IL-
mammalian

【在 b******n 的大作中提到】

: 1 Science 2 Cell papers:
: Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
: apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
: 3deprivation. Science 293: 829–834.
: Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
: lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
: 1293–1305.
: Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
: siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
: enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.

K*42012-11-02 07:11

22 楼

3篇magazine papers的一座是老印
不用看了。

IL-
mammalian

【在 b******n 的大作中提到】

: 1 Science 2 Cell papers:
: Devireddy LR, Teodoro JG, Richard FA, Green MR (2001) Induction of
: apoptosis by a secreted lipocalin that is transcriptionally regulated by IL-
: 3deprivation. Science 293: 829–834.
: Devireddy LR, Gazin C, Zhu X, Green MR (2005) A cell-surface receptor for
: lipocalin 24p3 selectively mediates apoptosis and iron uptake. Cell 123:
: 1293–1305.
: Devireddy, L. R., D. O. Hart, D. H. Goetz & M. R. Green, (2010) A mammalian
: siderophore synthesized by an enzyme with a bacterial homolog involved in
: enterobactin production. Cell 141: 1006-1017.

u*d2012-11-02 07:11

23 楼

lol

【在 K**4 的大作中提到】

: 3篇magazine papers的一座是老印
: 不用看了。
:
: IL-
: mammalian

b*s2012-11-02 07:11

24 楼

先看看无数的CNS是什么就知道了，尤其第一作者
列子先：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18267069
Oncogenic BRAF Induces Senescence and Apoptosis through Pathways Mediated by
the Secreted Protein IGFBP7
Narendra Wajapeyee1, Ryan W. Serra1, Xiaochun Zhu1, Meera Mahalingam2 and
Michael R. Green1, Go To Corresponding Author,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20478260
Cell. 2010 May 14;141(4):717-27.
IGFBP7 is not required for B-RAF-induced melanocyte senescence.

【在 a********k 的大作中提到】

: 话说Michael Green也是奇葩，CNS发了无数，引用也不错，混了这么多年都没有院士。
: 内行人说说为啥？
:
: IL-
: mammalian

m*82012-11-02 07:11

25 楼

这就足够了。
--------------
首先说根据化学结构常识分析来说A+B是不能被R结合
的

r*t2012-11-02 07:11

26 楼

反方才一片PLOSONE，似乎还不成气候嘛

f*r2012-11-02 07:11

27 楼

看看pten ub 那个才叫牛鼻呢

o*d2012-11-02 07:11

28 楼

ZKSS?

【在 f*****r 的大作中提到】

: 看看pten ub 那个才叫牛鼻呢