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问问 Cre lox system driven by tamoxifen negative control 问题
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问问 Cre lox system driven by tamoxifen negative control 问题# Biology - 生物学
K*R
1
我在想一个问题,现在都做tamoxifen 去敲出基因。 一个加过tamoxifen 一个没有,
然后用sequencing 或者其他技术比如western测试下游信号变化。
但是我想,如果到到时候会有人质疑你数据 因为一个你加过tamoxifen,很可能是
tamoxifen引起的,这个还挺难解释的。
如果这样,那我做RNA-seq 是不是还的加上一个tamoxifen处理WT mouse的,然后用
treatment group信号减去negative control 然后在和control比?
但是似乎很少看有人这么做?
谢谢
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t*k
2
Compare mice group A and B after tamoxifen treatment:
Group A genotype: tamoxifen-Cre+ Flox/flox
Group B genotype: flox/flox
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K*R
3
谢谢您,
另外 那如果用 Cre做control是不是更好?
我看过还有些人是这样做的, 首先用WT加tamoxifen和不加,在用lox system 加
tamoxifen和不加。 发现WT 加和不加变化不大, 然后两个图同时放上去。
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n*3
4
我认为用cre作对照要好。许多文章已经发现cre对一些细胞有毒性,如果你的细胞对
cre敏感,建议用cre only做对照

【在 K**R 的大作中提到】
: 谢谢您,
: 另外 那如果用 Cre做control是不是更好?
: 我看过还有些人是这样做的, 首先用WT加tamoxifen和不加,在用lox system 加
: tamoxifen和不加。 发现WT 加和不加变化不大, 然后两个图同时放上去。

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