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请教 microarry 的结果该做哪些分析，及某些信息栏的问题？

请教 microarry 的结果该做哪些分析，及某些信息栏的问题？# Biology - 生物学

h*d2013-07-30 07:07

1 楼

上个月底refinance的，从FHA转到conventional。
当时盘算着，可以把FHA的upfront mortgage insurance拿回来，买房和refinance的br
oker都说没问题
可是昨天打电话到HUD一问，现在FHA refinance成非FHA的loan，已经不给退保险了，损
失了几千...
也怪我事先没做好功课...给大家提个醒

b*n2013-07-30 07:07

2 楼

刚做完array工作，芯片是Affymetrix GeneChip Mouse 2.0ST. ，实验设计简单，只有
两组各四例。Facility 捎带给做了Class Comparison，列出了近八百个基因有变化。
结果很好，但老板仅有Class Comparison分析很不以为然，我自己也是第一次做，请问
我该进一步做哪些什么分析？
有些p-value, fold change变化位前的探针在基因身份栏和简称栏缺失，如何填补，或
找到sequence 自己 blast, 叩谢

c*e2013-07-30 07:07

3 楼

多往好处想呗，从FHA到conventional，至少你会少付不少利息吧。

br
，损

【在 h****d 的大作中提到】

: 上个月底refinance的，从FHA转到conventional。
: 当时盘算着，可以把FHA的upfront mortgage insurance拿回来，买房和refinance的br
: oker都说没问题
: 可是昨天打电话到HUD一问，现在FHA refinance成非FHA的loan，已经不给退保险了，损
: 失了几千...
: 也怪我事先没做好功课...给大家提个醒

B*m2013-07-30 07:07

4 楼

用过一次affymetrix的芯片，很不喜欢。确实很多probe set没有明确标注。对于这些
probe set，你可以到affymetrix的官方网站上搜索信息（需要注册）。在他们的官网
上，每个probe set都会有个链接，连到gemome browser上。我的经验是，如果官网上
实在没有这个probe set的信息，但是在genmome browser上这个probe set 覆盖了基
因A的一部分，那我就手动把这个probe set的对应基因标注为基因A。做这个手动工作
很烦人，所以手动查询一下变化倍数大的为止probe set 就行了，变化小的不管。
将probe set的变化转化成基因后，要用gene ontology对这些基因进行功能分类，进而
信号通路分析。

H*72013-07-30 07:07

5 楼

没看懂

br
，损

【在 h****d 的大作中提到】

b*n2013-07-30 07:07

6 楼

多谢BeCalm指教，敲这么多字，令鄙人感动不已。尤其是对标注缺失的探针，有立杆见
影的重大指导意义，再次感谢!
关于进一步分析，我们正在与一生物医学信息学部门接洽，他们说可以做statistical
analysis；然后是downstream bioinformatics mining，包括 signaling pathway, GO
enrichment 和 network analysis 等。现在我们在问他们是愿意付费服务呢，还是合
作研究。

【在 B****m 的大作中提到】

: 用过一次affymetrix的芯片，很不喜欢。确实很多probe set没有明确标注。对于这些
: probe set，你可以到affymetrix的官方网站上搜索信息（需要注册）。在他们的官网
: 上，每个probe set都会有个链接，连到gemome browser上。我的经验是，如果官网上
: 实在没有这个probe set的信息，但是在genmome browser上这个probe set 覆盖了基
: 因A的一部分，那我就手动把这个probe set的对应基因标注为基因A。做这个手动工作
: 很烦人，所以手动查询一下变化倍数大的为止probe set 就行了，变化小的不管。
: 将probe set的变化转化成基因后，要用gene ontology对这些基因进行功能分类，进而
: 信号通路分析。

l*o2013-07-30 07:07

7 楼

估计是刚开始用的fha贷款，首付不到20%, 所以付了一个保险。
refinance的时候这个保险不退。

【在 H******7 的大作中提到】

: 没看懂
:
: br
: ，损

H*72013-07-30 07:07

8 楼

如果改成普通的，后面0.5％的保险肯定取消了。但一次性交的那个相当于手续
费，当然是不退
的。

【在 l*****o 的大作中提到】

: 估计是刚开始用的fha贷款，首付不到20%, 所以付了一个保险。
: refinance的时候这个保险不退。

c*e2013-07-30 07:07

9 楼

FHA的loan只要很少的首付，但在会要求borrower在loan closing的时侯付一个upfront
mortgage insurance premium (UFMIP)，金额为贷款额的1.75%。
楼上hazard说的是将其FHA loan重贷成了conventional loan，原指望能将那个UFMIP拿
回来的，但现在不行了。

broker都说没问题
，损

【在 H******7 的大作中提到】

: 没看懂
:
: br
: ，损

l*o2013-07-30 07:07

10 楼

upfront insurance本来就是最开始一次性收的呀，不是后来每月交的。

【在 H******7 的大作中提到】

: 如果改成普通的，后面0.5％的保险肯定取消了。但一次性交的那个相当于手续
: 费，当然是不退
: 的。

l*o2013-07-30 07:07

11 楼

现在ms都涨到2.25%了, 真贵啊

upfront

【在 c**********e 的大作中提到】

: FHA的loan只要很少的首付，但在会要求borrower在loan closing的时侯付一个upfront
: mortgage insurance premium (UFMIP)，金额为贷款额的1.75%。
: 楼上hazard说的是将其FHA loan重贷成了conventional loan，原指望能将那个UFMIP拿
: 回来的，但现在不行了。
:
: broker都说没问题
: ，损

b*d2013-07-30 07:07

12 楼

你是说你以前交的保险，那个钱是不退回来的。

br
，损

【在 h****d 的大作中提到】

N*a2013-07-30 07:07

13 楼

恩，当初就是发现FHA很多陷阱，坚决没用FHA

你是说你以前交的保险，那个钱是不退回来的。
br
，损

【在 b*d 的大作中提到】

: 你是说你以前交的保险，那个钱是不退回来的。
:
: br
: ，损

d*n2013-07-30 07:07

14 楼

我们不做FHA loan，不过，考试的时候要学，没见说那个upfront mortgage insurance
是refundable的呀。