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Can I put single and pair-ended RNAseq data together in DESeq analysis

Can I put single and pair-ended RNAseq data together in DESeq analysis# Biology - 生物学

l*u2013-08-14 07:08

1 楼

看到最新的消息，说其实是陈羽凡在11年就劈腿然后15年就离婚了，结果到了17年，卓
伟这个狗仔队还爆料说白百何出轨小鲜肉，看到这个最新的八卦猛料，我觉得自己太单
纯了，太天真了。
其实羽泉组合我很喜欢的，比那好路人的喜欢要好很多，白百何也是，没想到他们生活
中也能做的比演戏还要牛逼，都离婚了，劈腿了，在人前还那么秀恩爱，这点只有娱乐
圈的人才能做到。
想起白百何与陈羽凡，我想起一个猛人，阿Sa，这妹纸结婚时候没人知道，香港狗仔队
都不知道，竟然是离婚的时候才知道她竟然结婚了，而且是嫁给了郑中基这个无赖，最
无语的是那时候很多人还在炒作郑中基与杨千嬅的八卦，这阿Sa还在笑。演技做到这一
点，我真觉得他们的演技实在不得了。
然后胡海泉这次也给你搞了一个，好多个为什么，被人说是在甩锅，这个还真不好说。

z*r2013-08-14 07:08

2 楼

问问

x*m2013-08-14 07:08

3 楼

I have RNA-seq data from Illumina GA (single-ended)and Hiseq (pair-ended).
Just wonder if I could put them together in differential gene expression
analysis. I know pair-end is much better than single-end in accuracy. But
not sure if it is reasonable to put them together in the analysis. many
thanks

R*b2013-08-14 07:08

4 楼

陈羽凡这家伙一看就像吸毒的

d*02013-08-14 07:08

5 楼

估计需要开发个ultimate版。。。

t*g2013-08-14 07:08

6 楼

u can, as long as u have the lib type accounted for
check the package vignette for a similar analysis

【在 x******m 的大作中提到】

: I have RNA-seq data from Illumina GA (single-ended)and Hiseq (pair-ended).
: Just wonder if I could put them together in differential gene expression
: analysis. I know pair-end is much better than single-end in accuracy. But
: not sure if it is reasonable to put them together in the analysis. many
: thanks

l*a2013-08-14 07:08

7 楼

这陈不是好人

B*g2013-08-14 07:08

8 楼

你太敬业了

【在 z**r 的大作中提到】

: 问问

x*m2013-08-14 07:08

9 楼

thanks for reply.
cannot find the exact tutorial for mixed single and pair-ended cases. Do you
mind show me one? many thanks.

i*y2013-08-14 07:08

10 楼

郑中基是太子爷，不然为啥歌神都捧他
阿sa也不是傻子

【在 l******u 的大作中提到】

: 看到最新的消息，说其实是陈羽凡在11年就劈腿然后15年就离婚了，结果到了17年，卓
: 伟这个狗仔队还爆料说白百何出轨小鲜肉，看到这个最新的八卦猛料，我觉得自己太单
: 纯了，太天真了。
: 其实羽泉组合我很喜欢的，比那好路人的喜欢要好很多，白百何也是，没想到他们生活
: 中也能做的比演戏还要牛逼，都离婚了，劈腿了，在人前还那么秀恩爱，这点只有娱乐
: 圈的人才能做到。
: 想起白百何与陈羽凡，我想起一个猛人，阿Sa，这妹纸结婚时候没人知道，香港狗仔队
: 都不知道，竟然是离婚的时候才知道她竟然结婚了，而且是嫁给了郑中基这个无赖，最
: 无语的是那时候很多人还在炒作郑中基与杨千嬅的八卦，这阿Sa还在笑。演技做到这一
: 点，我真觉得他们的演技实在不得了。

z*r2013-08-14 07:08

11 楼

主要奥运会弄的。qia让俺当板斧，结果发现尼玛每天的事情恨不得比得上这里一个月了

【在 B*****g 的大作中提到】

: 你太敬业了