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大家觉得哪个蛋白功能结构域的预测网站比较好用呢?
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大家觉得哪个蛋白功能结构域的预测网站比较好用呢?# Biology - 生物学
c*7
1
哦也
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y*y
2
目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
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o*e
3
操,我手贱,还验证了一下。
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c*7
5
哈哈,能开门不?

【在 o**********e 的大作中提到】
: 操,我手贱,还验证了一下。
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j*x
6
这几个prediction server各自的侧重点不同,结果不一致很正常。
如果想比较全面的分析预测目的序列中的functional motif/domain,还是得结合多种
预测工具来分析,除了SMART和Pfam,个人推荐InterPro以及LS提到的Prosite。
但预测毕竟只是预测,false positive/negative都很高,还是要靠实验证据来说明问
题。

【在 y***y 的大作中提到】
: 目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
: 构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
: 大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。

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l*r
7
me 2, ft

【在 o**********e 的大作中提到】
: 操,我手贱,还验证了一下。
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f*r
8
同意楼上说法,预测过几个,感觉不是很准~最后还是老老实实的做实验了,没敢信预
测结果~
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f*s
9
能, 但是链子不够长

【在 c*******7 的大作中提到】
: 哈哈,能开门不?
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r*e
10
好像打不开?设计有误?

【在 c*******7 的大作中提到】
: 哦也
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B*e
11


【在 c*******7 的大作中提到】
: 哦也
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i*y
12
为什么不够长?
难道你是顺着轨迹把链子铺开?

【在 f*****s 的大作中提到】
: 能, 但是链子不够长
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V*8
13
实际情况是,从右边的钩子解开。
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Z*l
14
左下角大圆圈为出口。

【在 r*********e 的大作中提到】
: 好像打不开?设计有误?
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a*s
15
笑点是,如果链子有这么长,人是可以钻进来滴。
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c*a
16
这个贴子里J点真多,笑死我了

【在 a****s 的大作中提到】
: 笑点是,如果链子有这么长,人是可以钻进来滴。
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