y*y
2 楼
目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
o*e
3 楼
操,我手贱,还验证了一下。
j*t
4 楼
j*x
6 楼
这几个prediction server各自的侧重点不同,结果不一致很正常。
如果想比较全面的分析预测目的序列中的functional motif/domain,还是得结合多种
预测工具来分析,除了SMART和Pfam,个人推荐InterPro以及LS提到的Prosite。
但预测毕竟只是预测,false positive/negative都很高,还是要靠实验证据来说明问
题。
【在 y***y 的大作中提到】
: 目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
: 构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
: 大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
如果想比较全面的分析预测目的序列中的functional motif/domain,还是得结合多种
预测工具来分析,除了SMART和Pfam,个人推荐InterPro以及LS提到的Prosite。
但预测毕竟只是预测,false positive/negative都很高,还是要靠实验证据来说明问
题。
【在 y***y 的大作中提到】
: 目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
: 构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
: 大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
f*r
8 楼
同意楼上说法,预测过几个,感觉不是很准~最后还是老老实实的做实验了,没敢信预
测结果~
测结果~
V*8
13 楼
实际情况是,从右边的钩子解开。
a*s
15 楼
笑点是,如果链子有这么长,人是可以钻进来滴。
相关阅读
比生物再定性的,就不算科学了吧生物同修们,这两天家里的网络连接都还好?发育生物学Phd找Industry job不如说说具体哪个生物领域比较容易和数学结合起来吧?美国上诉法院作出有利于干细胞研究的判决学生物的真的找不到工作吗回复那位仁兄,不同意见,求同存异。找博后遇到要先写Proposal的老板怎么办统计算不算数学?NIBS 的新 Science 文章:epigenetics,PRC2,H3K27me3问问题:去哪里查开会的信息学生物怎么规划啊,小弟有个亲戚读了生物学刚进大学我这种想法靠谱吗关于生物与数学相结合...(原楼歪的太厉害了,楼主不好意思)360行,行行出状元寻一个好kit: DNA transfection into cell lines看复旦大学教授弄虚作假,如何减少引进人才的造假行为(ZZ)用Ubuntu有什么不好的?长neurosphere老贴壁zz:北京生命科学研究所(NIBS)上半年发表的部分文章