y*y
2 楼
目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
o*e
3 楼
操,我手贱,还验证了一下。
j*t
4 楼
j*x
6 楼
这几个prediction server各自的侧重点不同,结果不一致很正常。
如果想比较全面的分析预测目的序列中的functional motif/domain,还是得结合多种
预测工具来分析,除了SMART和Pfam,个人推荐InterPro以及LS提到的Prosite。
但预测毕竟只是预测,false positive/negative都很高,还是要靠实验证据来说明问
题。
【在 y***y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png)
: 目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
: 构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
: 大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
如果想比较全面的分析预测目的序列中的functional motif/domain,还是得结合多种
预测工具来分析,除了SMART和Pfam,个人推荐InterPro以及LS提到的Prosite。
但预测毕竟只是预测,false positive/negative都很高,还是要靠实验证据来说明问
题。
【在 y***y 的大作中提到】
![](/moin_static193/solenoid/img/up.png)
: 目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
: 构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
: 大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
f*r
8 楼
同意楼上说法,预测过几个,感觉不是很准~最后还是老老实实的做实验了,没敢信预
测结果~
测结果~
V*8
13 楼
实际情况是,从右边的钩子解开。
a*s
15 楼
笑点是,如果链子有这么长,人是可以钻进来滴。
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