w*k
2 楼
正在找文献,还没有找到那个统计方法和公式合适(统计水平有限)
大概最简单的应该假定每个SNP都是50-50 heterozygous (AA, Aa, aa)
人类总共有多少SNPs
总共有多少人
或者是forensic里面match database,有多好的 power of discrimination
谢谢
大概最简单的应该假定每个SNP都是50-50 heterozygous (AA, Aa, aa)
人类总共有多少SNPs
总共有多少人
或者是forensic里面match database,有多好的 power of discrimination
谢谢
H*l
3 楼
Bose QC30/QC35
D*a
4 楼
为什么要用SNPs鉴定而不用STRs
s*m
11 楼
一副有线 Sennheiser CX 300 II
一副无线 iDeaUSA Bluetooth Headphones
一副无线 iDeaUSA Bluetooth Headphones
n*u
13 楼
飞机上QC25或者QC35,静下来不听音乐都可以。
或者好一些的入耳耳机(耳塞一样的耳机)也可以,但是必须开着声音。
或者好一些的入耳耳机(耳塞一样的耳机)也可以,但是必须开着声音。
w*k
14 楼
如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
,其中的错误的可能性小到可以忽略。
【在 D*a 的大作中提到】
: 是没做过,请问哪里错了?
是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
,其中的错误的可能性小到可以忽略。
【在 D*a 的大作中提到】
: 是没做过,请问哪里错了?
m*s
15 楼
你这个就是个概率问题了,算清楚概率就行了
如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
,其中的错误的可能性小到可以忽略。
【在 w**k 的大作中提到】
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
: 者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
: panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
,其中的错误的可能性小到可以忽略。
【在 w**k 的大作中提到】
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
: 者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
: panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
w*k
17 楼
问题就是怎么算概率,还有该要多少SNPs
X
SNP
【在 m*****s 的大作中提到】
: 你这个就是个概率问题了,算清楚概率就行了
:
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
X
SNP
【在 m*****s 的大作中提到】
: 你这个就是个概率问题了,算清楚概率就行了
:
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
a*k
18 楼
真要做的话不仅仅是概率了,SNP和种族的关系太大,多样性又不如STR。做起来有难度。
X
SNP
【在 m*****s 的大作中提到】
: 你这个就是个概率问题了,算清楚概率就行了
:
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
X
SNP
【在 m*****s 的大作中提到】
: 你这个就是个概率问题了,算清楚概率就行了
:
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
D*a
19 楼
哦对,我想错了。
hetero可以再详细分么?比如如果是A/C,按照测序原理会不会看出来是爸爸是A还是妈
妈是A?还是只能看出来是hetero呢?
X
SNP
【在 w**k 的大作中提到】
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
: 者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
: panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
hetero可以再详细分么?比如如果是A/C,按照测序原理会不会看出来是爸爸是A还是妈
妈是A?还是只能看出来是hetero呢?
X
SNP
【在 w**k 的大作中提到】
: 如果测定某个点位,两套染色体上可以是n=10种组合(4 homo and 6 hetero)。也就
: 是说,如果全世界的人都测定了这个位置,那么全世界的人可以分进这n组中某个组。
: 具体到SNP,通常某个位置上有个主要的常见的,比如C/C,一个不常见的,比如T/T。
: 常见的C/C也许是80%,T/T 20%,那就是64% CC,32% CT,4% TT的分布。
: 我的问题其实是这样的。假定我有某个人(X)的DNA,我还有一个两百万大小DNA数据
: 库。数据库里面有X的DNA。这两百万的样品都测定了某些SNPs,比如说20个吧。然后X
: 的DNA也测了这个SNP panel。我需要通过X的SNP panel结果来判定X和数据库里面的X是
: 不是同一个人。需要考虑的是我的DNA样品有可能是X的,也有可能是X的父母亲的,或
: 者兄弟姐妹的,或者邻居老王的,甚至不遗传相关的陌生人。我需要设计这么一个SNP
: panel,然后我测定X之后,可以在统计学意义上说,样品X和数据库里面的X是同一个人
g*a
21 楼
关键是选择哪几个SNP。CNV, rare variant的发生概率不一样,更何况还有linkage
disequilibrium。根本不可能按照随机事件的概率来假设。所以选择SNP很重要。这方
面应该有很多文章讨论的。DNA测试选的那几个SNP都是有原因的。话说,要达到你的目
的,直接选用那些SNP不就可以了吗?
disequilibrium。根本不可能按照随机事件的概率来假设。所以选择SNP很重要。这方
面应该有很多文章讨论的。DNA测试选的那几个SNP都是有原因的。话说,要达到你的目
的,直接选用那些SNP不就可以了吗?
w*k
22 楼
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