logo
Redian新闻
>未名空间
>Biology - 生物学
>
请教怎样从GEO数据库里下载到某一类肿瘤完整的数据？
avatar
Z*5
2 楼
GEO有没有依据肿瘤类型对数据进行分类？ 比如怎样能快速、完整地下载到breast
cancer的表达谱数据？
avatar
k*b
3 楼
不安分有什么坏处？美国的游戏规则是爱哭的孩子有糖吃，不是顺民坐等青天大老爷降
临。有的人喜欢玩犬儒主义，自己不去争取，还要嘲笑那些努力争取的人，末了再说一
句，“你看，我早就说了没戏的”，以显示自己高明。华人在美国人口丝毫不少，政治
地位几乎没有，犬儒主义功不可没。
avatar
r*0
4 楼
TCGA
avatar
m*x
5 楼
太绕了，哪位大牛概括一下文章大意？
avatar
s*s
6 楼
提醒一下，要仔细用TCGA data的话，要看一下annotation database。
否则garbage in，garbage out

【在 r******0 的大作中提到】
: TCGA
avatar
w*7
7 楼
"爱哭的孩子有糖吃"没错，但你们这是“爱幻想的孩子有糖吃”。
人数没那么多，自己又没怎么作为，就幻想着大赦老墨顺带着自己也绿了。
这种幻想要是能实现，美国就不再是美国，美国梦就变成了美国幻想。
你们这种人，就应该继续“苦熬吧”，苦熬个n年，才能让你们知道什么是可以指望的
，什么是不能指望的。

【在 k*b 的大作中提到】
: 不安分有什么坏处？美国的游戏规则是爱哭的孩子有糖吃，不是顺民坐等青天大老爷降
: 临。有的人喜欢玩犬儒主义，自己不去争取，还要嘲笑那些努力争取的人，末了再说一
: 句，“你看，我早就说了没戏的”，以显示自己高明。华人在美国人口丝毫不少，政治
: 地位几乎没有，犬儒主义功不可没。
avatar
R*n
8 楼
什么意思?你说的是临床那部分数据吧?breast应该是tcga最早完成，数据量最大的

【在 s******s 的大作中提到】
: 提醒一下，要仔细用TCGA data的话，要看一下annotation database。
: 否则garbage in，garbage out
avatar
k*o
9 楼
说好听点，
审时度势咯。
跟老墨一起斗争，我觉得是最可能成事的一个策略。
现在怎么看，老墨这个族群的政治号召力比我们抢，
一是人多，
二是只有华山一条路，人心团结

【在 w******7 的大作中提到】
: "爱哭的孩子有糖吃"没错，但你们这是“爱幻想的孩子有糖吃”。
: 人数没那么多，自己又没怎么作为，就幻想着大赦老墨顺带着自己也绿了。
: 这种幻想要是能实现，美国就不再是美国，美国梦就变成了美国幻想。
: 你们这种人，就应该继续“苦熬吧”，苦熬个n年，才能让你们知道什么是可以指望的
: ，什么是不能指望的。
avatar
Z*5
12 楼
准备把GEO的和TCGA的乳腺癌数据都整理一下。 TCGA的还没详细看，但大概知道可以整
类的下载。 GEO的自己处理了一些，但是搜索和分类有点麻烦，要是有直接分类好的
就好了。

【在 r******0 的大作中提到】
: TCGA
avatar
N*B
13 楼
绝对支持爱哭的孩子，也捐了些钱
只是不想新警察们每年看见一个法案就很兴奋，以为一定能过，回头又愤愤不平，觉得
很有道理的东西则么过不了，

【在 k*b 的大作中提到】
: 不安分有什么坏处？美国的游戏规则是爱哭的孩子有糖吃，不是顺民坐等青天大老爷降
: 临。有的人喜欢玩犬儒主义，自己不去争取，还要嘲笑那些努力争取的人，末了再说一
: 句，“你看，我早就说了没戏的”，以显示自己高明。华人在美国人口丝毫不少，政治
: 地位几乎没有，犬儒主义功不可没。
avatar
s*s
14 楼
你要表达谱的话，TCGA里面尽量用RNAseqV2, 然后把annotation里面提到的去掉。
不过,TCGA里面V2用的是mapslice＋RSEM，gene model是GAF2，单独看还行，
和其他的项目比较还有more work

【在 Z******5 的大作中提到】
: 准备把GEO的和TCGA的乳腺癌数据都整理一下。 TCGA的还没详细看，但大概知道可以整
: 类的下载。 GEO的自己处理了一些，但是搜索和分类有点麻烦，要是有直接分类好的
: 就好了。
avatar
k*b
15 楼
兴奋是兴奋，好像没见过有谁“以为一定能过”。除非是杨老师那种。如果真是“一定
能过”，那也就没必要去争取了，甚至没必要讨论了，在家等卡就是。正因为有可能不
过，所以才要尽量发动力量去争取。教育别人“安心排队”，好像没有什么建设性。

【在 N**B 的大作中提到】
: 绝对支持爱哭的孩子，也捐了些钱
: 只是不想新警察们每年看见一个法案就很兴奋，以为一定能过，回头又愤愤不平，觉得
: 很有道理的东西则么过不了，
avatar
N*B
16 楼
你提点建设性的

【在 k*b 的大作中提到】
: 兴奋是兴奋，好像没见过有谁“以为一定能过”。除非是杨老师那种。如果真是“一定
: 能过”，那也就没必要去争取了，甚至没必要讨论了，在家等卡就是。正因为有可能不
: 过，所以才要尽量发动力量去争取。教育别人“安心排队”，好像没有什么建设性。
avatar
k*b
17 楼
华人的问题不是不够安分，而是太安分。华人缺的不是冷水，而是太擅长自己给自己泼
冷水。在我看来，华人越兴奋越好，“哭”得越大声越好，这是在美国争取华人权益的
最直接方法。

【在 N**B 的大作中提到】
: 你提点建设性的
avatar
m*x
18 楼
去白宫网站I petition呼吁直接给老中发卡

【在 N**B 的大作中提到】
: 你提点建设性的
相关阅读
@!@请帮忙找几篇paper，有包子酬谢！radio probe放在scintillation fluid里有问题吗？Paper help为什么Nature审稿审了快4个月了，还没有消息啊？请教：有人知道 Johns Hopkins 的 Solomon Snyder 吗？RNAi knockdownPaper Help: Current Opinion in Oncology美国银行白金卡租车能免各种保险吗 (转载)再求病毒学文章， 请帮忙[Paper help]Can Repost some of good articles here on my blog?怎样研究一个特定转录因子的功能？中医的最高境界是不医 (转载)how to test DIRECT interations between proteins?PCR拉不出片断，求助！【菜鸟求教】维生素有效期重要吗？过期的能不能吃？区分人源肿瘤细胞和鼠的组织细胞的MARKER忠言逆耳。High-Tech Agriculturetissue distribution.
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章，不代表同意其说法或描述，仅为提供更多信息，也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责，与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿，如发现稿件侵权，或作者不愿在本网发表文章，请版权拥有者通知本网处理。