c*l
2 楼
【 以下文字转载自 Hardware 讨论区 】
发信人: coupondeal (coupon and deal), 信区: Hardware
标 题: 有人用过Herman Miller的stool吗??
发信站: BBS 未名空间站 (Wed May 4 11:42:20 2011, 美东)
有人用过Herman Miller的stool吗??
我想买一个这样的椅子
http://www.sit4less.com/products/Herman-miller/Aeron174-by-herm
miller-fully-loaded-work-stool/175
不知道版上有没有人用过,谈谈经验
发信人: coupondeal (coupon and deal), 信区: Hardware
标 题: 有人用过Herman Miller的stool吗??
发信站: BBS 未名空间站 (Wed May 4 11:42:20 2011, 美东)
有人用过Herman Miller的stool吗??
我想买一个这样的椅子
http://www.sit4less.com/products/Herman-miller/Aeron174-by-herm
miller-fully-loaded-work-stool/175
不知道版上有没有人用过,谈谈经验
s*s
3 楼
我的理解是array-based的genotyping都没法直接出ATGC的genotype, 出来的都是
cluster的AA/AB/BB。这个要变成ATGC,只有用minor allele frequency去猜,但是
maf如果接近0.5,这玩意岂不是错误很多。
就算错了,做gwas估计问题不大。但是imputation的时候,一堆正确的genotype里面
有一堆相反的,用这个数据impute,岂不是错误百出?!还是我理解有问题?
想了一下,也许这些maf接近0.5的也比较集中,另外,就算相反,maf接近0.5的对
imputation提供的information也不多(比maf0.1的少的多了),是不是这个原因
大家都不care了?
cluster的AA/AB/BB。这个要变成ATGC,只有用minor allele frequency去猜,但是
maf如果接近0.5,这玩意岂不是错误很多。
就算错了,做gwas估计问题不大。但是imputation的时候,一堆正确的genotype里面
有一堆相反的,用这个数据impute,岂不是错误百出?!还是我理解有问题?
想了一下,也许这些maf接近0.5的也比较集中,另外,就算相反,maf接近0.5的对
imputation提供的information也不多(比maf0.1的少的多了),是不是这个原因
大家都不care了?
G*y
4 楼
microarray的probe上的allele都是有定义的。你说的这种A/B互换的情况只在allele是
A/T或者C/G的位点会出现。imputation时这种位点以前是会被排除在外的。
A/T或者C/G的位点会出现。imputation时这种位点以前是会被排除在外的。
v*e
5 楼
不是猜的,厂家有manifest查表从AB到ACGT。CG和AT有可能错,用MAF检测一下。
【在 s******s 的大作中提到】
: 我的理解是array-based的genotyping都没法直接出ATGC的genotype, 出来的都是
: cluster的AA/AB/BB。这个要变成ATGC,只有用minor allele frequency去猜,但是
: maf如果接近0.5,这玩意岂不是错误很多。
: 就算错了,做gwas估计问题不大。但是imputation的时候,一堆正确的genotype里面
: 有一堆相反的,用这个数据impute,岂不是错误百出?!还是我理解有问题?
: 想了一下,也许这些maf接近0.5的也比较集中,另外,就算相反,maf接近0.5的对
: imputation提供的information也不多(比maf0.1的少的多了),是不是这个原因
: 大家都不care了?
【在 s******s 的大作中提到】
: 我的理解是array-based的genotyping都没法直接出ATGC的genotype, 出来的都是
: cluster的AA/AB/BB。这个要变成ATGC,只有用minor allele frequency去猜,但是
: maf如果接近0.5,这玩意岂不是错误很多。
: 就算错了,做gwas估计问题不大。但是imputation的时候,一堆正确的genotype里面
: 有一堆相反的,用这个数据impute,岂不是错误百出?!还是我理解有问题?
: 想了一下,也许这些maf接近0.5的也比较集中,另外,就算相反,maf接近0.5的对
: imputation提供的information也不多(比maf0.1的少的多了),是不是这个原因
: 大家都不care了?
i*e
8 楼
基本上做imputation的时候要strand flipping一下
【在 s******s 的大作中提到】
: 我的理解是array-based的genotyping都没法直接出ATGC的genotype, 出来的都是
: cluster的AA/AB/BB。这个要变成ATGC,只有用minor allele frequency去猜,但是
: maf如果接近0.5,这玩意岂不是错误很多。
: 就算错了,做gwas估计问题不大。但是imputation的时候,一堆正确的genotype里面
: 有一堆相反的,用这个数据impute,岂不是错误百出?!还是我理解有问题?
: 想了一下,也许这些maf接近0.5的也比较集中,另外,就算相反,maf接近0.5的对
: imputation提供的information也不多(比maf0.1的少的多了),是不是这个原因
: 大家都不care了?
【在 s******s 的大作中提到】
: 我的理解是array-based的genotyping都没法直接出ATGC的genotype, 出来的都是
: cluster的AA/AB/BB。这个要变成ATGC,只有用minor allele frequency去猜,但是
: maf如果接近0.5,这玩意岂不是错误很多。
: 就算错了,做gwas估计问题不大。但是imputation的时候,一堆正确的genotype里面
: 有一堆相反的,用这个数据impute,岂不是错误百出?!还是我理解有问题?
: 想了一下,也许这些maf接近0.5的也比较集中,另外,就算相反,maf接近0.5的对
: imputation提供的information也不多(比maf0.1的少的多了),是不是这个原因
: 大家都不care了?
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