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怎样分析一个lncRNA水平在疾病中上调或者下降的机理?
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怎样分析一个lncRNA水平在疾病中上调或者下降的机理?# Biology - 生物学
g*7
1
虽然知道这个没人说得准,但就是问问,想在圣诞节时候换个手机
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v*a
2
我们做RNA-seq, 发现一个已经报道的lncRNA在病人样本中水平显著上调。现在想弄清
这个背后的原因,几无良策。
目前唯一想到的,就是分析这个lncRNA的启动子区,看看在里面能否找到和该疾病相关
的基因。
请问大家还有什么其他思路,可以去展开研究呢?
谢谢
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d*0
3
galaxy nexus直到下市才有免税免运费的。
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x*d
4
首先你得考虑一下因果关系,是lncRNA导致了疾病,还是先有了疾病,然后lncRNA的表
达升高了?如果是后者,可以考虑一下你研究的这种病和PRC1、PRC2有没有关系。比如
会不会是疾病影响了某些TF,然后那些TF上调了lncRNA。其他关于lncRNA的机理,你可
以参考一下Howard Chang关于HOTAIR和NeST的paper。
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k*e
5
我的backorder 的N4三周后到,做为补偿给免运费,但是怎么才能免税,您给说说
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f*9
6
你可以做go analysis 参考 rinn 2007的nature paper

【在 v********a 的大作中提到】
: 我们做RNA-seq, 发现一个已经报道的lncRNA在病人样本中水平显著上调。现在想弄清
: 这个背后的原因,几无良策。
: 目前唯一想到的,就是分析这个lncRNA的启动子区,看看在里面能否找到和该疾病相关
: 的基因。
: 请问大家还有什么其他思路,可以去展开研究呢?
: 谢谢

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a*n
7
third party seller

【在 k***e 的大作中提到】
: 我的backorder 的N4三周后到,做为补偿给免运费,但是怎么才能免税,您给说说
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v*a
8

=====
我目前就是准备想这么做。

【在 x*****d 的大作中提到】
: 首先你得考虑一下因果关系,是lncRNA导致了疾病,还是先有了疾病,然后lncRNA的表
: 达升高了?如果是后者,可以考虑一下你研究的这种病和PRC1、PRC2有没有关系。比如
: 会不会是疾病影响了某些TF,然后那些TF上调了lncRNA。其他关于lncRNA的机理,你可
: 以参考一下Howard Chang关于HOTAIR和NeST的paper。

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v*a
9

哪篇文章啊,谢谢
Rinn JL, M. Kertesz, J. Wang, S. Brunghman, H. Goodnough, B. Wong, M. Cleary
, J.A. Helms, E. Segal, H.Y. Chang. (2007) Functional Demarcation of Active
and Silent Chromatin Domains in Human HOX Loci by Non-Coding RNAs. Cell. Jun
29;129(7):1311-23.
F. Lan, P.E. Bayliss, J.L. Rinn, J.R. Whetstine, J.K. Wang, S. Chen, S.
Iwase, T.M. Roberts, H.Y. Chang, and Y. Shi (2007). A histone H3 lysine 27
demethylase regulates animal posterior development. Nature Oct 11;449(7163):
689-94 (online 9/12/08).
T.A. Khavari and Rinn JL. (2007). Ras/Erk MAPK Signaling in Epidermal
Homeostasis and Neoplasia. Cell Cycle. Sept ; 6(23):2928-31
H. O'Green, S.L. Squazzo, S. Iyengar, K. Blahink, Rinn JL, H.Y.Chang, R.
Green and P.J. Farnham (2007) Genome Wide Analysis of KAP1 Binding Reveals
Auto-regulation of KRAB-ZNFs. PLoS Genetics. Jun 1;3(6):e89

【在 f*********9 的大作中提到】
: 你可以做go analysis 参考 rinn 2007的nature paper
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