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请教如何计算一段随机序列在基因组中出现的次数
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请教如何计算一段随机序列在基因组中出现的次数# Biology - 生物学
o*y
1 楼
他们追杀共产主义者的时候，
我没有说话———因为我不是共产主义者；
他们追杀犹太人的时候，
我没有说话———因为我不是犹太人；
他们追杀工会成员的时候，
我没有说话———因为我不是工会成员；
他们追杀天主教徒的时候，
我没有说话———因为我是新教教徒；
最后他们奔我而来，
已经没有人能为我说话了。
——马丁·尼莫拉牧师
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c*y
2 楼
假设genome scaffold 长度 5 million bases， 一段 长度为20 的特定序列理论上可
以出现多少次?
Thanks a lot!
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a*g
3 楼
如果是完全随机的，这是个combination的probability
如果是特定的序列，可以重复出现几千次都有可能
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c*y
4 楼
如果序列完全随机，如何计算这个理论上的combination probability?
谢谢了!

【在 a****g 的大作中提到】
: 如果是完全随机的，这是个combination的probability
: 如果是特定的序列，可以重复出现几千次都有可能
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h*x
5 楼
0
5000000 * 4^(-20)

【在 c***y 的大作中提到】
: 假设genome scaffold 长度 5 million bases， 一段 长度为20 的特定序列理论上可
: 以出现多少次?
: Thanks a lot!
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j*n
6 楼
偷偷说一下 这个不是初中数学？

【在 c***y 的大作中提到】
: 如果序列完全随机，如何计算这个理论上的combination probability?
: 谢谢了!
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c*y
7 楼
谢谢回复!

【在 h*****x 的大作中提到】
: 0
: 5000000 * 4^(-20)
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c*y
8 楼
还真没有自信应付初中数学了呢...

【在 j****n 的大作中提到】
: 偷偷说一下 这个不是初中数学？
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e*o
9 楼
貌似有问题
想想总base 是20的情况 或者21的情况

【在 h*****x 的大作中提到】
: 0
: 5000000 * 4^(-20)
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e*o
10 楼
那你解解看？看看能否做对

【在 j****n 的大作中提到】
: 偷偷说一下 这个不是初中数学？
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k*l
11 楼
如果DNA是线性的，更准确一点是： （5000000-19）/(4^20）

【在 h*****x 的大作中提到】
: 0
: 5000000 * 4^(-20)
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