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请教ChIPseq的技术问题
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请教ChIPseq的技术问题# Biology - 生物学
c*g
1 楼
我八月底就要搬到LA了。听朋友说south pasadena的学校不错。我家里有孩子要上小学
。请大家介绍一下那个小学最好，次好，第三好。同时还希望朋友介绍一下在好学区租
一个两室1卫或两卫的房子，租金大概是多少。同时向LA的朋友问好，在这里新人拜个
码头。
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m*n
2 楼
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: tatausa00004 (tatausa0004), 信区: Military
标 题: 看到有傻逼挑战上帝就觉得,傻逼都一样自以为是
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Sep 16 13:45:49 2011, 美东)
3000年前，有些傻逼以为地球是平的
400-500年前，有些傻逼认为太阳围着地球转
几十年前，有些傻逼想，光怎么可能又是波又是例子
质疑上帝的傻逼，2000年来没断过。现在都在历史的垃圾堆里躺着。
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R*e
3 楼
1. 现在做ChIPseq是不是都得做重复？记得前几年的ChIPseq，都是一次实验，就可以。
2. 现在做ChIPseq，spiked－in 是必须的吗？
3. biorupter和covaris，哪个好？为什么？
谢谢！
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L*m
4 楼
http://www.schooldigger.com/go/CA/schoolrank.aspx
1500 bucks/month? not sure.

【在 c*****g 的大作中提到】
: 我八月底就要搬到LA了。听朋友说south pasadena的学校不错。我家里有孩子要上小学
: 。请大家介绍一下那个小学最好，次好，第三好。同时还希望朋友介绍一下在好学区租
: 一个两室1卫或两卫的房子，租金大概是多少。同时向LA的朋友问好，在这里新人拜个
: 码头。
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R*e
5 楼
还有，测序深度的问题。
histone marker 测多少reads？TF测多少reads？
谢谢！
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k*n
6 楼
至少两个重复，样品特难搞的一次还勉强说得过去。看你想address什么问题了，一般
20-40m够用，但越深越好
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k*n
7 楼
spike in 不是必要的，而且你打算怎么spike in?
c容易over shearing，条件摸好后估计会很稳定，b开始做比较好，但是用久了机子会
搞幺蛾子，个人还是觉得Branson好……
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R*e
8 楼
https://www.activemotif.com/catalog/1091/chip-normalization
用这个啊

【在 k*****n 的大作中提到】
: spike in 不是必要的，而且你打算怎么spike in?
: c容易over shearing，条件摸好后估计会很稳定，b开始做比较好，但是用久了机子会
: 搞幺蛾子，个人还是觉得Branson好……
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