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有谁知道Sigma的nuclear isolation buffer的配方?
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有谁知道Sigma的nuclear isolation buffer的配方?# Biology - 生物学
v*e
1
总觉得一个一个同他们握手显得太呆板或做作。另外,介绍时说什么呢,老说"Hello",
"nice to meet you"有点单调啊
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j*g
2
www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/nuc101
Nuclei Isolation Kit: Nuclei EZ Prep
到处都找不到recipe. 想自己配点,实在不想买(到货太慢)。
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P*l
3
...
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f*9
4
最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒的
,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate
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p*y
5
多少个一起来啊?通常都是一个一个面试官吧
你参考一下the pursuit of happiness里面的面试
可以说 pleasure to meet you. Thanks for takeing time to see me. Or happy new
year...

",

【在 v***e 的大作中提到】
: 总觉得一个一个同他们握手显得太呆板或做作。另外,介绍时说什么呢,老说"Hello",
: "nice to meet you"有点单调啊

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T*i
6
re

【在 f*********9 的大作中提到】
: 最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒的
: ,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate

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c*e
7
不需要非得握手,拥抱一下,或者吻一下脸颊也可以。
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D*a
8
能再详细一些吗?谢谢。 比如是用votex,还是针头加注射器,还是dounce
homogenizer?

【在 f*********9 的大作中提到】
: 最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒的
: ,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate

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x*n
9
哈哈哈。

【在 c**********e 的大作中提到】
: 不需要非得握手,拥抱一下,或者吻一下脸颊也可以。
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j*g
10
我买了他家的这个buffer了。我给客服写信了,他说他家的buffer有专利的,配方不公
开,他只能说是非离子型去垢剂,但是不是NP40,也不含Triton。
[在 florida2009 (福达) 的大作中提到:]
:最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒
的,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate
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Y*d
11
好喜欢这个帖子!
我认为可以深情的凝视一下,如果你不愿意握手的话。
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c*r
13
进公司前用绷带把手缠起来就ok了
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R*n
14
搭车问一下,这个细胞核可以直接用MNase or DNaseI 处理跑agarose?

【在 f*********9 的大作中提到】
: 最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒的
: ,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate

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c*b
15
MNase的话加点Ca应该可以,在植物细胞里面试过的。DNase I的话RIPA的盐浓度高了点。

【在 R****n 的大作中提到】
: 搭车问一下,这个细胞核可以直接用MNase or DNaseI 处理跑agarose?
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R*n
16
多谢!其实我也刚定了那个kit,要是时间太长,就自己配buffer吧

点。

【在 c********b 的大作中提到】
: MNase的话加点Ca应该可以,在植物细胞里面试过的。DNase I的话RIPA的盐浓度高了点。
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R*n
17
核提出来了,有几个问题
1)trypen blue染色下很多都聚团,如果使劲吹打就破碎了。
2)因为聚团所以没法计算核的浓度,CTL和KD怎么相对定量?
3) MNase大概放多少细胞核?
我基本是这个protocl
http://www.nature.com/nmeth/journal/v2/n9/abs/nmeth0905-719.html

点。

【在 c********b 的大作中提到】
: MNase的话加点Ca应该可以,在植物细胞里面试过的。DNase I的话RIPA的盐浓度高了点。
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R*n
18
avatar
c*b
19
我做的植物细胞,在植物里面一般都是说取多少gram的叶子或者苗做起始材料,到了核
这一步不像你们那样再计数的,所以我也不知道该怎么回答。我一般放NEB的MNase,5-
10g的起始材料,拿到核以后放5000-10000 gel units。
我做RNA-IP是拿特异抗体处理,非特异抗体做negative control。如果是一般的WB,
histone和ADK kinase分别做marker。如果是RNA,就是U2或者U6。

【在 R****n 的大作中提到】
: 核提出来了,有几个问题
: 1)trypen blue染色下很多都聚团,如果使劲吹打就破碎了。
: 2)因为聚团所以没法计算核的浓度,CTL和KD怎么相对定量?
: 3) MNase大概放多少细胞核?
: 我基本是这个protocl
: http://www.nature.com/nmeth/journal/v2/n9/abs/nmeth0905-719.html
:
: 点。

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R*n
20
今天简单一下,虽然不好看,但是意思出来了,似乎核有点结块问题不大。见图,还有
几个问题。
1)我准备后续做southern,MNase处理后,要不要加RNase A 和 proteinase K,原有
MNase buffer行不行?因为lane 2-5,band之间有smear.
2) 1%的胶跑出去了,理想是多大浓度?
非常感谢!

5-

【在 c********b 的大作中提到】
: 我做的植物细胞,在植物里面一般都是说取多少gram的叶子或者苗做起始材料,到了核
: 这一步不像你们那样再计数的,所以我也不知道该怎么回答。我一般放NEB的MNase,5-
: 10g的起始材料,拿到核以后放5000-10000 gel units。
: 我做RNA-IP是拿特异抗体处理,非特异抗体做negative control。如果是一般的WB,
: histone和ADK kinase分别做marker。如果是RNA,就是U2或者U6。

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d*i
21

应该就是NP40.
https://www.sigmaaldrich.com/content/dam/sigma-aldrich/docs/Sigma/General_
Information/1/ascb_1999_ned_poster_pdf.pdf
0.1%NP40即可。

【在 j*********g 的大作中提到】
: 我买了他家的这个buffer了。我给客服写信了,他说他家的buffer有专利的,配方不公
: 开,他只能说是非离子型去垢剂,但是不是NP40,也不含Triton。
: [在 florida2009 (福达) 的大作中提到:]
: :最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒
: 的,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate

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j*g
22
没错,我看了你贴的poster,确实就是NP40(也叫Igepel CA630)。
Sigma坑人啊,这个buffer卖的不便宜。
Sigma的客服回信说
Hello
Thank you for contacting Sigma-Aldrich Technical Service, now MilliporeSigma
- the life science business of Merck KGaA, Darmstadt, Germany.
The exact formulation of the lysis buffer in the NUC101 - Nuclei Isolation
Kit: Nuclei EZ Prep is withheld as proprietary information. We can say that
it is a non-ionic detergent that does not contain reducing agents. And it
does not contain Triton or any protease inhibitors.
Jon-Erik Hansen
Technical Service Scientist, North America Technical Service

【在 d****i 的大作中提到】
:
: 应该就是NP40.
: https://www.sigmaaldrich.com/content/dam/sigma-aldrich/docs/Sigma/General_
: Information/1/ascb_1999_ned_poster_pdf.pdf
: 0.1%NP40即可。

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d*i
23

MilliporeSigma
that
要卖钱就不能给你说实话啊。

【在 j*********g 的大作中提到】
: 没错,我看了你贴的poster,确实就是NP40(也叫Igepel CA630)。
: Sigma坑人啊,这个buffer卖的不便宜。
: Sigma的客服回信说
: Hello
: Thank you for contacting Sigma-Aldrich Technical Service, now MilliporeSigma
: - the life science business of Merck KGaA, Darmstadt, Germany.
: The exact formulation of the lysis buffer in the NUC101 - Nuclei Isolation
: Kit: Nuclei EZ Prep is withheld as proprietary information. We can say that
: it is a non-ionic detergent that does not contain reducing agents. And it
: does not contain Triton or any protease inhibitors.

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R*n
24
这个溶液保存提取的核怎么样?

【在 f*********9 的大作中提到】
: 最简单的方法Tris pH7.4 加NaCL 浓度都是25 mM 外加0.5% 的NP40, 提细胞核棒棒的
: ,细胞核裂解可以用RIPA 直接sonicate

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l*7
25
这么简单的问题需要问吗?
查查文献就能找出来原始或改良配方。
N decades 前都是自己配自用, 根本不需要买。
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S*e
26
这个实验要做好确实需要高超的技巧,比方说,np40浓度,温度,时间,甚至细胞浓度
确实需要严格控制。否则最后结果可能多多少少有交叉污染,即使公司卖的也不是每一
个都有很少的细胞核细胞浆交叉污染,省时间有钱建议买配好的,严格执行说明书。

【在 l*****7 的大作中提到】
: 这么简单的问题需要问吗?
: 查查文献就能找出来原始或改良配方。
: N decades 前都是自己配自用, 根本不需要买。

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l*7
27
交叉污染几乎难免, 只是程度问题。
公司卖的和自配的没什么差别。
对那些对交叉污染要求不高的实验,很容易。
对那些对交叉污染要求很高的实验, 为将交叉污染减到尽可能小,必需修改protocol。

【在 S**********e 的大作中提到】
: 这个实验要做好确实需要高超的技巧,比方说,np40浓度,温度,时间,甚至细胞浓度
: 确实需要严格控制。否则最后结果可能多多少少有交叉污染,即使公司卖的也不是每一
: 个都有很少的细胞核细胞浆交叉污染,省时间有钱建议买配好的,严格执行说明书。

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