谁来谈谈现在bioinformatics的情况啊 - 未名空间MITBBS历史存档

谁来谈谈现在bioinformatics的情况啊# Biology - 生物学

E*F2010-01-31 08:01

1 楼

我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
我现在对bioinformatics有点兴趣
本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
因为自己不懂，所以想听听意见
另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考
网上找不到很全的

C*m2010-01-31 08:01

2 楼

这两个没有啥前途

【在 E*******F 的大作中提到】

: 我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
: 我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
: 后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
: 中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
: 我现在对bioinformatics有点兴趣
: 本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
: 他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
: 这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
: 因为自己不懂，所以想听听意见
: 另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考

g*t2010-01-31 08:01

3 楼

同意，我也觉得这两个方向没啥太大前途。我觉得systems biology比较适合你（当然
是其中的偏理论和计算的方向），而且前景不错。而且ee学的控制论、信号处理之类的
课程还比较有用。

【在 C*********m 的大作中提到】

:
: 这两个没有啥前途

D*n2010-01-31 08:01

4 楼

very productive, but no openings in industry. also very few in academia.

【在 E*******F 的大作中提到】

: 我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
: 我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
: 后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
: 中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
: 我现在对bioinformatics有点兴趣
: 本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
: 他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
: 这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
: 因为自己不懂，所以想听听意见
: 另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考

S*i2010-01-31 08:01

5 楼

我算是做生物信息的吧。“有点兴趣”具体指的是有多大兴趣？我当年就是被
我自己所谓有点小兴趣忽悠的。ME应该是好专业啊，望你三思而后行。（请
不要误会我的意思，我并不想打击你从事研究的积极性，相反我只是想给你提
个醒而已；如果你已经想好了要做研究，那我说的就不攻自破了）

向往。
simulation
end

【在 E*******F 的大作中提到】

: 我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
: 我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
: 后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
: 中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
: 我现在对bioinformatics有点兴趣
: 本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
: 他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
: 这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
: 因为自己不懂，所以想听听意见
: 另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考

h*y2010-01-31 08:01

6 楼

google "2006年北美生物信息学申请指南"

【在 E*******F 的大作中提到】

: 我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
: 我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
: 后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
: 中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
: 我现在对bioinformatics有点兴趣
: 本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
: 他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
: 这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
: 因为自己不懂，所以想听听意见
: 另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考

E*F2010-01-31 08:01

7 楼

thanks
我就是想听各方意见，特别是负面的信息。
因为人在冲动的时候往往对不利的因素认识不足。
你能说说你遇到了那些不利因素吗？或者哪些跟想象的不一样？
我们学校的计算机系有bioinformatics的方向
同时还有个专门的bioinformatics的program
我看了一下那里的faculty好像都是做分子生物学出身的
那我是不是应该考虑计算机系的那个program呢？
因为如果最后不能做下去，至少有很多data mining, machine learning的训练
找其他相关工作也有戏？
当然计算机的那个方向可能就是非常偏重计算了，学不到什么实验性的东西

【在 S*******i 的大作中提到】

: 我算是做生物信息的吧。“有点兴趣”具体指的是有多大兴趣？我当年就是被
: 我自己所谓有点小兴趣忽悠的。ME应该是好专业啊，望你三思而后行。（请
: 不要误会我的意思，我并不想打击你从事研究的积极性，相反我只是想给你提
: 个醒而已；如果你已经想好了要做研究，那我说的就不攻自破了）
:
: 向往。
: simulation
: end

l*h2010-01-31 08:01

8 楼

发文章还是挺容易的，别的方面请大家补充

【在 E*******F 的大作中提到】

: 我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
: 我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
: 后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
: 中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
: 我现在对bioinformatics有点兴趣
: 本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
: 他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
: 这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
: 因为自己不懂，所以想听听意见
: 另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考

S*i2010-01-31 08:01

9 楼

请问你想做生物的兴趣具体来源于哪里呢？

g*t2010-01-31 08:01

10 楼

计算机系的bioinformatics不错，可以考虑。不过很多计算机系的bioinformatics其实
就是把data mining和statistics的方法应用于生物学数据分析而已，跟这些老板生物
学理论会比较差一些。
最后强调一下，bioinformatics做科研的话我觉得前景不错，但是现在还看不到太显著
的直接的应用价值。如果你是那种一定要科研且打算做一辈子科研的人比较合适，如果
不是就要再多想一想。

【在 E*******F 的大作中提到】

: thanks
: 我就是想听各方意见，特别是负面的信息。
: 因为人在冲动的时候往往对不利的因素认识不足。
: 你能说说你遇到了那些不利因素吗？或者哪些跟想象的不一样？
: 我们学校的计算机系有bioinformatics的方向
: 同时还有个专门的bioinformatics的program
: 我看了一下那里的faculty好像都是做分子生物学出身的
: 那我是不是应该考虑计算机系的那个program呢？
: 因为如果最后不能做下去，至少有很多data mining, machine learning的训练
: 找其他相关工作也有戏？

D*n2010-01-31 08:01

11 楼

就学术来说，跟CS，bio 或者stat的教授搞bioinfo各有长处。
但就就业来讲，跟bioinfo沾边了，你在CS好stat好，都会比同学差很多。

【在 g**********t 的大作中提到】

: 计算机系的bioinformatics不错，可以考虑。不过很多计算机系的bioinformatics其实
: 就是把data mining和statistics的方法应用于生物学数据分析而已，跟这些老板生物
: 学理论会比较差一些。
: 最后强调一下，bioinformatics做科研的话我觉得前景不错，但是现在还看不到太显著
: 的直接的应用价值。如果你是那种一定要科研且打算做一辈子科研的人比较合适，如果
: 不是就要再多想一想。

E*F2010-01-31 08:01

12 楼

嗯，也都是比较naive的想法。
首先，我觉得生物这个东西值得做的内容很多，而且以后长期都是如此。
对人类社会也有很大的直接作用（比较那啥的想法）
另外，我中学时对生物的aptitude还不错。高中生物竞赛是全省前十。
我当时没学生物主要原因是自己物理课很好，就follow了engineering
最后，我逐渐意识到自己不是特别喜欢industrial的工作（我工作过）
我觉得自己creativity还可以，记忆力也还好
无法忍受重复性的工作
当然都是一些自我评价，可能片面

【在 S*******i 的大作中提到】

: 请问你想做生物的兴趣具体来源于哪里呢？

F*p2010-01-31 08:01

13 楼

做药物设计的公司opening很多,做蛋白结构和system bio的academia opening也很多

【在 D******n 的大作中提到】

: very productive, but no openings in industry. also very few in academia.

C*m2010-01-31 08:01

14 楼

发文章容易也得是这个圈子里的人，structure prediction 和 molecular simulation
这两个领域圈子太小，帮派林立，搞不好就会被对手玩死。要进场一定要跟对老板。如
果是今后找工业界的工作，还是molecular simulation好一点。很多搞药物开发的都喜
欢拿这个来装点门面。我的感觉今后bioinformtics找工作容易的方向是 -omics，海量
数据的分析处理。

【在 l*h 的大作中提到】

: 发文章还是挺容易的，别的方面请大家补充

g*t2010-01-31 08:01

15 楼

中学的时候你喜欢生物竞赛的哪一部分？遗传还是动植物分类？要是喜欢遗传搞生物信
息比较合适，要是不喜欢遗传学而喜欢传统的博物学的话，现代生物学的大部分研究不
见得适合你。

【在 E*******F 的大作中提到】

: 嗯，也都是比较naive的想法。
: 首先，我觉得生物这个东西值得做的内容很多，而且以后长期都是如此。
: 对人类社会也有很大的直接作用（比较那啥的想法）
: 另外，我中学时对生物的aptitude还不错。高中生物竞赛是全省前十。
: 我当时没学生物主要原因是自己物理课很好，就follow了engineering
: 最后，我逐渐意识到自己不是特别喜欢industrial的工作（我工作过）
: 我觉得自己creativity还可以，记忆力也还好
: 无法忍受重复性的工作
: 当然都是一些自我评价，可能片面

g*t2010-01-31 08:01

16 楼

其实我一直觉着structure prediction和molecular simulation应该算物理化学的一个
分支而不是生物学的一个分支。

simulation

【在 C*********m 的大作中提到】

: 发文章容易也得是这个圈子里的人，structure prediction 和 molecular simulation
: 这两个领域圈子太小，帮派林立，搞不好就会被对手玩死。要进场一定要跟对老板。如
: 果是今后找工业界的工作，还是molecular simulation好一点。很多搞药物开发的都喜
: 欢拿这个来装点门面。我的感觉今后bioinformtics找工作容易的方向是 -omics，海量
: 数据的分析处理。

l*h2010-01-31 08:01

17 楼

其实生物研究的各个方向都有帮派的问题

simulation

【在 C*********m 的大作中提到】

: 发文章容易也得是这个圈子里的人，structure prediction 和 molecular simulation
: 这两个领域圈子太小，帮派林立，搞不好就会被对手玩死。要进场一定要跟对老板。如
: 果是今后找工业界的工作，还是molecular simulation好一点。很多搞药物开发的都喜
: 欢拿这个来装点门面。我的感觉今后bioinformtics找工作容易的方向是 -omics，海量
: 数据的分析处理。

D*n2010-01-31 08:01

18 楼

first there are very few drug design companies
second they usually hire computational chemists, not bioinformaticists.

【在 F******p 的大作中提到】

: 做药物设计的公司opening很多,做蛋白结构和system bio的academia opening也很多

e*a2010-01-31 08:01

19 楼

千万别往这坑跳除非能找到大牛老板

w*y2010-01-31 08:01

20 楼

r u serious?
quite a few systems biology faculty openings out there
but for structural bioinformatics, there are very few openings

K*S2010-01-31 08:01

21 楼

任何工作都是重复性的

【在 E*******F 的大作中提到】

: 嗯，也都是比较naive的想法。
: 首先，我觉得生物这个东西值得做的内容很多，而且以后长期都是如此。
: 对人类社会也有很大的直接作用（比较那啥的想法）
: 另外，我中学时对生物的aptitude还不错。高中生物竞赛是全省前十。
: 我当时没学生物主要原因是自己物理课很好，就follow了engineering
: 最后，我逐渐意识到自己不是特别喜欢industrial的工作（我工作过）
: 我觉得自己creativity还可以，记忆力也还好
: 无法忍受重复性的工作
: 当然都是一些自我评价，可能片面

L*d2010-01-31 08:01

22 楼

除非你能进David Baker组，否则没啥前途

【在 E*******F 的大作中提到】

: 我前不久咨询过一次换专业的情况，现在follow up一下。
: 我本科是机械类的专业，一点兴趣也没有。
: 后来学过一些计算机的课，还有点兴趣。对生物科学一窍不通，但是有点向往。
: 中学时生化都学得很好，大学学了一点化学的皮毛。
: 我现在对bioinformatics有点兴趣
: 本着尽量减少折腾的原则，我想试着往本校的program转
: 他们做的主要是structure prediction of proteins和molecular simulation
: 这些方向有前途吗？我主要是关心这些学科是否productive，还是dead end
: 因为自己不懂，所以想听听意见
: 另外有谁知道bioinformatics的排名情况呢？想有个大致参考

u*n2010-01-31 08:01

23 楼

飘过。

O*O2010-01-31 08:01

24 楼

展开说说？
他的组的前途

【在 L********d 的大作中提到】

: 除非你能进David Baker组，否则没啥前途

M*s2010-01-31 08:01

25 楼

推荐systems bio
MD 和 Bioinfo 虽然很好但是不管怎么样，systems bio才是最终需要做的东西
MD 和 Bioinfo 只是途中发展出来的学科目前研究方法已经都比较成熟了。。。而
且到最后还是要服务于systems bio的
而且，systems bio目前还没有啥人能够提出非常强大的研究方法。。。所以对于
creativity的要求更高一点

s*r2010-01-31 08:01

26 楼

CS is much better than bioinformatics.

l*d2010-01-31 08:01

27 楼

我觉得，博后开始适合做交叉学科，博士期间属于专业训练，越纯越好，这样做交叉学
科才有一技之长。不过你也可以先做一两个跟生物有关的小项目，感受一下。

k*o2010-01-31 08:01

28 楼

现在NEXTGEN SEQUENCING那么火；不管什么样的SEQUENCING PLATFORM上下来的数据
都需要大量的计算机分析； INDUSTRY对BIOINFO的需求其实非常大。

【在 F******p 的大作中提到】

: 做药物设计的公司opening很多,做蛋白结构和system bio的academia opening也很多