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求助:如何找到这个基因的promoter sequence?
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求助:如何找到这个基因的promoter sequence?# Biology - 生物学
x*i
1
大家有用过好的专利律师推荐一下吧,谢谢!
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s*1
2
上次寒假嚷嚷了,寒假3个星期,熬一熬就过来了
暑假3个月呐!今天一去,人说琴都拿走了,擦,还让不让人活了! 求安慰。
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S*l
3
【 以下文字转载自 Piebridge 讨论区 】
发信人: tiantian2011 (甜甜), 信区: Piebridge
标 题: 大叔也罢,剩男也罢
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Mar 20 03:22:35 2012, 美东)
额从未见过哪个发达国家,这样多元化的贬损单身的,盲目提升已婚的虚荣价值。。。
有这样一个规律,凡是高调炫耀婚姻的,基本都以离婚告终。。只不过时间早晚的问题
。bbs上这种例子太多了。。。。
//这是玄学。
所以呢,多诉诉苦。。。
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t*9
4
各位大侠,我对基因方面懂得不多,现在有一个基因方面的问题向大家请教。我想找一
个基因tag-24 的promoter sequence,这个基因是c.elegans中的。下面是有关的信息
(包括了tag-24 的一个上游基因和一个下游基因)。请大侠帮忙算一下这个promoter
sequence 是多长呢?请讲讲是怎么算的。(因为tag-24 给的是complement, 我不知道
怎么办)(就按tag-24 得第一个isoform 为例吧。)多谢了!!!
gene 5604536..5609082
/locus_tag="F14D12.1"
/db_xref="GeneID:180829"
/db_xref="WormBase:WBGene00017463"
mRNA join(5604536..5604550,5604616..5604684,5604731..5604985,
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t*0
5
肿么了?。。。没看太明白。

【在 s*********1 的大作中提到】
: 上次寒假嚷嚷了,寒假3个星期,熬一熬就过来了
: 暑假3个月呐!今天一去,人说琴都拿走了,擦,还让不让人活了! 求安慰。

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S*l
6
我只是想转“这是玄学”这四个字
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a*e
7
go to wormbase.org
search tag-24
go to "location", click the picture, "Showing 2.515 kbp from X, positions 5,
608,905 to 5,611,419"
in "landmark or region", change "X:5608905..5611419" to "X:5608905..5613419"
In "reports & analysis", change to "download sequence files", click "go"
it will give you the 2k promoter plus the whole gene sequence.
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B*k
8
靠,就一台琴?强烈安慰

【在 s*********1 的大作中提到】
: 上次寒假嚷嚷了,寒假3个星期,熬一熬就过来了
: 暑假3个月呐!今天一去,人说琴都拿走了,擦,还让不让人活了! 求安慰。

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m*o
9
不懂啊。。。

【在 S*********l 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Piebridge 讨论区 】
: 发信人: tiantian2011 (甜甜), 信区: Piebridge
: 标 题: 大叔也罢,剩男也罢
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Mar 20 03:22:35 2012, 美东)
: 额从未见过哪个发达国家,这样多元化的贬损单身的,盲目提升已婚的虚荣价值。。。
: 有这样一个规律,凡是高调炫耀婚姻的,基本都以离婚告终。。只不过时间早晚的问题
: 。bbs上这种例子太多了。。。。
: //这是玄学。
: 所以呢,多诉诉苦。。。

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a*e
10
and for "tag-24", the upstream gene is 20kb away.
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M*t
11
强烈安慰!
看看附近有没有琴房可以租时间吧。

【在 s*********1 的大作中提到】
: 上次寒假嚷嚷了,寒假3个星期,熬一熬就过来了
: 暑假3个月呐!今天一去,人说琴都拿走了,擦,还让不让人活了! 求安慰。

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m*o
12
这是哪门学问?

【在 S*********l 的大作中提到】
: 我只是想转“这是玄学”这四个字
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t*9
13
Thanks a lot Arche!!!
Could you let me know why I need to change "X:5608905..5611419" to "X:
5608905..5613419"in "landmark or region"?

5,
5613419"

【在 a***e 的大作中提到】
: go to wormbase.org
: search tag-24
: go to "location", click the picture, "Showing 2.515 kbp from X, positions 5,
: 608,905 to 5,611,419"
: in "landmark or region", change "X:5608905..5611419" to "X:5608905..5613419"
: In "reports & analysis", change to "download sequence files", click "go"
: it will give you the 2k promoter plus the whole gene sequence.

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s*s
14
严重安慰!
回想当年我在大学乐团的时候,校团委的老师们特别不尊重我们,还特小气,不打个招
呼就把钢琴搬走,锁起来,一台没人调音的立式老珠江,还当个大宝贝,我们这些音乐
青年就没琴玩了,还是无期的。所以啊,你至少知道几个月以后又会有得弹,不错啦~
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S*l
15

不觉得好笑么
以后说话可以加一句:这是玄学

【在 m***o 的大作中提到】
: 这是哪门学问?
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t*9
16
Arche. I think I know why I need to change the number.This way it will give
me 2 kb promoter sequence. Thanks!!!
However, do you or anyone know how to figure out the promoter sequence based
on the information from pubmed.com as I pasted in the first message?

【在 t********9 的大作中提到】
: Thanks a lot Arche!!!
: Could you let me know why I need to change "X:5608905..5611419" to "X:
: 5608905..5613419"in "landmark or region"?
:
: 5,
: 5613419"

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d*n
17
安慰下。。。看来小型乐器还是有好处。。。不用看别人脸色
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c*t
18
简单点就直接说自己也不懂,还会让人认为你谦虚啊!

【在 S*********l 的大作中提到】
:
: 不觉得好笑么
: 以后说话可以加一句:这是玄学

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t*9
19
ahche, why I can not find the tag-24 gene sequence from the "2k promoter
plus the whole gene sequence"? tag-24 gene starts with atgtggaaccttaactg.....

5,
5613419"

【在 a***e 的大作中提到】
: go to wormbase.org
: search tag-24
: go to "location", click the picture, "Showing 2.515 kbp from X, positions 5,
: 608,905 to 5,611,419"
: in "landmark or region", change "X:5608905..5611419" to "X:5608905..5613419"
: In "reports & analysis", change to "download sequence files", click "go"
: it will give you the 2k promoter plus the whole gene sequence.

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d*n
20
你们学校怎么暑假还把琴搬走藏起来?大气。。。。
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a*i
21
你懂吗?

简单点就直接说自己也不懂,还会让人认为你谦虚啊!

【在 c********t 的大作中提到】
: 简单点就直接说自己也不懂,还会让人认为你谦虚啊!
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a*e
22
you can download the cosmid sequence to your computer, and then according
to the position of tag-24 on that cosmid, you can select out the sequence
you need.
however, I never did that way. I prefer wormbase.

give
based

【在 t********9 的大作中提到】
: Arche. I think I know why I need to change the number.This way it will give
: me 2 kb promoter sequence. Thanks!!!
: However, do you or anyone know how to figure out the promoter sequence based
: on the information from pubmed.com as I pasted in the first message?

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s*e
23
同问。够变态。
星弟买电钢吧,不就一个月奖学金。实在紧张了姐姐给你捐点伪币。。

【在 d********n 的大作中提到】
: 你们学校怎么暑假还把琴搬走藏起来?大气。。。。
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c*t
24
其实我也不懂。
里围城,外围城,今日不好是心情。
日总圆,月无晴。葡萄虽酸却水灵。
谁来把握一双小手,能把忧伤抚平。

【在 a*****i 的大作中提到】
: 你懂吗?
:
: 简单点就直接说自己也不懂,还会让人认为你谦虚啊!

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a*e
25
change that to "reverse complementation" first.

atgtggaaccttaactg.....

【在 t********9 的大作中提到】
: ahche, why I can not find the tag-24 gene sequence from the "2k promoter
: plus the whole gene sequence"? tag-24 gene starts with atgtggaaccttaactg.....
:
: 5,
: 5613419"

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B*k
26
支持!

【在 s*****e 的大作中提到】
: 同问。够变态。
: 星弟买电钢吧,不就一个月奖学金。实在紧张了姐姐给你捐点伪币。。

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t*9
27
arche, thank you very much! I found it.
I really appreciate your help!!!

【在 a***e 的大作中提到】
: change that to "reverse complementation" first.
:
: atgtggaaccttaactg.....

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M*t
28
同支持!

【在 B*********k 的大作中提到】
: 支持!
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s*1
29
今天整个那栋music technology那栋楼里都是piano sales, 漫山遍野的三角钢琴,
upright的钢琴,还有电钢琴,有一个老得掉渣的琴弹出来都是harpsichord的音色...
哎,工科学校就是丫一文化沙漠,你还指望他个啥!

【在 s*****e 的大作中提到】
: 同问。够变态。
: 星弟买电钢吧,不就一个月奖学金。实在紧张了姐姐给你捐点伪币。。

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s*1
30
唔~ 上个寒假我也抱怨过大楼锁门没琴弹... 哎,每个学期总有那么几天不舒服不让你
弹琴...

【在 t****0 的大作中提到】
: 肿么了?。。。没看太明白。
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B*k
31
全要卖?然后不买新的?

【在 s*********1 的大作中提到】
: 今天整个那栋music technology那栋楼里都是piano sales, 漫山遍野的三角钢琴,
: upright的钢琴,还有电钢琴,有一个老得掉渣的琴弹出来都是harpsichord的音色...
: 哎,工科学校就是丫一文化沙漠,你还指望他个啥!

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s*1
32
商家来搞展览吧,顺便把学校的琴收回去,好像每年暑假都要把琴收回去好像拿到别的
地方用,算是学校租给第三方用,收钱。 万恶的美帝国资本主义!

【在 B*********k 的大作中提到】
: 全要卖?然后不买新的?
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s*1
33
我想过呢,还没有settle down下来,多一样金贵的家具,以后挪起来够麻烦的

【在 s*****e 的大作中提到】
: 同问。够变态。
: 星弟买电钢吧,不就一个月奖学金。实在紧张了姐姐给你捐点伪币。。

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B*k
34
我原本也这么想,在忍不住买了若干难搬家的东西后,终于觉悟“既然都有了这件搬家
麻烦的东西,再多一件也一样”,破罐子破摔了。

【在 s*********1 的大作中提到】
: 我想过呢,还没有settle down下来,多一样金贵的家具,以后挪起来够麻烦的
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s*1
35
呀呀呀呀呀呀呀!!!! 暑假有个师兄要去实习,说不定可以把他的privia借来爽一
下~ 不过跟你们买的相比似乎很低端,七八百块钱的样子~
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