m*r
2 楼
我似乎前面已经发过帖子了,但是过了两周后,对这个问题知道的更多了,也有新
的疑惑,特来请教。
我的蛋白13KDa在连了N-端GB1tag后solubility增加了,也能拿到纯的,但是切掉
tag后就找不到我的蛋白了。我们一般用Ni柱,tag挂在柱上(因为有6xhis),目的蛋
白在flow-thorough.但是这个FL跑胶没东西。不是量的问题,因为浓缩后也没条带。(
我试过GST-tag,类似的结果,而且不加tag的时候我基本看不到表达条带)现在我怀疑
是降解掉了,因为上个帖子说过,结构预测N-terminal没结构,之后C-terminal 70aa
有一些二级结构。问题是在切掉tag前他已经很纯了,为什么切了tag还会降解呢?是不
是因为本身不稳定,跟有没有protease没关系?还有既然如此,我以后的生化试验是不
只能连着tag做了?唉,希望这个tag不会影响吧。
的疑惑,特来请教。
我的蛋白13KDa在连了N-端GB1tag后solubility增加了,也能拿到纯的,但是切掉
tag后就找不到我的蛋白了。我们一般用Ni柱,tag挂在柱上(因为有6xhis),目的蛋
白在flow-thorough.但是这个FL跑胶没东西。不是量的问题,因为浓缩后也没条带。(
我试过GST-tag,类似的结果,而且不加tag的时候我基本看不到表达条带)现在我怀疑
是降解掉了,因为上个帖子说过,结构预测N-terminal没结构,之后C-terminal 70aa
有一些二级结构。问题是在切掉tag前他已经很纯了,为什么切了tag还会降解呢?是不
是因为本身不稳定,跟有没有protease没关系?还有既然如此,我以后的生化试验是不
只能连着tag做了?唉,希望这个tag不会影响吧。
p*a
3 楼
no, 情节上到最后了,但是线索太多,估计得花很多笔墨来收尾。
g*y
4 楼
细胞裂解的时候有没有加protease inhibitor cocktail?
q*8
6 楼
过柱子第一遍的FLOW THROUGH,洗出来的FLOW THROUGH,还有RLUTION以后的FLOW
THROUGH都做一下看看
THROUGH都做一下看看
m*r
7 楼
sonication的时候加了PMSF和sigma的 cocktail了;
“还有RLUTION以后的FLOW THROUGH都做一下看看”是啥意思?我们这一步已经很纯了
,所以就是过柱,flowthrough,然后300mM咪唑洗了,这两部分都没我要的蛋白。
“还有RLUTION以后的FLOW THROUGH都做一下看看”是啥意思?我们这一步已经很纯了
,所以就是过柱,flowthrough,然后300mM咪唑洗了,这两部分都没我要的蛋白。
y*1
8 楼
降解是蛋白本身性质决定, 具体可以在expasy的protparam上查estimated参数
另外你说看不到13kda的带不排除电泳已经跑没了 可以上FPLC用uv检测
另外你说看不到13kda的带不排除电泳已经跑没了 可以上FPLC用uv检测
y*1
9 楼
狠一点的还可以用LC-MS
e*s
10 楼
如果我是你,先检查下面2个问题再考虑Protease的问题。Protease也不会切得干干净
净,你应该在胶上看到略小的带才是。
1.tag有没有切下来?
Ni-column用咪唑洗一下,跑跑看柱子上挂的是不是只有小tag.
2.没Tag了,蛋白是不是沉淀了?
酶切前后的样品高速离心一下,上清和pellet都测一下。
70aa
【在 m********r 的大作中提到】
: sonication的时候加了PMSF和sigma的 cocktail了;
: “还有RLUTION以后的FLOW THROUGH都做一下看看”是啥意思?我们这一步已经很纯了
: ,所以就是过柱,flowthrough,然后300mM咪唑洗了,这两部分都没我要的蛋白。
净,你应该在胶上看到略小的带才是。
1.tag有没有切下来?
Ni-column用咪唑洗一下,跑跑看柱子上挂的是不是只有小tag.
2.没Tag了,蛋白是不是沉淀了?
酶切前后的样品高速离心一下,上清和pellet都测一下。
70aa
【在 m********r 的大作中提到】
: sonication的时候加了PMSF和sigma的 cocktail了;
: “还有RLUTION以后的FLOW THROUGH都做一下看看”是啥意思?我们这一步已经很纯了
: ,所以就是过柱,flowthrough,然后300mM咪唑洗了,这两部分都没我要的蛋白。
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