Redian新闻
>
问蛋白降解是不是本身的性质决定的?
avatar
问蛋白降解是不是本身的性质决定的?# Biology - 生物学
s*e
1
最近没人看了?
avatar
m*r
2
我似乎前面已经发过帖子了,但是过了两周后,对这个问题知道的更多了,也有新
的疑惑,特来请教。
我的蛋白13KDa在连了N-端GB1tag后solubility增加了,也能拿到纯的,但是切掉
tag后就找不到我的蛋白了。我们一般用Ni柱,tag挂在柱上(因为有6xhis),目的蛋
白在flow-thorough.但是这个FL跑胶没东西。不是量的问题,因为浓缩后也没条带。(
我试过GST-tag,类似的结果,而且不加tag的时候我基本看不到表达条带)现在我怀疑
是降解掉了,因为上个帖子说过,结构预测N-terminal没结构,之后C-terminal 70aa
有一些二级结构。问题是在切掉tag前他已经很纯了,为什么切了tag还会降解呢?是不
是因为本身不稳定,跟有没有protease没关系?还有既然如此,我以后的生化试验是不
只能连着tag做了?唉,希望这个tag不会影响吧。
avatar
p*a
3
no, 情节上到最后了,但是线索太多,估计得花很多笔墨来收尾。
avatar
g*y
4
细胞裂解的时候有没有加protease inhibitor cocktail?
avatar
s*e
5
能收起来吗?
收不好我就不看了,前面看了点不错

【在 p********a 的大作中提到】
: no, 情节上到最后了,但是线索太多,估计得花很多笔墨来收尾。
avatar
q*8
6
过柱子第一遍的FLOW THROUGH,洗出来的FLOW THROUGH,还有RLUTION以后的FLOW
THROUGH都做一下看看
avatar
m*r
7
sonication的时候加了PMSF和sigma的 cocktail了;
“还有RLUTION以后的FLOW THROUGH都做一下看看”是啥意思?我们这一步已经很纯了
,所以就是过柱,flowthrough,然后300mM咪唑洗了,这两部分都没我要的蛋白。
avatar
y*1
8
降解是蛋白本身性质决定, 具体可以在expasy的protparam上查estimated参数
另外你说看不到13kda的带不排除电泳已经跑没了 可以上FPLC用uv检测
avatar
y*1
9
狠一点的还可以用LC-MS
avatar
e*s
10
如果我是你,先检查下面2个问题再考虑Protease的问题。Protease也不会切得干干净
净,你应该在胶上看到略小的带才是。
1.tag有没有切下来?
Ni-column用咪唑洗一下,跑跑看柱子上挂的是不是只有小tag.
2.没Tag了,蛋白是不是沉淀了?
酶切前后的样品高速离心一下,上清和pellet都测一下。

70aa

【在 m********r 的大作中提到】
: sonication的时候加了PMSF和sigma的 cocktail了;
: “还有RLUTION以后的FLOW THROUGH都做一下看看”是啥意思?我们这一步已经很纯了
: ,所以就是过柱,flowthrough,然后300mM咪唑洗了,这两部分都没我要的蛋白。

相关阅读
logo
联系我们隐私协议©2024 redian.news
Redian新闻
Redian.news刊载任何文章,不代表同意其说法或描述,仅为提供更多信息,也不构成任何建议。文章信息的合法性及真实性由其作者负责,与Redian.news及其运营公司无关。欢迎投稿,如发现稿件侵权,或作者不愿在本网发表文章,请版权拥有者通知本网处理。