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如果只盯着一个蛋白，该怎么研究才能发好文章？

如果只盯着一个蛋白，该怎么研究才能发好文章？# Biology - 生物学

a*y2011-02-24 08:02

1 楼

【以下文字转载自 Notice 讨论区】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标题: aaaty 封 maya 在 Apple 版
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Wed Nov 9 00:36:46 2011)
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
由于 maya 在 Apple 版的 9月转无关话题+标题污染版行为，
被暂时取消在本版的发文权力 14 天。
版主:aaaty
Wed Nov 9 00:35:37 2011

h*02011-02-24 08:02

2 楼

manufacture refurbished
看起来不错啊。有人有评论吗？跟sony ebookreader和amazon kindle比？

w*r2011-02-24 08:02

3 楼

实验室规模不大，多年来一直都在研究一个蛋白，主要技术就是flow cytometry 和
EMSA。
好多关于这个蛋白在其它过程中的新功能都是别的实验室发现的。貌似人家实验室都是
针对一个特定的现象，比如apoptosis，或是一个通路，研究此过程中涉及到的相关蛋
白和调控机制。
在研究中顺带就发现了我们研究的蛋白在这个过程中起的特定作用。
我感觉如果只盯着一个蛋白研究，只能在别人发现的基础上，做做突变，看看不同
domain对功能的影响，再加上我们用的实验技术也比较单一，作出的结果都是很
general的表象，不能在分子水平解释mechanism。所以很难有什么原创性的发现，发
好文章。
想跟老板说改改方向，针对某个过程研究，估计他不会愿意，因为那样我们就没优势了
。。。他做这个蛋白这么多年了，也很难放得下吧。。。
求板上朋友们指点一二，大牛实验室都是怎么针对一个蛋白研究的？我该怎么跟老板说
呢？

f*n2011-02-24 08:02

4 楼

你结晶一下吧.可能发好文章哦.

w*r2011-02-24 08:02

5 楼

我们实验室不做结构。。。而且这个蛋白结构已经被解了。。。

【在 f********n 的大作中提到】

: 你结晶一下吧.可能发好文章哦.

R*N2011-02-24 08:02

6 楼

No guarantee it could be correct. Given X-ray technique, no way to make sure how and where the sequence is folded.
Do you have your proteomic sequence dataset? Can you check if your predicted folding is the same as measured?

【在 w*******r 的大作中提到】

: 我们实验室不做结构。。。而且这个蛋白结构已经被解了。。。

f*n2011-02-24 08:02

7 楼

就是啊.
现在结晶而且结构被破解的,也就是RHODOPSIN还有人肾上腺蛋白等少数几个呢.
人家都是发CNS的.

sure how and where the sequence is folded.
predicted folding is the same as measured?

【在 R*******N 的大作中提到】

: No guarantee it could be correct. Given X-ray technique, no way to make sure how and where the sequence is folded.
: Do you have your proteomic sequence dataset? Can you check if your predicted folding is the same as measured?

t*m2011-02-24 08:02

8 楼

太坏了...

【在 f********n 的大作中提到】

: 就是啊.
: 现在结晶而且结构被破解的,也就是RHODOPSIN还有人肾上腺蛋白等少数几个呢.
: 人家都是发CNS的.
:
: sure how and where the sequence is folded.
: predicted folding is the same as measured?

p*s2011-02-24 08:02

9 楼

It seems that you don't understand Xray at all... structure prediction is
one of the most difficult fields. Of
course you can claim swiss-prot prediction has better structure than in
vitro structural methods, but no one
really believes that. How about to read some articles by David Baker? They
did a lot of protein design, and they
ALWAYS use Xray or NMR to prove their design. If you don't believe Xray,
which is arguably the best method in
the market, I don't know how you can believe any 3D structure models. --oh
by the way, most structure
prediction methods are based on Xray structure, lol

sure how and where the sequence
is folded.
predicted folding is the same as
measured?

【在 R*******N 的大作中提到】