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大家来聊聊CNV，methylation和gene expression的关系

大家来聊聊CNV，methylation和gene expression的关系# Biology - 生物学

r*z2011-06-17 07:06

1 楼

Red Maple --- 1.5"--- 9-10' ---$60
Autumn Blaze Maple --- 1.75"--- 12'--- $60
October Glory Maple --- 1.5" ---9'--- $80
Summer Red Maple --- 1.75" ---10' ---$60
Trident Maple --- 1.75" ---10' ---$80
Nuttal Oak --- 1.75" ---10'--- $80
Willow Oak --- 1.75" ---12' ---$80
Heritage Riverburch --- 1" ---9' ---$80
Green Vase Zelkovia --- 1"--- 10'--- $90
Village Green Zelkovia --- 1.5"--- 10'--- $90
Bald Cypress --- 1.5"--- 9' ---$90
Weeping Willow --- 1"--- 9' $60
Evergreen Trees
Yoshino Cryptomeria -

u*a2011-06-17 07:06

2 楼

在 Lovelace 里出演 Linda Lovelace. 本来以为会本色演出, 结果因为剧中 porn
star 的原型不好看所以被迫扮丑了. 感觉没有平时的无辜感. 虽然这次好像演技高级
了不少, 可是观众本来是期望看伪装无辜的porn star的吧...

e*t2011-06-17 07:06

3 楼

如果能建一个统计模型，把这三个整合到一起，是不是很cool？

m*22011-06-17 07:06

4 楼

depends on where you are.
p.s. the prices are kind of too high.

g*r2011-06-17 07:06

5 楼

以前的片子真的没演技
这个不错
可能本人就有这方面潜质吧 XD

【在 u******a 的大作中提到】

: 在 Lovelace 里出演 Linda Lovelace. 本来以为会本色演出, 结果因为剧中 porn
: star 的原型不好看所以被迫扮丑了. 感觉没有平时的无辜感. 虽然这次好像演技高级
: 了不少, 可是观众本来是期望看伪装无辜的porn star的吧...

d*e2011-06-17 07:06

6 楼

好像有无数人在做这个

【在 e*****t 的大作中提到】

: 如果能建一个统计模型，把这三个整合到一起，是不是很cool？

n*a2011-06-17 07:06

7 楼

i got a Little Gem Magnolia (7') at local homedepot for $40. I think you can
get it even cheaper somewhere else.

u*a2011-06-17 07:06

8 楼

演技在 porn star 里算高级的了...

【在 g*******r 的大作中提到】

: 以前的片子真的没演技
: 这个不错
: 可能本人就有这方面潜质吧 XD

e*t2011-06-17 07:06

9 楼

really? i search some literature. only couples of paper talk about the model
of integration of these three.many ppl do model correlation between cnv and
gene expression or methylation and gene expression. but only few try to put
the three together. there are some statistical issues hard to handle.

【在 d*******e 的大作中提到】

: 好像有无数人在做这个

m*y2011-06-17 07:06

10 楼

outgrown your property.

s*n2011-06-17 07:06

11 楼

觉得她演技还行，不能算多好，但比很多花瓶强，
那个骚样很适合演妓女角色。

【在 g*******r 的大作中提到】

: 以前的片子真的没演技
: 这个不错
: 可能本人就有这方面潜质吧 XD

t*d2011-06-17 07:06

12 楼

methylation 和 gene expression 相关性好吗？

u*a2011-06-17 07:06

13 楼

是的, 看到她就来气...

【在 s******n 的大作中提到】

: 觉得她演技还行，不能算多好，但比很多花瓶强，
: 那个骚样很适合演妓女角色。

d*u2011-06-17 07:06

14 楼

我觉得最重要还是你这个模型得够精确吧。很多时候模型分析出来得准确程度并不见得
就比纯手工实验得准确度高很多

J*e2011-06-17 07:06

15 楼

我觉得至少比现在的真实很多。

【在 g*******r 的大作中提到】

: 以前的片子真的没演技
: 这个不错
: 可能本人就有这方面潜质吧 XD

s*s2011-06-17 07:06

16 楼

想入非非。这么一点信息就可以预测了，那帮做histone marker的都关门算了。
我这么说吧，你把什么methylation, histone, SNV, SNP, 其他各种marker
全加进去，算出来一个能解释90%的expression，我认为是没问题的，不过任然
没用，换个细胞系得推翻重来。

【在 e*****t 的大作中提到】

: 如果能建一个统计模型，把这三个整合到一起，是不是很cool？

d*d2011-06-17 07:06

17 楼

她也露了？看来她也想拿奥斯卡。

【在 u******a 的大作中提到】

l*u2011-06-17 07:06

18 楼

这个是5年前的fashion了，叫 integrative genomics.

【在 e*****t 的大作中提到】

: 如果能建一个统计模型，把这三个整合到一起，是不是很cool？

L*h2011-06-17 07:06

19 楼

她什么时候有过无辜感。。。
总是鼓着金鱼泡眼，等着被干的样子

【在 u******a 的大作中提到】

e*t2011-06-17 07:06

20 楼

5年前有CNV吗？

【在 l******u 的大作中提到】

: 这个是5年前的fashion了，叫 integrative genomics.

u*a2011-06-17 07:06

21 楼

我觉得很无辜啊. 有种无辜的 little slut 感...看着就来气, 总想好好惩罚一下.

【在 L*********h 的大作中提到】

:
: 她什么时候有过无辜感。。。
: 总是鼓着金鱼泡眼，等着被干的样子

e*t2011-06-17 07:06

22 楼

随着统计学方法的不断改进，总是会越来越精确。如果measurement的noise越来越小，
signal/noise越来越大的话。

【在 d****u 的大作中提到】

: 我觉得最重要还是你这个模型得够精确吧。很多时候模型分析出来得准确程度并不见得
: 就比纯手工实验得准确度高很多

h*o2011-06-17 07:06

23 楼

哈哈刮叔是想SM伊吗

【在 u******a 的大作中提到】

: 我觉得很无辜啊. 有种无辜的 little slut 感...看着就来气, 总想好好惩罚一下.

e*t2011-06-17 07:06

24 楼

做histone marker和这个不矛盾。现代生物学就是bench和计算相结合。你要找任何生
物现象的相关性，就得用统计模型，就像QTL 对gene mapping的贡献。有种你发
genomic paper，不用任何统计方法，能发的出去，我就佩服。

【在 s******s 的大作中提到】

: 想入非非。这么一点信息就可以预测了，那帮做histone marker的都关门算了。
: 我这么说吧，你把什么methylation, histone, SNV, SNP, 其他各种marker
: 全加进去，算出来一个能解释90%的expression，我认为是没问题的，不过任然
: 没用，换个细胞系得推翻重来。

u*a2011-06-17 07:06

25 楼

啊, 没有sm的爱好, 就是看她无辜的样子不爽而已, 要用某种惩罚来还原她的本来面目.
人有欺负无辜生物的本能, 类似看到很可爱的小孩就想过去捏脸. 像 Amanda 这种无辜
的小荡妇就很容易把人的这种本能激发起来了...

【在 h**********o 的大作中提到】

: 哈哈刮叔是想SM伊吗

l*u2011-06-17 07:06

26 楼

早都有了，有FISH的时候就开始研究这个了，后来有了array CGH 就方便很多了，现在
的测序技术更是极大提升了这方向的研究能力。

【在 e*****t 的大作中提到】

: 5年前有CNV吗？

l*k2011-06-17 07:06

27 楼

她早就在chloe里头露点了

【在 d*****d 的大作中提到】

: 她也露了？看来她也想拿奥斯卡。

l*u2011-06-17 07:06

28 楼

为啥一定要用cell line 这么artificial的东西？

【在 s******s 的大作中提到】

d*d2011-06-17 07:06

29 楼

谢谢推荐，找来看看。

【在 l**k 的大作中提到】

: 她早就在chloe里头露点了

e*t2011-06-17 07:06

30 楼

那时候的data还远没有到whole genome的程度。几十年前就有SNP了，那时候能做GWAS
吗？

【在 l******u 的大作中提到】

: 早都有了，有FISH的时候就开始研究这个了，后来有了array CGH 就方便很多了，现在
: 的测序技术更是极大提升了这方向的研究能力。

s*s2011-06-17 07:06

31 楼

cell line都做不出来，组织就更不用混了。
我的point就是，yes, 你可以用统计方法拼命regression，加无数变量做个R2 0.9;
但是仍然没啥意义，因为如果是好方法，就要不仅能解释，还要能应用，也就是同样
用来解释其他cell line或者组织。如果你不把细胞特异性考虑进去，我觉得这种
model多半不work, 如果为了每个cell line都要做实验estimate一些新的variable,
意义也不大。

【在 l******u 的大作中提到】

: 为啥一定要用cell line 这么artificial的东西？

l*u2011-06-17 07:06

32 楼

array CGH 就是GWAS 的，比10年前就有了。

GWAS

【在 e*****t 的大作中提到】

: 那时候的data还远没有到whole genome的程度。几十年前就有SNP了，那时候能做GWAS
: 吗？

l*u2011-06-17 07:06

33 楼

为啥“cell line都做不出来，组织就更不用混了。”牛人解释一下？

【在 s******s 的大作中提到】

: cell line都做不出来，组织就更不用混了。
: 我的point就是，yes, 你可以用统计方法拼命regression，加无数变量做个R2 0.9;
: 但是仍然没啥意义，因为如果是好方法，就要不仅能解释，还要能应用，也就是同样
: 用来解释其他cell line或者组织。如果你不把细胞特异性考虑进去，我觉得这种
: model多半不work, 如果为了每个cell line都要做实验estimate一些新的variable,
: 意义也不大。

s*t2011-06-17 07:06

34 楼

CNV主要还是依赖于array的。
CNV－seq虽然有些人在做，但是并不好用。找CNV也不需要测序，array足以。
CNV还是最近两年得到重视的。

【在 l******u 的大作中提到】

: 早都有了，有FISH的时候就开始研究这个了，后来有了array CGH 就方便很多了，现在
: 的测序技术更是极大提升了这方向的研究能力。

n*72011-06-17 07:06

35 楼

array找breakpoint的精度也太差了吧？

【在 s*********t 的大作中提到】

: CNV主要还是依赖于array的。
: CNV－seq虽然有些人在做，但是并不好用。找CNV也不需要测序，array足以。
: CNV还是最近两年得到重视的。