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很多人都在找的重要蛋白
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c*h
2
耆那教尊奉尊者大雄(Mahavira)笩駄摩那为第24代祖师(Tirthankar),也是最后一位祖
师。根据耆那哲学所述,所有的祖师都是人类。但是,他们已经通过禅定训练和自我实
现达到了完美或觉悟的状态——他们就是耆那(jina)即胜者、「生命痛苦的征服者」,
。在汉译佛典中称耆那教为尼干外道﹑无系外道﹑裸形外道﹑无惭外道或宿作因论等
第24代祖师大雄,实际上也算是创教教主,于公元前599年延生在古印度距吠舍离(
Vesali)45公里的贡得村,其父母属刹帝利种姓,父亲是贝拿勒斯一个小王国的君主。
他家庭富裕,生活奢华。大雄婚后生有一女,但他并不感到幸福,他父亲死后,当他大
约30岁时便立志出家苦行,寻找解脱不幸的宗教途径。
在极端困难条件下,他苦行修炼,长达12年之久。当他苦修到13个年头时,终于在吠耶
婆达东北建皮耶村的一棵沙罗树下觉悟成道,时年42岁。大雄成道后,先后组织教团,
宣传教义,进行宗教改革活动,长达30多年,他于公元前527年死于巴瓦,终年72岁。
耆那教中不存在作为宇宙创造神,保护神和破坏神的概念。另外,神为了降伏恶魔而投
胎成人的想法在耆那教中也不被接受。认为世界是由极微构成,不由神造。
教主大雄解释道:「无始以来,所有的生物(灵魂)都是在业的束缚中,而业是善或恶
行为的积聚。在业的影响下,灵魂习惯于在物质财富中寻找快乐,从而就有暴力的想法
、行为、愤怒、怨恨、贪婪及诸如此类的罪恶在心中扎根。这些结果也导致业的进一步
积聚。」
耆那教否定当地婆罗门教主张的吠陀天启,祭祀万能,婆罗门至上,针锋相对地提出吠
陀并非真知,祭祀杀生,只会增加罪恶,婆罗门是不学无术的祭司,宣传种姓平等,反
对种姓制度和婆罗门教的神灵崇拜,崇信耆那教经典,以对抗吠陀经,强调苦行和戒杀
,以对抗祭祀万能。耆那教固守灵魂转世、因果报应和轮回解脱,并且认为,一切生物
都有灵魂,都是神圣的,人的灵魂在未解脱前为业所束缚并无限轮回。认为“业”可决
定人的过去和未来,将禁欲和苦行视为解脱的最佳途径。人们只有通过修炼,使灵魂摆
脱“业”的桎梏,才能获得最后解脱。
主张五戒:不杀生、不妄言、不偷盗、不奸淫、戒私财。耆那教认为,只有严格实行戒
律,经过苦行修炼,才能清除旧业的束缚,就可达到“寂静”,灭其情欲,获得“解脱
”。
教主大雄教导:「正知(samyak-darshana)、正见(samyak-jnana)和正行(samyak-
charitra)是自我解脱的真实之路。」
正行由五誓言构成:
1. 非暴力(Ahimsa)——不伤害任何生物。
2. 诚实语(Satya)——只说实话且语不伤人。
3. 不偷窃(Asteya)——不拿经由不当方法、途径得到的东西。
4. 纯洁行(Brahmacharya)——不沉溺于肉欲的快乐。
5. 不执着(Aparigraha)——完全不粘着人、地和物。
关于精神进阶的问题,如同大雄所预言的那样,男女在条件上是平等的。放弃和解脱的
魅力也同样吸引着女性为之奋斗。很多女性遵循大雄指示的道路,为寻找最终的幸福放
下了和世间的关系。
这样,如果她们以正见理解,并忠实地遵循耆那教的原则,就将为他们在此世的生命带
来满足和内在的幸福,死后灵魂将再生到具有更高精神水平的世界,获得完全的觉悟,
达到最后永恒的至福,结束所有的生无穷循环。
(cpath注: 耆那教想达到的解脱,看起来与佛教没有差别,看起来。)
被大雄教义吸引的人们包括了各阶层的民众:富户和贫者,国王和平民,男和女,王子
和公主,高贵者和贱民。
耆那教也属于反婆罗门的异端宗教,主张不害(非暴力),提倡严格苦行,公元区分为"白衣
派"和"天衣派"(裸体派,以天为衣)。现代印度民族独立领袖圣雄甘地吸收耆那教不害的
教义,曾发起反对英国殖民统治的非暴力不合作运动。
该教是一种禁欲宗教,其教徒主要集中在西印度。耆那教不讲究信神,但崇拜24祖。
由于宗教信仰的原因,耆那教徒一般不从事以屠宰为生的职业,诸如当兵、屠夫、皮匠
等,甚至也不从事农业。在他们看来农夫犁地也会伤害虫类等生物,所以耆那教徒从事
商业、贸易或工业的较多,由于他们讲究诚实和道德,他们成了印度优秀的商人或著名
财团。著名的瓦尔昌德、达尔米亚和贾恩三个财团的家族都是耆那教徒。耆那教徒在印
度社会声望相当高。他们工作努力,脚踏实地,是印度最富有的阶层之一。
耆那教与印度教很接近,因此,在印度信耆那教的人,也可以被算作印度教的第三种性
,他们与印度教徒可以彼此通婚。
耆那教最初的活动中心是恒河流域,公元前3世纪,由于摩揭陀地区12年连续发生灾荒
,于是耆那教开始由北南移,转移到南印度德干高原和西印度地区。公元1世纪左右,
它分裂为天衣派和白衣派,后来两派又继续分裂。白衣派主张男女一样能获得拯救,各
种姓一律平等,否认裸体的必要性,主张僧侣穿白袍。允许出家人占有一定的生活必需
品,允许男女结婚生育等。
据耆那教文献《圣行经》记载,大雄逝世时已有教徒52万多人。到公元前 3世纪耆那教
和佛教都受到孔雀王朝阿育王的支持和保护。
在1990年的人数耆那教徒全世界估计为365.0万,几乎所有的人生活在印度。
教义与学说
教义有六谛说,即命、漏入、系缚、制御、寂静和解脱。认为宇宙万物由灵魂(命
)和非灵魂(非命)组成,灵魂包括能动和不动的两大类,能动的则根据感觉器官的多
少分为六种:一个器官(皮)的,如植物;二个器官(皮、舌)的,如虫;三个器官(
皮、舌、鼻)的,如蚁;四个器官(皮、舌、鼻、眼)的,如蜂;五个器官(皮、舌、鼻
、眼、耳)的,如兽;五个以上器官(皮、舌、鼻、眼、耳、心)的,如人。不动的灵
魂存在于地、水、风、火四大元素之中。所以耆那教认为动植物和非生物体内均有灵魂
存在,不能任意伤害。非灵魂也包括两大类,一类是定形的物质,由原子和原子的复合
体组成;另一类是不定形的物质,由时间、空间、法和非法组成。耆那教是印度最早提
出原子论学说的派别之一。
伦理观
耆那教在宗教伦理观上,提出了漏入和系缚的理论,他们认为一切有生命的物类其
本性是清净、圆满的,但是非生命体的物质却常常形成一种障碍,掩盖着灵魂原有的光
辉,使灵魂受着束缚。这种障碍称为业。他们认为业是一种特殊的、细微不可见的物质
,这种物质流入灵魂并附着于灵魂即为漏入。业有八类:智业遮盖灵魂的智慧;见业遮
盖正确的直觉;受业遮盖灵魂的幸福,滋生苦乐;痴业遮盖正信,产生情欲;寿业决定生
命的长短;名业决定身体的特质;种业决定种姓、国籍;遮业决定性力。这八种业是前
生所定的(宿作因),它们系缚在灵魂上,要想解脱就得制御。
他们认为制御的方法是持五戒,修三宝,实行苦行。五戒是不杀生、不欺狂、不偷盗、
不奸淫、不蓄私财。三宝为正智(正确习解)、正信(正确信仰)、正行(正确实行)
。耆那教徒还实行各种苦行,他们认为只有苦行才能排除旧业,使新业不生,达到寂静
,使灵魂呈现出原有的光辉,从而脱离轮回之苦,获得解脱。
耆那教与佛教的比较
佛陀认为「老病死苦」的逼迫是缘于「生」,所谓「有生故有老病死,生灭故老病死灭
」,而「生」的生起主要是缘于对五蕴的妄取,所谓妄取五蕴是我、我所,又妄取是缘
于对五蕴生贪爱,而贪爱则是缘于不知五蕴无常的「无明」。因此, 佛陀对于灭除「
老病死苦」的修行方法,即强调「当正见五蕴无常,正见者则于五蕴生厌、离欲,乃至
灭尽」是唯一的道路。

然而,早于佛教的耆那教,却有着和 佛陀的主张完全不同的见解,耆那教的解脱思惟
主要源于印度古典奥义书,主张一切众生本来即具有「常乐我净的神我」,认为生死的
逼迫是「常乐我净的神我」受到「染污的烦恼(阿尸婆罗)」所蒙蔽的缘故,所谓:因
「烦恼」而造业,因「业」而有生死业报,所以除了要伏断「烦恼」以体现「常乐我净
的神我」以外,更要远离一切
的「业」,因为只有如此才能彻底的除尽生死业报。所以,耆那教不仅以修持禅定与「
梵我一如」的观想,作为体现「常乐我净的神我」的方法,另外还实践种种严苛的苦行
,除了终生不着衣物、赤身露体,即使是饮食所需的钵也不受用,甚至主张饿死,并且
为了彻底远离任何有关于「杀生的业」而提倡「不食鱼、肉」,如此种种即为耆那教为
了「彻底消业」而主张的修行办法。
耆那教以为众生本具「常乐我净的神我」,主张众生平等,而 佛陀以为人不因血统、
身份与性别而有差别,但有着智慧、德行与功绩的分别,所以主张「种姓平等」。此外
,耆那教以为女性是染污与卑贱的业报,所以女性必需经由业报的净化待「女转男身」
以后,才有真正解脱的可能(但后来分裂而出的白衣派,则主张两性平等),而 佛陀
却认为只要能正见「五蕴无常」,进而断除对五蕴的贪爱,不妄取五蕴是我、我所,即
可正向于苦灭,这是不分男女老少皆有机会于此生达至,不认为圆满的解脱需要「女转
男身」
以上摘自—
wiki,http://blog.yam.com/jainism/,百度,http://www.arahant.org/middle07.html
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w*1
3
Tue, 12 Jun 2012 16:19:32 PDT
Apple claims that iOS 6, the next version of its iPhone and iPad operating
system, is "compatible" with devices as old as the iPhone 3GS. The 3GS was
originally released nearly three years ago in June 2009 -- an eternity in
gadget time.
However, at the bottom of Apple's iOS 6 info page lies a small disclaimer: "
Not all features are available on all devices." This is followed by 8
footnotes detailing exactly what features work on what device.
Some features, like the VIP List for email, the Offline Reading List, and
Shared Photo Stream won't work on the iPhone 3GS. Even flagship iOS features
like Flyover, turn-by-turn navigation, and FaceTime over cellular won't
work on recent devices like the iPhone 4 or the iPad 2 -- not to mention the
iPhone 3GS.
All that said, however, iPhone 3GS owners will receive iOS 6 features like
redesigned App and Music Stores, Cloud Tabs in Safari, Facebook integration,
and other improvements -- it just won't include nearly the same number of
features as the owners of Apple's latest and greatest gadgets.
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c*o
4
说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA
是完全出乎意料的)。大家还知道别的例子不(特别是那些molecular identity还没有
确定的)?
BTW俺是从2020年来的但不会做实验,所以我们可以合作:你提出问题我可以给出答案
提示。。。
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p*e
5


【在 p*****e 的大作中提到】
: 按摩女。
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q*2
6
请问知道不知道2015年发表的重要蛋白的名称和功能?谢谢:)
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b*a
7
第一次看到她你家猫这么可怜巴巴的。

【在 p*****e 的大作中提到】

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h*8
8
2019年生物是不是还是这么惨淡?

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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S*t
9
真凄凉,
岁月和操劳在她的额头刻下了痕迹,
形成了一个M形的纹路

【在 p*****e 的大作中提到】

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b*e
10
请问2011年底的mega乐透最后彩票号码多少,站内回信,非常感谢。

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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c*a
11
哈哈哈
挺形象
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s*y
12
ABA receptor
DNA de-methylase

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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p*e
13
坐姿挺好吧。。。现在天天晚上给爸爸按模
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p*m
14
哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
paper还是看的不够广泛
俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
等我再想想。。

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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b*a
15
bso啊。

【在 p*****e 的大作中提到】
: 坐姿挺好吧。。。现在天天晚上给爸爸按模
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p*m
16
另外,你要真的是穿越的 就偷偷站内告诉我几个答案吧...我最想知道第三第五 拿10年
命来换也行...

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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p*e
17
眼镜来了,胖丽就凄凉了,开始讨好她爸寥。

【在 b******a 的大作中提到】
: bso啊。
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r*a
18
mTOR的plasma membrane amino acid transporter好象有一个cell paper提到过,只是
amino acid transporter,但是不知道怎么引起phosphorylation cascade...

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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b*a
19
你家眼镜是不是偷偷被胖丽揍了,这眼圈真黑啊。

【在 p*****e 的大作中提到】
: 眼镜来了,胖丽就凄凉了,开始讨好她爸寥。
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M*n
20
don't miss suPAR
published in Nat Med latest issue.
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s*r
21
lol

【在 S********t 的大作中提到】
: 真凄凉,
: 岁月和操劳在她的额头刻下了痕迹,
: 形成了一个M形的纹路

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b*r
22
我觉得最近那几篇关于5-Hydroxymethylcytosine的文章还是比较靠谱的
你觉得靠不住?

【在 s******y 的大作中提到】
: ABA receptor
: DNA de-methylase
:
: microRNA

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o*l
23
这么胖的按摩女。。。嘿嘿。。。
又来一个小racoon?!
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b*r
24
楼主既然提到这些蛋白,想必故事了然于心,不拿出来分享一下就有点不地道了
我觉得还不太清楚的几个关键分子/pathway,一个是控制器官大小和形状的(当然最近Hippo还是做
出来了一些东西),一个是双链染色体怎么在分裂的时候配对和同源重组。
neuroscience方面就更多了,什么东西控制人的性格,人的智力等等
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t*u
25
现在大佬不好伺候呀……
眼睛咋来的?
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c*r
26
lz,我想要2020年的数据库链接!! 站内,多谢~
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d*g
27
lol

【在 b******a 的大作中提到】
: 你家眼镜是不是偷偷被胖丽揍了,这眼圈真黑啊。
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s*y
28
我觉得在其他实验室陆续重复出来之前都不可信。
主要是狼来了好几次了,我都不知道哪只是真狼哪只是假狼了

【在 b****r 的大作中提到】
: 我觉得最近那几篇关于5-Hydroxymethylcytosine的文章还是比较靠谱的
: 你觉得靠不住?

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y*l
29
可怜哪~~~
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p*m
30
\up...这么好的话题为啥没人聊。。。

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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t*8
31
你俩都挺逗
看你们养猫的,我也痒痒了

【在 S********t 的大作中提到】
: 真凄凉,
: 岁月和操劳在她的额头刻下了痕迹,
: 形成了一个M形的纹路

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c*l
32
关于amino acid transporter, mTOR的上游开关, 不是David Sabatini老早有paper了
吗,Rag ABCD,但不是膜蛋白。

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
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p*e
33
眼镜是朋友家的。过来视察环境,12月要在我这儿代养一周。:)
眼睛很乖,典型的lap cat. 可以一直坐在腿上不下来。
眼镜一哼哼,我家大丽就钻沙发底了。不时又会出来偷窥一下眼镜。
眼镜回去了,她就每晚给我们按摩了:)
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p*m
34
AA又不能自己穿过细胞膜 那个只能算mTOR上游一个很重要的分子罢了。AA本身怎么从循
环系统进入细胞调节细胞内活动还是个未知问题,而且是个更有意思的问题,因为吧wh
ole organism和细胞联系起来了。
endosome上好像有AA transporter有报道,但是这个和细胞膜上的是不是一样的还不知
道,八成不是一样的

【在 c****l 的大作中提到】
: 关于amino acid transporter, mTOR的上游开关, 不是David Sabatini老早有paper了
: 吗,Rag ABCD,但不是膜蛋白。
:
: story
: plasma

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p*e
35
她不要欺负胖丽就好。。。
我家胖丽只会欺负我们。

【在 b******a 的大作中提到】
: 你家眼镜是不是偷偷被胖丽揍了,这眼圈真黑啊。
avatar
j*e
36
1. What is the receptor of A-beta protein? is PrP real?
2. What is the least number of mutations that can transform cells into
cancer?
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m*u
37
艳后咋混得这么惨?
眼镜不会就是版上那个眼镜吧?挺象的。
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P*d
38
什么样的条件可以算气体的受体呢?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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p*e
39
眼睛他妈刚领养她不久,前两周贴过的。
眼睛他妈刚领养她不久,前两周贴过的。眼镜家还有老大二傻,眼睛经常被二傻哈和哼
。到我家来她就哼胖丽了,胖丽没脾气就钻沙发了。
avatar
X*n
40
乙烯的受体算不算活性气体的细胞内受体呢?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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j*a
41
艳后太乖了,虽然贵为艳后,可还是如此孝顺爸爸~
avatar
p*m
42
乙烯受体找到了吧 呵呵 这个当然算很重要的

【在 X******n 的大作中提到】
: 乙烯的受体算不算活性气体的细胞内受体呢?
:
: story
: plasma

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s*a
43
爸妈有新宠,怪不得艳后忧郁了
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X*n
44
mTOR的上游开关估计是很多做autophagy的人做梦都想解决的问题。
avatar
h*o
45
小模样儿。。。。。。
avatar
c*l
46
Lots of membrane amino acid transporters has been identified!! You can
easily find a review paper on this like the following one.
Amino Acid Transport Across Mammalian Intestinal and Renal Epithelia
http://physrev.physiology.org/content/88/1/249.short
The transport of amino acids in kidney and intestine is critical for the
supply of amino acids to all tissues and the homeostasis of plasma amino
acid levels. This is illustrated by a number of inherited disorders
affecting amino acid transport in epithelial cells, such as cystinuria,
lysinuric protein intolerance, Hartnup disorder, iminoglycinuria,
dicarboxylic aminoaciduria, and some other less well-described disturbances
of amino acid transport. The identification of most epithelial amino acid
transporters over the past 15 years allows the definition of these disorders
at the molecular level and provides a clear picture of the functional
cooperation between transporters in the apical and basolateral membranes of
mammalian epithelial cells. Transport of amino acids across the apical
membrane not only makes use of sodium-dependent symporters, but also uses
the proton-motive force and the gradient of other amino acids to efficiently
absorb amino acids from the lumen. In the basolateral membrane, antiporters
cooperate with facilitators to release amino acids without depleting cells
of valuable nutrients. With very few exceptions, individual amino acids are
transported by more than one transporter, providing backup capacity for
absorption in the case of mutational inactivation of a transport system.

从循
wh

【在 p*****m 的大作中提到】
: AA又不能自己穿过细胞膜 那个只能算mTOR上游一个很重要的分子罢了。AA本身怎么从循
: 环系统进入细胞调节细胞内活动还是个未知问题,而且是个更有意思的问题,因为吧wh
: ole organism和细胞联系起来了。
: endosome上好像有AA transporter有报道,但是这个和细胞膜上的是不是一样的还不知
: 道,八成不是一样的

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t*u
47
看一次笑一次
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
avatar
c*o
48
乙肝病毒HBV的human receptor这个有些蹊跷,expression cloning和genome wide
RNAi都这么多年了。。。其实可以靠模式生物解决
千万得相信俺是穿越来的啊。。。

【在 p*****m 的大作中提到】
: 另外,你要真的是穿越的 就偷偷站内告诉我几个答案吧...我最想知道第三第五 拿10年
: 命来换也行...
:
: story
: plasma

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x*n
49
太太太。。。搞笑乐。

【在 S********t 的大作中提到】
: 真凄凉,
: 岁月和操劳在她的额头刻下了痕迹,
: 形成了一个M形的纹路

avatar
c*l
50
what 模式生物 do you think Hep B is able to infect?

【在 c***o 的大作中提到】
: 乙肝病毒HBV的human receptor这个有些蹊跷,expression cloning和genome wide
: RNAi都这么多年了。。。其实可以靠模式生物解决
: 千万得相信俺是穿越来的啊。。。

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p*e
51
为啥压?我看着挺凄凉的。:(

【在 t*****u 的大作中提到】
: 看一次笑一次
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈
: 哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈哈

avatar
c*o
52
rotten egg smell receptor 这个更奇怪了,跟GPCR好像没有任何关系,俺看到那个蛋
白的名字都晕了,不懂。

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

avatar
t*u
53
艳后的小表情,真的太好玩了!

【在 p*****e 的大作中提到】
: 为啥压?我看着挺凄凉的。:(
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c*o
54
有一个很hot的protein叫ChM2,某微生物里发现的电磁敏感的通道蛋白,不知道为什么
那么hot
是一个叫什么Carl D的实验室发现的

【在 q****2 的大作中提到】
: 请问知道不知道2015年发表的重要蛋白的名称和功能?谢谢:)
avatar
X*n
55
AA的transporter当然绝大多数很早就知道了,可是mTOR的开关还是个迷

disturbances

【在 c****l 的大作中提到】
: Lots of membrane amino acid transporters has been identified!! You can
: easily find a review paper on this like the following one.
: Amino Acid Transport Across Mammalian Intestinal and Renal Epithelia
: http://physrev.physiology.org/content/88/1/249.short
: The transport of amino acids in kidney and intestine is critical for the
: supply of amino acids to all tissues and the homeostasis of plasma amino
: acid levels. This is illustrated by a number of inherited disorders
: affecting amino acid transport in epithelial cells, such as cystinuria,
: lysinuric protein intolerance, Hartnup disorder, iminoglycinuria,
: dicarboxylic aminoaciduria, and some other less well-described disturbances

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X*n
56
比如protein interactome in yeast?

【在 c****l 的大作中提到】
: what 模式生物 do you think Hep B is able to infect?
avatar
X*n
57
haha

【在 c***o 的大作中提到】
: 有一个很hot的protein叫ChM2,某微生物里发现的电磁敏感的通道蛋白,不知道为什么
: 那么hot
: 是一个叫什么Carl D的实验室发现的

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c*l
58
Are you sure, have you ever read David Sabatini's papers on Rag proteins??

【在 X******n 的大作中提到】
: AA的transporter当然绝大多数很早就知道了,可是mTOR的开关还是个迷
:
: disturbances

avatar
c*o
59
话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊
的,从此线粒体Ca2+领域进入了全面的分子时代。。。”BTW,Vamsi用的Darwin程序可
真是强大,充分利用了几亿年地球生物上的劳动成果,你说他能不比咱们广大千老们有
效率么!

近Hippo还是做

【在 b****r 的大作中提到】
: 楼主既然提到这些蛋白,想必故事了然于心,不拿出来分享一下就有点不地道了
: 我觉得还不太清楚的几个关键分子/pathway,一个是控制器官大小和形状的(当然最近Hippo还是做
: 出来了一些东西),一个是双链染色体怎么在分裂的时候配对和同源重组。
: neuroscience方面就更多了,什么东西控制人的性格,人的智力等等

avatar
p*m
60
AA transporter当然知道了n多了 但是我问的是 哪个AA transporter能直接作为mTOR的
上游,换句话说就是直接检测extracellular AA然后induce mTOR response。也许会像
果蝇里发现的slimfast那种。而不是简单的运输AA到细胞里面。
既然你提到Sabatini 那好吧。。我前些时候和他meeting,我还提到了这个问题 他自己
都觉得这是个没解决的的极端重要问题

【在 c****l 的大作中提到】
: Are you sure, have you ever read David Sabatini's papers on Rag proteins??
avatar
p*m
61
怎么用模式生物呢?仔细说说?
HBV receptor可能>1,甚至>n 所以简单的expression cloning没法做。因为HBV不能侵
染cell line,因此RNAi screen也没法做啊。穿越帝看来2020这个问题也没解决么 哈哈

我曾经想过用oocyte做 expression cloning,这样一次可以搞n个gene筛选,等我有了上
千万每年花不掉我就搞人来筛这个

【在 c***o 的大作中提到】
: 乙肝病毒HBV的human receptor这个有些蹊跷,expression cloning和genome wide
: RNAi都这么多年了。。。其实可以靠模式生物解决
: 千万得相信俺是穿越来的啊。。。

avatar
z*t
62
这个办法得assume protein的修饰和人类细胞中是一致的吧,倒是肝细胞人源化的小鼠
是一个出路

【在 X******n 的大作中提到】
: 比如protein interactome in yeast?
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p*m
63
....

【在 c***o 的大作中提到】
: rotten egg smell receptor 这个更奇怪了,跟GPCR好像没有任何关系,俺看到那个蛋
: 白的名字都晕了,不懂。
:
: story
: plasma

avatar
p*m
64
居然不是M.People实验室发现的?555

【在 c***o 的大作中提到】
: 有一个很hot的protein叫ChM2,某微生物里发现的电磁敏感的通道蛋白,不知道为什么
: 那么hot
: 是一个叫什么Carl D的实验室发现的

avatar
c*o
65
Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
-Induced Pruritus
这个不算?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

avatar
c*l
66
Vamsi Mootha has very intereting background.
Dr. Mootha received his B.S. (with honors, with distinction) in Mathematical
and Computational Science at Stanford University. He then received his M.D.
(cum laude) from the Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology
, where his thesis research focused on mitochondrial energetics. Following
an internship and residency in Internal Medicine at Brigham and Women’s
Hospital, he pursued postdoctoral training in Eric Lander’s laboratory at
the Whitehead Institute, where he applied the new tools of genomics to study
mitochondrial biology.

mitochondrial

【在 c***o 的大作中提到】
: 话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
: 世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
: 可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
: 兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
: 线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
: 些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
: biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
: calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
: molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
: 把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊

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c*o
67
模式生物里的突变不受你说的的那个1和n的问题限制
现在不是有HBV的antigen和GFP嘛,既然preS可以被直接饱吞,不用infection也能做
screen
完了,透露太多,信息熵变,2010-2011的历史被改写了。。。

了上

【在 p*****m 的大作中提到】
: 怎么用模式生物呢?仔细说说?
: HBV receptor可能>1,甚至>n 所以简单的expression cloning没法做。因为HBV不能侵
: 染cell line,因此RNAi screen也没法做啊。穿越帝看来2020这个问题也没解决么 哈哈
: 哈
: 我曾经想过用oocyte做 expression cloning,这样一次可以搞n个gene筛选,等我有了上
: 千万每年花不掉我就搞人来筛这个

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p*m
68
哦 我刚才说错了 记错paper了 他们这个算

Chloroquine

【在 c***o 的大作中提到】
: Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
: -Induced Pruritus
: 这个不算?
:
: story
: plasma

avatar
p*m
69
我想想。。。好像不对啊..

【在 c***o 的大作中提到】
: 模式生物里的突变不受你说的的那个1和n的问题限制
: 现在不是有HBV的antigen和GFP嘛,既然preS可以被直接饱吞,不用infection也能做
: screen
: 完了,透露太多,信息熵变,2010-2011的历史被改写了。。。
:
: 了上

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c*o
70
哦,别伤心,M.People实验室在某外星生物上发现了这个东东:
VSEE,电压敏感电磁发射蛋白
从此神经科学领域闹起来革命,因为这个东东可以做cell-resolution fMRI

【在 p*****m 的大作中提到】
: 居然不是M.People实验室发现的?555
avatar
f*u
71
不是很了解这方面。你确定mTOR检测的是胞外AA,而不是胞内AA?

mTOR的

【在 p*****m 的大作中提到】
: AA transporter当然知道了n多了 但是我问的是 哪个AA transporter能直接作为mTOR的
: 上游,换句话说就是直接检测extracellular AA然后induce mTOR response。也许会像
: 果蝇里发现的slimfast那种。而不是简单的运输AA到细胞里面。
: 既然你提到Sabatini 那好吧。。我前些时候和他meeting,我还提到了这个问题 他自己
: 都觉得这是个没解决的的极端重要问题

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c*o
72
都说了,你得相信俺是天马行空穿越来的:)

【在 p*****m 的大作中提到】
: 我想想。。。好像不对啊..
avatar
c*l
73
I think you are right. I think it is likely mTOR senses intracellular AA.
How come an intracellular protein sense exacellular AA? I guess he is not
sure what he is talking about.

【在 f**u 的大作中提到】
: 不是很了解这方面。你确定mTOR检测的是胞外AA,而不是胞内AA?
:
: mTOR的

avatar
p*m
74
mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
找文献吧。。。

【在 c****l 的大作中提到】
: I think you are right. I think it is likely mTOR senses intracellular AA.
: How come an intracellular protein sense exacellular AA? I guess he is not
: sure what he is talking about.

avatar
c*l
75
I agree with you on that mTOR is bound to intracellular membrane but I do
not think it is plasma membrane associated.

【在 p*****m 的大作中提到】
: mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
: 找文献吧。。。

avatar
P*d
76
被谁吞?

【在 c***o 的大作中提到】
: 都说了,你得相信俺是天马行空穿越来的:)
avatar
r*a
77
这个cell paper提到的amino acid transporter...
Bidirectional Transport of Amino Acids Regulates mTOR and Autophagy
是你说的那个吗?

【在 p*****m 的大作中提到】
: mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
: 找文献吧。。。

avatar
z*t
78
Tet family protein的发现更简单,blast出来的。。。

mitochondrial

【在 c***o 的大作中提到】
: 话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
: 世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
: 可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
: 兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
: 线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
: 些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
: biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
: calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
: molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
: 把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊

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q*g
79
一个是plasma membrane amino acid transporter:slc1a5, slc7a5,Nicklin et al.
, 2009, Cell.

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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q*g
80
他不做transporter, 他更关心leucine是如何激活mTOR的。虽然发现Rag和lysosome 的
作用,但中间还是少了个环节。以前的实验证明不是transporter激活下游的通路,但
也有可能错了呢?

【在 c****l 的大作中提到】
: 关于amino acid transporter, mTOR的上游开关, 不是David Sabatini老早有paper了
: 吗,Rag ABCD,但不是膜蛋白。
:
: story
: plasma

avatar
q*g
81
应该是细胞内的氨基酸,而最重要的是亮氨酸。而为什么亮氨酸对mTOR那么重要,就不
知道了。

【在 f**u 的大作中提到】
: 不是很了解这方面。你确定mTOR检测的是胞外AA,而不是胞内AA?
:
: mTOR的

avatar
q*g
82
关于氨基酸,浓度升高,激活mTor.
浓度降低,激活GCN2/eIFalpha2/ATF4,
同时,他还是组成蛋白的骨架。

【在 c****l 的大作中提到】
: I think you are right. I think it is likely mTOR senses intracellular AA.
: How come an intracellular protein sense exacellular AA? I guess he is not
: sure what he is talking about.

avatar
i*g
83
楼主,从现在起到2020年的 中美股市日K线图能不能给我一份啊
avatar
e*r
84
因为是必需氨基酸?
植物里面有TOR么?

【在 q******g 的大作中提到】
: 应该是细胞内的氨基酸,而最重要的是亮氨酸。而为什么亮氨酸对mTOR那么重要,就不
: 知道了。

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j*x
85
有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。

了上

【在 p*****m 的大作中提到】
: mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
: 找文献吧。。。

avatar
s*r
86
人的原代肝细胞还不能培养?
那刚刚出来的induced的肝细胞能不能用?

有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
了上

【在 j****x 的大作中提到】
: 有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
: 率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
: 不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
: 是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
:
: 了上

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p*m
87
恩 这个知道 但是效率不大可用啊。关于pres 我们知道是必须的 但是单纯pres进细胞
和病毒颗粒是不是一样还不清楚吧 而且穿越帝还要用在模式生物??

【在 j****x 的大作中提到】
: 有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
: 率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
: 不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
: 是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
:
: 了上

avatar
p*m
88
可以培养 但是拿这个screen会死人的。。。

【在 s******r 的大作中提到】
: 人的原代肝细胞还不能培养?
: 那刚刚出来的induced的肝细胞能不能用?
:
: 有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
: 率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
: 不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
: 是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
: 了上

avatar
j*x
89
10%-15%感染效率是足够了(即便是新鲜分离的人原代肝细胞,最佳效率也不过就是20%
-30%吧),对于筛受体绰绰有余。我猜想主要在RNAi抑制效率不够(转染效率太低),
要优化条件或者换别的载体吧细胞又不好好分化了,更没辙。
PreS前导肽介导和受体(至少是受体之一)的结合这个应该没有什么疑问,至于entry
机制和过程是不是完全一致这个无所谓了,你要钓的不就是受体吗?管它是吞钩还是吞
饵呢,钓到了再研究机制也不迟。
要说模式生物也不算错,十年前模式生物就那么几种,现在的“模式生物”差不多多了
几倍了吧,再过十年,模式生物涵盖大部分物种不奇怪啊,呵呵

【在 p*****m 的大作中提到】
: 恩 这个知道 但是效率不大可用啊。关于pres 我们知道是必须的 但是单纯pres进细胞
: 和病毒颗粒是不是一样还不清楚吧 而且穿越帝还要用在模式生物??

avatar
S*l
90
楼主你能告诉我2020年bioinformatics还热么?

【在 c***o 的大作中提到】
: 都说了,你得相信俺是天马行空穿越来的:)
avatar
p*m
91
10%可能困难吧 一般筛受体不都是病毒挂个luciferase or GFP gene,然后看秦染细胞
以后的signal 要是本底信号就highly variable(侵染了10%的细胞或者15%就差出50%),
上了RNAi screen放进plate reader还不得愁死人
preS binding receptor这个可能问题不大(话说回来,PreS binding cell surface
molecle是真的,PreS是进细胞必须应该也是真的.但是这个是不是就说明preS binding
的是receptor?) 话说有没有人直接拿preS和人肝原代细胞incubate然后TAP-MS? 没查
过... 另外,和乙肝病毒或者那个鸟的类似病毒binding的surface molecule找了大于5
个了吧 还是没有找够sufficient的 所以光靠binding来找我是觉得不够的 还是得有
functional assay(i.e. 至少能看到进细胞表达reporter基因)
其实也许HCV的故事会有启发性.HCV一共是找了3个还是4个receptor才算是sufficient
了吧

20%
entry

【在 j****x 的大作中提到】
: 10%-15%感染效率是足够了(即便是新鲜分离的人原代肝细胞,最佳效率也不过就是20%
: -30%吧),对于筛受体绰绰有余。我猜想主要在RNAi抑制效率不够(转染效率太低),
: 要优化条件或者换别的载体吧细胞又不好好分化了,更没辙。
: PreS前导肽介导和受体(至少是受体之一)的结合这个应该没有什么疑问,至于entry
: 机制和过程是不是完全一致这个无所谓了,你要钓的不就是受体吗?管它是吞钩还是吞
: 饵呢,钓到了再研究机制也不迟。
: 要说模式生物也不算错,十年前模式生物就那么几种,现在的“模式生物”差不多多了
: 几倍了吧,再过十年,模式生物涵盖大部分物种不奇怪啊,呵呵

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j*x
92
10%足够了,我认识有几个组用这个系统做entry inhibitor的筛选,效果还不错,有几
个candidates已经开始准备Phase I trial了。10%和15%的差异主要看批次和人手,同
批细胞之间的差异很小(所以实际上Variation没有想象的大),但不同人工之间的差
异不小,属于技术活。主要的问题在,1.这细胞得持续分化1个月以上才能正常感染,
其间不能出任何岔子,否则前功尽弃。一个月后究竟能不能用,谁也不知道,用了才知
道。2. 细胞极其敏感,转染效率低是一定的,siRNA基本没法用。用Lenti转导shRNA吧
,转导完了细胞分化又出问题,更不能用。最主要的是,欧美对HBV这玩艺儿的重视程
度远低于HCV,做的人少自然没结果。要是像HIV那么投入,问题估计已经解决了。
PreS的问题我觉得没有什么争议,Anti-preS Ab有中和抗体活性,结构分析等等证据也
表明了,PreS就是结合受体的(至少是受体之一)。至于能不能一下子找全,谁也没把
握。一个一个来呗。HCV找到现在还不是一样没结论,虽然CD81, SR-BI, DC-SIGN,
Claudin-1,Occludin这个组合缺一不可,但是在非肝源细胞上同时表达这几个蛋白仍然
不能成功建立entry,说明这故事还没完呢,还不算真正sufficient。
有种新理论,in vivo中HBV感染肝细胞是由其他细胞所介导的,这个说法很有趣,也能
解释很多以前解释不了的现象

),
binding
5
sufficient

【在 p*****m 的大作中提到】
: 10%可能困难吧 一般筛受体不都是病毒挂个luciferase or GFP gene,然后看秦染细胞
: 以后的signal 要是本底信号就highly variable(侵染了10%的细胞或者15%就差出50%),
: 上了RNAi screen放进plate reader还不得愁死人
: preS binding receptor这个可能问题不大(话说回来,PreS binding cell surface
: molecle是真的,PreS是进细胞必须应该也是真的.但是这个是不是就说明preS binding
: 的是receptor?) 话说有没有人直接拿preS和人肝原代细胞incubate然后TAP-MS? 没查
: 过... 另外,和乙肝病毒或者那个鸟的类似病毒binding的surface molecule找了大于5
: 个了吧 还是没有找够sufficient的 所以光靠binding来找我是觉得不够的 还是得有
: functional assay(i.e. 至少能看到进细胞表达reporter基因)
: 其实也许HCV的故事会有启发性.HCV一共是找了3个还是4个receptor才算是sufficient

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p*m
93
嗯 受教了(我也想起来以前看到这个细胞要分化n久。。)
我本来也是想硬筛的。因为这玩意看起来也不会比HCV难做太多(HCV的好处是起步容易
,因为一开始就有还说的过去的可侵染的cell line) 无非是有n多receptor必须就是了
。我以前想过用xenopus oocyte,一次把肝细胞total mRNA搭进去看看有没有用 有用的
话不断的fractionation,这样说不定可以一次找全。。
问个问题哈,现在已知那几个HBV receptor-like protein,有没有人针对他们做药物了
?我一直不是很相信那些结果的原因一个就是好像号称发现一个receptor一半就没下文
了(还有原因就是LoS都做得不彻底,这个没办法,要做真正的LoS得用人元代肝细胞进
行遗传操作)

【在 j****x 的大作中提到】
: 10%足够了,我认识有几个组用这个系统做entry inhibitor的筛选,效果还不错,有几
: 个candidates已经开始准备Phase I trial了。10%和15%的差异主要看批次和人手,同
: 批细胞之间的差异很小(所以实际上Variation没有想象的大),但不同人工之间的差
: 异不小,属于技术活。主要的问题在,1.这细胞得持续分化1个月以上才能正常感染,
: 其间不能出任何岔子,否则前功尽弃。一个月后究竟能不能用,谁也不知道,用了才知
: 道。2. 细胞极其敏感,转染效率低是一定的,siRNA基本没法用。用Lenti转导shRNA吧
: ,转导完了细胞分化又出问题,更不能用。最主要的是,欧美对HBV这玩艺儿的重视程
: 度远低于HCV,做的人少自然没结果。要是像HIV那么投入,问题估计已经解决了。
: PreS的问题我觉得没有什么争议,Anti-preS Ab有中和抗体活性,结构分析等等证据也
: 表明了,PreS就是结合受体的(至少是受体之一)。至于能不能一下子找全,谁也没把

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j*x
94
有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说
效果已经非常好了,另有其他一些entry inhibitory peptide/molecule在pre-
clinical阶段的效果也不错,所以我估计眼下针对“疑似”receptor的rational
design不会有太大的吸引力。
chronic HBV治疗,要说最终解决还是得靠免疫学的方法,传统的NRTI也好,entry
inhibitor也罢,治标不治本,解决不了问题。强效Interferon以及前几天热炒的
Adoptive T cell therapy,我觉得应该是目前看来最有前景的方向吧,这玩意在国内
时市场太大了。

是了
用的

【在 p*****m 的大作中提到】
: 嗯 受教了(我也想起来以前看到这个细胞要分化n久。。)
: 我本来也是想硬筛的。因为这玩意看起来也不会比HCV难做太多(HCV的好处是起步容易
: ,因为一开始就有还说的过去的可侵染的cell line) 无非是有n多receptor必须就是了
: 。我以前想过用xenopus oocyte,一次把肝细胞total mRNA搭进去看看有没有用 有用的
: 话不断的fractionation,这样说不定可以一次找全。。
: 问个问题哈,现在已知那几个HBV receptor-like protein,有没有人针对他们做药物了
: ?我一直不是很相信那些结果的原因一个就是好像号称发现一个receptor一半就没下文
: 了(还有原因就是LoS都做得不彻底,这个没办法,要做真正的LoS得用人元代肝细胞进
: 行遗传操作)

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p*m
95
我理解你的意思 不过国内靠大分子药我觉得还是不靠谱 太贵了 用起来又不方便 1亿携
带者呢。。。国内还是要靠疫苗外加小分子药物。而小分子药物最直接的就是block病毒
entry.
当然了,你可以说乙肝携带者其实大多数的肝细胞都已经被侵染了 阻止entry用处不大
。但是现在乙肝在肝细胞之间怎么transfer的似乎了解的不是很清楚,也许阻止entry会
有意想不到的效果?(比如说,virus transfer对维持病毒的存在是关键的)

有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说
效果已经非常好了,另有其他一些entry inhibitory peptide/molecule在pre-
clinical阶段的效果也不错,所以我估计眼下针对“疑似”receptor的rational
design不会有太大的吸引力。
chronic HBV治疗,要说最终解决还是得靠免疫学的方法,传统的NRTI也好,entry
inhibitor也罢,治标不治本,解决不了问题。强效Interferon以及前几天热炒的
Adoptive T cell therapy,我觉得应该是目前看来最有前景的方向吧,这玩意在国内
时市场太大了。
是了
用的

【在 j****x 的大作中提到】
: 有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
: 那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
: 猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说
: 效果已经非常好了,另有其他一些entry inhibitory peptide/molecule在pre-
: clinical阶段的效果也不错,所以我估计眼下针对“疑似”receptor的rational
: design不会有太大的吸引力。
: chronic HBV治疗,要说最终解决还是得靠免疫学的方法,传统的NRTI也好,entry
: inhibitor也罢,治标不治本,解决不了问题。强效Interferon以及前几天热炒的
: Adoptive T cell therapy,我觉得应该是目前看来最有前景的方向吧,这玩意在国内
: 时市场太大了。

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a*e
96
直接上疫苗吧
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j*x
97
entry inhibitor当然有价值,不仅对HBV了,HIV/HCV这些个老大难,如果是有效的
entry inhibitor,价值自然不菲。最近看到几个candidates,很BT的居然能光谱的同
时抑制多种病毒,太发指了。不过要说小分子药物,自然是NRTI和PI最简单,这在HIV/
HCV上体现的最明显。
HBV维持病毒的关键是核内cccDNA,类似HIV整合后的progenome(虽然cccDNA不整合
host genomic DNA),可以在肝细胞内长期稳定存在。小分子药物可以抑制病毒感染/
复制5年10年,但是只要还存在persistent form,病毒就有可能卷土重来。显然目前的
药物还无法直接清除。

亿携
病毒
entry会

【在 p*****m 的大作中提到】
: 我理解你的意思 不过国内靠大分子药我觉得还是不靠谱 太贵了 用起来又不方便 1亿携
: 带者呢。。。国内还是要靠疫苗外加小分子药物。而小分子药物最直接的就是block病毒
: entry.
: 当然了,你可以说乙肝携带者其实大多数的肝细胞都已经被侵染了 阻止entry用处不大
: 。但是现在乙肝在肝细胞之间怎么transfer的似乎了解的不是很清楚,也许阻止entry会
: 有意想不到的效果?(比如说,virus transfer对维持病毒的存在是关键的)
:
: 有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
: 那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
: 猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说

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p*m
98
NRTI/PI总体来说还是容易诱发抗药性吧 这个如果是entry inhibitor从原理上要好?
嗯 cccDNA是很难去掉的,但是如果能有效的抑制entry外加复制,肝细胞应该还是有自
我清除机制的吧?因为成年人即便被乙肝感染也会很快清除掉

HIV/

【在 j****x 的大作中提到】
: entry inhibitor当然有价值,不仅对HBV了,HIV/HCV这些个老大难,如果是有效的
: entry inhibitor,价值自然不菲。最近看到几个candidates,很BT的居然能光谱的同
: 时抑制多种病毒,太发指了。不过要说小分子药物,自然是NRTI和PI最简单,这在HIV/
: HCV上体现的最明显。
: HBV维持病毒的关键是核内cccDNA,类似HIV整合后的progenome(虽然cccDNA不整合
: host genomic DNA),可以在肝细胞内长期稳定存在。小分子药物可以抑制病毒感染/
: 复制5年10年,但是只要还存在persistent form,病毒就有可能卷土重来。显然目前的
: 药物还无法直接清除。
:
: 亿携

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p*m
99
这个是长久之计 但是现在放着1亿携带者也不能让他们自生自灭啊

【在 a***e 的大作中提到】
: 直接上疫苗吧
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q*g
100
yeast, fly里都有。植物不太清楚。

【在 e**r 的大作中提到】
: 因为是必需氨基酸?
: 植物里面有TOR么?

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P*d
101
如果是这个样子,interferon和T cell therapy就不好办了吧?

【在 p*****m 的大作中提到】
: 这个是长久之计 但是现在放着1亿携带者也不能让他们自生自灭啊
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P*d
102
这个感染效率是因为细胞状态的heterogeneity,还是entry本身低效?换句话说,如果
分离已被感染的细胞做二次感染,效率会高么?

20%

【在 j****x 的大作中提到】
: 10%-15%感染效率是足够了(即便是新鲜分离的人原代肝细胞,最佳效率也不过就是20%
: -30%吧),对于筛受体绰绰有余。我猜想主要在RNAi抑制效率不够(转染效率太低),
: 要优化条件或者换别的载体吧细胞又不好好分化了,更没辙。
: PreS前导肽介导和受体(至少是受体之一)的结合这个应该没有什么疑问,至于entry
: 机制和过程是不是完全一致这个无所谓了,你要钓的不就是受体吗?管它是吞钩还是吞
: 饵呢,钓到了再研究机制也不迟。
: 要说模式生物也不算错,十年前模式生物就那么几种,现在的“模式生物”差不多多了
: 几倍了吧,再过十年,模式生物涵盖大部分物种不奇怪啊,呵呵

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j*x
103
靶向病毒本身的entry inhibitor同样会有耐药性的问题(最天然的比如中和抗体逃逸
),靶向宿主蛋白的理论上说好一些,但是从HIV上的经历来看,问题同样存在。当然
对HBV而言问题会小得多,毕竟变异没HIV那么夸张。
Entry inhibitor作为combination therapy的一个组分,效果必然比NRTI/PI
monotherapy效果要好,这是自然的。但是对于Chronic HBV而言,对于彻底清除病毒的
意义不是特别大。对于HCV而言,是一个不错的option,但是我觉得意义也不是特别大
,因为毕竟是RNA病毒,没有persistent form,现在有了2种PI,加上原来的pegIFN和
RBV,(未来还会有几种核苷类RNA聚合酶inhibitor),基本上HCV的治疗未来看不再是
问题了,这个是HBV/HIV无法比的。
cccDNA的清除是个根本问题。自然条件下有1%左右的慢性感染者能自动清除完全自愈,
这个现象临床上几十年前就发现了,但是机制至今无法解释。反正目前看就算能长期抑
制病毒复制,外周血中检测不到HBV DNA很多年后,cccDNA仍然能稳定存在,所以这个
和entry的关系似乎不大,只能是在肝细胞分裂过程中不断的稀释了。或者特异性的靶
向cccDNA的治疗策略,比如利用ZFN,但是显然只是在概念阶段了。

【在 p*****m 的大作中提到】
: NRTI/PI总体来说还是容易诱发抗药性吧 这个如果是entry inhibitor从原理上要好?
: 嗯 cccDNA是很难去掉的,但是如果能有效的抑制entry外加复制,肝细胞应该还是有自
: 我清除机制的吧?因为成年人即便被乙肝感染也会很快清除掉
:
: HIV/

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j*x
104
很多年前,临床上就发现IFN有non-cytolytic HBV clearence effect,究竟啥机制,至
今不明。目前IFN仍然是最有效的chronic HBV治疗方式之一,主要问题是,2种主要的
基因型C/D,尤其是中国流行的C,IFN效果不佳。以后就看怎么提高效率上做文章了。
T cell therapy也没什么不好办,肝脏的再生能力极强,就是一下子切掉80%,一样长
回来。对于T cell therapy,目前的策略基本是,先常规抗病毒治疗清除绝大部分病毒
,然后T cell transfer争取把剩下的仍然有HBV抗原表达的肝细胞灭了,这样有两个好
处,一是真正清除剩余的残留cccDNA(能不能除干净另说),二是有可能打破免疫耐受
,这个对于真正的治愈是关键。理论上讲,这个策略类似solid tumor T cell therapy
,但是成功的可能性会大的多。

【在 P****d 的大作中提到】
: 如果是这个样子,interferon和T cell therapy就不好办了吧?
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s*s
105
mTOR的话题怎么没人聊了?每天等着看更新呢。leucine 的receptor 不在细胞膜上的可
能性有多大?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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c*g
106
发现楼主真的挺厉害,俺也来弱弱地问下cholesterol的合成和transport方面以后还会
有什么较大的突破点?谢谢。
avatar
c*g
107

mitochondrial
这个Darwin程序真是不简单,俺还还专门找来文献来看了看,发现简直就是天书嘛。再
加上mRNA和protein的表达谱分析就找到了伊--MCU!!!这种screening手法不愧是大
师手笔。不知道版上有没有牛人来指点一二?

【在 c***o 的大作中提到】
: 话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
: 世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
: 可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
: 兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
: 线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
: 些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
: biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
: calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
: molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
: 把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊

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c*o
108
说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA
是完全出乎意料的)。大家还知道别的例子不(特别是那些molecular identity还没有
确定的)?
BTW俺是从2020年来的但不会做实验,所以我们可以合作:你提出问题我可以给出答案
提示。。。
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q*2
109
请问知道不知道2015年发表的重要蛋白的名称和功能?谢谢:)
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h*8
110
2019年生物是不是还是这么惨淡?

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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b*e
111
请问2011年底的mega乐透最后彩票号码多少,站内回信,非常感谢。

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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s*y
112
ABA receptor
DNA de-methylase

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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p*m
113
哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
paper还是看的不够广泛
俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
等我再想想。。

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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p*m
114
另外,你要真的是穿越的 就偷偷站内告诉我几个答案吧...我最想知道第三第五 拿10年
命来换也行...

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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r*a
115
mTOR的plasma membrane amino acid transporter好象有一个cell paper提到过,只是
amino acid transporter,但是不知道怎么引起phosphorylation cascade...

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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M*n
116
don't miss suPAR
published in Nat Med latest issue.
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b*r
117
我觉得最近那几篇关于5-Hydroxymethylcytosine的文章还是比较靠谱的
你觉得靠不住?

【在 s******y 的大作中提到】
: ABA receptor
: DNA de-methylase
:
: microRNA

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b*r
118
楼主既然提到这些蛋白,想必故事了然于心,不拿出来分享一下就有点不地道了
我觉得还不太清楚的几个关键分子/pathway,一个是控制器官大小和形状的(当然最近Hippo还是做
出来了一些东西),一个是双链染色体怎么在分裂的时候配对和同源重组。
neuroscience方面就更多了,什么东西控制人的性格,人的智力等等
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c*r
119
lz,我想要2020年的数据库链接!! 站内,多谢~
avatar
s*y
120
我觉得在其他实验室陆续重复出来之前都不可信。
主要是狼来了好几次了,我都不知道哪只是真狼哪只是假狼了

【在 b****r 的大作中提到】
: 我觉得最近那几篇关于5-Hydroxymethylcytosine的文章还是比较靠谱的
: 你觉得靠不住?

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p*m
121
\up...这么好的话题为啥没人聊。。。

microRNA

【在 c***o 的大作中提到】
: 说的是那些大家都知道其重要性,但相当长时间一直没有找到的,介导某一个狠重要生
: 物功能的,其发现以后对本领域能产生重大影响的蛋白分子。最近的例子包括:
: 1. MCU mitochondiral uniporter (2011 Mootha et al.)
: 2. PYLs as ABA receptor (2009 Cutler et al.)
: 3. HIF hydroxylases as O2 sensors (2001 Kaelin et al.)
: 4. LSD/JMJD enzymes as histone demethylases (2004 Shi et al.)
: 5. Orail channels as CRAC (2006 Rao et al.)
: 6. TET enzymes as 5mC hydroxylase (2009 Rao et al.)
: 7. Piezo as mechanosensory channels (2010 Patapoutian et al.)
: 看看这些original的发现历史和来龙去脉很有启发性(虽然很多其他发现比如microRNA

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c*l
122
关于amino acid transporter, mTOR的上游开关, 不是David Sabatini老早有paper了
吗,Rag ABCD,但不是膜蛋白。

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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p*m
123
AA又不能自己穿过细胞膜 那个只能算mTOR上游一个很重要的分子罢了。AA本身怎么从循
环系统进入细胞调节细胞内活动还是个未知问题,而且是个更有意思的问题,因为吧wh
ole organism和细胞联系起来了。
endosome上好像有AA transporter有报道,但是这个和细胞膜上的是不是一样的还不知
道,八成不是一样的

【在 c****l 的大作中提到】
: 关于amino acid transporter, mTOR的上游开关, 不是David Sabatini老早有paper了
: 吗,Rag ABCD,但不是膜蛋白。
:
: story
: plasma

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j*e
124
1. What is the receptor of A-beta protein? is PrP real?
2. What is the least number of mutations that can transform cells into
cancer?
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P*d
125
什么样的条件可以算气体的受体呢?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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X*n
126
乙烯的受体算不算活性气体的细胞内受体呢?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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p*m
127
乙烯受体找到了吧 呵呵 这个当然算很重要的

【在 X******n 的大作中提到】
: 乙烯的受体算不算活性气体的细胞内受体呢?
:
: story
: plasma

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X*n
128
mTOR的上游开关估计是很多做autophagy的人做梦都想解决的问题。
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c*l
129
Lots of membrane amino acid transporters has been identified!! You can
easily find a review paper on this like the following one.
Amino Acid Transport Across Mammalian Intestinal and Renal Epithelia
http://physrev.physiology.org/content/88/1/249.short
The transport of amino acids in kidney and intestine is critical for the
supply of amino acids to all tissues and the homeostasis of plasma amino
acid levels. This is illustrated by a number of inherited disorders
affecting amino acid transport in epithelial cells, such as cystinuria,
lysinuric protein intolerance, Hartnup disorder, iminoglycinuria,
dicarboxylic aminoaciduria, and some other less well-described disturbances
of amino acid transport. The identification of most epithelial amino acid
transporters over the past 15 years allows the definition of these disorders
at the molecular level and provides a clear picture of the functional
cooperation between transporters in the apical and basolateral membranes of
mammalian epithelial cells. Transport of amino acids across the apical
membrane not only makes use of sodium-dependent symporters, but also uses
the proton-motive force and the gradient of other amino acids to efficiently
absorb amino acids from the lumen. In the basolateral membrane, antiporters
cooperate with facilitators to release amino acids without depleting cells
of valuable nutrients. With very few exceptions, individual amino acids are
transported by more than one transporter, providing backup capacity for
absorption in the case of mutational inactivation of a transport system.

从循
wh

【在 p*****m 的大作中提到】
: AA又不能自己穿过细胞膜 那个只能算mTOR上游一个很重要的分子罢了。AA本身怎么从循
: 环系统进入细胞调节细胞内活动还是个未知问题,而且是个更有意思的问题,因为吧wh
: ole organism和细胞联系起来了。
: endosome上好像有AA transporter有报道,但是这个和细胞膜上的是不是一样的还不知
: 道,八成不是一样的

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c*o
130
乙肝病毒HBV的human receptor这个有些蹊跷,expression cloning和genome wide
RNAi都这么多年了。。。其实可以靠模式生物解决
千万得相信俺是穿越来的啊。。。

【在 p*****m 的大作中提到】
: 另外,你要真的是穿越的 就偷偷站内告诉我几个答案吧...我最想知道第三第五 拿10年
: 命来换也行...
:
: story
: plasma

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c*l
131
what 模式生物 do you think Hep B is able to infect?

【在 c***o 的大作中提到】
: 乙肝病毒HBV的human receptor这个有些蹊跷,expression cloning和genome wide
: RNAi都这么多年了。。。其实可以靠模式生物解决
: 千万得相信俺是穿越来的啊。。。

avatar
c*o
132
rotten egg smell receptor 这个更奇怪了,跟GPCR好像没有任何关系,俺看到那个蛋
白的名字都晕了,不懂。

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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c*o
133
有一个很hot的protein叫ChM2,某微生物里发现的电磁敏感的通道蛋白,不知道为什么
那么hot
是一个叫什么Carl D的实验室发现的

【在 q****2 的大作中提到】
: 请问知道不知道2015年发表的重要蛋白的名称和功能?谢谢:)
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X*n
134
AA的transporter当然绝大多数很早就知道了,可是mTOR的开关还是个迷

disturbances

【在 c****l 的大作中提到】
: Lots of membrane amino acid transporters has been identified!! You can
: easily find a review paper on this like the following one.
: Amino Acid Transport Across Mammalian Intestinal and Renal Epithelia
: http://physrev.physiology.org/content/88/1/249.short
: The transport of amino acids in kidney and intestine is critical for the
: supply of amino acids to all tissues and the homeostasis of plasma amino
: acid levels. This is illustrated by a number of inherited disorders
: affecting amino acid transport in epithelial cells, such as cystinuria,
: lysinuric protein intolerance, Hartnup disorder, iminoglycinuria,
: dicarboxylic aminoaciduria, and some other less well-described disturbances

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X*n
135
比如protein interactome in yeast?

【在 c****l 的大作中提到】
: what 模式生物 do you think Hep B is able to infect?
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X*n
136
haha

【在 c***o 的大作中提到】
: 有一个很hot的protein叫ChM2,某微生物里发现的电磁敏感的通道蛋白,不知道为什么
: 那么hot
: 是一个叫什么Carl D的实验室发现的

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c*l
137
Are you sure, have you ever read David Sabatini's papers on Rag proteins??

【在 X******n 的大作中提到】
: AA的transporter当然绝大多数很早就知道了,可是mTOR的开关还是个迷
:
: disturbances

avatar
c*o
138
话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊
的,从此线粒体Ca2+领域进入了全面的分子时代。。。”BTW,Vamsi用的Darwin程序可
真是强大,充分利用了几亿年地球生物上的劳动成果,你说他能不比咱们广大千老们有
效率么!

近Hippo还是做

【在 b****r 的大作中提到】
: 楼主既然提到这些蛋白,想必故事了然于心,不拿出来分享一下就有点不地道了
: 我觉得还不太清楚的几个关键分子/pathway,一个是控制器官大小和形状的(当然最近Hippo还是做
: 出来了一些东西),一个是双链染色体怎么在分裂的时候配对和同源重组。
: neuroscience方面就更多了,什么东西控制人的性格,人的智力等等

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p*m
139
AA transporter当然知道了n多了 但是我问的是 哪个AA transporter能直接作为mTOR的
上游,换句话说就是直接检测extracellular AA然后induce mTOR response。也许会像
果蝇里发现的slimfast那种。而不是简单的运输AA到细胞里面。
既然你提到Sabatini 那好吧。。我前些时候和他meeting,我还提到了这个问题 他自己
都觉得这是个没解决的的极端重要问题

【在 c****l 的大作中提到】
: Are you sure, have you ever read David Sabatini's papers on Rag proteins??
avatar
p*m
140
怎么用模式生物呢?仔细说说?
HBV receptor可能>1,甚至>n 所以简单的expression cloning没法做。因为HBV不能侵
染cell line,因此RNAi screen也没法做啊。穿越帝看来2020这个问题也没解决么 哈哈

我曾经想过用oocyte做 expression cloning,这样一次可以搞n个gene筛选,等我有了上
千万每年花不掉我就搞人来筛这个

【在 c***o 的大作中提到】
: 乙肝病毒HBV的human receptor这个有些蹊跷,expression cloning和genome wide
: RNAi都这么多年了。。。其实可以靠模式生物解决
: 千万得相信俺是穿越来的啊。。。

avatar
z*t
141
这个办法得assume protein的修饰和人类细胞中是一致的吧,倒是肝细胞人源化的小鼠
是一个出路

【在 X******n 的大作中提到】
: 比如protein interactome in yeast?
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p*m
142
....

【在 c***o 的大作中提到】
: rotten egg smell receptor 这个更奇怪了,跟GPCR好像没有任何关系,俺看到那个蛋
: 白的名字都晕了,不懂。
:
: story
: plasma

avatar
p*m
143
居然不是M.People实验室发现的?555

【在 c***o 的大作中提到】
: 有一个很hot的protein叫ChM2,某微生物里发现的电磁敏感的通道蛋白,不知道为什么
: 那么hot
: 是一个叫什么Carl D的实验室发现的

avatar
c*o
144
Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
-Induced Pruritus
这个不算?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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c*l
145
Vamsi Mootha has very intereting background.
Dr. Mootha received his B.S. (with honors, with distinction) in Mathematical
and Computational Science at Stanford University. He then received his M.D.
(cum laude) from the Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology
, where his thesis research focused on mitochondrial energetics. Following
an internship and residency in Internal Medicine at Brigham and Women’s
Hospital, he pursued postdoctoral training in Eric Lander’s laboratory at
the Whitehead Institute, where he applied the new tools of genomics to study
mitochondrial biology.

mitochondrial

【在 c***o 的大作中提到】
: 话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
: 世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
: 可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
: 兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
: 线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
: 些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
: biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
: calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
: molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
: 把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊

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c*o
146
模式生物里的突变不受你说的的那个1和n的问题限制
现在不是有HBV的antigen和GFP嘛,既然preS可以被直接饱吞,不用infection也能做
screen
完了,透露太多,信息熵变,2010-2011的历史被改写了。。。

了上

【在 p*****m 的大作中提到】
: 怎么用模式生物呢?仔细说说?
: HBV receptor可能>1,甚至>n 所以简单的expression cloning没法做。因为HBV不能侵
: 染cell line,因此RNAi screen也没法做啊。穿越帝看来2020这个问题也没解决么 哈哈
: 哈
: 我曾经想过用oocyte做 expression cloning,这样一次可以搞n个gene筛选,等我有了上
: 千万每年花不掉我就搞人来筛这个

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p*m
147
哦 我刚才说错了 记错paper了 他们这个算

Chloroquine

【在 c***o 的大作中提到】
: Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
: -Induced Pruritus
: 这个不算?
:
: story
: plasma

avatar
p*m
148
我想想。。。好像不对啊..

【在 c***o 的大作中提到】
: 模式生物里的突变不受你说的的那个1和n的问题限制
: 现在不是有HBV的antigen和GFP嘛,既然preS可以被直接饱吞,不用infection也能做
: screen
: 完了,透露太多,信息熵变,2010-2011的历史被改写了。。。
:
: 了上

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c*o
149
哦,别伤心,M.People实验室在某外星生物上发现了这个东东:
VSEE,电压敏感电磁发射蛋白
从此神经科学领域闹起来革命,因为这个东东可以做cell-resolution fMRI

【在 p*****m 的大作中提到】
: 居然不是M.People实验室发现的?555
avatar
f*u
150
不是很了解这方面。你确定mTOR检测的是胞外AA,而不是胞内AA?

mTOR的

【在 p*****m 的大作中提到】
: AA transporter当然知道了n多了 但是我问的是 哪个AA transporter能直接作为mTOR的
: 上游,换句话说就是直接检测extracellular AA然后induce mTOR response。也许会像
: 果蝇里发现的slimfast那种。而不是简单的运输AA到细胞里面。
: 既然你提到Sabatini 那好吧。。我前些时候和他meeting,我还提到了这个问题 他自己
: 都觉得这是个没解决的的极端重要问题

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c*o
151
都说了,你得相信俺是天马行空穿越来的:)

【在 p*****m 的大作中提到】
: 我想想。。。好像不对啊..
avatar
c*l
152
I think you are right. I think it is likely mTOR senses intracellular AA.
How come an intracellular protein sense exacellular AA? I guess he is not
sure what he is talking about.

【在 f**u 的大作中提到】
: 不是很了解这方面。你确定mTOR检测的是胞外AA,而不是胞内AA?
:
: mTOR的

avatar
p*m
153
mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
找文献吧。。。

【在 c****l 的大作中提到】
: I think you are right. I think it is likely mTOR senses intracellular AA.
: How come an intracellular protein sense exacellular AA? I guess he is not
: sure what he is talking about.

avatar
c*l
154
I agree with you on that mTOR is bound to intracellular membrane but I do
not think it is plasma membrane associated.

【在 p*****m 的大作中提到】
: mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
: 找文献吧。。。

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P*d
155
被谁吞?

【在 c***o 的大作中提到】
: 都说了,你得相信俺是天马行空穿越来的:)
avatar
r*a
156
这个cell paper提到的amino acid transporter...
Bidirectional Transport of Amino Acids Regulates mTOR and Autophagy
是你说的那个吗?

【在 p*****m 的大作中提到】
: mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
: 找文献吧。。。

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z*t
157
Tet family protein的发现更简单,blast出来的。。。

mitochondrial

【在 c***o 的大作中提到】
: 话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
: 世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
: 可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
: 兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
: 线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
: 些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
: biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
: calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
: molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
: 把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊

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q*g
158
一个是plasma membrane amino acid transporter:slc1a5, slc7a5,Nicklin et al.
, 2009, Cell.

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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q*g
159
他不做transporter, 他更关心leucine是如何激活mTOR的。虽然发现Rag和lysosome 的
作用,但中间还是少了个环节。以前的实验证明不是transporter激活下游的通路,但
也有可能错了呢?

【在 c****l 的大作中提到】
: 关于amino acid transporter, mTOR的上游开关, 不是David Sabatini老早有paper了
: 吗,Rag ABCD,但不是膜蛋白。
:
: story
: plasma

avatar
q*g
160
应该是细胞内的氨基酸,而最重要的是亮氨酸。而为什么亮氨酸对mTOR那么重要,就不
知道了。

【在 f**u 的大作中提到】
: 不是很了解这方面。你确定mTOR检测的是胞外AA,而不是胞内AA?
:
: mTOR的

avatar
q*g
161
关于氨基酸,浓度升高,激活mTor.
浓度降低,激活GCN2/eIFalpha2/ATF4,
同时,他还是组成蛋白的骨架。

【在 c****l 的大作中提到】
: I think you are right. I think it is likely mTOR senses intracellular AA.
: How come an intracellular protein sense exacellular AA? I guess he is not
: sure what he is talking about.

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i*g
162
楼主,从现在起到2020年的 中美股市日K线图能不能给我一份啊
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e*r
163
因为是必需氨基酸?
植物里面有TOR么?

【在 q******g 的大作中提到】
: 应该是细胞内的氨基酸,而最重要的是亮氨酸。而为什么亮氨酸对mTOR那么重要,就不
: 知道了。

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j*x
164
有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。

了上

【在 p*****m 的大作中提到】
: mTOR是个细胞内蛋白 但是mTOR早就被提示和各种膜结构associate 这个不用我来给你
: 找文献吧。。。

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s*r
165
人的原代肝细胞还不能培养?
那刚刚出来的induced的肝细胞能不能用?

有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
了上

【在 j****x 的大作中提到】
: 有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
: 率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
: 不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
: 是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
:
: 了上

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p*m
166
恩 这个知道 但是效率不大可用啊。关于pres 我们知道是必须的 但是单纯pres进细胞
和病毒颗粒是不是一样还不清楚吧 而且穿越帝还要用在模式生物??

【在 j****x 的大作中提到】
: 有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
: 率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
: 不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
: 是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
:
: 了上

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p*m
167
可以培养 但是拿这个screen会死人的。。。

【在 s******r 的大作中提到】
: 人的原代肝细胞还不能培养?
: 那刚刚出来的induced的肝细胞能不能用?
:
: 有一个cell line叫HepRG,类似人原代肝细胞,可以在体外被HBV感染,做的好的话效
: 率大约在10%-15%左右,不少人尝试过以此来RNAi screen,但是成本很高,效果很差,
: 不知道现在还有没有人继续。穿越帝后面说的还挺靠谱,利用preS上位于N端的结合肽
: 是一个思路,不过目前的条件下我猜想背景应该很高,干扰因素很多。
: 了上

avatar
j*x
168
10%-15%感染效率是足够了(即便是新鲜分离的人原代肝细胞,最佳效率也不过就是20%
-30%吧),对于筛受体绰绰有余。我猜想主要在RNAi抑制效率不够(转染效率太低),
要优化条件或者换别的载体吧细胞又不好好分化了,更没辙。
PreS前导肽介导和受体(至少是受体之一)的结合这个应该没有什么疑问,至于entry
机制和过程是不是完全一致这个无所谓了,你要钓的不就是受体吗?管它是吞钩还是吞
饵呢,钓到了再研究机制也不迟。
要说模式生物也不算错,十年前模式生物就那么几种,现在的“模式生物”差不多多了
几倍了吧,再过十年,模式生物涵盖大部分物种不奇怪啊,呵呵

【在 p*****m 的大作中提到】
: 恩 这个知道 但是效率不大可用啊。关于pres 我们知道是必须的 但是单纯pres进细胞
: 和病毒颗粒是不是一样还不清楚吧 而且穿越帝还要用在模式生物??

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S*l
169
楼主你能告诉我2020年bioinformatics还热么?

【在 c***o 的大作中提到】
: 都说了,你得相信俺是天马行空穿越来的:)
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p*m
170
10%可能困难吧 一般筛受体不都是病毒挂个luciferase or GFP gene,然后看秦染细胞
以后的signal 要是本底信号就highly variable(侵染了10%的细胞或者15%就差出50%),
上了RNAi screen放进plate reader还不得愁死人
preS binding receptor这个可能问题不大(话说回来,PreS binding cell surface
molecle是真的,PreS是进细胞必须应该也是真的.但是这个是不是就说明preS binding
的是receptor?) 话说有没有人直接拿preS和人肝原代细胞incubate然后TAP-MS? 没查
过... 另外,和乙肝病毒或者那个鸟的类似病毒binding的surface molecule找了大于5
个了吧 还是没有找够sufficient的 所以光靠binding来找我是觉得不够的 还是得有
functional assay(i.e. 至少能看到进细胞表达reporter基因)
其实也许HCV的故事会有启发性.HCV一共是找了3个还是4个receptor才算是sufficient
了吧

20%
entry

【在 j****x 的大作中提到】
: 10%-15%感染效率是足够了(即便是新鲜分离的人原代肝细胞,最佳效率也不过就是20%
: -30%吧),对于筛受体绰绰有余。我猜想主要在RNAi抑制效率不够(转染效率太低),
: 要优化条件或者换别的载体吧细胞又不好好分化了,更没辙。
: PreS前导肽介导和受体(至少是受体之一)的结合这个应该没有什么疑问,至于entry
: 机制和过程是不是完全一致这个无所谓了,你要钓的不就是受体吗?管它是吞钩还是吞
: 饵呢,钓到了再研究机制也不迟。
: 要说模式生物也不算错,十年前模式生物就那么几种,现在的“模式生物”差不多多了
: 几倍了吧,再过十年,模式生物涵盖大部分物种不奇怪啊,呵呵

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j*x
171
10%足够了,我认识有几个组用这个系统做entry inhibitor的筛选,效果还不错,有几
个candidates已经开始准备Phase I trial了。10%和15%的差异主要看批次和人手,同
批细胞之间的差异很小(所以实际上Variation没有想象的大),但不同人工之间的差
异不小,属于技术活。主要的问题在,1.这细胞得持续分化1个月以上才能正常感染,
其间不能出任何岔子,否则前功尽弃。一个月后究竟能不能用,谁也不知道,用了才知
道。2. 细胞极其敏感,转染效率低是一定的,siRNA基本没法用。用Lenti转导shRNA吧
,转导完了细胞分化又出问题,更不能用。最主要的是,欧美对HBV这玩艺儿的重视程
度远低于HCV,做的人少自然没结果。要是像HIV那么投入,问题估计已经解决了。
PreS的问题我觉得没有什么争议,Anti-preS Ab有中和抗体活性,结构分析等等证据也
表明了,PreS就是结合受体的(至少是受体之一)。至于能不能一下子找全,谁也没把
握。一个一个来呗。HCV找到现在还不是一样没结论,虽然CD81, SR-BI, DC-SIGN,
Claudin-1,Occludin这个组合缺一不可,但是在非肝源细胞上同时表达这几个蛋白仍然
不能成功建立entry,说明这故事还没完呢,还不算真正sufficient。
有种新理论,in vivo中HBV感染肝细胞是由其他细胞所介导的,这个说法很有趣,也能
解释很多以前解释不了的现象

),
binding
5
sufficient

【在 p*****m 的大作中提到】
: 10%可能困难吧 一般筛受体不都是病毒挂个luciferase or GFP gene,然后看秦染细胞
: 以后的signal 要是本底信号就highly variable(侵染了10%的细胞或者15%就差出50%),
: 上了RNAi screen放进plate reader还不得愁死人
: preS binding receptor这个可能问题不大(话说回来,PreS binding cell surface
: molecle是真的,PreS是进细胞必须应该也是真的.但是这个是不是就说明preS binding
: 的是receptor?) 话说有没有人直接拿preS和人肝原代细胞incubate然后TAP-MS? 没查
: 过... 另外,和乙肝病毒或者那个鸟的类似病毒binding的surface molecule找了大于5
: 个了吧 还是没有找够sufficient的 所以光靠binding来找我是觉得不够的 还是得有
: functional assay(i.e. 至少能看到进细胞表达reporter基因)
: 其实也许HCV的故事会有启发性.HCV一共是找了3个还是4个receptor才算是sufficient

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p*m
172
嗯 受教了(我也想起来以前看到这个细胞要分化n久。。)
我本来也是想硬筛的。因为这玩意看起来也不会比HCV难做太多(HCV的好处是起步容易
,因为一开始就有还说的过去的可侵染的cell line) 无非是有n多receptor必须就是了
。我以前想过用xenopus oocyte,一次把肝细胞total mRNA搭进去看看有没有用 有用的
话不断的fractionation,这样说不定可以一次找全。。
问个问题哈,现在已知那几个HBV receptor-like protein,有没有人针对他们做药物了
?我一直不是很相信那些结果的原因一个就是好像号称发现一个receptor一半就没下文
了(还有原因就是LoS都做得不彻底,这个没办法,要做真正的LoS得用人元代肝细胞进
行遗传操作)

【在 j****x 的大作中提到】
: 10%足够了,我认识有几个组用这个系统做entry inhibitor的筛选,效果还不错,有几
: 个candidates已经开始准备Phase I trial了。10%和15%的差异主要看批次和人手,同
: 批细胞之间的差异很小(所以实际上Variation没有想象的大),但不同人工之间的差
: 异不小,属于技术活。主要的问题在,1.这细胞得持续分化1个月以上才能正常感染,
: 其间不能出任何岔子,否则前功尽弃。一个月后究竟能不能用,谁也不知道,用了才知
: 道。2. 细胞极其敏感,转染效率低是一定的,siRNA基本没法用。用Lenti转导shRNA吧
: ,转导完了细胞分化又出问题,更不能用。最主要的是,欧美对HBV这玩艺儿的重视程
: 度远低于HCV,做的人少自然没结果。要是像HIV那么投入,问题估计已经解决了。
: PreS的问题我觉得没有什么争议,Anti-preS Ab有中和抗体活性,结构分析等等证据也
: 表明了,PreS就是结合受体的(至少是受体之一)。至于能不能一下子找全,谁也没把

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j*x
173
有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说
效果已经非常好了,另有其他一些entry inhibitory peptide/molecule在pre-
clinical阶段的效果也不错,所以我估计眼下针对“疑似”receptor的rational
design不会有太大的吸引力。
chronic HBV治疗,要说最终解决还是得靠免疫学的方法,传统的NRTI也好,entry
inhibitor也罢,治标不治本,解决不了问题。强效Interferon以及前几天热炒的
Adoptive T cell therapy,我觉得应该是目前看来最有前景的方向吧,这玩意在国内
时市场太大了。

是了
用的

【在 p*****m 的大作中提到】
: 嗯 受教了(我也想起来以前看到这个细胞要分化n久。。)
: 我本来也是想硬筛的。因为这玩意看起来也不会比HCV难做太多(HCV的好处是起步容易
: ,因为一开始就有还说的过去的可侵染的cell line) 无非是有n多receptor必须就是了
: 。我以前想过用xenopus oocyte,一次把肝细胞total mRNA搭进去看看有没有用 有用的
: 话不断的fractionation,这样说不定可以一次找全。。
: 问个问题哈,现在已知那几个HBV receptor-like protein,有没有人针对他们做药物了
: ?我一直不是很相信那些结果的原因一个就是好像号称发现一个receptor一半就没下文
: 了(还有原因就是LoS都做得不彻底,这个没办法,要做真正的LoS得用人元代肝细胞进
: 行遗传操作)

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p*m
174
我理解你的意思 不过国内靠大分子药我觉得还是不靠谱 太贵了 用起来又不方便 1亿携
带者呢。。。国内还是要靠疫苗外加小分子药物。而小分子药物最直接的就是block病毒
entry.
当然了,你可以说乙肝携带者其实大多数的肝细胞都已经被侵染了 阻止entry用处不大
。但是现在乙肝在肝细胞之间怎么transfer的似乎了解的不是很清楚,也许阻止entry会
有意想不到的效果?(比如说,virus transfer对维持病毒的存在是关键的)

有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说
效果已经非常好了,另有其他一些entry inhibitory peptide/molecule在pre-
clinical阶段的效果也不错,所以我估计眼下针对“疑似”receptor的rational
design不会有太大的吸引力。
chronic HBV治疗,要说最终解决还是得靠免疫学的方法,传统的NRTI也好,entry
inhibitor也罢,治标不治本,解决不了问题。强效Interferon以及前几天热炒的
Adoptive T cell therapy,我觉得应该是目前看来最有前景的方向吧,这玩意在国内
时市场太大了。
是了
用的

【在 j****x 的大作中提到】
: 有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
: 那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
: 猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说
: 效果已经非常好了,另有其他一些entry inhibitory peptide/molecule在pre-
: clinical阶段的效果也不错,所以我估计眼下针对“疑似”receptor的rational
: design不会有太大的吸引力。
: chronic HBV治疗,要说最终解决还是得靠免疫学的方法,传统的NRTI也好,entry
: inhibitor也罢,治标不治本,解决不了问题。强效Interferon以及前几天热炒的
: Adoptive T cell therapy,我觉得应该是目前看来最有前景的方向吧,这玩意在国内
: 时市场太大了。

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a*e
175
直接上疫苗吧
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j*x
176
entry inhibitor当然有价值,不仅对HBV了,HIV/HCV这些个老大难,如果是有效的
entry inhibitor,价值自然不菲。最近看到几个candidates,很BT的居然能光谱的同
时抑制多种病毒,太发指了。不过要说小分子药物,自然是NRTI和PI最简单,这在HIV/
HCV上体现的最明显。
HBV维持病毒的关键是核内cccDNA,类似HIV整合后的progenome(虽然cccDNA不整合
host genomic DNA),可以在肝细胞内长期稳定存在。小分子药物可以抑制病毒感染/
复制5年10年,但是只要还存在persistent form,病毒就有可能卷土重来。显然目前的
药物还无法直接清除。

亿携
病毒
entry会

【在 p*****m 的大作中提到】
: 我理解你的意思 不过国内靠大分子药我觉得还是不靠谱 太贵了 用起来又不方便 1亿携
: 带者呢。。。国内还是要靠疫苗外加小分子药物。而小分子药物最直接的就是block病毒
: entry.
: 当然了,你可以说乙肝携带者其实大多数的肝细胞都已经被侵染了 阻止entry用处不大
: 。但是现在乙肝在肝细胞之间怎么transfer的似乎了解的不是很清楚,也许阻止entry会
: 有意想不到的效果?(比如说,virus transfer对维持病毒的存在是关键的)
:
: 有没有人在做最针对这些个疑似receptor的药物,我也不是很清楚,只知道现在号称的
: 那些个receptor,没有一个是真正HBV specific甚至hepatocyte specific的,所以我
: 猜测这些不会是很好的target。PreS1 derived peptide作为entry inhibitor目前据说

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p*m
177
NRTI/PI总体来说还是容易诱发抗药性吧 这个如果是entry inhibitor从原理上要好?
嗯 cccDNA是很难去掉的,但是如果能有效的抑制entry外加复制,肝细胞应该还是有自
我清除机制的吧?因为成年人即便被乙肝感染也会很快清除掉

HIV/

【在 j****x 的大作中提到】
: entry inhibitor当然有价值,不仅对HBV了,HIV/HCV这些个老大难,如果是有效的
: entry inhibitor,价值自然不菲。最近看到几个candidates,很BT的居然能光谱的同
: 时抑制多种病毒,太发指了。不过要说小分子药物,自然是NRTI和PI最简单,这在HIV/
: HCV上体现的最明显。
: HBV维持病毒的关键是核内cccDNA,类似HIV整合后的progenome(虽然cccDNA不整合
: host genomic DNA),可以在肝细胞内长期稳定存在。小分子药物可以抑制病毒感染/
: 复制5年10年,但是只要还存在persistent form,病毒就有可能卷土重来。显然目前的
: 药物还无法直接清除。
:
: 亿携

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p*m
178
这个是长久之计 但是现在放着1亿携带者也不能让他们自生自灭啊

【在 a***e 的大作中提到】
: 直接上疫苗吧
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q*g
179
yeast, fly里都有。植物不太清楚。

【在 e**r 的大作中提到】
: 因为是必需氨基酸?
: 植物里面有TOR么?

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P*d
180
如果是这个样子,interferon和T cell therapy就不好办了吧?

【在 p*****m 的大作中提到】
: 这个是长久之计 但是现在放着1亿携带者也不能让他们自生自灭啊
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P*d
181
这个感染效率是因为细胞状态的heterogeneity,还是entry本身低效?换句话说,如果
分离已被感染的细胞做二次感染,效率会高么?

20%

【在 j****x 的大作中提到】
: 10%-15%感染效率是足够了(即便是新鲜分离的人原代肝细胞,最佳效率也不过就是20%
: -30%吧),对于筛受体绰绰有余。我猜想主要在RNAi抑制效率不够(转染效率太低),
: 要优化条件或者换别的载体吧细胞又不好好分化了,更没辙。
: PreS前导肽介导和受体(至少是受体之一)的结合这个应该没有什么疑问,至于entry
: 机制和过程是不是完全一致这个无所谓了,你要钓的不就是受体吗?管它是吞钩还是吞
: 饵呢,钓到了再研究机制也不迟。
: 要说模式生物也不算错,十年前模式生物就那么几种,现在的“模式生物”差不多多了
: 几倍了吧,再过十年,模式生物涵盖大部分物种不奇怪啊,呵呵

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j*x
182
靶向病毒本身的entry inhibitor同样会有耐药性的问题(最天然的比如中和抗体逃逸
),靶向宿主蛋白的理论上说好一些,但是从HIV上的经历来看,问题同样存在。当然
对HBV而言问题会小得多,毕竟变异没HIV那么夸张。
Entry inhibitor作为combination therapy的一个组分,效果必然比NRTI/PI
monotherapy效果要好,这是自然的。但是对于Chronic HBV而言,对于彻底清除病毒的
意义不是特别大。对于HCV而言,是一个不错的option,但是我觉得意义也不是特别大
,因为毕竟是RNA病毒,没有persistent form,现在有了2种PI,加上原来的pegIFN和
RBV,(未来还会有几种核苷类RNA聚合酶inhibitor),基本上HCV的治疗未来看不再是
问题了,这个是HBV/HIV无法比的。
cccDNA的清除是个根本问题。自然条件下有1%左右的慢性感染者能自动清除完全自愈,
这个现象临床上几十年前就发现了,但是机制至今无法解释。反正目前看就算能长期抑
制病毒复制,外周血中检测不到HBV DNA很多年后,cccDNA仍然能稳定存在,所以这个
和entry的关系似乎不大,只能是在肝细胞分裂过程中不断的稀释了。或者特异性的靶
向cccDNA的治疗策略,比如利用ZFN,但是显然只是在概念阶段了。

【在 p*****m 的大作中提到】
: NRTI/PI总体来说还是容易诱发抗药性吧 这个如果是entry inhibitor从原理上要好?
: 嗯 cccDNA是很难去掉的,但是如果能有效的抑制entry外加复制,肝细胞应该还是有自
: 我清除机制的吧?因为成年人即便被乙肝感染也会很快清除掉
:
: HIV/

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j*x
183
很多年前,临床上就发现IFN有non-cytolytic HBV clearence effect,究竟啥机制,至
今不明。目前IFN仍然是最有效的chronic HBV治疗方式之一,主要问题是,2种主要的
基因型C/D,尤其是中国流行的C,IFN效果不佳。以后就看怎么提高效率上做文章了。
T cell therapy也没什么不好办,肝脏的再生能力极强,就是一下子切掉80%,一样长
回来。对于T cell therapy,目前的策略基本是,先常规抗病毒治疗清除绝大部分病毒
,然后T cell transfer争取把剩下的仍然有HBV抗原表达的肝细胞灭了,这样有两个好
处,一是真正清除剩余的残留cccDNA(能不能除干净另说),二是有可能打破免疫耐受
,这个对于真正的治愈是关键。理论上讲,这个策略类似solid tumor T cell therapy
,但是成功的可能性会大的多。

【在 P****d 的大作中提到】
: 如果是这个样子,interferon和T cell therapy就不好办了吧?
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s*s
184
mTOR的话题怎么没人聊了?每天等着看更新呢。leucine 的receptor 不在细胞膜上的可
能性有多大?

story
plasma

【在 p*****m 的大作中提到】
: 哇 本年度most insightful好贴啊!!居然没有什么人顶?不如你有空讲讲这些story
: 背后的故事吧?里面有几个我感觉简直像石头缝里蹦出来的,不知道奥秘在哪里。。
: paper还是看的不够广泛
: 俺个人感兴趣的分子但是还不知道identity的 2020年不知道搞定了没?一个是plasma
: membrane amino acid transporter, mTOR的上游开关;一个是真正的itch receptor,
: non-histominergic的;一个是乙肝病毒HBV的human receptor,一个是生物活性气体的
: 细胞内受体(非嗅觉系统的),Co2(现在找的不知道是不是真正的受体),H2S, H2,
: etc. 一个是megnetosensory molecule,cryptochrome看着很可疑。
: 等我再想想。。
:

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c*g
185
发现楼主真的挺厉害,俺也来弱弱地问下cholesterol的合成和transport方面以后还会
有什么较大的突破点?谢谢。
avatar
c*g
186

mitochondrial
这个Darwin程序真是不简单,俺还还专门找来文献来看了看,发现简直就是天书嘛。再
加上mRNA和protein的表达谱分析就找到了伊--MCU!!!这种screening手法不愧是大
师手笔。不知道版上有没有牛人来指点一二?

【在 c***o 的大作中提到】
: 话说这个molecular identity of MCU是多少年来很多人梦寐以求的东东,差不多半个
: 世纪以前就知道伊一定在线粒体的膜上,以为是控制细胞内Ca2+存储的一个主要开关。
: 可是随着IP3R的发现以及its localization at ER,大家都把注意力放在了线粒体的小
: 兄弟ER上面。几十年过去了,神秘的MCU躺在那里没人理睬。开始越来越多的证据表明
: 线粒体Ca2+对很多生理病理过程是多么di重要啊(你相信不,我是信了),可是由于某
: 些技术和具体操作上的限制,即使90年代gene cloning的黄金年代很多molecular
: biologist都有心无力。都到2004了,Clapham发了一片内取而,“The mitochondrial
: calcium uniporter is a highly selective ion channel”居然都一字不提MCU的
: molecular identity。哈大佛学院的Vamsi看准了这个金矿,居然以迅雷不及掩耳之势
: 把MCU冒烟的火枪给提了出来,哦,据他说,“俺是用计算机程序(你不懂的)找到伊

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s*s
187
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22053050
mTORC1 senses lysosomal amino acids through an inside-out mechanism that
requires the vacuolar H⁺-ATPase.
Sabatini 垄断mtor啊

【在 r**a 的大作中提到】
: mTOR的plasma membrane amino acid transporter好象有一个cell paper提到过,只是
: amino acid transporter,但是不知道怎么引起phosphorylation cascade...
:
: story
: plasma

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r*a
188
看了这个文章,这样一来,似乎leucine就没有特殊了
而且,aa ester也有同样的作用了
而且,tor是不是变成了lysosome 的aa sensor了
或者说,只要改变了vATPase的结构,就影响了tor了
继续看他们倒底在做什么啦,呵呵

【在 s********s 的大作中提到】
: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22053050
: mTORC1 senses lysosomal amino acids through an inside-out mechanism that
: requires the vacuolar H⁺-ATPase.
: Sabatini 垄断mtor啊

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