a*v
2 楼
you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
call
"A a;"
to create obj on stack.
But someday another developer add a new ctor:
"A(int)"
and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
stack. How do you prevent that?
call
"A a;"
to create obj on stack.
But someday another developer add a new ctor:
"A(int)"
and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
stack. How do you prevent that?
a*g
3 楼
大家还记得这个情节吗?他们第一次穿越虫洞时,女主用手指着窗外,手指都变形弯曲
了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
象?
了。女主表情很惊讶,她旁边的男主还关心的问怎么回事?
后面,影片快结尾时揭示了。原来是在高维的男主与女主有了交流。谁能够解释这个现
象?
g*y
4 楼
大家好,
我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
)引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
预见的可能问题及解决方法:
1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
ShRNA的序列(避免同源序列)来降低非特异抑制,请问大家还有什么办法来提高特异性
吗?
2:体外合成的SiRNA在体内容易被降解:
通过对SiRNA进行一定的修饰可以提高稳定性,但是我觉得通过病毒介导表达ShRNA 可
能是一个更好的办法,因为这个是由基因突变(Gain of function)产生的疾病,体外
合成的SiRNA不能永久的抑制基因表达。
3:病毒载体的安全性:
有的病毒载体(retro, lentivirus)会整合基因组,从而可能破坏一些重要基因的表
达而引起一些副作用。所以我打算选用相对安全的AAV载体。
4:AAV载体的靶向问题,
AAV载体通过静脉注射到小鼠,高效地感染肝脏之类的器官,但是对于血液系统的感染
效率相对低。可以在病毒的Capsid上插入表达一段能特异识别T细胞的蛋白(我还不知
道什么蛋白)来提高T细胞的感染效率。
5:ShRNA能否特异的抑制肿瘤细胞里面的癌基因的表达。
因为目前没有病毒载体能特异的感染T细胞,所以进行基因治疗的时候带有ShRNA的病毒
也会感染正常细胞并且抑制这个基因在正常细胞里面的表达,所以我打算用一个T cell
specific promoter 来控制ShRNA的表达,这样虽然其它细胞也能被感染,但是ShRNA
并不表达。
简单的说,我想用AAV携带ShRNA来抑制T cell leukemia 里面的oncogene 的表达,从
而治疗这个基因引起的癌症,可行吗?
目前这个实验还处于思考阶段,不知道可行性怎样,欢迎大家批评和建议。
我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
)引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
预见的可能问题及解决方法:
1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
ShRNA的序列(避免同源序列)来降低非特异抑制,请问大家还有什么办法来提高特异性
吗?
2:体外合成的SiRNA在体内容易被降解:
通过对SiRNA进行一定的修饰可以提高稳定性,但是我觉得通过病毒介导表达ShRNA 可
能是一个更好的办法,因为这个是由基因突变(Gain of function)产生的疾病,体外
合成的SiRNA不能永久的抑制基因表达。
3:病毒载体的安全性:
有的病毒载体(retro, lentivirus)会整合基因组,从而可能破坏一些重要基因的表
达而引起一些副作用。所以我打算选用相对安全的AAV载体。
4:AAV载体的靶向问题,
AAV载体通过静脉注射到小鼠,高效地感染肝脏之类的器官,但是对于血液系统的感染
效率相对低。可以在病毒的Capsid上插入表达一段能特异识别T细胞的蛋白(我还不知
道什么蛋白)来提高T细胞的感染效率。
5:ShRNA能否特异的抑制肿瘤细胞里面的癌基因的表达。
因为目前没有病毒载体能特异的感染T细胞,所以进行基因治疗的时候带有ShRNA的病毒
也会感染正常细胞并且抑制这个基因在正常细胞里面的表达,所以我打算用一个T cell
specific promoter 来控制ShRNA的表达,这样虽然其它细胞也能被感染,但是ShRNA
并不表达。
简单的说,我想用AAV携带ShRNA来抑制T cell leukemia 里面的oncogene 的表达,从
而治疗这个基因引起的癌症,可行吗?
目前这个实验还处于思考阶段,不知道可行性怎样,欢迎大家批评和建议。
J*d
6 楼
加个pure virtual function在里面.
【在 a*****v 的大作中提到】
: you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
: call
: "A a;"
: to create obj on stack.
: But someday another developer add a new ctor:
: "A(int)"
: and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
: stack. How do you prevent that?
【在 a*****v 的大作中提到】
: you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
: call
: "A a;"
: to create obj on stack.
: But someday another developer add a new ctor:
: "A(int)"
: and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
: stack. How do you prevent that?
w*a
8 楼
如果目的就是灌水的话,这种project做做也没问题。
真要治病,我看还是算了吧。
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
真要治病,我看还是算了吧。
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
m*m
12 楼
the off-target effect of shRNA might be a big concern
l*i
13 楼
可以。不过由于高压锅压力各不相同,你得自己试验看看需要多少时间。基本上可以先
从30-40分钟开始。
从30-40分钟开始。
f*4
14 楼
没理解错的话,这是在问你怎么样能禁止在stack上创建obj
除了把ctor声明为private,还有个办法就是把destructor声明为private
这里明显就是想问你后一种情况
你可以try一下private destructor的情况
compiler会报错的
【在 a*****v 的大作中提到】
: you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
: call
: "A a;"
: to create obj on stack.
: But someday another developer add a new ctor:
: "A(int)"
: and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
: stack. How do you prevent that?
除了把ctor声明为private,还有个办法就是把destructor声明为private
这里明显就是想问你后一种情况
你可以try一下private destructor的情况
compiler会报错的
【在 a*****v 的大作中提到】
: you have a class A, where you set ctor to be private, so a client can't
: call
: "A a;"
: to create obj on stack.
: But someday another developer add a new ctor:
: "A(int)"
: and try to call "A a(1);" inside main(). So this will create a obj on
: stack. How do you prevent that?
g*y
16 楼
谢谢评论, 我也觉得ShRNA的特异性是一个很大的问题, 不过目前有一些文献说可以
optimized siRNA design来提高或者解决特异性的问题(当然这些文章可能就是wdgca所
说的灌水文章,赫赫).
考虑到很多药物都有off-target effect, 或者说目前的治疗手段(如化疗)会有大的副
作用, 对于癌症病人来说, 很多时候是存活时间长短的问题, 如果一种手段能把存活期
由一年延伸到5-10年的话,这种手段还是有一定价值的.
回到我的project, 如果我optimized shRNA design, 并且把ShRNA 连到 T Cell
specific promoter 后面, 那就可以把off-target effect限制在T细胞(大部分都是
leukemia)里面, 这样是不是可以提高这个实验设计的可行性呢?
optimized siRNA design来提高或者解决特异性的问题(当然这些文章可能就是wdgca所
说的灌水文章,赫赫).
考虑到很多药物都有off-target effect, 或者说目前的治疗手段(如化疗)会有大的副
作用, 对于癌症病人来说, 很多时候是存活时间长短的问题, 如果一种手段能把存活期
由一年延伸到5-10年的话,这种手段还是有一定价值的.
回到我的project, 如果我optimized shRNA design, 并且把ShRNA 连到 T Cell
specific promoter 后面, 那就可以把off-target effect限制在T细胞(大部分都是
leukemia)里面, 这样是不是可以提高这个实验设计的可行性呢?
x*r
17 楼
我每次都是用高压锅煮的,压一个小时左右。
C*h
20 楼
No, using virus to deliver shRNAs to T cells is not a viable option.
You can never have enough viruses to infect human cells.
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
You can never have enough viruses to infect human cells.
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
b*e
21 楼
高压锅半小时,不用高压锅估计要等到崩溃
y*i
22 楼
如果把析构函数声明为私有的,那就是不能用delete了,那在heap上创建对象的话,如
何析构呢?首先要收回heap上allocate的内存的话,只能用placement new对吧?然后
还不能手动调用析构函数,必须要调用一个公用Destroy函数,在这个Destroy函数里调
用析构函数,最后再free在heap上allocate的内存,是这样么?
【在 f****4 的大作中提到】
: 没理解错的话,这是在问你怎么样能禁止在stack上创建obj
: 除了把ctor声明为private,还有个办法就是把destructor声明为private
: 这里明显就是想问你后一种情况
: 你可以try一下private destructor的情况
: compiler会报错的
何析构呢?首先要收回heap上allocate的内存的话,只能用placement new对吧?然后
还不能手动调用析构函数,必须要调用一个公用Destroy函数,在这个Destroy函数里调
用析构函数,最后再free在heap上allocate的内存,是这样么?
【在 f****4 的大作中提到】
: 没理解错的话,这是在问你怎么样能禁止在stack上创建obj
: 除了把ctor声明为private,还有个办法就是把destructor声明为private
: 这里明显就是想问你后一种情况
: 你可以try一下private destructor的情况
: compiler会报错的
C*h
24 楼
You may want to try some ligands that are specific to T cell receptors to
deliver drugs.
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
deliver drugs.
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
a*r
25 楼
用高压锅最好,我冒气煮一小时。
不用高压锅的话,我记得奶奶要煮一上午。。。
不用高压锅的话,我记得奶奶要煮一上午。。。
g*1
26 楼
use explict may work
g*y
28 楼
To Carwash: Thank you very much for comment
I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
AAV载体的靶向问题).
As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
infection efficiency in T cells.
Do you think this approach works?
Here are some related papers:
A high-capacity, capsid-modified hybrid adenovirus/adeno-associated virus
vector for stable transduction of human hematopoietic cells. J Virol. 2002
Feb;76(3):1135-43.
Development of novel cell surface CD34-targeted recombinant adenoassociated
virus vectors for gene therapy. Hum Gene Ther. 1998 Sep 1;9(13):1929-37.
I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
AAV载体的靶向问题).
As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
infection efficiency in T cells.
Do you think this approach works?
Here are some related papers:
A high-capacity, capsid-modified hybrid adenovirus/adeno-associated virus
vector for stable transduction of human hematopoietic cells. J Virol. 2002
Feb;76(3):1135-43.
Development of novel cell surface CD34-targeted recombinant adenoassociated
virus vectors for gene therapy. Hum Gene Ther. 1998 Sep 1;9(13):1929-37.
t*d
32 楼
是不是肝癌通过这种方法治疗更好?
4:AAV载体的靶向问题,
AAV载体通过静脉注射到小鼠,高效地感染肝脏之类的器官,但是对于血液系统的感染
效率相对低。可以在病毒的Capsid上插入表达一段能特异识别T细胞的蛋白(我还不知
道什么蛋白)来提高T细胞的感染效率。
【在 g****y 的大作中提到】
: To Carwash: Thank you very much for comment
: I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
: cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
: AAV载体的靶向问题).
: As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
: liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
: AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
: infection efficiency in T cells.
: Do you think this approach works?
: Here are some related papers:
4:AAV载体的靶向问题,
AAV载体通过静脉注射到小鼠,高效地感染肝脏之类的器官,但是对于血液系统的感染
效率相对低。可以在病毒的Capsid上插入表达一段能特异识别T细胞的蛋白(我还不知
道什么蛋白)来提高T细胞的感染效率。
【在 g****y 的大作中提到】
: To Carwash: Thank you very much for comment
: I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
: cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
: AAV载体的靶向问题).
: As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
: liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
: AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
: infection efficiency in T cells.
: Do you think this approach works?
: Here are some related papers:
d*1
33 楼
我专门买高压锅煮粽子的
C*h
36 楼
我知道日本有一家公司,他们用一种脂质体,上面经过修饰加工,
带有T cell receptor的ligand,脂质体里面包埋逆转录病毒的RNA。
脂质体把RNA送到T cells里面,再逆转录,整合到genome
the
the
【在 g****y 的大作中提到】
: To Carwash: Thank you very much for comment
: I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
: cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
: AAV载体的靶向问题).
: As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
: liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
: AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
: infection efficiency in T cells.
: Do you think this approach works?
: Here are some related papers:
带有T cell receptor的ligand,脂质体里面包埋逆转录病毒的RNA。
脂质体把RNA送到T cells里面,再逆转录,整合到genome
the
the
【在 g****y 的大作中提到】
: To Carwash: Thank you very much for comment
: I can't agree more with you about the low efficiency in infecting the T
: cells in vivo with virus. That is why I mentioned the potential problem 4(
: AAV载体的靶向问题).
: As you suggested, we could modify the virus caspid, for example, mutate the
: liver cell recognition sequence and express a chimeric protein combining the
: AAV capsid protein and the T cell ligand so that we can increase the
: infection efficiency in T cells.
: Do you think this approach works?
: Here are some related papers:
t*d
39 楼
off-target effect 是关键问题。如你所说,所有癌症治疗手段都有副作用。问题是副
作用是不是在可承受范围内。每个现在市面上的药都花了大钱从无数先导物里面筛出来
的。如果你能塞出一个副作用在可受范围内的 siRNA,就发财了。
看上去 siRNA 比化学小分子更容易被 rationally des
igned。可是目前 siRNA 这个
领域还没有这样成功的例子。也许只是时间问题?
【在 g****y 的大作中提到】
: 谢谢评论, 我也觉得ShRNA的特异性是一个很大的问题, 不过目前有一些文献说可以
: optimized siRNA design来提高或者解决特异性的问题(当然这些文章可能就是wdgca所
: 说的灌水文章,赫赫).
: 考虑到很多药物都有off-target effect, 或者说目前的治疗手段(如化疗)会有大的副
: 作用, 对于癌症病人来说, 很多时候是存活时间长短的问题, 如果一种手段能把存活期
: 由一年延伸到5-10年的话,这种手段还是有一定价值的.
: 回到我的project, 如果我optimized shRNA design, 并且把ShRNA 连到 T Cell
: specific promoter 后面, 那就可以把off-target effect限制在T细胞(大部分都是
: leukemia)里面, 这样是不是可以提高这个实验设计的可行性呢?
作用是不是在可承受范围内。每个现在市面上的药都花了大钱从无数先导物里面筛出来
的。如果你能塞出一个副作用在可受范围内的 siRNA,就发财了。
看上去 siRNA 比化学小分子更容易被 rationally des
igned。可是目前 siRNA 这个
领域还没有这样成功的例子。也许只是时间问题?
【在 g****y 的大作中提到】
: 谢谢评论, 我也觉得ShRNA的特异性是一个很大的问题, 不过目前有一些文献说可以
: optimized siRNA design来提高或者解决特异性的问题(当然这些文章可能就是wdgca所
: 说的灌水文章,赫赫).
: 考虑到很多药物都有off-target effect, 或者说目前的治疗手段(如化疗)会有大的副
: 作用, 对于癌症病人来说, 很多时候是存活时间长短的问题, 如果一种手段能把存活期
: 由一年延伸到5-10年的话,这种手段还是有一定价值的.
: 回到我的project, 如果我optimized shRNA design, 并且把ShRNA 连到 T Cell
: specific promoter 后面, 那就可以把off-target effect限制在T细胞(大部分都是
: leukemia)里面, 这样是不是可以提高这个实验设计的可行性呢?
A*a
43 楼
我高压锅煮了1小時,,,我覺得好吃
我媽說煮得太爛了
我媽說煮得太爛了
r*n
44 楼
g*y
45 楼
To Ttd:
肝癌通过这种方法治疗应该会更好,当然也会面临特异性的问题,
我也觉得SiRNA比小分子化合物更靠铺, 今年AACR的时候和一个药厂的前辈聊天的时候
说到我在筛选小分子化合物来抑制蛋白蛋白之间的相互作用, 前辈直接说这种project
灌水可行, 都是做药物研发不可靠. 我也觉得是这样的,毕竟蛋白质作用的surface比较
大, 小分子药物的特异性不够高.
至于SiRNA的副作用在能不能在可受范围内,这个无法预测, 只有在优化SiRNA的设计并
且提高T细胞的感染效率后去试了才知道.
肝癌通过这种方法治疗应该会更好,当然也会面临特异性的问题,
我也觉得SiRNA比小分子化合物更靠铺, 今年AACR的时候和一个药厂的前辈聊天的时候
说到我在筛选小分子化合物来抑制蛋白蛋白之间的相互作用, 前辈直接说这种project
灌水可行, 都是做药物研发不可靠. 我也觉得是这样的,毕竟蛋白质作用的surface比较
大, 小分子药物的特异性不够高.
至于SiRNA的副作用在能不能在可受范围内,这个无法预测, 只有在优化SiRNA的设计并
且提高T细胞的感染效率后去试了才知道.
a*a
46 楼
谢谢大家回复,实践证明,上气半个小时,已经很熟了
c*3
50 楼
这个我感兴趣,我做siRNA efficacy predition的。
当然从某种角度来说也算是灌水文章,毕竟计算也就是一个概率游戏,不可能得到100%
肯定的结果。
有兴趣可以聊聊
当然从某种角度来说也算是灌水文章,毕竟计算也就是一个概率游戏,不可能得到100%
肯定的结果。
有兴趣可以聊聊
h*e
51 楼
non viral siRNA delivery体系不少, in vitro silencing efficacy 到95%以上的也
有一些,上临床的也有1-2个,好像没成功
主要现在最大的问题是liver accumulation和毒性
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
有一些,上临床的也有1-2个,好像没成功
主要现在最大的问题是liver accumulation和毒性
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
g*y
52 楼
谢谢,我当然有兴趣了,能不能告诉我siRNA efficacy predition是怎么做的吗? 通
过Blast? 我看有一些文献为了筛选specific的SiRNA, 设计好几个不同的SiRNA去处理
细胞, 然后做Microarray去看这些SiRNA的调控的基因,通过对比来看特异性,不过我
觉得这个好像也不是很可靠,毕竟Microarray里表达量下降的基因很多,我们也不知道
哪些基因是直接由SiRNA抑制的
100%
【在 c***3 的大作中提到】
: 这个我感兴趣,我做siRNA efficacy predition的。
: 当然从某种角度来说也算是灌水文章,毕竟计算也就是一个概率游戏,不可能得到100%
: 肯定的结果。
: 有兴趣可以聊聊
过Blast? 我看有一些文献为了筛选specific的SiRNA, 设计好几个不同的SiRNA去处理
细胞, 然后做Microarray去看这些SiRNA的调控的基因,通过对比来看特异性,不过我
觉得这个好像也不是很可靠,毕竟Microarray里表达量下降的基因很多,我们也不知道
哪些基因是直接由SiRNA抑制的
100%
【在 c***3 的大作中提到】
: 这个我感兴趣,我做siRNA efficacy predition的。
: 当然从某种角度来说也算是灌水文章,毕竟计算也就是一个概率游戏,不可能得到100%
: 肯定的结果。
: 有兴趣可以聊聊
g*y
55 楼
hehe, 这么说治疗肝癌还是比较可行的了,无论病毒还是非病毒,deliver到肝脏都是
小事一桩阿
小事一桩阿
h*e
56 楼
ANYWAY,现在CANCER THERAPY的最新方向不是SIRNA了,发好文章没问题,拿FUNDING问
题多多
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
题多多
function
【在 g****y 的大作中提到】
: 大家好,
: 我有一个课题是通过抑制一个oncogene的功能来治疗这个基因突变(Gain of function
: )引起的癌症(T cell leukemia),之前通过molecular docking从NCI 筛选小分子化
: 合物来抑制蛋白与蛋白的相互作用,做的不是很理想。
: 最近想通过SiRNA或者ShRNA抑制这个基因的表达,最终目的是为了能在体内有效的特异
: 地抑制肿瘤细胞里这个oncogene的表达,从而可以选择性的杀死肿瘤细胞。对这个领域
: 不是很熟悉,读了一些文献之后上来寻求大家的帮助,
: 预见的可能问题及解决方法:
: 1:SiRNA 或者ShRNA的特异性:
: SiRNA 或者ShRNA可能会非特异的抑制其它基因的表达,可以通过仔细选择SiRNA 或者
g*y
58 楼
现在CANCER THERAPY的最新方向是什么? Immunotherapy? 赫赫,感觉SiRNA都还没有
成为过CANCER THERAPY的重要方向就已经被淘汰了?如果能发好文章也行啊, 有好文
章才有可能拿funding阿,呵呵,题外话了
成为过CANCER THERAPY的重要方向就已经被淘汰了?如果能发好文章也行啊, 有好文
章才有可能拿funding阿,呵呵,题外话了
d*p
59 楼
siRNA 还是一个不错的方向,毒性和specific delivery是药界的共同的问题,也是
siRNA目前最大障碍了,不过对肝脏疾病我觉得还是很有用的。
siRNA目前最大障碍了,不过对肝脏疾病我觉得还是很有用的。
s*t
60 楼
SiRNA is NOT specific.
use Morpholinos oligos (made by Gene Tools,LLC, http://www.gene-tools.com/). It is antisense oligo with high specificity, stable in the cells (can not degraded by RNAase or DNAase or Proteinase etc). I have used Morpholinos in cell culture and mouse. Work really well.
use Morpholinos oligos (made by Gene Tools,LLC, http://www.gene-tools.com/). It is antisense oligo with high specificity, stable in the cells (can not degraded by RNAase or DNAase or Proteinase etc). I have used Morpholinos in cell culture and mouse. Work really well.
C*h
61 楼
Antisense oligos are not specific either.
【在 s*******t 的大作中提到】
: SiRNA is NOT specific.
: use Morpholinos oligos (made by Gene Tools,LLC, http://www.gene-tools.com/). It is antisense oligo with high specificity, stable in the cells (can not degraded by RNAase or DNAase or Proteinase etc). I have used Morpholinos in cell culture and mouse. Work really well.
【在 s*******t 的大作中提到】
: SiRNA is NOT specific.
: use Morpholinos oligos (made by Gene Tools,LLC, http://www.gene-tools.com/). It is antisense oligo with high specificity, stable in the cells (can not degraded by RNAase or DNAase or Proteinase etc). I have used Morpholinos in cell culture and mouse. Work really well.
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