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请教做单个病人的whole cancer genome 测序的意义

请教做单个病人的whole cancer genome 测序的意义# Biology - 生物学

s*y2011-12-12 08:12

1 楼

大家好
问个Costco副卡的问题
室友先开了costco的账户，然后我今年加进去了，而我是木有AMEX卡的，准备近期申请
请问这种情况下，还要交AMEX年费么？
另外大家比较推荐哪种AMEX呢？fidelity还是spg呢。。。还是同时申。。。
刚才贴到省钱版去了被一兄台建议到此打探。。。
谢啦

e*e2011-12-12 08:12

2 楼

现在手头上有个 patient sample 是一种 rare cancer. 请问一下有相关经验的人,
如果给这个sample 做个100x genomic测序,把所有的存在的突变搞清楚,有无重大意义?
主要担忧是只有单一样本,出来的结果没有统计意义,下一步不好继续研究真正的致病
基因. 同时,想请教正常组织或细胞是不是也有些随机突变? 那样的话给结果带来的干
扰就更大了

v*u2011-12-12 08:12

3 楼

I guess you need to pay. Paying CC fee could save you costco member ship fee
.
if not bonus, fidelity for sure.

【在 s*****y 的大作中提到】

: 大家好
: 问个Costco副卡的问题
: 室友先开了costco的账户，然后我今年加进去了，而我是木有AMEX卡的，准备近期申请
: 请问这种情况下，还要交AMEX年费么？
: 另外大家比较推荐哪种AMEX呢？fidelity还是spg呢。。。还是同时申。。。
: 刚才贴到省钱版去了被一兄台建议到此打探。。。
: 谢啦

o*d2011-12-12 08:12

4 楼

MDACC新任校长的目标之一就是这个。

m*22011-12-12 08:12

5 楼

我印象中COSTCO的卡是一份会员费,可以有一个主会员,一个附属会员的.
所以我觉得你不用再交钱了.相反地,你应该和室友SHARE会员费.付她一半的钱吧.
SPG的话如果有BONUS那当然划算.但要看你是否新手,信用历史能否支撑起这张卡.
如果不是的话,建议FIDELITY 2%.新手先从CASH BACK搞起.

s*y2011-12-12 08:12

6 楼

正常人和正常组织的随机突变应该在数据库中已经有了，所以可以用来做对照
后继工作可以用老鼠模型什么的来确认啊。

义?

【在 e*******e 的大作中提到】

: 现在手头上有个 patient sample 是一种 rare cancer. 请问一下有相关经验的人,
: 如果给这个sample 做个100x genomic测序,把所有的存在的突变搞清楚,有无重大意义?
: 主要担忧是只有单一样本,出来的结果没有统计意义,下一步不好继续研究真正的致病
: 基因. 同时,想请教正常组织或细胞是不是也有些随机突变? 那样的话给结果带来的干
: 扰就更大了

C*n2011-12-12 08:12

7 楼

先去costco成为那个人的costo membership的副会员。然后才能申请costco amex副卡。
没有任何额外费用。
俺家就是这么搞的。
spg等deal吧。fidelity cc没deal。

a*k2011-12-12 08:12

8 楼

各种各样的genetic variation现在已知的信息只是九牛一毛吧？
什么数据库比较全呢？

【在 s******y 的大作中提到】

: 正常人和正常组织的随机突变应该在数据库中已经有了，所以可以用来做对照
: 后继工作可以用老鼠模型什么的来确认啊。
:
: 义?

i*s2011-12-12 08:12

9 楼

spg 和 costco 没关系
年费一样要交

【在 s*****y 的大作中提到】

s*y2011-12-12 08:12

10 楼

这个问题要等莎同学来回答：）

【在 a******k 的大作中提到】

: 各种各样的genetic variation现在已知的信息只是九牛一毛吧？
: 什么数据库比较全呢？

y*i2011-12-12 08:12

11 楼

being a Costco member, either primary or household, waives the annual fee
for Costco TrueEarnings AmEx card, not other AmEx cards.
Paying annual fee to any AmEx cards would not waive your Costco Membership
fee.

【在 s*****y 的大作中提到】

s*s2011-12-12 08:12

12 楼

well, 如果这个人是billionare，那就可以做，顺便敲一把

义?

【在 e*******e 的大作中提到】

s*y2011-12-12 08:12

13 楼

对的我是和室友share的
我是新手看来SPG暂时不要入手为妙。。。而且也不常旅游。。。

【在 m****2 的大作中提到】

: 我印象中COSTCO的卡是一份会员费,可以有一个主会员,一个附属会员的.
: 所以我觉得你不用再交钱了.相反地,你应该和室友SHARE会员费.付她一半的钱吧.
: SPG的话如果有BONUS那当然划算.但要看你是否新手,信用历史能否支撑起这张卡.
: 如果不是的话,建议FIDELITY 2%.新手先从CASH BACK搞起.

A*22011-12-12 08:12

14 楼

虽然我是做微生物的，但是如果只有一个病人就算测出序列来怎么可能知道哪个
mutation是causative的呢？

s*y2011-12-12 08:12

15 楼

我已经成为副会员了。。。costco amex副卡？？神马个意思呢。。。我想申请自己的
amex。。。不想副卡啊。。。

卡。

【在 C******n 的大作中提到】

: 先去costco成为那个人的costo membership的副会员。然后才能申请costco amex副卡。
: 没有任何额外费用。
: 俺家就是这么搞的。
: spg等deal吧。fidelity cc没deal。

d*j2011-12-12 08:12

16 楼

首先，你需要matched normal，比如此病人的白细胞或正常组织DNA。如果你是给这个
病人服务，那你只要找到这个sample的somatic mutation就可以，有可能成为治疗的靶
或者检测病情的marker。如果你要研究这个rare cancer type，那至少需要8-10对样品
，找找有没有什么新的基因在多个样品中都有突变。genomic测序的话不需要那么高的
coverage，如果只是找突变的话做exome测序也可以。

义?

【在 e*******e 的大作中提到】

s*y2011-12-12 08:12

17 楼

长见识了，那就不考虑了暂且，谢谢

【在 i******s 的大作中提到】

: spg 和 costco 没关系
: 年费一样要交

e*e2011-12-12 08:12

18 楼

谢谢各位解惑!

s*y2011-12-12 08:12

19 楼

Oh, that means the only credit card from AMEX without annual fee for me is
Costco TrueEarnings AMEX... right?

【在 y****i 的大作中提到】

: being a Costco member, either primary or household, waives the annual fee
: for Costco TrueEarnings AmEx card, not other AmEx cards.
: Paying annual fee to any AmEx cards would not waive your Costco Membership
: fee.

M*n2011-12-12 08:12

20 楼

问题是跟什么比较啦。
删除了SNP以后，还是会有很多variation的。
建议从exon入手啊。
把病人的所有组织都测一遍。

y*i2011-12-12 08:12

21 楼

let me rephrase it for you
there are quite a few no annual fee AmEx cards.
among those AmEx cards that do have annual fees, if you are a Costco member
and you are approved for the trueearnings card, the annual fee for the
trueearnings card will be waived as long as you pay your Costco membership
fee.

【在 s*****y 的大作中提到】

: Oh, that means the only credit card from AMEX without annual fee for me is
: Costco TrueEarnings AMEX... right?

f*e2011-12-12 08:12

22 楼

给组织／瘤测序 coverage 也不能太小。在瘤里边很大部分的细胞还是正常的，所以要有
够深的 coverage 才能至少测到一次坏细胞的 genome.

【在 d*******j 的大作中提到】

: 首先，你需要matched normal，比如此病人的白细胞或正常组织DNA。如果你是给这个
: 病人服务，那你只要找到这个sample的somatic mutation就可以，有可能成为治疗的靶
: 或者检测病情的marker。如果你要研究这个rare cancer type，那至少需要8-10对样品
: ，找找有没有什么新的基因在多个样品中都有突变。genomic测序的话不需要那么高的
: coverage，如果只是找突变的话做exome测序也可以。
:
: 义?