学术贴，acetylation，乙酰化# Biology - 生物学
m*r
1 楼
好像有些人收到combo卡之后也收到了单独的AP证明，而我收到卡后一直没有收到单独
的AP。请问现在北京边检到底认不认这种combo卡，谢谢
的AP。请问现在北京边检到底认不认这种combo卡，谢谢
c*l
2 楼
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: cynic ([email protected]/* */ 1998->2010->?), 信区: Military
标 题: 张艺谋《长城》白男华女不再滚床单
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 30 03:41:35 2016, 美东)
据说真实原因是华女背景太牛
发信人: cynic ([email protected]/* */ 1998->2010->?), 信区: Military
标 题: 张艺谋《长城》白男华女不再滚床单
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 30 03:41:35 2016, 美东)
据说真实原因是华女背景太牛
h*b
3 楼
我在mac自带的mail里面设置了多个邮箱账户，接受没有任何问题，但是发送邮件经常
乱七八糟的，比如说，我想用A邮箱发送email，但是写完，发送出去，发现系统是用B
邮箱送出的，别人回复的时候，也是给我回复到了B邮箱。即使我编辑的时候很仔细的
确认过是用A邮箱编辑的也是这样。
那位高人帮忙看看是什么地方设置的不对？谢谢了！包子答谢！
乱七八糟的，比如说，我想用A邮箱发送email，但是写完，发送出去，发现系统是用B
邮箱送出的，别人回复的时候，也是给我回复到了B邮箱。即使我编辑的时候很仔细的
确认过是用A邮箱编辑的也是这样。
那位高人帮忙看看是什么地方设置的不对？谢谢了！包子答谢！
c*1
4 楼
请教做乙酰化的专家：
1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
个paper提到这个情况。
2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
有没有什么影响？
非常感谢！！！
1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
个paper提到这个情况。
2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
有没有什么影响？
非常感谢！！！
i*t
5 楼
problem resolved
【在 m********r 的大作中提到】
: 好像有些人收到combo卡之后也收到了单独的AP证明，而我收到卡后一直没有收到单独
: 的AP。请问现在北京边检到底认不认这种combo卡，谢谢
【在 m********r 的大作中提到】
: 好像有些人收到combo卡之后也收到了单独的AP证明，而我收到卡后一直没有收到单独
: 的AP。请问现在北京边检到底认不认这种combo卡，谢谢
i*a
6 楼
是不是其实张艺谋也想她滚的?
【在 c*********l 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: cynic ([email protected]/* */ 1998->2010->?), 信区: Military
: 标 题: 张艺谋《长城》白男华女不再滚床单
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 30 03:41:35 2016, 美东)
: 据说真实原因是华女背景太牛
【在 c*********l 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
: 发信人: cynic ([email protected]/* */ 1998->2010->?), 信区: Military
: 标 题: 张艺谋《长城》白男华女不再滚床单
: 发信站: BBS 未名空间站 (Fri Dec 30 03:41:35 2016, 美东)
: 据说真实原因是华女背景太牛
e*n
7 楼
发之前看看啊……
B
【在 h**b 的大作中提到】
: 我在mac自带的mail里面设置了多个邮箱账户，接受没有任何问题，但是发送邮件经常
: 乱七八糟的，比如说，我想用A邮箱发送email，但是写完，发送出去，发现系统是用B
: 邮箱送出的，别人回复的时候，也是给我回复到了B邮箱。即使我编辑的时候很仔细的
: 确认过是用A邮箱编辑的也是这样。
: 那位高人帮忙看看是什么地方设置的不对？谢谢了！包子答谢！
B
【在 h**b 的大作中提到】
: 我在mac自带的mail里面设置了多个邮箱账户，接受没有任何问题，但是发送邮件经常
: 乱七八糟的，比如说，我想用A邮箱发送email，但是写完，发送出去，发现系统是用B
: 邮箱送出的，别人回复的时候，也是给我回复到了B邮箱。即使我编辑的时候很仔细的
: 确认过是用A邮箱编辑的也是这样。
: 那位高人帮忙看看是什么地方设置的不对？谢谢了！包子答谢！
s*y
8 楼
取决于具体的抗体，有的是可以识别所有的acetyl-lysine，有的则对背景序列
也敏感
一般比较稳定。
去乙酰化不需要能量，但是需要酶催化才能高效。
RNAlater具体是什么成分？如果不是碱性很强， 应该问题不大。
【在 c****1 的大作中提到】
: 请教做乙酰化的专家：
: 1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
: 肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
: 如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
: 的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
: 个paper提到这个情况。
: 2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
: 有没有什么影响？
: 非常感谢！！！
t*a
9 楼
what is the answer to this question?
s*x
10 楼
这个算张艺谋的功劳。华女可能背后恨得牙痒痒。
h*b
11 楼
看了，很确定是A信箱发出的，但是接受的显示是B发出了。我自己试了好几次。
我觉得是系统哪里设置的一个问题。
我觉得是系统哪里设置的一个问题。
c*1
12 楼
非常感谢！！
抗体的问题，如果写paper，reviewer问到，改如何argue呢？对背景序列是否敏感，貌
似不好检测啊。我觉得，唯一的方法就是用同时应用不同公司的抗体，看是否有相同的
结果。
RNAlater是一种RNA稳定剂，主要用于RNA的提取，具体成分不详，作用机理就是让所有
蛋白变性。
【在 s******y 的大作中提到】
:
: 取决于具体的抗体，有的是可以识别所有的acetyl-lysine，有的则对背景序列
: 也敏感
: 一般比较稳定。
: 去乙酰化不需要能量，但是需要酶催化才能高效。
: RNAlater具体是什么成分？如果不是碱性很强， 应该问题不大。
抗体的问题，如果写paper，reviewer问到，改如何argue呢？对背景序列是否敏感，貌
似不好检测啊。我觉得，唯一的方法就是用同时应用不同公司的抗体，看是否有相同的
结果。
RNAlater是一种RNA稳定剂，主要用于RNA的提取，具体成分不详，作用机理就是让所有
蛋白变性。
【在 s******y 的大作中提到】
:
: 取决于具体的抗体，有的是可以识别所有的acetyl-lysine，有的则对背景序列
: 也敏感
: 一般比较稳定。
: 去乙酰化不需要能量，但是需要酶催化才能高效。
: RNAlater具体是什么成分？如果不是碱性很强， 应该问题不大。
e*2
13 楼
现在从北京出关用EAD/AP combo一点问题没有。去年12月底官方接到新卡的通知的。我
们1月19-2月4回国从北京进出的。
们1月19-2月4回国从北京进出的。
u*a
14 楼
我也偶尔这样...某个email的smtp服务器offline就自动用别的smtp服务器发了.
B
【在 h**b 的大作中提到】
: 我在mac自带的mail里面设置了多个邮箱账户，接受没有任何问题，但是发送邮件经常
: 乱七八糟的，比如说，我想用A邮箱发送email，但是写完，发送出去，发现系统是用B
: 邮箱送出的，别人回复的时候，也是给我回复到了B邮箱。即使我编辑的时候很仔细的
: 确认过是用A邮箱编辑的也是这样。
: 那位高人帮忙看看是什么地方设置的不对？谢谢了！包子答谢！
B
【在 h**b 的大作中提到】
: 我在mac自带的mail里面设置了多个邮箱账户，接受没有任何问题，但是发送邮件经常
: 乱七八糟的，比如说，我想用A邮箱发送email，但是写完，发送出去，发现系统是用B
: 邮箱送出的，别人回复的时候，也是给我回复到了B邮箱。即使我编辑的时候很仔细的
: 确认过是用A邮箱编辑的也是这样。
: 那位高人帮忙看看是什么地方设置的不对？谢谢了！包子答谢！
A*y
15 楼
For number 1, if you are worry about reviewers, you have to do two things: 1
. Mass spec will tell you where the modification is. 2. For your gene of
interest, you can use different but well know histone acetylation or
methylation marker doing chromatin IP. Both require experience and special
training to do them right though. Even if you can find specific actylated
ab for the resiude, reviewers will ask for these two experiments for a good
journal. As for as I know, histone H3 K9 Chip is very common.
For number 2, acetylation is very stable if you have significant increase
using chemical inhibitors. If you want to look at responses to different
conditions, I will recommend adding 0.5 microM of the HDAC inhibitor TSA
into the LYSIS BUFFER (same theory using phosphatase inhibitor for phos-
residues).
【在 c****1 的大作中提到】
: 请教做乙酰化的专家：
: 1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
: 肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
: 如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
: 的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
: 个paper提到这个情况。
: 2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
: 有没有什么影响？
: 非常感谢！！！
. Mass spec will tell you where the modification is. 2. For your gene of
interest, you can use different but well know histone acetylation or
methylation marker doing chromatin IP. Both require experience and special
training to do them right though. Even if you can find specific actylated
ab for the resiude, reviewers will ask for these two experiments for a good
journal. As for as I know, histone H3 K9 Chip is very common.
For number 2, acetylation is very stable if you have significant increase
using chemical inhibitors. If you want to look at responses to different
conditions, I will recommend adding 0.5 microM of the HDAC inhibitor TSA
into the LYSIS BUFFER (same theory using phosphatase inhibitor for phos-
residues).
【在 c****1 的大作中提到】
: 请教做乙酰化的专家：
: 1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
: 肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
: 如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
: 的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
: 个paper提到这个情况。
: 2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
: 有没有什么影响？
: 非常感谢！！！
h*b
16 楼
我的两个email账户都是gmail，电脑一直是网络接通的，没理由一个smtp offline另外
一个是好的
一个是好的
c*1
17 楼
多谢回答!
1.Mass Spec不错，不仅可以知道哪些位点被修饰了，而且可以量化。但是，我的样品
是组织，同一个位点可能有多个修饰，Mass Spec可以分辨出来么？
2. ChIP貌似也是运用抗体，跟WB一样，也不能辨别它对背景序列的敏感程度吧？
3. 我听说，TSA可以人为的增加Acetylation的程度，有这回事么？
1
special
good
【在 A******y 的大作中提到】
: For number 1, if you are worry about reviewers, you have to do two things: 1
: . Mass spec will tell you where the modification is. 2. For your gene of
: interest, you can use different but well know histone acetylation or
: methylation marker doing chromatin IP. Both require experience and special
: training to do them right though. Even if you can find specific actylated
: ab for the resiude, reviewers will ask for these two experiments for a good
: journal. As for as I know, histone H3 K9 Chip is very common.
: For number 2, acetylation is very stable if you have significant increase
: using chemical inhibitors. If you want to look at responses to different
: conditions, I will recommend adding 0.5 microM of the HDAC inhibitor TSA
1.Mass Spec不错，不仅可以知道哪些位点被修饰了，而且可以量化。但是，我的样品
是组织，同一个位点可能有多个修饰，Mass Spec可以分辨出来么？
2. ChIP貌似也是运用抗体，跟WB一样，也不能辨别它对背景序列的敏感程度吧？
3. 我听说，TSA可以人为的增加Acetylation的程度，有这回事么？
1
special
good
【在 A******y 的大作中提到】
: For number 1, if you are worry about reviewers, you have to do two things: 1
: . Mass spec will tell you where the modification is. 2. For your gene of
: interest, you can use different but well know histone acetylation or
: methylation marker doing chromatin IP. Both require experience and special
: training to do them right though. Even if you can find specific actylated
: ab for the resiude, reviewers will ask for these two experiments for a good
: journal. As for as I know, histone H3 K9 Chip is very common.
: For number 2, acetylation is very stable if you have significant increase
: using chemical inhibitors. If you want to look at responses to different
: conditions, I will recommend adding 0.5 microM of the HDAC inhibitor TSA
u*a
18 楼
我5个账号都是gmail的...3个online2个offline是常有的事, 大概是mail的bug.
【在 h**b 的大作中提到】
: 我的两个email账户都是gmail，电脑一直是网络接通的，没理由一个smtp offline另外
: 一个是好的
【在 h**b 的大作中提到】
: 我的两个email账户都是gmail，电脑一直是网络接通的，没理由一个smtp offline另外
: 一个是好的
s*y
19 楼
抗体的问题很简单，你找公司去合成另外几个 peptide，在acetyl-Lysine
附近放进不同的氨基酸，用它们作为control来测试你的抗体。
关于你对另外一个人的问题：Mass Spec 完全可以知道是那个残基上的修饰
【在 c****1 的大作中提到】
: 非常感谢！！
: 抗体的问题，如果写paper，reviewer问到，改如何argue呢？对背景序列是否敏感，貌
: 似不好检测啊。我觉得，唯一的方法就是用同时应用不同公司的抗体，看是否有相同的
: 结果。
: RNAlater是一种RNA稳定剂，主要用于RNA的提取，具体成分不详，作用机理就是让所有
: 蛋白变性。
附近放进不同的氨基酸，用它们作为control来测试你的抗体。
关于你对另外一个人的问题：Mass Spec 完全可以知道是那个残基上的修饰
【在 c****1 的大作中提到】
: 非常感谢！！
: 抗体的问题，如果写paper，reviewer问到，改如何argue呢？对背景序列是否敏感，貌
: 似不好检测啊。我觉得，唯一的方法就是用同时应用不同公司的抗体，看是否有相同的
: 结果。
: RNAlater是一种RNA稳定剂，主要用于RNA的提取，具体成分不详，作用机理就是让所有
: 蛋白变性。
h*b
20 楼
只好考虑是不是再装一个thunderbird了
T*O
21 楼
1. Polyclonal Abs would be less specific to Ac-K9. Hypothetically, an Ab
could grab AA4-AA8 regardless antigens have Ac-K9 and Ac-K12 or not.
To get Ac-site-specific Abs you'll have to make them, affinity-purify and
confirm them with those peptides.
【在 c****1 的大作中提到】
: 请教做乙酰化的专家：
: 1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
: 肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
: 如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
: 的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
: 个paper提到这个情况。
: 2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
: 有没有什么影响？
: 非常感谢！！！
could grab AA4-AA8 regardless antigens have Ac-K9 and Ac-K12 or not.
To get Ac-site-specific Abs you'll have to make them, affinity-purify and
confirm them with those peptides.
【在 c****1 的大作中提到】
: 请教做乙酰化的专家：
: 1. 通常的乙酰化的抗体，都是用一个短肽做免疫原。比如，一个用来做K9ac抗体的短
: 肽，是4-15的序列，但是这个序列中，K9是ac修饰的，但是还有其他没有修饰的K，比
: 如K5，K12。我的问题是，这个抗体，是不是只能识别K9乙酰化，同时K5和K12没有修饰
: 的序列？这样一来的话，这个抗体，并没有识别所有的K9乙酰化的状态。好像还没有那
: 个paper提到这个情况。
: 2. 乙酰化修饰是否稳定？去乙酰化需要能量么？在RNAlater中解剖组织对乙酰化修饰
: 有没有什么影响？
: 非常感谢！！！
u*a
22 楼
不用吧, preference-account底下有个选项是only use this server可破.
【在 h**b 的大作中提到】
: 只好考虑是不是再装一个thunderbird了
【在 h**b 的大作中提到】
: 只好考虑是不是再装一个thunderbird了
c*1
23 楼
我觉得证明对ac-k9的特异性的最好的办法就是过表达k9的mutant， 然后用此抗体检测
。大家说呢？
【在 T****O 的大作中提到】
: 1. Polyclonal Abs would be less specific to Ac-K9. Hypothetically, an Ab
: could grab AA4-AA8 regardless antigens have Ac-K9 and Ac-K12 or not.
: To get Ac-site-specific Abs you'll have to make them, affinity-purify and
: confirm them with those peptides.
。大家说呢？
【在 T****O 的大作中提到】
: 1. Polyclonal Abs would be less specific to Ac-K9. Hypothetically, an Ab
: could grab AA4-AA8 regardless antigens have Ac-K9 and Ac-K12 or not.
: To get Ac-site-specific Abs you'll have to make them, affinity-purify and
: confirm them with those peptides.
h*b
24 楼
非常感谢！你说的没错，把每一个only use this server都选定，问题就解决了。我大
概测试了一下，没有问题。
请收一个包子！
【在 u******a 的大作中提到】
: 不用吧, preference-account底下有个选项是only use this server可破.
概测试了一下，没有问题。
请收一个包子！
【在 u******a 的大作中提到】
: 不用吧, preference-account底下有个选项是only use this server可破.
A*y
25 楼
If that's what you want to do, you have to do both positive mutant (Lysine
to arginine) and negative mutant. Although, how many copies of histone H3
are there in human? I know for histone H4 there are more than 14 different
coding regions.
【在 c****1 的大作中提到】
: 我觉得证明对ac-k9的特异性的最好的办法就是过表达k9的mutant， 然后用此抗体检测
: 。大家说呢？
to arginine) and negative mutant. Although, how many copies of histone H3
are there in human? I know for histone H4 there are more than 14 different
coding regions.
【在 c****1 的大作中提到】
: 我觉得证明对ac-k9的特异性的最好的办法就是过表达k9的mutant， 然后用此抗体检测
: 。大家说呢？
f*f
26 楼
我的经验是用哪个smtp server不是决定发信邮箱的因素。
我两个帐户a和b都设置成用a的smtp server only发信， 发信邮箱还是互不干扰，可以
自由选择。
这是种么回事
【在 h**b 的大作中提到】
: 非常感谢！你说的没错，把每一个only use this server都选定，问题就解决了。我大
: 概测试了一下，没有问题。
: 请收一个包子！
我两个帐户a和b都设置成用a的smtp server only发信， 发信邮箱还是互不干扰，可以
自由选择。
这是种么回事
【在 h**b 的大作中提到】
: 非常感谢！你说的没错，把每一个only use this server都选定，问题就解决了。我大
: 概测试了一下，没有问题。
: 请收一个包子！
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