DePinho的文章也有copy and paste - 未名空间MITBBS历史存档

DePinho的文章也有copy and paste# Biology - 生物学

p*x2012-02-17 08:02

1 楼

今天早上era上出分了，在borderline上，是否应该现在给PO写信，还是再等等
statement出了以后再写？
如果写的话，应该为什么呢，就问有没有希望fund，如果重新提交怎么改进（
statement还没出，我也不知道有什么comments）？
多谢牛牛们指教

p*y2012-02-17 08:02

2 楼

功能简单就行了，噪音不要太大

g*12012-02-17 08:02

3 楼

最新一期cell上的文章figure S4B的P-p53那个western blot的第6条道是贴上去的。
http://www.sciencedirect.com/cache/MiamiImageURL/1-s2.0-S0092867412000268-figs4_lrg.jpg/0?wchp=dGLzVlS-zSkWA
用NIH的droplets分析以后更明显，背景明显不一样。不知道会不会影响结论

b*d2012-02-17 08:02

4 楼

等statement出来了给他打电话,就问他下一步该怎么办.探探他的口风.

f*c2012-02-17 08:02

5 楼

便宜的噪音都很大

【在 p******y 的大作中提到】

: 功能简单就行了，噪音不要太大

s*s2012-02-17 08:02

6 楼

实在看不出有什么问题。
片子上有些水印。

【在 g*********1 的大作中提到】

: 最新一期cell上的文章figure S4B的P-p53那个western blot的第6条道是贴上去的。
: http://www.sciencedirect.com/cache/MiamiImageURL/1-s2.0-S0092867412000268-figs4_lrg.jpg/0?wchp=dGLzVlS-zSkWA
: 用NIH的droplets分析以后更明显，背景明显不一样。不知道会不会影响结论

p*x2012-02-17 08:02

7 楼

多谢，必须打电话吗，写邮件可以不

【在 b*****d 的大作中提到】

: 等statement出来了给他打电话,就问他下一步该怎么办.探探他的口风.

F*t2012-02-17 08:02

8 楼

此物噪音都很大

g*12012-02-17 08:02

9 楼

附件里面有用NIH droplet分析后图，更明显些

【在 s**s 的大作中提到】

: 实在看不出有什么问题。
: 片子上有些水印。

b*d2012-02-17 08:02

10 楼

写邮件.约个时间打电话.很多时候,打电话更好些.能得到更多的信息.

【在 p**x 的大作中提到】

: 多谢，必须打电话吗，写邮件可以不

L*e2012-02-17 08:02

11 楼

上星期刚买了一个food network，用的觉得还行，也不知道那个牌子好，看到打折就买
了。

s*s2012-02-17 08:02

12 楼

我觉得这个根本就没有什么问题。只是因为中间那条带signal弱，所以看起来象是不同
的背景。
把帖子删了吧。
背靠背两篇cell的第一作者都是中国人，很好的事情。这些工作不做3－5年做不出来。

【在 g*********1 的大作中提到】

: 附件里面有用NIH droplet分析后图，更明显些

s*y2012-02-17 08:02

13 楼

赞同。

【在 b*****d 的大作中提到】

: 写邮件.约个时间打电话.很多时候,打电话更好些.能得到更多的信息.

b*s2012-02-17 08:02

14 楼

vita-mix or blendtec

g*12012-02-17 08:02

15 楼

我也作过很多western blot,条带信号弱的话，背景应该一致，这条带的背景明显和两
边的不一致，懂行的过来看看

【在 s**s 的大作中提到】

: 我觉得这个根本就没有什么问题。只是因为中间那条带signal弱，所以看起来象是不同
: 的背景。
: 把帖子删了吧。
: 背靠背两篇cell的第一作者都是中国人，很好的事情。这些工作不做3－5年做不出来。

g*g2012-02-17 08:02

16 楼

搭车问个小白的问题，老师们都是什么时候知道分数？开完会几天后能查到？
我是申的K99，出分速度和R01啥的差不多吧？

【在 p**x 的大作中提到】

: 今天早上era上出分了，在borderline上，是否应该现在给PO写信，还是再等等
: statement出了以后再写？
: 如果写的话，应该为什么呢，就问有没有希望fund，如果重新提交怎么改进（
: statement还没出，我也不知道有什么comments）？
: 多谢牛牛们指教

g*12012-02-17 08:02

17 楼

你辛辛苦苦做实验，人家copy paste 想要的结果，你很高兴吗？这样做是research
misconduct.需要向学校和nih反映

s*s2012-02-17 08:02

18 楼

羡慕嫉妒恨。莫名其妙。
首先，这个东西是不是copy paste凭你那个分析根本不能说明什么问题。有时候如果条
带比周围的条带信号弱，背景看起来会弱些。而有时条带信号强会使得背景看起来也强
些。
其次，这个工作，看这个文章的工作量，人家肯定是辛辛苦苦做了很多年，而觉不是
copy paste想要的结果。我们应该为这样的同胞高兴。
再次，楼主在第一个帖子里问别人这个图影响不影响结论。既然这个图影不影响结论楼
主都没有搞清楚，想必没有好好读这个文章。我就搞不明白楼主为什么对一个不去好好
读明白的文章的supplemental figures这么感兴趣。

【在 g*********1 的大作中提到】

: 你辛辛苦苦做实验，人家copy paste 想要的结果，你很高兴吗？这样做是research
: misconduct.需要向学校和nih反映

c*y2012-02-17 08:02

19 楼

这篇文章的一作托我在这里转贴对你的质疑的一个回应（图片在附件里）
"我是文章的第一作者。我想我有义务出来澄清一下。我们欢迎任何形式的质疑，澄清
这些质疑也是我们对科学社区的责任。我把原始的没有processed过的film扫描了。请
参考附件。我不知道为什么Cell登出来的图片为什么质量这么低，但是我会联系他们的
技术部门。如果有任何其他关于我们工作的问题，欢迎你联系我本人或者我的导师
Ronald DePinho。我的email是j**[email protected]"

【在 g*********1 的大作中提到】

: 最新一期cell上的文章figure S4B的P-p53那个western blot的第6条道是贴上去的。
: http://www.sciencedirect.com/cache/MiamiImageURL/1-s2.0-S0092867412000268-figs4_lrg.jpg/0?wchp=dGLzVlS-zSkWA
: 用NIH的droplets分析以后更明显，背景明显不一样。不知道会不会影响结论

d*m2012-02-17 08:02

20 楼

这才是牛人当有的风格啊。cong, 占牛气

【在 c**y 的大作中提到】

: 这篇文章的一作托我在这里转贴对你的质疑的一个回应（图片在附件里）
: "我是文章的第一作者。我想我有义务出来澄清一下。我们欢迎任何形式的质疑，澄清
: 这些质疑也是我们对科学社区的责任。我把原始的没有processed过的film扫描了。请
: 参考附件。我不知道为什么Cell登出来的图片为什么质量这么低，但是我会联系他们的
: 技术部门。如果有任何其他关于我们工作的问题，欢迎你联系我本人或者我的导师
: Ronald DePinho。我的email是j**[email protected]"

s*s2012-02-17 08:02

21 楼

呵呵。为牛人当了一回辩护人。
牛人不需要辩护人。

【在 c**y 的大作中提到】

: 这篇文章的一作托我在这里转贴对你的质疑的一个回应（图片在附件里）
: "我是文章的第一作者。我想我有义务出来澄清一下。我们欢迎任何形式的质疑，澄清
: 这些质疑也是我们对科学社区的责任。我把原始的没有processed过的film扫描了。请
: 参考附件。我不知道为什么Cell登出来的图片为什么质量这么低，但是我会联系他们的
: 技术部门。如果有任何其他关于我们工作的问题，欢迎你联系我本人或者我的导师
: Ronald DePinho。我的email是j**[email protected]"

s*j2012-02-17 08:02

22 楼

你贴几张你做的胶上来, 看看能不能调出什么"copy and paste"?

【在 g*********1 的大作中提到】

: 你辛辛苦苦做实验，人家copy paste 想要的结果，你很高兴吗？这样做是research
: misconduct.需要向学校和nih反映

s*j2012-02-17 08:02

23 楼

"我们对科学社区的责任", "科学社区"--真是做学问的人呀.

【在 c**y 的大作中提到】

: 这篇文章的一作托我在这里转贴对你的质疑的一个回应（图片在附件里）
: "我是文章的第一作者。我想我有义务出来澄清一下。我们欢迎任何形式的质疑，澄清
: 这些质疑也是我们对科学社区的责任。我把原始的没有processed过的film扫描了。请
: 参考附件。我不知道为什么Cell登出来的图片为什么质量这么低，但是我会联系他们的
: 技术部门。如果有任何其他关于我们工作的问题，欢迎你联系我本人或者我的导师
: Ronald DePinho。我的email是j**[email protected]"

n*e2012-02-17 08:02

24 楼

This is outrageous!
On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.
It is hard to believe that this was an innocent mistake.
My 2 cents.

h*s2012-02-17 08:02

25 楼

真牛人。完全同意这个分析。
唉。这个行业要自律呀。
科学社区的人们呀，聪明人加上不自律，比copy paste更过分呀。把人耍了还数钱呀。

by

【在 n****e 的大作中提到】

: This is outrageous!
: On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
: resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
: signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
: loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
: the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
: However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
: horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
: original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
: it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.

s*s2012-02-17 08:02

26 楼

这个分析很有道理。
希望作者不是有意的。
我为牛人的辩护是基于图片不是”copy paste“。

by

【在 n****e 的大作中提到】

: This is outrageous!
: On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
: resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
: signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
: loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
: the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
: However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
: horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
: original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
: it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.

d*y2012-02-17 08:02

27 楼

呵呵，学术打假很有必要……

y*82012-02-17 08:02

28 楼

依照经验，total protein没有over-load，lane之间的差异在20%以内。
150kd附近的带，量差异在100%以内。
p53, p21 positive的lanes比，量差异在5倍以上。

by

【在 n****e 的大作中提到】

: This is outrageous!
: On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
: resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
: signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
: loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
: the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
: However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
: horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
: original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
: it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.

M*t2012-02-17 08:02

29 楼

没看懂.意思即使不over-load,也有显著差异?
20%成100%到底有没有over-load?

【在 y******8 的大作中提到】

: 依照经验，total protein没有over-load，lane之间的差异在20%以内。
: 150kd附近的带，量差异在100%以内。
: p53, p21 positive的lanes比，量差异在5倍以上。
:
: by

n*e2012-02-17 08:02

30 楼

Anyone who understands the basic principle of ECL knows its linearity is
quite limited. It turns to exaggerate differences between weaker signals but
minimize and underestimate the differences among strong saturated bands.
When the immunosignals are weak, a 2-fold change may appear to be 10-fold on
films. It is hard to know what the real result was given the information
here is limited, but it is rather puzzling that the author made such an
effort on flipping the images. Regardless of the truth related to this
paper, I believe such behavior is a good indicator of the author’s
integrity.

【在 y******8 的大作中提到】

: 依照经验，total protein没有over-load，lane之间的差异在20%以内。
: 150kd附近的带，量差异在100%以内。
: p53, p21 positive的lanes比，量差异在5倍以上。
:
: by

y*82012-02-17 08:02

31 楼

经验就是经验，你做过一千个WB就知道了。
我没看出作者在这张film上刻意manipulate Expo Time的地方。

but
on

【在 n****e 的大作中提到】

: Anyone who understands the basic principle of ECL knows its linearity is
: quite limited. It turns to exaggerate differences between weaker signals but
: minimize and underestimate the differences among strong saturated bands.
: When the immunosignals are weak, a 2-fold change may appear to be 10-fold on
: films. It is hard to know what the real result was given the information
: here is limited, but it is rather puzzling that the author made such an
: effort on flipping the images. Regardless of the truth related to this
: paper, I believe such behavior is a good indicator of the author’s
: integrity.

r*t2012-02-17 08:02

32 楼

靠，图看不见了。。这个撤的还很快。

by

【在 n****e 的大作中提到】

: This is outrageous!
: On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
: resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
: signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
: loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
: the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
: However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
: horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
: original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
: it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.

n*e2012-02-17 08:02

33 楼

Flipping and mis-presenting original images is clearly a research misconduct
that can’t be tolerated. It is not about how many westerns you have done.
What being questioned is the author’s integrity!

【在 y******8 的大作中提到】

: 经验就是经验，你做过一千个WB就知道了。
: 我没看出作者在这张film上刻意manipulate Expo Time的地方。
:
: but
: on

y*82012-02-17 08:02

34 楼

那你去告啊。
别人最多加个erratum. 什么都没影响。我觉得作者很坦荡，integrity不比各位差。

misconduct
.

【在 n****e 的大作中提到】

: Flipping and mis-presenting original images is clearly a research misconduct
: that can’t be tolerated. It is not about how many westerns you have done.
: What being questioned is the author’s integrity!

P*o2012-02-17 08:02

35 楼

好眼力

by

【在 n****e 的大作中提到】

: This is outrageous!
: On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
: resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
: signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
: loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
: the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
: However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
: horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
: original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
: it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.

p*n2012-02-17 08:02

36 楼

靠，还真是这么回事
这位”胸怀坦荡“的牛人敢贴出原图来，真是小觑了天下英雄啊

by

【在 n****e 的大作中提到】

: This is outrageous!
: On the original scan, from left to right, Lanes 7 and 9 were overloaded,
: resulting in higher level signals for all three proteins. The Vinculin
: signal was very strong and reached saturation, so that the difference in
: loading wasn’t obvious. Yet, lanes 7 and 9 were overloaded as indicated by
: the non-specific bands between 76kDa and 120 kDa.
: However, in the published figure, the P-p53 and p21 blots were flipped
: horizontally, but the Vinculin blot wasn’t flipped. In this way the
: original lane 7 and lane 9 became lane 2 and 4, respectively. By doing so,
: it appears in the end that tumors #1 and 2 showed elevated P-p53 and p21.

r*t2012-02-17 08:02

37 楼

这个是真的 NC 了，还是韩寒团队的马甲呢

【在 s**s 的大作中提到】

: 呵呵。为牛人当了一回辩护人。
: 牛人不需要辩护人。

l*12012-02-17 08:02

38 楼

想将来坐美国牢狱里边的尽管copy and paste
then published at NCS except N sub

s*t2012-02-17 08:02

39 楼

怕坐牢，不敢copy and paste就老老实实滴做自己。不要JJYY，眼红别人copy and paste。没必要

【在 l**********1 的大作中提到】

: 想将来坐美国牢狱里边的尽管copy and paste
: then published at NCS except N sub

l*12012-02-17 08:02

40 楼

是吗
咋看象第五纵队的一份子呢
我不怕虎一样的对手就怕猪一样的队友更忌蛇一般的潜伏者
是啥名句吧啊

【在 p****n 的大作中提到】

: 靠，还真是这么回事
: 这位”胸怀坦荡“的牛人敢贴出原图来，真是小觑了天下英雄啊
:
: by

s*t2012-02-17 08:02

41 楼

哎，人家辛辛苦苦好几年发一篇Cell，正高兴呢，当头一盆冷水。
别回应别理睬，做自己的。越回应越来劲，人们都喜欢看热闹看笑话。
方舟子之流就是这么利用人们的心理的

【在 c**y 的大作中提到】

: 这篇文章的一作托我在这里转贴对你的质疑的一个回应（图片在附件里）
: "我是文章的第一作者。我想我有义务出来澄清一下。我们欢迎任何形式的质疑，澄清
: 这些质疑也是我们对科学社区的责任。我把原始的没有processed过的film扫描了。请
: 参考附件。我不知道为什么Cell登出来的图片为什么质量这么低，但是我会联系他们的
: 技术部门。如果有任何其他关于我们工作的问题，欢迎你联系我本人或者我的导师
: Ronald DePinho。我的email是j**[email protected]"

l*12012-02-17 08:02

42 楼

this kind of Cell contents including SOM contents correction if met "11thJigen"
might be 2nd Kato S possible:
>Jigen says he began looking into Kato's publications after a colleague told
him about a correction to a 2009 Nature paper that appeared in October 2011
. Several images "were inadvertently duplicated or erroneously created
during figure assembly," the correction notice reads. Jigen and his
colleague then examined 24 papers from the Kato group and spotted 60 those
allegedly problematic images.
//news.sciencemag.org/scienceinsider/2012/01/whistleblower-uses-youtube-to-
assert.html
NB: 人怕出名猪怕壮 NCS一作/末作就怕登一erratum 被 11th Jigen 瞄上其它的copy and paste

【在 y******8 的大作中提到】

: 那你去告啊。
: 别人最多加个erratum. 什么都没影响。我觉得作者很坦荡，integrity不比各位差。
:
: misconduct
: .

s*s2012-02-17 08:02

43 楼

我为牛人的辩护是基于图片不是copy paste。
唉。我只知道开始，不知道结局。

【在 r****t 的大作中提到】

: 这个是真的 NC 了，还是韩寒团队的马甲呢

M*t2012-02-17 08:02

44 楼

我开始怀疑这个贴子是作者内斗了,sigh....
发这么牛文的一作来贴图不能认真点么?

r*u2012-02-17 08:02

45 楼

在我看来只有p53的原图被贴了出来，vinculin和p21都不是原图。

c*d2012-02-17 08:02

46 楼

同感。原图那个vinculin和published差别有点大啊。而且原图中lane4到9基本上是一
直往下走，published的图，patter明显不一样。

【在 r***u 的大作中提到】

: 在我看来只有p53的原图被贴了出来，vinculin和p21都不是原图。

M*t2012-02-17 08:02

47 楼

图是原图吧？不过可能是扫描的时候不小心翻过来扫了。

【在 c****d 的大作中提到】

: 同感。原图那个vinculin和published差别有点大啊。而且原图中lane4到9基本上是一
: 直往下走，published的图，patter明显不一样。

z*i2012-02-17 08:02

48 楼

看图上标注的marker，应该是vinculin翻转了一下。如果重新跑一下western，可能没
有什么问题。

【在 M******t 的大作中提到】

: 图是原图吧？不过可能是扫描的时候不小心翻过来扫了。

L*O2012-02-17 08:02

49 楼

无知群众来围观

b*n2012-02-17 08:02

50 楼

打着红旗反红旗，高级黑？

【在 l**********1 的大作中提到】

: 是吗
: 咋看象第五纵队的一份子呢
: 我不怕虎一样的对手就怕猪一样的队友更忌蛇一般的潜伏者
: 是啥名句吧啊

l*12012-02-17 08:02

51 楼

薄希踢断其老爸薄一几根肋骨后还在当三番王还妄想进京当常委的那教育出来的
学术政治上高级黑的概率上比其它宗教教育出来的高点正常啦

【在 b*******n 的大作中提到】

: 打着红旗反红旗，高级黑？

m*32012-02-17 08:02

52 楼

看了这个帖子，我对做生物一点兴趣都没有了，决定华丽丽的转行了。感觉现在的生物
就是一个给别人挑毛病的专业。不懂得欣赏别人，造成这个领域的方舟子这样的人越来
越多。同时，发文章的为了不让别人挑毛病，造假也越来越多，最后成为一个前人骗后
人，后人骗后后人的烂摊子。我现在做的领域，可以说30-50%的前人的结果重复不出来
。不光是我重复不出来，公开报道的互相扯皮打架的就有无数。造成几大学霸相互排挤
，投文章时老板写的要回避的名单都是一大串。这种经历，您们有木有，有木有。

l*12012-02-17 08:02

53 楼

转进合成人工系统生物学/计算人工生物学/计算人工生物数学吧
不用造假本来就是假的
反正可以指鹿为马隔年又可以指马为驯鹿的学科啊
总指挥是
//www.hhmi.org/news/lim_bio.html
//limlab.ucsf.edu/papers.html

【在 m**********3 的大作中提到】

: 看了这个帖子，我对做生物一点兴趣都没有了，决定华丽丽的转行了。感觉现在的生物
: 就是一个给别人挑毛病的专业。不懂得欣赏别人，造成这个领域的方舟子这样的人越来
: 越多。同时，发文章的为了不让别人挑毛病，造假也越来越多，最后成为一个前人骗后
: 人，后人骗后后人的烂摊子。我现在做的领域，可以说30-50%的前人的结果重复不出来
: 。不光是我重复不出来，公开报道的互相扯皮打架的就有无数。造成几大学霸相互排挤
: ，投文章时老板写的要回避的名单都是一大串。这种经历，您们有木有，有木有。

L*O2012-02-17 08:02

54 楼

花街的人不是一样骗来骗去的~~~

【在 m**********3 的大作中提到】

: 看了这个帖子，我对做生物一点兴趣都没有了，决定华丽丽的转行了。感觉现在的生物
: 就是一个给别人挑毛病的专业。不懂得欣赏别人，造成这个领域的方舟子这样的人越来
: 越多。同时，发文章的为了不让别人挑毛病，造假也越来越多，最后成为一个前人骗后
: 人，后人骗后后人的烂摊子。我现在做的领域，可以说30-50%的前人的结果重复不出来
: 。不光是我重复不出来，公开报道的互相扯皮打架的就有无数。造成几大学霸相互排挤
: ，投文章时老板写的要回避的名单都是一大串。这种经历，您们有木有，有木有。