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为什么提蛋白要换盐浓度然后透析
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为什么提蛋白要换盐浓度然后透析# Biology - 生物学
n*h
1
一条长长的池塘穿过院子。里面有众多锦锂,太漂亮了。回到家才想起没拍照。院子里
植物搭配也好。
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f*e
2
为什么不能直接裂解在最终的IP buffer里头,如果可以用机械法等各种方法解决细胞
破碎的问题,求达人赐教
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D*1
3
MPPMZX LOL

【在 n******h 的大作中提到】
: 一条长长的池塘穿过院子。里面有众多锦锂,太漂亮了。回到家才想起没拍照。院子里
: 植物搭配也好。

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s*y
4
分情况。
有的是古代的时候大家就是用那个溶液来裂解细胞的,后来有了其他方法大家也懒得去
换溶液。
有的则是因为某些酶需要在裂解细胞的时候用某些盐来抑制
有的则是因为某些蛋白是聚合体,需要先用比较高的盐来让他们分开。

【在 f*******e 的大作中提到】
: 为什么不能直接裂解在最终的IP buffer里头,如果可以用机械法等各种方法解决细胞
: 破碎的问题,求达人赐教

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l*u
5
这种院子基本就没有办法做体育运动了。偶纠结了很久,在连续的草地,和小桥流水之
间。

子里

【在 D*******1 的大作中提到】
: MPPMZX LOL
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s*t
6
透析和直接稀释区别何在?文献上都是透析。
比如抽提细胞系的细胞质和核蛋白纯化complex,我一直是这么做的:
harvest 细胞。加5倍细胞pellet体积的低盐溶液(20mM KCl),冰上放10分钟,用
homogenizer捣12次(用tight的B型活塞),3500 rpm离心10min,上清取出,加0.11倍
体积的1.4M KCl,使得终浓度成100mM,我看文献上说要10万g离心若干小时。可是我们这没有这
样的离心机。只能最大速度(5万G)离心1h,作为细胞质抽提物
S100,分装后液氮速冻,-80保存。这一步很难,因为不管离心多久,都有脂状物质悬浮着,得到的
是浑浊的东西。
对于pellet,加两倍体积的420mM KCl。用homogenizer捣若干下,把鼻涕状黏糊糊的东
西充分散开。然后4度摇30min-1h。然后1万2千g离心30min,分装后液氮速冻,再放-80
,作为nuclear extract。
不知道液氮速冻这一步对于防止蛋白变性有好处,还是别的原因?为何需要速冻?
如果用于蛋白复合物的纯化,我以前是用300mM的盐。但是boss让我改成250mM。
文献上一般是透析至少4h到300mM或者250mM。但是我觉得透析后有很多沉淀,直接用
0mM 盐的buffer,稀释至300/250mM,不知道这样好不好?稀释后,其实还是会有沉淀
,我一般再次离心1.2万g 30min。
另外,我们实验室还有人在pellet那一步,直接加250mM盐溶液,然后超声,然后加
benzonase,4度过夜。他说这样能得到更多蛋白,同样的细胞得到3倍于我的方法得到
的蛋白量。不过我怀疑得到的更多的只是无效蛋白?
求大牛解释下,我一直一直非常困惑。

【在 s******y 的大作中提到】
: 分情况。
: 有的是古代的时候大家就是用那个溶液来裂解细胞的,后来有了其他方法大家也懒得去
: 换溶液。
: 有的则是因为某些酶需要在裂解细胞的时候用某些盐来抑制
: 有的则是因为某些蛋白是聚合体,需要先用比较高的盐来让他们分开。

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c*p
7
bso富人区大院子

【在 l*****u 的大作中提到】
: 这种院子基本就没有办法做体育运动了。偶纠结了很久,在连续的草地,和小桥流水之
: 间。
:
: 子里

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s*t
8
另外,第一次得到的上清和细胞核pellet,我们实验室还有人再次用低盐溶液洗涤一次
细胞核pellet。可是我试过一次,细胞用homogenizer捣过之后,再离心,得到的
pellet已经有黏糊糊的倾向了,是不是细胞核也破碎了?如果再次洗涤,我担心细胞核
蛋白会损失。所以我都不洗涤。
所以做western检测quality,总是发现CE里面也混有少量NE蛋白(anti Histone),NE
里面混有少量CE (anti GAPDH)。
所以我现在最烦做从大量细胞制备NE,S100的实验,因为跟文献的方法总是有些修改,不同的文献使用
的方法也不同,同个实验室,不同的人用的都不同,让我无所适从。
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c*p
9
我要有大院子,先养他几条狗几只喵
弄的鸡飞狗跳
然后找四哥来打扫,lol
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i*l
10
你自己应该能回答这些问题,do you have QC assay? pos. ctl?

们这没有这
悬浮着,得到的
80

【在 s*********t 的大作中提到】
: 透析和直接稀释区别何在?文献上都是透析。
: 比如抽提细胞系的细胞质和核蛋白纯化complex,我一直是这么做的:
: harvest 细胞。加5倍细胞pellet体积的低盐溶液(20mM KCl),冰上放10分钟,用
: homogenizer捣12次(用tight的B型活塞),3500 rpm离心10min,上清取出,加0.11倍
: 体积的1.4M KCl,使得终浓度成100mM,我看文献上说要10万g离心若干小时。可是我们这没有这
: 样的离心机。只能最大速度(5万G)离心1h,作为细胞质抽提物
: S100,分装后液氮速冻,-80保存。这一步很难,因为不管离心多久,都有脂状物质悬浮着,得到的
: 是浑浊的东西。
: 对于pellet,加两倍体积的420mM KCl。用homogenizer捣若干下,把鼻涕状黏糊糊的东
: 西充分散开。然后4度摇30min-1h。然后1万2千g离心30min,分装后液氮速冻,再放-80

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l*u
11
老四只想火锅那狗那喵,还有那神秘出现的鸡。

【在 c***p 的大作中提到】
: 我要有大院子,先养他几条狗几只喵
: 弄的鸡飞狗跳
: 然后找四哥来打扫,lol

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s*t
12
你说的QC assay是什么?
我做western检测NE和CE的quality,总是发现CE里面也混有少量NE蛋白(anti Histone
),NE
里面混有少量CE (anti GAPDH)。不过这些都是粗蛋白总蛋白,怎么进一步检测呢?
我担心的一是破碎细胞之后的细胞核pellet已经像鼻涕了,是不是细胞核也被弄破了?
然后NE和CE各自有少量互相污染。
二是透析会产生大量沉淀,直接稀释也会产生很多沉淀。也许你要研究的未知蛋白就在
这些沉淀里面呢 。。。
我查了n多文献,从80年代的方法到现在的,都不相同。同一个实验室,不同人各自的
做法也有差异。
无所适从啊。

【在 i***l 的大作中提到】
: 你自己应该能回答这些问题,do you have QC assay? pos. ctl?
:
: 们这没有这
: 悬浮着,得到的
: 80

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f*e
13
院子里有大块完整的空地还是挺重要的。
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f*e
14
我在想,除了破碎细胞,高盐低盐是不是对蛋白的释放有作用啊,可是细胞都破了,蛋
白还没有释放,就是不懂,为什么要搞透析这一步

Histone

【在 s*********t 的大作中提到】
: 你说的QC assay是什么?
: 我做western检测NE和CE的quality,总是发现CE里面也混有少量NE蛋白(anti Histone
: ),NE
: 里面混有少量CE (anti GAPDH)。不过这些都是粗蛋白总蛋白,怎么进一步检测呢?
: 我担心的一是破碎细胞之后的细胞核pellet已经像鼻涕了,是不是细胞核也被弄破了?
: 然后NE和CE各自有少量互相污染。
: 二是透析会产生大量沉淀,直接稀释也会产生很多沉淀。也许你要研究的未知蛋白就在
: 这些沉淀里面呢 。。。
: 我查了n多文献,从80年代的方法到现在的,都不相同。同一个实验室,不同人各自的
: 做法也有差异。

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c*p
15
隔壁家的鸡随便火锅

【在 l*****u 的大作中提到】
: 老四只想火锅那狗那喵,还有那神秘出现的鸡。
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l*u
16
我问了市里,说是可以养鸡,不过不可以杀。偶还在犹豫还在犹豫。

【在 c***p 的大作中提到】
: 隔壁家的鸡随便火锅
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l*u
17
然。偶老爹总是说要规划一下,把院子隔开几个部分搞些小意思。每次看他在院子里琢
磨都提心吊胆。

【在 f*******e 的大作中提到】
: 院子里有大块完整的空地还是挺重要的。
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c*p
18
除非院子很大,且没有hoa管,否则狠吵狠臭狠麻烦

【在 l*****u 的大作中提到】
: 我问了市里,说是可以养鸡,不过不可以杀。偶还在犹豫还在犹豫。
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n*h
19
哪天我得拍片去
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h*a
20
上pp有真相!

【在 n******h 的大作中提到】
: 哪天我得拍片去
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h*n
21
re

【在 c***p 的大作中提到】
: 除非院子很大,且没有hoa管,否则狠吵狠臭狠麻烦
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y*8
22
必须的

哪天我得拍片去

【在 n******h 的大作中提到】
: 哪天我得拍片去
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d*s
23
他怎么知道你少一只,又少一只的?
被动物吃了不就行吗?
人本来也是动物的嘛。。嘻嘻。

【在 l*****u 的大作中提到】
: 我问了市里,说是可以养鸡,不过不可以杀。偶还在犹豫还在犹豫。
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