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G*G
1
设计一个软件,可以预测蛋白质和药物之间的关系。
这个软件,可以测量任何蛋白质和任何药物之间的关系,包括目前没有报导的关系。
但是怎么能知道这个软件的false positive rate?
比如:这个软件报导蛋白质A与药物B有关联。但是目前的文献没有报导,没有报导,
并不意味着A与B没有关联。
如果你有好方法,回信。10个伪币,以表谢意。
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a*x
2
用已知确定无关联的蛋白与药物(特异性特别高的)的配对建database。比如建10000
对,然后用软件看预测出来多少配对的。

【在 G***G 的大作中提到】
: 设计一个软件,可以预测蛋白质和药物之间的关系。
: 这个软件,可以测量任何蛋白质和任何药物之间的关系,包括目前没有报导的关系。
: 但是怎么能知道这个软件的false positive rate?
: 比如:这个软件报导蛋白质A与药物B有关联。但是目前的文献没有报导,没有报导,
: 并不意味着A与B没有关联。
: 如果你有好方法,回信。10个伪币,以表谢意。

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p*u
3
你疯了嘛?

【在 G***G 的大作中提到】
: 设计一个软件,可以预测蛋白质和药物之间的关系。
: 这个软件,可以测量任何蛋白质和任何药物之间的关系,包括目前没有报导的关系。
: 但是怎么能知道这个软件的false positive rate?
: 比如:这个软件报导蛋白质A与药物B有关联。但是目前的文献没有报导,没有报导,
: 并不意味着A与B没有关联。
: 如果你有好方法,回信。10个伪币,以表谢意。

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D*a
4
re

10000

【在 a*****x 的大作中提到】
: 用已知确定无关联的蛋白与药物(特异性特别高的)的配对建database。比如建10000
: 对,然后用软件看预测出来多少配对的。

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G*G
5
什么意思?

【在 p*****u 的大作中提到】
: 你疯了嘛?
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G*G
6
哪儿能找到蛋白和药物明确无关联的这样的信息?
如果软件能预测出来,预测出来多少,那就是错误多少?

10000

【在 a*****x 的大作中提到】
: 用已知确定无关联的蛋白与药物(特异性特别高的)的配对建database。比如建10000
: 对,然后用软件看预测出来多少配对的。

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g*t
7
最简单的方法是随机将蛋白和药物配对,生成随机的阴性组。这里的假定是随机配对产
生有生物学意义的配对的概率很小。注意我们只需要将阴性组中的真阳性比例控制在很
低的水平即可。

【在 G***G 的大作中提到】
: 哪儿能找到蛋白和药物明确无关联的这样的信息?
: 如果软件能预测出来,预测出来多少,那就是错误多少?
:
: 10000

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