r*e
2 楼
尤其以后sequencing的data都有了,那么就继续做association study,鉴定各种
variants?
感觉挺忽悠人
但好像complex disease也没有什么别的好的思路
但我知道很多bioinformatics的小组除了找variants,也慢慢开始研究gene-gene
interaction,gene-environment interaction,听起来很有意思,但会不会也是忽悠
人的?
想听下大家的看法
谢谢
variants?
感觉挺忽悠人
但好像complex disease也没有什么别的好的思路
但我知道很多bioinformatics的小组除了找variants,也慢慢开始研究gene-gene
interaction,gene-environment interaction,听起来很有意思,但会不会也是忽悠
人的?
想听下大家的看法
谢谢
B*e
3 楼
个人观点 ,如果你是做bench work的 ,我觉得没有什么前途。 因为 biological
training 不是很 rigorous. 从某种程度上说,这种science拼的是sample的数量和所
采用的技术(烧钱);如果你以前是做bench work的,要上手做数据分析会很困谈。
如果你是做biostat/bioinformatics的, 很有前途, 因为和疾病联系起来,results
里不仅有理论的方法和数理模型,还会有实际的生物学意义。这样可以发到很好的杂志
去。
training 不是很 rigorous. 从某种程度上说,这种science拼的是sample的数量和所
采用的技术(烧钱);如果你以前是做bench work的,要上手做数据分析会很困谈。
如果你是做biostat/bioinformatics的, 很有前途, 因为和疾病联系起来,results
里不仅有理论的方法和数理模型,还会有实际的生物学意义。这样可以发到很好的杂志
去。
M*n
4 楼
it is very hot now. but you need briliant ideas to stand out in this field.
【在 r**********e 的大作中提到】
: 尤其以后sequencing的data都有了,那么就继续做association study,鉴定各种
: variants?
: 感觉挺忽悠人
: 但好像complex disease也没有什么别的好的思路
: 但我知道很多bioinformatics的小组除了找variants,也慢慢开始研究gene-gene
: interaction,gene-environment interaction,听起来很有意思,但会不会也是忽悠
: 人的?
: 想听下大家的看法
: 谢谢
【在 r**********e 的大作中提到】
: 尤其以后sequencing的data都有了,那么就继续做association study,鉴定各种
: variants?
: 感觉挺忽悠人
: 但好像complex disease也没有什么别的好的思路
: 但我知道很多bioinformatics的小组除了找variants,也慢慢开始研究gene-gene
: interaction,gene-environment interaction,听起来很有意思,但会不会也是忽悠
: 人的?
: 想听下大家的看法
: 谢谢
n*7
9 楼
我们就做这个
跟合作的组既做variance,也做所谓的system biology
做这个要有钱,做SNP,CNV什么的,需要搞到病人samples,然后测序,都是烧钱的事情
system biology,我接触最多的interaction network,大规模做也是烧钱
至于前途,看你怎么定义。
发文章还是不错的,有的文章不发CNS都难
就实际价值来说,我自己的感觉,sequencing什么的还是有意义的,data比较靠谱,技
术本身也非常有用,非常看好未来的钱景。但是对于测序结果的解释,目前还是处于洪
荒状态,主要就是看看引起protein变化的mutation,还是太初级了
system biology相关的,不能说一无是处,但是目前的技术手段太多问题了,想在沙滩
上起高楼,最后的结果多少真的多少假的,只有天知道。不过反正高通量吗,总是能整
出一些结论的。我是要吐血了,觉得自己的精力都花在编故事上,真正对于研究的问题
的贡献可能是0,如果不是负数的话。不过老板似乎还好,反正说多了,自己也就信了
。
跟合作的组既做variance,也做所谓的system biology
做这个要有钱,做SNP,CNV什么的,需要搞到病人samples,然后测序,都是烧钱的事情
system biology,我接触最多的interaction network,大规模做也是烧钱
至于前途,看你怎么定义。
发文章还是不错的,有的文章不发CNS都难
就实际价值来说,我自己的感觉,sequencing什么的还是有意义的,data比较靠谱,技
术本身也非常有用,非常看好未来的钱景。但是对于测序结果的解释,目前还是处于洪
荒状态,主要就是看看引起protein变化的mutation,还是太初级了
system biology相关的,不能说一无是处,但是目前的技术手段太多问题了,想在沙滩
上起高楼,最后的结果多少真的多少假的,只有天知道。不过反正高通量吗,总是能整
出一些结论的。我是要吐血了,觉得自己的精力都花在编故事上,真正对于研究的问题
的贡献可能是0,如果不是负数的话。不过老板似乎还好,反正说多了,自己也就信了
。
n*k
10 楼
the field is still in its infancy and people are still building the
infrastructure and accumulate data...thus the bar is still low...many
studies are for stories rather than being tested on real biology...Thus, one
solution is going back to biology and repeat the integrative analysis with
biology in a cyclic manner...as it progresses and we might get closer to
what's really going on...One bottle neck would be for higher organisms: how
can we go back to biology in a meaningful and effective manner?
【在 n******7 的大作中提到】
: 我们就做这个
: 跟合作的组既做variance,也做所谓的system biology
: 做这个要有钱,做SNP,CNV什么的,需要搞到病人samples,然后测序,都是烧钱的事情
: system biology,我接触最多的interaction network,大规模做也是烧钱
: 至于前途,看你怎么定义。
: 发文章还是不错的,有的文章不发CNS都难
: 就实际价值来说,我自己的感觉,sequencing什么的还是有意义的,data比较靠谱,技
: 术本身也非常有用,非常看好未来的钱景。但是对于测序结果的解释,目前还是处于洪
: 荒状态,主要就是看看引起protein变化的mutation,还是太初级了
: system biology相关的,不能说一无是处,但是目前的技术手段太多问题了,想在沙滩
infrastructure and accumulate data...thus the bar is still low...many
studies are for stories rather than being tested on real biology...Thus, one
solution is going back to biology and repeat the integrative analysis with
biology in a cyclic manner...as it progresses and we might get closer to
what's really going on...One bottle neck would be for higher organisms: how
can we go back to biology in a meaningful and effective manner?
【在 n******7 的大作中提到】
: 我们就做这个
: 跟合作的组既做variance,也做所谓的system biology
: 做这个要有钱,做SNP,CNV什么的,需要搞到病人samples,然后测序,都是烧钱的事情
: system biology,我接触最多的interaction network,大规模做也是烧钱
: 至于前途,看你怎么定义。
: 发文章还是不错的,有的文章不发CNS都难
: 就实际价值来说,我自己的感觉,sequencing什么的还是有意义的,data比较靠谱,技
: 术本身也非常有用,非常看好未来的钱景。但是对于测序结果的解释,目前还是处于洪
: 荒状态,主要就是看看引起protein变化的mutation,还是太初级了
: system biology相关的,不能说一无是处,但是目前的技术手段太多问题了,想在沙滩
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