x*6
2 楼
小弟最近在申请博后,博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析,
主要是细菌的,博士组里的强项是phylogenetic network,个人的生信背景偏
phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
同学发了一水的牛paper,很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能,比如
assembly,resequencing,structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
分析。现在对这方面了解甚少。
个人觉得comparative genomics还是有很多可做,但是至今个人的paper档次很低,都
是bmc之类。而且comparative genomics做多了,觉得不是很有motivation,NGS感觉可
是说出不少临床的应用来,觉得工作更有价值些,呵呵。
一直在单枪匹马干(老板是放羊型),觉得特别吃力。工作不系统,打一枪换个地方。
老板也推荐了几个博后的组,方向都和博士比较接近,中等学校(top 10~20),4,5
个人,平均每年能搞一篇5到10的中游文章,没有啥collaboration(自然也不会有
coauthor的文章),觉得这样下来博后做完也没啥竞争力。
另外和一个做metabolomics湿实验的老板也谈了下,他貌似很反对去sequencing
center。觉得那个东西不能持久。但是感觉他有点偏激,貌似对NGS也不是很了解。
请牛人们指点下哪个方向比较有前途?个人想呆在学术界。谢谢!!
主要是细菌的,博士组里的强项是phylogenetic network,个人的生信背景偏
phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
同学发了一水的牛paper,很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能,比如
assembly,resequencing,structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
分析。现在对这方面了解甚少。
个人觉得comparative genomics还是有很多可做,但是至今个人的paper档次很低,都
是bmc之类。而且comparative genomics做多了,觉得不是很有motivation,NGS感觉可
是说出不少临床的应用来,觉得工作更有价值些,呵呵。
一直在单枪匹马干(老板是放羊型),觉得特别吃力。工作不系统,打一枪换个地方。
老板也推荐了几个博后的组,方向都和博士比较接近,中等学校(top 10~20),4,5
个人,平均每年能搞一篇5到10的中游文章,没有啥collaboration(自然也不会有
coauthor的文章),觉得这样下来博后做完也没啥竞争力。
另外和一个做metabolomics湿实验的老板也谈了下,他貌似很反对去sequencing
center。觉得那个东西不能持久。但是感觉他有点偏激,貌似对NGS也不是很了解。
请牛人们指点下哪个方向比较有前途?个人想呆在学术界。谢谢!!
g*n
4 楼
这是个技术型工作,没有很多“科学”成分。前景就是到中心实验室敲键盘,为别人的
科学服务。
科学服务。
u*1
5 楼
我觉得这都算一个大方向吧
comparative genomics或许是更偏evolution?但估计也是和sequence打交道吧?
你说的好发paper的,估计都是和人类疾病有关的把?
所以我觉得你的phd training的东西肯定也可以用上的,只不过evolution是冷门,更
理论。。。
【在 x*******6 的大作中提到】
: 小弟最近在申请博后,博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析,
: 主要是细菌的,博士组里的强项是phylogenetic network,个人的生信背景偏
: phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
: 同学发了一水的牛paper,很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能,比如
: assembly,resequencing,structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
: 分析。现在对这方面了解甚少。
: 个人觉得comparative genomics还是有很多可做,但是至今个人的paper档次很低,都
: 是bmc之类。而且comparative genomics做多了,觉得不是很有motivation,NGS感觉可
: 是说出不少临床的应用来,觉得工作更有价值些,呵呵。
: 一直在单枪匹马干(老板是放羊型),觉得特别吃力。工作不系统,打一枪换个地方。
comparative genomics或许是更偏evolution?但估计也是和sequence打交道吧?
你说的好发paper的,估计都是和人类疾病有关的把?
所以我觉得你的phd training的东西肯定也可以用上的,只不过evolution是冷门,更
理论。。。
【在 x*******6 的大作中提到】
: 小弟最近在申请博后,博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析,
: 主要是细菌的,博士组里的强项是phylogenetic network,个人的生信背景偏
: phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
: 同学发了一水的牛paper,很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能,比如
: assembly,resequencing,structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
: 分析。现在对这方面了解甚少。
: 个人觉得comparative genomics还是有很多可做,但是至今个人的paper档次很低,都
: 是bmc之类。而且comparative genomics做多了,觉得不是很有motivation,NGS感觉可
: 是说出不少临床的应用来,觉得工作更有价值些,呵呵。
: 一直在单枪匹马干(老板是放羊型),觉得特别吃力。工作不系统,打一枪换个地方。
x*6
7 楼
你说的对,我们也和sequence打交道,不过都是下载NCBI人家注解好的全序列。我们其
实主要做的就是evolution,物种树基因树reconciliation啥的。
觉得人类疾病是个大picture,想上个大船,将来拉钱找工作比纯evolution容易些。
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我觉得这都算一个大方向吧
: comparative genomics或许是更偏evolution?但估计也是和sequence打交道吧?
: 你说的好发paper的,估计都是和人类疾病有关的把?
: 所以我觉得你的phd training的东西肯定也可以用上的,只不过evolution是冷门,更
: 理论。。。
实主要做的就是evolution,物种树基因树reconciliation啥的。
觉得人类疾病是个大picture,想上个大船,将来拉钱找工作比纯evolution容易些。
【在 u*********1 的大作中提到】
: 我觉得这都算一个大方向吧
: comparative genomics或许是更偏evolution?但估计也是和sequence打交道吧?
: 你说的好发paper的,估计都是和人类疾病有关的把?
: 所以我觉得你的phd training的东西肯定也可以用上的,只不过evolution是冷门,更
: 理论。。。
O*e
8 楼
现在对NGS data analysis的需求比较大。你可以试着找找比较大的实验室有没有机会。
【在 x*******6 的大作中提到】
: 小弟最近在申请博后,博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析,
: 主要是细菌的,博士组里的强项是phylogenetic network,个人的生信背景偏
: phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
: 同学发了一水的牛paper,很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能,比如
: assembly,resequencing,structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
: 分析。现在对这方面了解甚少。
: 个人觉得comparative genomics还是有很多可做,但是至今个人的paper档次很低,都
: 是bmc之类。而且comparative genomics做多了,觉得不是很有motivation,NGS感觉可
: 是说出不少临床的应用来,觉得工作更有价值些,呵呵。
: 一直在单枪匹马干(老板是放羊型),觉得特别吃力。工作不系统,打一枪换个地方。
【在 x*******6 的大作中提到】
: 小弟最近在申请博后,博士在一个偏理论组做的是comparative genomics的数据分析,
: 主要是细菌的,博士组里的强项是phylogenetic network,个人的生信背景偏
: phylogenetics和pathway modeling多些。最近看着好多在sequencing center做NGS的
: 同学发了一水的牛paper,很心动。想博后往sequencing上靠靠不知有否可能,比如
: assembly,resequencing,structural variation或者Chip-seq, RNA-seq之类的数据
: 分析。现在对这方面了解甚少。
: 个人觉得comparative genomics还是有很多可做,但是至今个人的paper档次很低,都
: 是bmc之类。而且comparative genomics做多了,觉得不是很有motivation,NGS感觉可
: 是说出不少临床的应用来,觉得工作更有价值些,呵呵。
: 一直在单枪匹马干(老板是放羊型),觉得特别吃力。工作不系统,打一枪换个地方。
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