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请问啥是T2A puro？

请问啥是T2A puro？# Biology - 生物学

c*e2012-11-07 08:11

1 楼

因为没见过这个题，所以想了好半天才答上来
面试感觉一般，答得不顺利，move on了
一个很长的text文档，怎样遍历一边，随机输出其中的一行
限制：
1.只能遍历一边
2.随机均匀分配
================
我的答案是：
保存已经遍历的行中的一个preLine
每读入第n行，在line_n和preLine中选一个，update preLine.
line_n的概率是1/n, preLine的概率是(n-1)/n
读到文件尾return preLine.

a*n2012-11-07 08:11

2 楼

大屏还是很爽的。
据说这个屏不是大猩猩
有测试它防划能力的文章或视频吗？

J*n2012-11-07 08:11

3 楼

在下做植物的，猜想T2A puro应该是个promoter吧？谢谢解惑。

l*x2012-11-07 08:11

4 楼

I can think of two possible solutions, in both solutions we calculated the
random number first.
1. Since it is a text file, can we get the size of the file? As we read
through the file, we can calculate the size of all the lines have been read.
Once the size read / size all = the random number, the current line is the
line to return.
2. If the random number is X out of 100, save the lines from (x/100) *
current total to the current line. e.g is X is 50 out of 100, current total
line number is 20, save lines 10 to 20. Once we reach the end of the file,
the first line being saved is the line to be returned. This way, we can only
need to save up to half of the whole file.
If the X is less than 50/100, assume we can read the file backward.

w*s2012-11-07 08:11

5 楼

哪个州？VA的怎么还没消息啊？

d*d2012-11-07 08:11

6 楼

T2A编码的是一个peptide，可以连接两个蛋白质的coding sequence使其转录时为一个
mRNA但在翻译时分开成为两个独立的蛋白。
以你的问题为例子，你可以在T2A上游插入你感兴趣的蛋白质的coding sequence，最终
你的蛋白和puromycin resistant gene (Puromycin N-acetyl-tranferase)所编码的蛋
白会被翻译成两个蛋白。这种同时表达多个基因的策略同IRES策略相比，好处是上下游
蛋白的比例理论上讲是严格的1：1.

【在 J****n 的大作中提到】

: 在下做植物的，猜想T2A puro应该是个promoter吧？谢谢解惑。

c*t2012-11-07 08:11

7 楼

LZ right answer
LS complicated and may not be allowed

y*02012-11-07 08:11

8 楼

va已经去拿回来了呵呵

J*n2012-11-07 08:11

9 楼

感谢你的解答

【在 d****d 的大作中提到】

: T2A编码的是一个peptide，可以连接两个蛋白质的coding sequence使其转录时为一个
: mRNA但在翻译时分开成为两个独立的蛋白。
: 以你的问题为例子，你可以在T2A上游插入你感兴趣的蛋白质的coding sequence，最终
: 你的蛋白和puromycin resistant gene (Puromycin N-acetyl-tranferase)所编码的蛋
: 白会被翻译成两个蛋白。这种同时表达多个基因的策略同IRES策略相比，好处是上下游
: 蛋白的比例理论上讲是严格的1：1.

l*x2012-11-07 08:11

10 楼

汗，读贴不仔细。以为LZ保存读过的每条line。

N*n2012-11-07 08:11

11 楼

大猩猩到底有什么好处？防刮？不容易碎？
普通屏需要注意什么？

w*e2012-11-07 08:11

12 楼

顺便问一个，
但是2A的原理是"ribosome skip",所以在前后两个蛋白的尾巴处都多留了一个或者几个
氨基酸，难道没人怀疑过会这个也许会影响蛋白的功能？

【在 d****d 的大作中提到】

k*a2012-11-07 08:11

13 楼

这个不是老题目了吗
用一个cache
读第一行，保存
第二行，1/2概率 replace
第三行，1/3概率 replace
。。。
第n行， 1/n概率 replace

y*02012-11-07 08:11

14 楼

va已经去拿回来了呵呵

S*s2012-11-07 08:11

15 楼

可能会
对于2A前面的蛋白，如果C terminal序列有功能的话，还是用 IRES吧
对于2A后面的蛋白，一般就是Puro或fluoresence protein，关系不大。

【在 w*e 的大作中提到】

: 顺便问一个，
: 但是2A的原理是"ribosome skip",所以在前后两个蛋白的尾巴处都多留了一个或者几个
: 氨基酸，难道没人怀疑过会这个也许会影响蛋白的功能？

w*s2012-11-07 08:11

16 楼

xmjdh,你是几号去challenge的？我是27号中午

【在 y****0 的大作中提到】

: va已经去拿回来了呵呵

w*e2012-11-07 08:11

17 楼

有的2A后面就是接的是功能蛋白
记得iPS的4个因子的小鼠就是这么造的

【在 S*********s 的大作中提到】

: 可能会
: 对于2A前面的蛋白，如果C terminal序列有功能的话，还是用 IRES吧
: 对于2A后面的蛋白，一般就是Puro或fluoresence protein，关系不大。

w*s2012-11-07 08:11

18 楼

呃，看到另外一个帖子了，比我早一天去的。

【在 w*********s 的大作中提到】

: xmjdh,你是几号去challenge的？我是27号中午

B*g2012-11-07 08:11

19 楼

我比你早，等电话中

【在 w*********s 的大作中提到】

: 呃，看到另外一个帖子了，比我早一天去的。

a*n2012-11-07 08:11

20 楼

是弯曲
26号一点的

t*d2012-11-07 08:11

21 楼

怎么都是va的？nova是不是就我一个人没去揩ws的油啊？可恶it开在tc而不是reston
town center。

【在 y****0 的大作中提到】

: va已经去拿回来了呵呵

w*s2012-11-07 08:11

22 楼

你还好吧，我在rockville都开过去了

【在 t*******d 的大作中提到】

: 怎么都是va的？nova是不是就我一个人没去揩ws的油啊？可恶it开在tc而不是reston
: town center。

w*s2012-11-07 08:11

23 楼

你比我早一两个小时吧，好像。希望礼拜五之前能拿到，发功中...

【在 B*****g 的大作中提到】

: 我比你早，等电话中

s*l2012-11-07 08:11

24 楼

请问你去MS Store拿手机的时候，有检查是不是第一次比赛的时候的手机么？
那几张纸上是不是有让自己写手机型号？我不记得了。你还记得么？
还有，去拿手机的时候，会怎么检查？我记得当时说的是要能开机，型号是否必须一模
一样？

【在 a******n 的大作中提到】

: 大屏还是很爽的。
: 据说这个屏不是大猩猩
: 有测试它防划能力的文章或视频吗？

m*d2012-11-07 08:11

25 楼

你上次拿什么手机去就拿什么手机去呗，有什么问题？

【在 s*******l 的大作中提到】

: 请问你去MS Store拿手机的时候，有检查是不是第一次比赛的时候的手机么？
: 那几张纸上是不是有让自己写手机型号？我不记得了。你还记得么？
: 还有，去拿手机的时候，会怎么检查？我记得当时说的是要能开机，型号是否必须一模
: 一样？