small ncRNA 问题求教# Biology - 生物学
A*a
1 楼
我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上，而
Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢？此small ncRNA不曾被研究，功能一无所
知。
Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢？此small ncRNA不曾被研究，功能一无所
知。
s*s
2 楼
找一堆RNA类似物把这玩意儿block了看phenotype?
【在 A***a 的大作中提到】
: 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上，而
: Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢？此small ncRNA不曾被研究，功能一无所
: 知。
【在 A***a 的大作中提到】
: 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上，而
: Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢？此small ncRNA不曾被研究，功能一无所
: 知。
x*d
3 楼
next: miRNA structure prediction and targets prediction.
s*s
4 楼
人家没说是mirna吧
【在 x*****d 的大作中提到】
: next: miRNA structure prediction and targets prediction.
【在 x*****d 的大作中提到】
: next: miRNA structure prediction and targets prediction.
a*l
5 楼
clip-seq研究的是此蛋白bind small RNA,这个数据太表象了.......你要做此蛋白还是
做small RNA啊.....还是要做蛋白结合small RNA的function significance....
若此small rna功能都未知,建议先做small rna classification/function, RNAi,
overexpression study function et al...
但你做clip-seq很明显侧重点是你那个RNA binding protein而不是small rna, 如果此
small rna功能都未知,这种superficial binding data不值得深入,........that's my
suggestion...
做small RNA啊.....还是要做蛋白结合small RNA的function significance....
若此small rna功能都未知,建议先做small rna classification/function, RNAi,
overexpression study function et al...
但你做clip-seq很明显侧重点是你那个RNA binding protein而不是small rna, 如果此
small rna功能都未知,这种superficial binding data不值得深入,........that's my
suggestion...
A*a
6 楼
this is what i tried first.
only found one miRNA homolog,but no targets found
【在 x*****d 的大作中提到】
: next: miRNA structure prediction and targets prediction.
only found one miRNA homolog,but no targets found
【在 x*****d 的大作中提到】
: next: miRNA structure prediction and targets prediction.
A*a
7 楼
开始是做这个RBP，是个splicing factor,可做了几年都没有大突破，发现这个binding
，想着能不能有些新东西。
my
【在 a***l 的大作中提到】
: clip-seq研究的是此蛋白bind small RNA,这个数据太表象了.......你要做此蛋白还是
: 做small RNA啊.....还是要做蛋白结合small RNA的function significance....
: 若此small rna功能都未知,建议先做small rna classification/function, RNAi,
: overexpression study function et al...
: 但你做clip-seq很明显侧重点是你那个RNA binding protein而不是small rna, 如果此
: small rna功能都未知,这种superficial binding data不值得深入,........that's my
: suggestion...
，想着能不能有些新东西。
my
【在 a***l 的大作中提到】
: clip-seq研究的是此蛋白bind small RNA,这个数据太表象了.......你要做此蛋白还是
: 做small RNA啊.....还是要做蛋白结合small RNA的function significance....
: 若此small rna功能都未知,建议先做small rna classification/function, RNAi,
: overexpression study function et al...
: 但你做clip-seq很明显侧重点是你那个RNA binding protein而不是small rna, 如果此
: small rna功能都未知,这种superficial binding data不值得深入,........that's my
: suggestion...
c*b
8 楼
说不定是别人已经报导过的这种现象
http://www.nature.com/nrm/journal/v14/n4/full/nrm3557.html
【在 A***a 的大作中提到】
: 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上，而
: Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢？此small ncRNA不曾被研究，功能一无所
: 知。
http://www.nature.com/nrm/journal/v14/n4/full/nrm3557.html
【在 A***a 的大作中提到】
: 我的clip-seq发现我的这个RNA binding protein结合在一处small ncRNA 上，而
: Agonaut 也在此处有结合。怎样往下挖掘呢？此small ncRNA不曾被研究，功能一无所
: 知。
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