shRNA promoter能用来表达蛋白么?# Biology - 生物学b*k2014-04-10 07:041 楼搜了很久也没有找到。记得小时候到餐馆里吃饭,蛋花汤都是非常薄的飘带, 很漂亮。 就是怎么做都做不出来。很郁闷。有大厨知道做鸡蛋汤如何能让鸡蛋成飘带状吗? 最好有能复制出来的比例。
d*b2014-04-10 07:042 楼搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
s*y2014-04-10 07:043 楼我们本来是想做一个可诱导表达的蛋白载体,在同事们中问了一圈,只有一个人有一个tetracyclin-inducible vector for shRNA (Tet-On pLKO) ,而且promoter 是H1。 我想问的是,假如我用这个来表达一个很小的蛋白(10kd)行不行?
h*g2014-04-10 07:045 楼不停的补丁补丁,使用起来比mac复杂太多了,还要装杀病毒木马的软件,早死早超生【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
w*32014-04-10 07:046 楼不行。★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.0.1【在 s******y 的大作中提到】: 我们本来是想做一个可诱导表达的蛋白载体,在同事们中问了一圈,只有一个人有一个: tetracyclin-inducible vector for shRNA (Tet-On pLKO) ,而且promoter 是H1。 我: 想问的是,假如: 我用这个来表达一个很小的蛋白(10kd)行不行?
c*t2014-04-10 07:048 楼等Mac的收益占的比重越来越少的时候,这个还是很有可能的【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
t*o2014-04-10 07:0411 楼行为艺术么?osx那个让用户负责bug检测的风格和兼容性, 还是安心当个位数市场占有率的小众系统的好,现在Win10 的市场占有率已经基本超过osx了吧【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
d*u2014-04-10 07:0414 楼醒醒,该去刷试管了【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
s*y2014-04-10 07:0415 楼PolyA 以及ribosome binding site我们可以自己加啊。我比较担心的是RNA pol III 是不是不能转录比较长的RNA? 或者转录出来的头部结构不对所以核糖体结合不上去?【在 j****x 的大作中提到】: 没polyA呗
y*a2014-04-10 07:0416 楼汤先勾芡!★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6【在 b***k 的大作中提到】: 搜了很久也没有找到。记得小时候到餐馆里吃饭,蛋花汤都是非常薄的飘带, 很漂亮: 。 就是怎么做都做不出来。很郁闷。: 有大厨知道做鸡蛋汤如何能让鸡蛋成飘带状吗? 最好有能复制出来的比例。
a*a2014-04-10 07:0418 楼只知道polIII不能太长,最多一百多个碱基【在 s******y 的大作中提到】: PolyA 以及ribosome binding site我们可以自己加啊。: 我比较担心的是RNA pol III 是不是不能转录比较长的RNA? 或者转录出来的头部结构: 不对所以核糖体结合不上去?
O*d2014-04-10 07:0419 楼汤里要加淀粉。 水要开着,把打好的鸡蛋慢慢到入汤中。【在 b***k 的大作中提到】: 搜了很久也没有找到。记得小时候到餐馆里吃饭,蛋花汤都是非常薄的飘带, 很漂亮: 。 就是怎么做都做不出来。很郁闷。: 有大厨知道做鸡蛋汤如何能让鸡蛋成飘带状吗? 最好有能复制出来的比例。
d*a2014-04-10 07:0420 楼Mac的确不像PC那样频繁update【在 P**C 的大作中提到】: 就没Mac软件哪个可用性,除了装逼基本上干不了正事。说他安全,估计是闭着眼睛说: 的。
j*x2014-04-10 07:0421 楼首先你需要5'的mG cap,这个是核糖体结合的识别信号对吧?U6/H1都没戏。当然你可以搞个IRES,但是效率是个问题。polyA自己加?这个不现实吧,合并IRES,基本上就超过POL III的理想转录本长度范围了,何必冒险呢,既然要做表达载体,这么折腾没任何意义啊,你要的这类载体满天飞,不行几百块买一个或者直接序列合成了【在 s******y 的大作中提到】: PolyA 以及ribosome binding site我们可以自己加啊。: 我比较担心的是RNA pol III 是不是不能转录比较长的RNA? 或者转录出来的头部结构: 不对所以核糖体结合不上去?
k*h2014-04-10 07:0423 楼mac好用,安全都是吹出来的。mac air上mit惨不忍睹。硬件兼容性就更弱了,不说各种硬件组合,采集卡,USB外设的支持,就连显示器scale都只能简单double。那么多人连windows 25%一级的scale都嫌不够用,还要改注册表,搞出160%,170%这种scale。最近osx连安全这块都守不住了,爆出好多漏洞,病毒可以直接attack firmware,格硬盘都没用。以前只是用的人太少,黑客来的搞而已。mac的优势就在封闭,所以才能避免很多问题。如果osx变成windows一样的草地鸡,只会有更多的病。【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
c*t2014-04-10 07:0426 楼我这个果黑都看不过去了,在OSX面前win的scale就是一坨屎,OSX高分屏不是只能double,scale级别由小到大都做得很好【在 k*h 的大作中提到】: mac好用,安全都是吹出来的。mac air上mit惨不忍睹。硬件兼容性就更弱了,不说各: 种硬件组合,采集卡,USB外设的支持,就连显示器scale都只能简单double。那么多人: 连windows 25%一级的scale都嫌不够用,还要改注册表,搞出160%,170%这种scale。: 最近osx连安全这块都守不住了,爆出好多漏洞,病毒可以直接attack firmware,格硬: 盘都没用。以前只是用的人太少,黑客来的搞而已。: mac的优势就在封闭,所以才能避免很多问题。如果osx变成windows一样的草地鸡,只: 会有更多的病。
l*a2014-04-10 07:0428 楼我也有这个疑问,一直都是这么做的,可是就不能做出那种特别薄的蛋花,到底诀窍是啥?【在 O*******d 的大作中提到】: 汤里要加淀粉。 水要开着,把打好的鸡蛋慢慢到入汤中。
j*m2014-04-10 07:0429 楼那你就安心和xp过一辈子呗,无需动怒【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
s*y2014-04-10 07:0430 楼我们在Addgene翻了半天了,看到的可诱导系统都是需要两个vector 的,就是需要把那个repressor 放在另外一个vector 上的。但是我们的细胞因为转了其他东西已经用掉了两个marker 了(Neo/Kan 和GFP),所以希望弄一个单vector的系统。另外,我的博士后们不肯用gateway。他们貌似对没有用过的东西都有戒心。我怎么说都不行。麻烦啊。【在 X******n 的大作中提到】: Addgene $65一个,买一个吧。我有的全是gateway的,你又不喜欢 :)
o*m2014-04-10 07:0431 楼汤关火后再加鸡蛋,趁着汤的热气烧。餐馆里鸡蛋都加很多水【在 b***k 的大作中提到】: 搜了很久也没有找到。记得小时候到餐馆里吃饭,蛋花汤都是非常薄的飘带, 很漂亮: 。 就是怎么做都做不出来。很郁闷。: 有大厨知道做鸡蛋汤如何能让鸡蛋成飘带状吗? 最好有能复制出来的比例。
l*a2014-04-10 07:0432 楼人如其名!【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
X*n2014-04-10 07:0433 楼我的这些就在一个vector上。哈哈,让他们把一个基因放到10个不同的vector里面,他们就知道了。【在 s******y 的大作中提到】: 我们在Addgene翻了半天了,看到的可诱导系统都是需要两个vector 的,就是需要把那: 个repressor 放在另外一个vector 上的。但是我们的细胞因为转了其他东西已经用掉: 了两个marker 了(Neo/Kan 和GFP),所以希望弄一个单vector的系统。: 另外,我的博士后们不肯用gateway。他们貌似对没有用过的东西都有戒心。我怎么说: 都不行。麻烦啊。
b*k2014-04-10 07:0434 楼试过, 可能比例不对。 我需要的是那种像飘带一样的鸡蛋, 不是小花, 小云之类的样子。 我看了看网上很多贴的照片, 没有一个是以前餐馆蛋汤的样子。http://www.xiachufang.com/recipe/19114/dishes/有做出带子装蛋汤成功的, 麻烦给个详细的步骤和比例。 如一勺淀粉, 3杯水, 一个鸡蛋。。。 能复制的菜谱。 多谢。【在 o*****m 的大作中提到】: 汤关火后再加鸡蛋,趁着汤的热气烧。: 餐馆里鸡蛋都加很多水
l*z2014-04-10 07:0435 楼呵呵.【在 c****t 的大作中提到】: 我这个果黑都看不过去了,在OSX面前win的scale就是一坨屎,OSX高分屏不是只能: double,scale级别由小到大都做得很好
s*y2014-04-10 07:0439 楼谢谢!!!这个好像也是gateway cloning吧?应该不需要关心酶切点吧?【在 X******n 的大作中提到】: https://www.addgene.org/41394/: 这个能找到合适的酶切位点不?
B*r2014-04-10 07:0441 楼+1据说总部要去某个盛产咖喱的国了,要跳的赶紧跳吧。【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
X*n2014-04-10 07:0442 楼你也可以用酶切的,如果不喜gateway的话。【在 s******y 的大作中提到】: 谢谢!!!这个好像也是gateway cloning吧?应该不需要关心酶切点吧?
k*h2014-04-10 07:0444 楼刚试了下,还真的有很多scale level。不知道啥时候加的,以前没有。不过现在手上只有mac air,没法实验其他scale的支持效果如何,回头找个来试试。【在 c****t 的大作中提到】: 我这个果黑都看不过去了,在OSX面前win的scale就是一坨屎,OSX高分屏不是只能: double,scale级别由小到大都做得很好
a*d2014-04-10 07:0445 楼H1和U6 promotor 都不能用来过表达蛋白。FUW TetO是常用的dox inducible overexpression lentivector.这个载体有多个酶切位点,方便subcloning。我建议sunny老师找Stanford的Wernig lab要一下。
s*u2014-04-10 07:0446 楼多累呀【在 b***k 的大作中提到】: 搜了很久也没有找到。记得小时候到餐馆里吃饭,蛋花汤都是非常薄的飘带, 很漂亮: 。 就是怎么做都做不出来。很郁闷。: 有大厨知道做鸡蛋汤如何能让鸡蛋成飘带状吗? 最好有能复制出来的比例。
S*e2014-04-10 07:0447 楼俺觉得要是OS里加个鼠标右键进取Windows就真差不多完蛋了【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
X*n2014-04-10 07:0448 楼这个Addgene也有吧,我有一个就是这个改造的。【在 a****d 的大作中提到】: H1和U6 promotor 都不能用来过表达蛋白。: FUW TetO是常用的dox inducible overexpression lentivector.这个载体有多个酶切: 位点,方便subcloning。我建议sunny老师找Stanford的Wernig lab要一下。
l*82014-04-10 07:0450 楼id被盗了?【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
l*a2014-04-10 07:0452 楼能奔一个做好的飘带么,我也想知道飘带怎么做的!【在 T*****B 的大作中提到】: 关火,离灶,然后下蛋液,中等匀速朝一个方向搅拌即可。做成飘带,从不失败。
j*72014-04-10 07:0455 楼楼主说的飘带状是连在一起的那种吗?如果是想要鸡蛋连在一起的那种的话,水开了直接下锅,但是不用勺子搅动,然后就会变成大块的了~~反之,如果是想要一小片一小片飘在水里的那种的话,就水开了下锅以后使劲搅合,然后就能是那种只放一个鸡蛋,但是汤里都是鸡蛋沫子的那种感觉了
l*a2014-04-10 07:0456 楼windows out, doors in.【在 d*b 的大作中提到】: 搞到现在,除了偷信息,搞噱头外,这几年发布的操作系统都没有一个可以超越xp的,: 我老眼盘windows 10应该是windows最后一个操作系统了。对丫的区别是早死还是晚死: ,哪天apple要是让mac随便可以在pc上安装,这天估计就是microsoft的下葬日。
s*y2014-04-10 07:0457 楼我看看我能不能狠一点逼他们用这个gateway system. 他们现在都在得过且过的用传统的酶切法。我看他们主要是怕麻烦而且懒得去学新技术。【在 X******n 的大作中提到】: 你也可以用酶切的,如果不喜gateway的话。
s*r2014-04-10 07:0460 楼内切酶比重组酶便宜【在 s******y 的大作中提到】: 我看看我能不能狠一点逼他们用这个gateway system. 他们现在都在得过且过的用传统: 的酶切法。我看他们主要是怕麻烦而且懒得去学新技术。
a*a2014-04-10 07:0462 楼gibson呢?我们实验室三个人花了两个月用gateway做了四千个表达质粒并且验证了表达,还是很好用的。。我现在不用gateway/gibson主要是贵, 有人出钱还不用真是。。。【在 s******y 的大作中提到】: 我看看我能不能狠一点逼他们用这个gateway system. 他们现在都在得过且过的用传统: 的酶切法。我看他们主要是怕麻烦而且懒得去学新技术。
s*y2014-04-10 07:0463 楼哦。。。贵很多么?我其实还没有亲自用过不知道有多贵(大家别鄙视我。。。--)但是如果用酶切法的话在不同vector之间倒腾比较麻烦吧?【在 s******r 的大作中提到】: 内切酶比重组酶便宜
X*n2014-04-10 07:0464 楼如果只做一个基因,确实是。如果经常把一个基因放到不同的载体里面,其实gateway更便宜。不要follow invitrogen的protocol,这个酶效率很高,可以降低到1/4【在 s******r 的大作中提到】: 内切酶比重组酶便宜
X*n2014-04-10 07:0465 楼你们自己做的PCR,还是买的entry clone?很【在 a*******a 的大作中提到】: gibson呢?: 我们实验室三个人花了两个月用gateway做了四千个表达质粒并且验证了表达,还是很: 好用的。。: 我现在不用gateway/gibson主要是贵, 有人出钱还不用真是。。。
a*a2014-04-10 07:0467 楼好像以前算过一个反应大概20-30刀吧,用这个是否划算主要看看系统稳定否。我读博时候实验室所有的载体酶切位点顺序都是一样的,简单的换个载体什么的切了一连也就是几RMB钱半天的labor,国内的博士生你懂的。博后的话一天$100,克隆不稳定的实验室花一个星期去搞伐搞伐搞不出来就头疼了。你那一周在实验室出现60小时就是勤快人了吧。。。【在 s******y 的大作中提到】: 哦。。。贵很多么?我其实还没有亲自用过不知道有多贵: (大家别鄙视我。。。--): 但是如果用酶切法的话在不同vector之间倒腾比较麻烦吧?
g*52014-04-10 07:0468 楼hi, Bro, you are boss!【在 s******y 的大作中提到】: 我看看我能不能狠一点逼他们用这个gateway system. 他们现在都在得过且过的用传统: 的酶切法。我看他们主要是怕麻烦而且懒得去学新技术。
s*y2014-04-10 07:0469 楼刚才跑到实验室去和他们说了,然后勉强同意了,然后仔细一查我们的库存,发现我们没有Gateway entry vector... 悲剧了。。。【在 g*********5 的大作中提到】: hi, Bro, you are boss!
s*i2014-04-10 07:0471 楼找一个lenti的backbone, 把原来的MCS位点替换成 TRE-MCS-CMV-rtTA 就可以了。一劳永逸。【在 s******y 的大作中提到】: 刚才跑到实验室去和他们说了,然后勉强同意了,然后仔细一查我们的库存,发现我们: 没有Gateway entry vector... 悲剧了。。。
p*n2014-04-10 07:0472 楼gateway超好用的啊!【在 s******y 的大作中提到】: 我看看我能不能狠一点逼他们用这个gateway system. 他们现在都在得过且过的用传统: 的酶切法。我看他们主要是怕麻烦而且懒得去学新技术。
s*s2014-04-10 07:0473 楼 原来实验室做了几十种promoter,几十种各式tag或者T2Apuro一类的,要表达啥,随便找个tag,promoter,然后去网上或者facility的library里面挖个基因clone出来,一个礼拜就搞定,两个礼拜细胞转染好,异常方便。坏处是,gateway那个酶巨烂,绝对用不到十次。除非每次做多个克隆,否则用过五六次就失活了,极端怀疑life里面有猫腻,比如偷偷加了低浓度的蛋白酶一类很【在 a*******a 的大作中提到】: gibson呢?: 我们实验室三个人花了两个月用gateway做了四千个表达质粒并且验证了表达,还是很: 好用的。。: 我现在不用gateway/gibson主要是贵, 有人出钱还不用真是。。。
s*s2014-04-10 07:0474 楼 entry不用买,网上无数library, 大多数不到100,省时省力。我们学校facility以前做蛋白表达,自己都有全套的,全免费。我看如果学校比较大,搞这么一套太方便了。【在 X******n 的大作中提到】: 你们自己做的PCR,还是买的entry clone?: : 很
X*n2014-04-10 07:0475 楼哪个公司有这么便宜的entry clone,能不能推荐一家?特别是一些比较长的基因如果能在100块一下买来,那真可以省我不少时间?我通常都是自己PCR。【在 s******s 的大作中提到】: entry不用买,网上无数library, 大多数不到100,省时省力。: 我们学校facility以前做蛋白表达,自己都有全套的,全免费。: 我看如果学校比较大,搞这么一套太方便了。
s*s2014-04-10 07:0476 楼不是公司的,是哪个学校或者研究所的,好像90一个,刚才翻了一下找不到bookmark了。其实做的多,应该合起来买个ORFeomes的library,多爽啊【在 X******n 的大作中提到】: 哪个公司有这么便宜的entry clone,能不能推荐一家?特别是一些比较长的基因如果: 能在100块一下买来,那真可以省我不少时间?我通常都是自己PCR。
s*y2014-04-10 07:0477 楼哦,在哪里看到的?记起来之后跟我们分享一下吧!了。【在 s******s 的大作中提到】: 不是公司的,是哪个学校或者研究所的,好像90一个,刚才翻了一下找不到bookmark了。: 其实做的多,应该合起来买个ORFeomes的library,多爽啊
s*s2014-04-10 07:0478 楼找到一个,$43一个clone,1600一个plate,够一般实验室用一阵子了https://dnasu.org/DNASU/CloneCost.jsp【在 s******y 的大作中提到】: 哦,在哪里看到的?记起来之后跟我们分享一下吧!: : 了。
z*82014-04-10 07:0479 楼Good【在 s******s 的大作中提到】: 找到一个,$43一个clone,1600一个plate,够一般实验室用一阵子了: https://dnasu.org/DNASU/CloneCost.jsp
s*s2014-04-10 07:0480 楼 话说这个省时省力,雇一个postdoc哼哧哼哧做一个礼拜,测序说不定还是错的,不说人工,就是材料费也不值。一直想不通有的PI就是不喜欢买,老想着去讨或者自己做【在 z********8 的大作中提到】: : Good
X*n2014-04-10 07:0481 楼谢谢!这个真是太便宜了。可惜我想要的几个基因没有。提醒一下:Human Orfome 8.1里面大概有20%的基因不是全长或者是小的isoform。再问个问题:如果有pLX304 lentivrial expression collection(大概13000个基因),你会用它来干什么呢?【在 s******s 的大作中提到】: 找到一个,$43一个clone,1600一个plate,够一般实验室用一阵子了: https://dnasu.org/DNASU/CloneCost.jsp