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关于antibody / antigen的选择（有包子）

关于antibody / antigen的选择（有包子）# Biology - 生物学

g*y2014-06-23 07:06

1 楼

我现在有一些基因，我的问题是：
（1）怎么知道哪个基因所表达的蛋白是在细胞表面？
（2）怎么知道这个蛋白能够作为抗原（i.e. extracellular domains have
antigenicity).
(3) 怎么找相应的抗体？
谢谢，有包子答谢。

s*92014-06-23 07:06

2 楼

1）你去ensemble看看，pubmed一下，一般就有答案了。
2）只要你的蛋白和兔子或者大鼠的蛋白序列差异大，就可以最为抗原。免疫的最基本
尝试就是产生非同源的抗体。
3）直接google找有没有现成的抗体。如果没有，就需要自己做。如果你没有经验，最
好自己找公司。

【在 g**********y 的大作中提到】

: 我现在有一些基因，我的问题是：
: （1）怎么知道哪个基因所表达的蛋白是在细胞表面？
: （2）怎么知道这个蛋白能够作为抗原（i.e. extracellular domains have
: antigenicity).
: (3) 怎么找相应的抗体？
: 谢谢，有包子答谢。

g*d2014-06-23 07:06

3 楼

如果新基因的话你知道他功能吗？知道的话就大概知道是否膜蛋白了，不知道你只能比
对看同源基因看是否是膜蛋白了什么功能，要确定是否膜蛋白可以用荧光定位看具体位
置，是否具有抗原性可以预测的辅助实验证明纯化蛋白动物实验分离抗体测elisa，未
知基因可以外包公司设计制备抗体他们会选用部分序列制备抗体你也用此抗体定位基因
是否表达膜蛋白可以体内也可以免疫组化方法，希望这些对你有帮助

【在 g**********y 的大作中提到】

g*y2014-06-23 07:06

4 楼

我其实是有很多基因的，比如上千个，我要选出其中的20个，然后买抗体做实验。

g*y2014-06-23 07:06

5 楼

先做subcellular localization预测extracellular? 比如http://wolfpsort.org/aboutWoLF_PSORT.html.en
或者看gene ontology cellular component?
然后做antigenic peptide预测？

g*y2014-06-23 07:06

6 楼

先做subcellular localization预测extracellular? 比如http://wolfpsort.org/aboutWoLF_PSORT.html.en
或者看gene ontology cellular component?
然后做antigenic peptide预测？

g*y2014-06-23 07:06

7 楼

先做subcellular localization预测extracellular? 比如http://wolfpsort.org/aboutWoLF_PSORT.html.en
或者看gene ontology cellular component?
然后做antigenic peptide预测？

g*y2014-06-23 07:06

8 楼

spt009,gifted:包子已发。
继续集思广益，求各种答案。