一个转录因子的活化与抑制作用# Biology - 生物学g*y2014-08-08 07:081 楼3个月大的小柴犬。前几天给他买的Petco的球球,结果给他玩的时候被他扯下来好多绒毛,可能还吃下去一些,会有问题吗?这两天要注意观察什么?便便?新爹没经验,求指点。
l*i2014-08-08 07:082 楼一个转录因子即可activate transcription,也可repress transcription。这很常见。但某个转录因子对同一个靶基因,在不同的dosage下,分别具有activation与repression的作用,这种情况常不常见?有哪些已报道的发现,与某些重要现象/phenotype相关的?
T*e2014-08-08 07:084 楼这个很有意思啊,坐等高人进来解答。我先问问楼主,你这个同一个转录因子,你所谓的不同dosage是怎么得出来的?你自己过表达+KD了?这些外源性的表达和你转录之间的关系,你是用什么方法检测的?我们先讨论一种简单的情形,有没有可能这个转录因子招募了其他的co-factor?一种更复杂的情形:你这个转录因子和你的靶基因之间的关系仅仅是单向的调节吗?有没有可能形成反馈?又或者,你这个转录因子对其自身有没有反馈调节呢?不论正向或者反向?最后,对同一个靶基因,不考虑你说的dosage的情况下,有时激活,有时抑制的转录因子应该不少吧。比如Mef2。下游的phenotype很多啊,自己搜搜吧。坐等大牛进来分析。
l*i2014-08-08 07:086 楼非常感谢探讨!赞缜密的思维。我的回复如下过表达与KD都做了,qPCR/western都显示其表达的变化依赖于这个转录因子的dosage。现在转录因子的threshhold我已经确定出来这也是我的解释之一。问题是为什么不同的dosage,招募的co-factor不一样?这种可能性比较低,除非这个转录因子(A)在不同的dosage下激活了别的转录因子(比如B),B对A的靶基因起到相反的作用。可惜我们现在的实验不支持这一点,这种情况下,也只是维持的一个平衡,应该不会出现我的说这种现象吧?是的,很多转录因子即具有activation,也有repression的作用,但已报道的(据我的搜索)的,activate与repress的是不同的靶基因;同时激活和抑制同一个靶基因的,这种情况我暂时没找到相关报道。这也是我发帖探讨的原因。【在 T*****e 的大作中提到】: 这个很有意思啊,坐等高人进来解答。: 我先问问楼主,你这个同一个转录因子,你所谓的不同dosage是怎么得出来的?你自己: 过表达+KD了?这些外源性的表达和你转录之间的关系,你是用什么方法检测的?: 我们先讨论一种简单的情形,有没有可能这个转录因子招募了其他的co-factor?: 一种更复杂的情形:你这个转录因子和你的靶基因之间的关系仅仅是单向的调节吗?有: 没有可能形成反馈?: 又或者,你这个转录因子对其自身有没有反馈调节呢?不论正向或者反向?: 最后,对同一个靶基因,不考虑你说的dosage的情况下,有时激活,有时抑制的转录因: 子应该不少吧。比如Mef2。下游的phenotype很多啊,自己搜搜吧。: 坐等大牛进来分析。
m*u2014-08-08 07:088 楼hippo通路不就这样么【在 l*******i 的大作中提到】: 一个转录因子即可activate transcription,也可repress transcription。这很常见: 。但某个转录因子对同一个靶基因,在不同的dosage下,分别具有activation与: repression的作用,这种情况常不常见?有哪些已报道的发现,与某些重要现象/: phenotype相关的?