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关于肠道菌群宏基因组测序

关于肠道菌群宏基因组测序# Biology - 生物学

t*82014-12-11 08:12

1 楼

朋友最近在国内收集大队列标本,研究肠道菌群和某种疾病的关系.他想请教用粪便标本
应该测多少数据量比较靠谱?现在公司通常推荐每个病人测4G,他主要担心跟疾病有关的
细菌在肠道粘膜上,进入粪便的量很少,4G估计测到的大部分是优势菌群.但数据量太大,
对大队列来说,成本又太高,请问谁有这方面的经验体会?谢谢!

e*a2014-12-11 08:12

2 楼

测序能有多少成本，这么多样品，和测序公司讲讲价就成本下来了，想要多少数据就测
多少数据，差不了多少钱。

大,

【在 t**********8 的大作中提到】

: 朋友最近在国内收集大队列标本,研究肠道菌群和某种疾病的关系.他想请教用粪便标本
: 应该测多少数据量比较靠谱?现在公司通常推荐每个病人测4G,他主要担心跟疾病有关的
: 细菌在肠道粘膜上,进入粪便的量很少,4G估计测到的大部分是优势菌群.但数据量太大,
: 对大队列来说,成本又太高,请问谁有这方面的经验体会?谢谢!