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讨论population genetics的问题
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讨论population genetics的问题# Biology - 生物学
d*o
1
除了25000点(round trip)
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r*1
3
我现在不住在加州, 但听朋友说, 加州的公立大学又好又相对便宜(对州内的居民而
言)。 我有三小孩, 大的快进高中了, 老二和最小的在上小学。
如果作为外州的学生来加州读大学, 我知道会贵很多的。
我想问问住加州的, 你们来加州有没有是冲加州的大学来的(为了孩子)?
我自己的情况是, 可能要在加州找个一般的工作也许有点点可能(如果经济开始恢复
的话)。
谢谢建议啊!
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A*e
4
我在看自己做的一个功能基因的进化问题。 现在有一个超过800个samples的snp data
,包括上游和下游基因的。 上游邻接着它的是一个house keeping基因,这800个
sample里面超过95的house keeping基因都是同一个haplotype。而我自己的基因则是主
要有6个不同的haplotype,这6个加起来超过了95%。 我想请帮看看history上这两个基
因发生了什么,怎么演变的。
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m*s
5
省的那点学费还不够补高房价的

【在 r***1 的大作中提到】
: 我现在不住在加州, 但听朋友说, 加州的公立大学又好又相对便宜(对州内的居民而
: 言)。 我有三小孩, 大的快进高中了, 老二和最小的在上小学。
: 如果作为外州的学生来加州读大学, 我知道会贵很多的。
: 我想问问住加州的, 你们来加州有没有是冲加州的大学来的(为了孩子)?
: 我自己的情况是, 可能要在加州找个一般的工作也许有点点可能(如果经济开始恢复
: 的话)。
: 谢谢建议啊!

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m*u
6
snp用于进化分析是不是很限制于很短时间跨度的进化(演化),特别是同一物种不同
族群的,比如人的起源和迁徙。
我不懂,瞎问一个问题,请别见怪。
我到是有个蛋白,一直想看看它分子进化。真核生物分成5-8个超家族(不同研究者有
不同分类理念,有人认为划分8个,有人认为划成5个,也有人认为划为6个),这个蛋
白只在其中3个中有,其它类中则没有。而且in Oplsthokonts supergroup, which
includes fungi and animals, it is absent within fungi branch; and in
Chromalveolates supergroups, some branches also excluded this proteins.
你有什么见解?觉得怎样分析它的进化?
谢谢。
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v*s
7
加大十所分校是使全美最好的公立大学没错,加州的生活也是丰富多彩,如果没有一份
好工作,在加州很难待下去。另外,学费也不是很便宜。
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a*n
8
可以试着先算一下Dn/Ds来分析一下是否受自然选择的作用,是受positive selection
还是negative selection还是neutral的。

【在 m******u 的大作中提到】
: snp用于进化分析是不是很限制于很短时间跨度的进化(演化),特别是同一物种不同
: 族群的,比如人的起源和迁徙。
: 我不懂,瞎问一个问题,请别见怪。
: 我到是有个蛋白,一直想看看它分子进化。真核生物分成5-8个超家族(不同研究者有
: 不同分类理念,有人认为划分8个,有人认为划成5个,也有人认为划为6个),这个蛋
: 白只在其中3个中有,其它类中则没有。而且in Oplsthokonts supergroup, which
: includes fungi and animals, it is absent within fungi branch; and in
: Chromalveolates supergroups, some branches also excluded this proteins.
: 你有什么见解?觉得怎样分析它的进化?
: 谢谢。

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z*n
9
相比于竞争激烈程度来说,好像加州asian上好学校比外州难多了。那么多华裔gpa全是
满分,又有歧视政策,压力很大
相对外周,华人没那么多,华人小孩想考个本州最好的公立大学还不容易?

【在 v***s 的大作中提到】
: 加大十所分校是使全美最好的公立大学没错,加州的生活也是丰富多彩,如果没有一份
: 好工作,在加州很难待下去。另外,学费也不是很便宜。

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a*n
10
似乎很多人用coalescence theory在做population水平的分析。 不过我也不懂
population水平的。
也许你可以试一下比较Dn/Ds,可以简单得出是否受自然选择作用。 还可以分析种
群中基因的杂合度,看是否有显著性差异。

data

【在 A*******e 的大作中提到】
: 我在看自己做的一个功能基因的进化问题。 现在有一个超过800个samples的snp data
: ,包括上游和下游基因的。 上游邻接着它的是一个house keeping基因,这800个
: sample里面超过95的house keeping基因都是同一个haplotype。而我自己的基因则是主
: 要有6个不同的haplotype,这6个加起来超过了95%。 我想请帮看看history上这两个基
: 因发生了什么,怎么演变的。

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x*n
11


【在 r***1 的大作中提到】
: 我现在不住在加州, 但听朋友说, 加州的公立大学又好又相对便宜(对州内的居民而
: 言)。 我有三小孩, 大的快进高中了, 老二和最小的在上小学。
: 如果作为外州的学生来加州读大学, 我知道会贵很多的。
: 我想问问住加州的, 你们来加州有没有是冲加州的大学来的(为了孩子)?
: 我自己的情况是, 可能要在加州找个一般的工作也许有点点可能(如果经济开始恢复
: 的话)。
: 谢谢建议啊!

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m*8
12
If you know the population phylogeny, then it is easy -- simply mapping
difference onto branches... if you want to reconstruct and compare gene
phylogenies between the two genes using SNP data, you need consult with a
population geneticist -- different data and data quality need different
methods and to be interpreted differently.
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x*n
13
最好的两个公校UCLA and UC_B好像是家庭收入不到7万免学费的。

【在 r***1 的大作中提到】
: 我现在不住在加州, 但听朋友说, 加州的公立大学又好又相对便宜(对州内的居民而
: 言)。 我有三小孩, 大的快进高中了, 老二和最小的在上小学。
: 如果作为外州的学生来加州读大学, 我知道会贵很多的。
: 我想问问住加州的, 你们来加州有没有是冲加州的大学来的(为了孩子)?
: 我自己的情况是, 可能要在加州找个一般的工作也许有点点可能(如果经济开始恢复
: 的话)。
: 谢谢建议啊!

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v*r
14
what is its function?
draw a species tree, and label the external nodes with absent/present states
of the gene.

【在 m******u 的大作中提到】
: snp用于进化分析是不是很限制于很短时间跨度的进化(演化),特别是同一物种不同
: 族群的,比如人的起源和迁徙。
: 我不懂,瞎问一个问题,请别见怪。
: 我到是有个蛋白,一直想看看它分子进化。真核生物分成5-8个超家族(不同研究者有
: 不同分类理念,有人认为划分8个,有人认为划成5个,也有人认为划为6个),这个蛋
: 白只在其中3个中有,其它类中则没有。而且in Oplsthokonts supergroup, which
: includes fungi and animals, it is absent within fungi branch; and in
: Chromalveolates supergroups, some branches also excluded this proteins.
: 你有什么见解?觉得怎样分析它的进化?
: 谢谢。

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d*a
15
UC 的学费不也涨得很多了么。亚裔小孩在这里竞争很激烈,如果我娃以后能上个 UCLA
我做梦都要笑醒了
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m*u
16
有兴趣吗?有兴趣的话,我再多说点。
发信人: valar (和光同尘), 信区: Biology
标 题: Re: 讨论population genetics的问题
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Feb 13 21:28:08 2014, 美东)
what is its function?
draw a species tree, and label the external nodes with absent/present states
of the gene.
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J*6
17
哈佛等私校对低收入的家庭也是免学费的。 加州的公校 UC berkerly 名大些, 别的
一般了, 很多州都有类似的级别, 查查学校排名就知道了。 但SF, LA 的生活费太贵
, 不值得搬来。 你还要住满一年才能享受 州内学费。
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i*a
18
there are no decent schools in the state you live in now??

【在 r***1 的大作中提到】
: 我现在不住在加州, 但听朋友说, 加州的公立大学又好又相对便宜(对州内的居民而
: 言)。 我有三小孩, 大的快进高中了, 老二和最小的在上小学。
: 如果作为外州的学生来加州读大学, 我知道会贵很多的。
: 我想问问住加州的, 你们来加州有没有是冲加州的大学来的(为了孩子)?
: 我自己的情况是, 可能要在加州找个一般的工作也许有点点可能(如果经济开始恢复
: 的话)。
: 谢谢建议啊!

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f*8
19
楼主现在在哪个州?难道没有好大学?
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r*1
20
谢谢大家的各种建议啊! 尽管大家的看法不同。
我在Florida, 我老觉得Florida的大学(私立, 公立)都一般, 远不如
加州, 德州, 麻州, 北卡之类的。 也不知我对不对, 我估计不少人都
有类似的考虑? 我一直想在公立大学好点的州买房子。
我不敢奢望我的孩子能上什么免费的私立大学。
大家对这事都如何打算? 我知道大多数人都是随自己的工作而居的。但人无远虑, 必
有近忧啊。
谢谢!

【在 f**********8 的大作中提到】
: 楼主现在在哪个州?难道没有好大学?
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p*y
21
1.加州有地震危机
2.加州政府有财政危机
U of Michigan也是公立学校,非常好的学校。

【在 r***1 的大作中提到】
: 谢谢大家的各种建议啊! 尽管大家的看法不同。
: 我在Florida, 我老觉得Florida的大学(私立, 公立)都一般, 远不如
: 加州, 德州, 麻州, 北卡之类的。 也不知我对不对, 我估计不少人都
: 有类似的考虑? 我一直想在公立大学好点的州买房子。
: 我不敢奢望我的孩子能上什么免费的私立大学。
: 大家对这事都如何打算? 我知道大多数人都是随自己的工作而居的。但人无远虑, 必
: 有近忧啊。
: 谢谢!

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f*8
22
UIUC is also a public university, plus the housing price in IL is much
affordable than CA.
University of Texas, Univ of Virgina is not bad too.

【在 r***1 的大作中提到】
: 谢谢大家的各种建议啊! 尽管大家的看法不同。
: 我在Florida, 我老觉得Florida的大学(私立, 公立)都一般, 远不如
: 加州, 德州, 麻州, 北卡之类的。 也不知我对不对, 我估计不少人都
: 有类似的考虑? 我一直想在公立大学好点的州买房子。
: 我不敢奢望我的孩子能上什么免费的私立大学。
: 大家对这事都如何打算? 我知道大多数人都是随自己的工作而居的。但人无远虑, 必
: 有近忧啊。
: 谢谢!

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b*3
23
Why bother? Worst case scenario is to pay one full year of tuition as out of
state students. Your kids will get CA residency after one year anyway.
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r*1
24
No, I don't think that will be the case unless your kid will be financially
independent (i.e., he/she supports him/herself almost 100%) and you don't
claim him/her as your dependent on tax return.
Also, my impression is that it is easier to get admitted as in state student
than out of state student. Every state takes care of its residents first.
So for a student graduates from a CA high school will be easier to go to
UCLA than a student from Florida even though they could have the same GPA
and S

【在 b*******3 的大作中提到】
: Why bother? Worst case scenario is to pay one full year of tuition as out of
: state students. Your kids will get CA residency after one year anyway.

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