r*y
2 楼
用了NCBI,但是我的sequence file太大了,30M多,人家不给算,有什么可以下载用于
自己电脑blast的软件,而且可以用PHI-BLAST的?或者哪个网站能做>30M的文件的?谢
谢!
自己电脑blast的软件,而且可以用PHI-BLAST的?或者哪个网站能做>30M的文件的?谢
谢!
g*r
4 楼
可以在自己电脑上安装blast程序。有一个选项“-remote”可以用来检索ncbi网站的数
据库。虽然query依然是有限制,但你可以把大文件分成小块,分别提交任务。remote
模式依赖远程服务器,并受网络状况影响。有时会遇到超时、掉线、没反应等问题,你
检查结果发现后可以重新提交哪些没完成的序列。个人感觉remote的速度很不理想。
如果你序列很多或者用得比较频繁,可以考虑下载ncbi的database(比较大,起码几十
G,但对当今的硬盘来说小菜一碟)。local blast速度快,想怎么blast就怎么blast。
【在 r******y 的大作中提到】
: 用了NCBI,但是我的sequence file太大了,30M多,人家不给算,有什么可以下载用于
: 自己电脑blast的软件,而且可以用PHI-BLAST的?或者哪个网站能做>30M的文件的?谢
: 谢!
据库。虽然query依然是有限制,但你可以把大文件分成小块,分别提交任务。remote
模式依赖远程服务器,并受网络状况影响。有时会遇到超时、掉线、没反应等问题,你
检查结果发现后可以重新提交哪些没完成的序列。个人感觉remote的速度很不理想。
如果你序列很多或者用得比较频繁,可以考虑下载ncbi的database(比较大,起码几十
G,但对当今的硬盘来说小菜一碟)。local blast速度快,想怎么blast就怎么blast。
【在 r******y 的大作中提到】
: 用了NCBI,但是我的sequence file太大了,30M多,人家不给算,有什么可以下载用于
: 自己电脑blast的软件,而且可以用PHI-BLAST的?或者哪个网站能做>30M的文件的?谢
: 谢!
i*i
6 楼
楼上正解
X*0
7 楼
哈哈,都怕了?
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