E*e
2 楼
最近我们在研究几个调控基因expression的蛋白，我们自己做了几个活性和选择性都比
较好的小分子，在细胞里可以看到我们想要的phenotype。但是我们要研究的蛋白文献
报到的很少，我们想自己研究一下它们的功能到底是哪些。
我不是学生物的，不知道常规的方法有哪些。大概知道这些蛋白是和DNA作用然后起到
基因调节的作用。 我读了一点文献，似乎可以用RNA seq来测量细胞在小分子treat之
前之后gene expression的变化。找到变化大的基因然后看看它们是不是在某些经典的
pathway上。请问这种方法可行吗？是不是false positive rate会很高，所以还要做更
多的follow up work来验证？
可以做的话，学校里会有这样的lab吗？还是应该找公司做。 不可以做的话，有什么其
他的好方法
谢谢大家！
较好的小分子，在细胞里可以看到我们想要的phenotype。但是我们要研究的蛋白文献
报到的很少，我们想自己研究一下它们的功能到底是哪些。
我不是学生物的，不知道常规的方法有哪些。大概知道这些蛋白是和DNA作用然后起到
基因调节的作用。 我读了一点文献，似乎可以用RNA seq来测量细胞在小分子treat之
前之后gene expression的变化。找到变化大的基因然后看看它们是不是在某些经典的
pathway上。请问这种方法可行吗？是不是false positive rate会很高，所以还要做更
多的follow up work来验证？
可以做的话，学校里会有这样的lab吗？还是应该找公司做。 不可以做的话，有什么其
他的好方法
谢谢大家！
k*j
3 楼
SET 是做test
s*s
4 楼
几个问题都是yes，你不做生物就找个lab合作吧
【在 E*****e 的大作中提到】
: 最近我们在研究几个调控基因expression的蛋白，我们自己做了几个活性和选择性都比
: 较好的小分子，在细胞里可以看到我们想要的phenotype。但是我们要研究的蛋白文献
: 报到的很少，我们想自己研究一下它们的功能到底是哪些。
: 我不是学生物的，不知道常规的方法有哪些。大概知道这些蛋白是和DNA作用然后起到
: 基因调节的作用。 我读了一点文献，似乎可以用RNA seq来测量细胞在小分子treat之
: 前之后gene expression的变化。找到变化大的基因然后看看它们是不是在某些经典的
: pathway上。请问这种方法可行吗？是不是false positive rate会很高，所以还要做更
: 多的follow up work来验证？
: 可以做的话，学校里会有这样的lab吗？还是应该找公司做。 不可以做的话，有什么其
: 他的好方法
【在 E*****e 的大作中提到】
: 最近我们在研究几个调控基因expression的蛋白，我们自己做了几个活性和选择性都比
: 较好的小分子，在细胞里可以看到我们想要的phenotype。但是我们要研究的蛋白文献
: 报到的很少，我们想自己研究一下它们的功能到底是哪些。
: 我不是学生物的，不知道常规的方法有哪些。大概知道这些蛋白是和DNA作用然后起到
: 基因调节的作用。 我读了一点文献，似乎可以用RNA seq来测量细胞在小分子treat之
: 前之后gene expression的变化。找到变化大的基因然后看看它们是不是在某些经典的
: pathway上。请问这种方法可行吗？是不是false positive rate会很高，所以还要做更
: 多的follow up work来验证？
: 可以做的话，学校里会有这样的lab吗？还是应该找公司做。 不可以做的话，有什么其
: 他的好方法
p*2
5 楼
面试有什么不同吗？
【在 k*j 的大作中提到】
: SET 是做test
E*e
6 楼
谢谢 baozi sent
再问一下，学校生物lab很多，这种rna seq一般生物lab就能做吗？还是要找专门做rna
seq的lab。或者说说这种测序一般都是外包的，找一个做细胞的生物lab能分析结果和
做follow up work就行了。
这样的试验一般瓶颈在哪里呢？
谢谢
【在 s******s 的大作中提到】
: 几个问题都是yes，你不做生物就找个lab合作吧
再问一下，学校生物lab很多，这种rna seq一般生物lab就能做吗？还是要找专门做rna
seq的lab。或者说说这种测序一般都是外包的，找一个做细胞的生物lab能分析结果和
做follow up work就行了。
这样的试验一般瓶颈在哪里呢？
谢谢
【在 s******s 的大作中提到】
: 几个问题都是yes，你不做生物就找个lab合作吧
p*2
7 楼
Google recruiter email里提到的东西都需要准备吗？
s*s
8 楼
一般都给facility做。如果能找到有机器还能和你免费合作的实验室就太爽了。
RNA-seq没啥瓶颈，后期分析也不难，followup看运气
rna
【在 E*****e 的大作中提到】
: 谢谢 baozi sent
: 再问一下，学校生物lab很多，这种rna seq一般生物lab就能做吗？还是要找专门做rna
: seq的lab。或者说说这种测序一般都是外包的，找一个做细胞的生物lab能分析结果和
: 做follow up work就行了。
: 这样的试验一般瓶颈在哪里呢？
: 谢谢
RNA-seq没啥瓶颈，后期分析也不难，followup看运气
rna
【在 E*****e 的大作中提到】
: 谢谢 baozi sent
: 再问一下，学校生物lab很多，这种rna seq一般生物lab就能做吗？还是要找专门做rna
: seq的lab。或者说说这种测序一般都是外包的，找一个做细胞的生物lab能分析结果和
: 做follow up work就行了。
: 这样的试验一般瓶颈在哪里呢？
: 谢谢
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