求助一个测序分析的问题# Biology - 生物学
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1 楼
在Li Heng写的MAQ里边,
原文中是从一开始的28bp作为seed,生成6个template进行比较,貌似原始本版最短就
是28bp了。现在新版本都是16bp,显然没法用28bp作为seed,这样应该如何处理啊。是
不是新版本里边把起始的template数改成16个了,4个bp一段?
因为template的原因,用于对比的bp应该只能是4的倍数,那么不是4的倍数的长度的
reads,是应该什么样子的原理呢?是不是先减到4的倍数进行查找,然后再用全部的长
度进行计算呢?
这两个问题不确定,有没有对测序分析比较懂行的来降解一下。
原文中是从一开始的28bp作为seed,生成6个template进行比较,貌似原始本版最短就
是28bp了。现在新版本都是16bp,显然没法用28bp作为seed,这样应该如何处理啊。是
不是新版本里边把起始的template数改成16个了,4个bp一段?
因为template的原因,用于对比的bp应该只能是4的倍数,那么不是4的倍数的长度的
reads,是应该什么样子的原理呢?是不是先减到4的倍数进行查找,然后再用全部的长
度进行计算呢?
这两个问题不确定,有没有对测序分析比较懂行的来降解一下。