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做线虫的有人试过WGS+SNP的方法一步测序出mutant吗？

做线虫的有人试过WGS+SNP的方法一步测序出mutant吗？# Biology - 生物学

s*e2016-02-09 08:02

1 楼

【以下文字转载自 EB23 讨论区】
发信人: spruce (espruce), 信区: EB23
标题: 工资比prevailing wage低怎么办？
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Jul 20 13:15:51 2011, 美东)
prevailing wage是拿到绿卡后的工资，还是一开始办绿卡就要的工资？如果现在工资
比prevailing wage低3000块钱怎么办？公司不太可能给我涨工资。

g*n2016-02-09 08:02

2 楼

别人介绍了这个方法给我： “C. elegans mutant identification with a one-step
whole-genome-sequencing and SNP mapping strategy”，看上去不错，不知道版上有
没有人用过这个方法找出forward genetic screen里筛到的mutant？这个方法是否容易
，或者有没有什么瓶颈？
谢谢

M*s2016-02-09 08:02

3 楼

有人说在10%以内就可以，但是这并不可靠。最好换TITLE，降低工作年限要求，重新
作PW. - 最安全的做法

f*y2016-02-09 08:02

4 楼

理论上是的，但实际很困难。因为当你比较诱导突变型和野生型，你肯定可以发现上千
的SNPs,所以需要传统的遗传基因定位法。当然虫子容易拿到突变体，如果你能同时拿
到5，6个同基因不同的alleles,还是可能不需要定位了。

step

【在 g*****n 的大作中提到】

: 别人介绍了这个方法给我： “C. elegans mutant identification with a one-step
: whole-genome-sequencing and SNP mapping strategy”，看上去不错，不知道版上有
: 没有人用过这个方法找出forward genetic screen里筛到的mutant？这个方法是否容易
: ，或者有没有什么瓶颈？
: 谢谢

f*y2016-02-09 08:02

5 楼

Refer to research from Oliver Hobert in Columbia.
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pon

step

【在 g*****n 的大作中提到】

g*n2016-02-09 08:02

6 楼

谢谢回复。请问你用过或者知道有人用过这种方法吗？你链接里的文章我读了，但不知
道是不是操作起来像他们说的那么容易。谢谢