看表达差异,该用Microarray,RNA-Seq还是DGE?# Biology - 生物学
D*e
1 楼
手头的KO小鼠一直没做出来任何预设的结果。现在考虑把WT和KO去进行一下在做组织的
蛋白/基因表达分析,想看看可能的pathways和相关的蛋白表达是否有变化(如一些比
较关心的蛋白家族)。懂行的人说说这个思路靠谱不?靠谱的话,该用Microarray,
RNA-Seq还是DGE?已海归在国内,问了些公司,他们的销售都讲不清楚,有推荐
Microarray的,也有大力鼓吹RNA-Seq的。我以前没接触过这一块。其实我的诉求很简
单,就是做不下去了不想浪费,想扩大范围撞撞运气,但这个范围还是在我划定的一块
里面,而上述的测序之类看起来很庞杂的样子,不确定是否为我想要的。而且后期的数
据我不确定公司是否会分析到位。
如果有感兴趣的高手帮助我一起进行分析,可以给劳务费,也可以选择合作文章挂名。
蛋白/基因表达分析,想看看可能的pathways和相关的蛋白表达是否有变化(如一些比
较关心的蛋白家族)。懂行的人说说这个思路靠谱不?靠谱的话,该用Microarray,
RNA-Seq还是DGE?已海归在国内,问了些公司,他们的销售都讲不清楚,有推荐
Microarray的,也有大力鼓吹RNA-Seq的。我以前没接触过这一块。其实我的诉求很简
单,就是做不下去了不想浪费,想扩大范围撞撞运气,但这个范围还是在我划定的一块
里面,而上述的测序之类看起来很庞杂的样子,不确定是否为我想要的。而且后期的数
据我不确定公司是否会分析到位。
如果有感兴趣的高手帮助我一起进行分析,可以给劳务费,也可以选择合作文章挂名。