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为啥没有能从中间切断脂肪酸的酶?
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为啥没有能从中间切断脂肪酸的酶?# Biology - 生物学
s*k
1
昨天485状态改变,从acceptance直接跳到card production。感谢上帝。
131和765状态没有改变,还是initial review. 他们还会继续吗?绿卡应该是1个月内
可以寄到吧?
祝版上其他朋友也尽早拿到,估计现在批得很快,大家沉住气,好消息会来的
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I*h
2
纤维素有内切酶
DNA有内切酶
为啥脂肪酸没有内切酶?
是因为惰性碳碳键?
有没有可能有这种酶?
如果不可能,为什么?
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t*8
3
yes
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g*r
4
你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶,各种membrane 得有多不稳定?
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e*f
5
cong!
timeline?

【在 s****k 的大作中提到】
: 昨天485状态改变,从acceptance直接跳到card production。感谢上帝。
: 131和765状态没有改变,还是initial review. 他们还会继续吗?绿卡应该是1个月内
: 可以寄到吧?
: 祝版上其他朋友也尽早拿到,估计现在批得很快,大家沉住气,好消息会来的

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I*h
6
嗯,有道理
能人工设计这种酶吗?

【在 g******r 的大作中提到】
: 你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶,各种membrane 得有多不稳定?
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s*k
7
目前在欧洲,不太记得确切的日期。
485 rd is February-18-2014
Fp did without ant notice on mar-5-2014
Pd 11-2011

【在 e******f 的大作中提到】
: cong!
: timeline?

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g*r
8
要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
haloperoxidase或halogenase。
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s*k
9
直接越过什么decision等阶段直接从最初的状态跳到最后一步,这个正常吗? 直接没
有任何电话问询。
收到绿卡后可以寄到海外作为入美文件吗?

【在 t******8 的大作中提到】
: yes
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I*h
10
谢谢!
这种酶是不是理论上不可能在细胞里表达?只能体外合成?

【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。

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m*y
11
大半夜的又两个报绿…
恭喜

【在 s****k 的大作中提到】
: 昨天485状态改变,从acceptance直接跳到card production。感谢上帝。
: 131和765状态没有改变,还是initial review. 他们还会继续吗?绿卡应该是1个月内
: 可以寄到吧?
: 祝版上其他朋友也尽早拿到,估计现在批得很快,大家沉住气,好消息会来的

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I*h
12
你的头像是谁?

【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。

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p*s
13
Cong, tsc?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6

【在 s****k 的大作中提到】
: 昨天485状态改变,从acceptance直接跳到card production。感谢上帝。
: 131和765状态没有改变,还是initial review. 他们还会继续吗?绿卡应该是1个月内
: 可以寄到吧?
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l*d
14
酶学告诉我们,妹只能加快反应速度,降低能量壁垒,不会改变反应能级。
靠妹砍断碳碳键这种事情还是比较不靠谱,所以有β-oxidation这种天才的方法。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 你的头像是谁?
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c*2
15
恭喜。这个牛。
是原生EB3还是降级?

【在 s****k 的大作中提到】
: 直接越过什么decision等阶段直接从最初的状态跳到最后一步,这个正常吗? 直接没
: 有任何电话问询。
: 收到绿卡后可以寄到海外作为入美文件吗?

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g*r
16
energy barrier并不是最主要的问题,因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
存在,它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。
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m*y
17
这个题目 版大们怎么没有标上

【在 s****k 的大作中提到】
: 昨天485状态改变,从acceptance直接跳到card production。感谢上帝。
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b*H
18
生物的本质是化学,化学的本质是物理。
很多规律是不能违背的。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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a*j
19
gxgx!
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I*h
20
没有进化上的意义,所以没有出现这种酶

【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题,因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在,它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。

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m*z
21
恭喜!

【在 s****k 的大作中提到】
: 昨天485状态改变,从acceptance直接跳到card production。感谢上帝。
: 131和765状态没有改变,还是initial review. 他们还会继续吗?绿卡应该是1个月内
: 可以寄到吧?
: 祝版上其他朋友也尽早拿到,估计现在批得很快,大家沉住气,好消息会来的

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l*d
22
这种观点比较拉马克化。

【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题,因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在,它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。

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s*k
23
Info updated

【在 s****k 的大作中提到】
: 直接越过什么decision等阶段直接从最初的状态跳到最后一步,这个正常吗? 直接没
: 有任何电话问询。
: 收到绿卡后可以寄到海外作为入美文件吗?

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g*r
24
并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要cofactor
,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/inhibitor制约。
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p*j
25
你律师真好。
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H*i
26
有氧化烃类的微生物,随便搜了搜有直接切开苯环的机制,氧化烷烃似乎也是末端或者
倒数第二个碳氧化,这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
不过肯定不是水解。
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j*g
27
细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
[在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到:]
:并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要
cofactor,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/
inhibitor制约。
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g*r
28
记不清楚了。它切的是CH键不是CC键吧

【在 j*********g 的大作中提到】
: 细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
: [在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到:]
: :并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
: 。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要
: cofactor,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/
: inhibitor制约。

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I*h
29
拉马克?

【在 l*********d 的大作中提到】
: 这种观点比较拉马克化。
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l*d
30
用进废退。
通俗地说, 就是哥需要它长,它就进化的长啦。
(不要想歪了!!)

【在 I*****h 的大作中提到】
: 拉马克?
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l*d
31
苯环本质上是个C=C键。

【在 H*******i 的大作中提到】
: 有氧化烃类的微生物,随便搜了搜有直接切开苯环的机制,氧化烷烃似乎也是末端或者
: 倒数第二个碳氧化,这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
: 不过肯定不是水解。

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j*n
32
有没切双键的酶?感觉会有 hehe
那就通过desaturase引入double bond
然后再切?

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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t*e
33
Beta-oxidation 算吗?
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I*h
34
对头

【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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I*h
35
不算

【在 t********e 的大作中提到】
: Beta-oxidation 算吗?
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g*x
36
C-C bond稳定性很高,如果有能直接切C-C的酶,基本上就见啥杀啥了。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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g*x
37
胡扯。

【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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t*e
38
就是共轭大 π键。也是sp2 杂化。不能说就是双键,比较像双键。

【在 g*****x 的大作中提到】
: 胡扯。
avatar
t*e
39
酶的能力也很高,氧化还原都没问题的。他有选择性。

【在 g*****x 的大作中提到】
: C-C bond稳定性很高,如果有能直接切C-C的酶,基本上就见啥杀啥了。
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t*e
40
细胞花费大量ATP合成脂肪酸或者蛋白。是为了储存能量将来释放的。这个角度理解可
以吗?如果只是酶切的话,有需要大量能量去做。

cofactor

【在 g******r 的大作中提到】
: 并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
: 或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要cofactor
: ,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/inhibitor制约。

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I*h
41
纤维素有内切酶
DNA有内切酶
为啥脂肪酸没有内切酶?
是因为惰性碳碳键?
有没有可能有这种酶?
如果不可能,为什么?
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g*r
42
你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶,各种membrane 得有多不稳定?
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I*h
43
嗯,有道理
能人工设计这种酶吗?

【在 g******r 的大作中提到】
: 你的意思是hydrolysis of alkane? 如果有这样的酶,各种membrane 得有多不稳定?
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g*r
44
要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
haloperoxidase或halogenase。
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I*h
45
谢谢!
这种酶是不是理论上不可能在细胞里表达?只能体外合成?

【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。

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I*h
46
你的头像是谁?

【在 g******r 的大作中提到】
: 要hydrolyze alkane, 首要是造出Leaving group。理论上可以尝试改造
: haloperoxidase或halogenase。

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l*d
47
酶学告诉我们,妹只能加快反应速度,降低能量壁垒,不会改变反应能级。
靠妹砍断碳碳键这种事情还是比较不靠谱,所以有β-oxidation这种天才的方法。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 你的头像是谁?
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g*r
48
energy barrier并不是最主要的问题,因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
存在,它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。
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b*H
49
生物的本质是化学,化学的本质是物理。
很多规律是不能违背的。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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I*h
50
没有进化上的意义,所以没有出现这种酶

【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题,因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在,它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。

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l*d
51
这种观点比较拉马克化。

【在 g******r 的大作中提到】
: energy barrier并不是最主要的问题,因为酶催化反应本也没有确定的能级上限。一些
: 酶如lignin peroxidase催化的反应在energy barrier的角度看就已经难以置信。关键
: 是无限制水解alkane chain的反应对生物系统没有实际意义。有这种催化功能的酶如果
: 存在,它就会攻击各种膜层的疏水部分。造成的后果完全是破坏性的。

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g*r
52
并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要cofactor
,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/inhibitor制约。
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H*i
53
有氧化烃类的微生物,随便搜了搜有直接切开苯环的机制,氧化烷烃似乎也是末端或者
倒数第二个碳氧化,这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
不过肯定不是水解。
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j*g
54
细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
[在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到:]
:并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要
cofactor,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/
inhibitor制约。
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g*r
55
记不清楚了。它切的是CH键不是CC键吧

【在 j*********g 的大作中提到】
: 细胞色素P450 CYP450不能切断alkane链嘛
: [在 gatecher (WayneClough) 的大作中提到:]
: :并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在
: 。或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要
: cofactor,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/
: inhibitor制约。

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I*h
56
拉马克?

【在 l*********d 的大作中提到】
: 这种观点比较拉马克化。
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l*d
57
用进废退。
通俗地说, 就是哥需要它长,它就进化的长啦。
(不要想歪了!!)

【在 I*****h 的大作中提到】
: 拉马克?
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l*d
58
苯环本质上是个C=C键。

【在 H*******i 的大作中提到】
: 有氧化烃类的微生物,随便搜了搜有直接切开苯环的机制,氧化烷烃似乎也是末端或者
: 倒数第二个碳氧化,这样就回到一般的脂肪酸氧化过程了。
: 不过肯定不是水解。

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j*n
59
有没切双键的酶?感觉会有 hehe
那就通过desaturase引入double bond
然后再切?

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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t*e
60
Beta-oxidation 算吗?
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I*h
61
对头

【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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I*h
62
不算

【在 t********e 的大作中提到】
: Beta-oxidation 算吗?
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g*x
63
C-C bond稳定性很高,如果有能直接切C-C的酶,基本上就见啥杀啥了。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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g*x
64
胡扯。

【在 l*********d 的大作中提到】
: 苯环本质上是个C=C键。
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t*e
65
就是共轭大 π键。也是sp2 杂化。不能说就是双键,比较像双键。

【在 g*****x 的大作中提到】
: 胡扯。
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t*e
66
酶的能力也很高,氧化还原都没问题的。他有选择性。

【在 g*****x 的大作中提到】
: C-C bond稳定性很高,如果有能直接切C-C的酶,基本上就见啥杀啥了。
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t*e
67
细胞花费大量ATP合成脂肪酸或者蛋白。是为了储存能量将来释放的。这个角度理解可
以吗?如果只是酶切的话,有需要大量能量去做。

cofactor

【在 g******r 的大作中提到】
: 并不是断言有类似功能的酶不可能存在,只是目前看来无限制性的水解不大可能存在。
: 或许具有在特殊条件下能水解alkane链的酶,只是尚未发现。条件例如:需要cofactor
: ,只能作用于特异长度/位点,存在pH或温度要求,严格受regulator/inhibitor制约。

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j*g
68
AlkB and CYP153 are important alkane hydroxylases responsible for aerobic
alkane degradation in bioremediation of oil-polluted environments and
microbial enhanced oil recovery.

【在 g******r 的大作中提到】
: 记不清楚了。它切的是CH键不是CC键吧
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I*h
69
您在这个领域?

【在 j*********g 的大作中提到】
: AlkB and CYP153 are important alkane hydroxylases responsible for aerobic
: alkane degradation in bioremediation of oil-polluted environments and
: microbial enhanced oil recovery.

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I*h
70
AlkB是烷烃氧化第一步,负责从一头把-CH3变成-CH2-OH的
算不上内切酶
这里讨论的是内切酶的可能性

【在 j*********g 的大作中提到】
: AlkB and CYP153 are important alkane hydroxylases responsible for aerobic
: alkane degradation in bioremediation of oil-polluted environments and
: microbial enhanced oil recovery.

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w*k
71
有酶可以氧化烷烃到烯烃

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶
: DNA有内切酶
: 为啥脂肪酸没有内切酶?
: 是因为惰性碳碳键?
: 有没有可能有这种酶?
: 如果不可能,为什么?

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l*d
72
鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
鱼要的是能切金刚石的妹。

【在 w*****k 的大作中提到】
: 有酶可以氧化烷烃到烯烃
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w*k
73
他不怎么懂化学估计

鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。

【在 l*********d 的大作中提到】
: 鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
: 鱼要的是能切金刚石的妹。

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I*h
74
忘的差不多了

【在 w*****k 的大作中提到】
: 他不怎么懂化学估计
:
: 鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。

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I*h
75
狮心,你也太夸张了
金刚石能和烷烃比吗?金刚石能被乳化吗?

鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。

【在 l*********d 的大作中提到】
: 鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。
: 鱼要的是能切金刚石的妹。

avatar
g*x
76
oxidase一般是切C-H,不是直接切sp3的C-C

【在 t********e 的大作中提到】
: 酶的能力也很高,氧化还原都没问题的。他有选择性。
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g*x
77
你只学过初中化学?根本不像。普通C=C很容易发生加成反应,aromatic体系加成极难
,容易取代。

【在 t********e 的大作中提到】
: 就是共轭大 π键。也是sp2 杂化。不能说就是双键,比较像双键。
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l*d
78
哈,让你的帖子热闹点啊!别当真啦。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 狮心,你也太夸张了
: 金刚石能和烷烃比吗?金刚石能被乳化吗?
:
: 鱼的意思是说,加氧变Carbonyl再切断碳碳键一律不算。

avatar
I*h
79
:) 我知道,木当真

【在 l*********d 的大作中提到】
: 哈,让你的帖子热闹点啊!别当真啦。
avatar
w*k
80
今天就来回复一下
关于切CC键比较难 其实是一个很有意思的问题 如果看CC键的键能 从能量上来说是比
CH键要低的 切CC键的困难是CC键被CH键包裹着 主要是一个动力学的问题 这也是为什
么很多CC键的活化 要么是活化有张力的CC键 要么是活化极性的CC键 都是为了克服动
力学的问题 这也说明了 很多所谓的CC键活化 是经过了CH键活化 然后再CC键活化的一
个分步的过程 如果可以实现给定烷基的选择性卤化 氧化或者脱氢 接下来的CC活化并
不是那么的困难

【在 I*****h 的大作中提到】
: :) 我知道,木当真
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c*6
81
你这么比较C-C和C-H的离解能有点不对头。那是两种不同类型的键呀,C-C那是sp3-sp3
成键,而C-H是sp3-s成键,当然后者的离解能更大。

【在 w*****k 的大作中提到】
: 今天就来回复一下
: 关于切CC键比较难 其实是一个很有意思的问题 如果看CC键的键能 从能量上来说是比
: CH键要低的 切CC键的困难是CC键被CH键包裹着 主要是一个动力学的问题 这也是为什
: 么很多CC键的活化 要么是活化有张力的CC键 要么是活化极性的CC键 都是为了克服动
: 力学的问题 这也说明了 很多所谓的CC键活化 是经过了CH键活化 然后再CC键活化的一
: 个分步的过程 如果可以实现给定烷基的选择性卤化 氧化或者脱氢 接下来的CC活化并
: 不是那么的困难

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C*n
82
因为脂肪链不想蛋白质或者核酸有序列,没有序列就没必要有特定的内切酶
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I*h
83
纤维素有内切酶,纤维素有序列吗?

【在 C*********n 的大作中提到】
: 因为脂肪链不想蛋白质或者核酸有序列,没有序列就没必要有特定的内切酶
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C*n
84

有道理,呵呵。多谢提醒,赞一个。

【在 I*****h 的大作中提到】
: 纤维素有内切酶,纤维素有序列吗?
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w*k
85
我是说cc难切不是因为cc键能高

sp3

【在 c****6 的大作中提到】
: 你这么比较C-C和C-H的离解能有点不对头。那是两种不同类型的键呀,C-C那是sp3-sp3
: 成键,而C-H是sp3-s成键,当然后者的离解能更大。

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I*h
86
5
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h*r
87
不知道lipoxygenase算不算?其实也是分好几步,还有副反应。
将脂肪酸切成一个短的烷烃加上一个一头是醛基的短的脂肪酸
Biochemistry. 1996 Aug 20;35(33):10687-701.
Crystal structure of soybean lipoxygenase L-1 at 1.4 A resolution.
Minor W, Steczko J, Stec B, Otwinowski Z, Bolin JT, Walter R, Axelrod B.
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I*h
88
不算
这个好像是攻击的不饱和碳键吧

【在 h**********r 的大作中提到】
: 不知道lipoxygenase算不算?其实也是分好几步,还有副反应。
: 将脂肪酸切成一个短的烷烃加上一个一头是醛基的短的脂肪酸
: Biochemistry. 1996 Aug 20;35(33):10687-701.
: Crystal structure of soybean lipoxygenase L-1 at 1.4 A resolution.
: Minor W, Steczko J, Stec B, Otwinowski Z, Bolin JT, Walter R, Axelrod B.

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